MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_009456	T	6	6	1007121	1007126	0 %	100 %	0 %	0 %	147671627
19004	NC_009456	TATC	2	8	1007143	1007150	25 %	50 %	0 %	25 %	147671627
19005	NC_009456	ACT	2	6	1007159	1007164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671627
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19008	NC_009456	TAA	2	6	1007346	1007351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672080
19009	NC_009456	A	6	6	1007358	1007363	100 %	0 %	0 %	0 %	147672080
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19011	NC_009456	AAT	2	6	1007533	1007538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672080
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19016	NC_009456	CCAT	2	8	1007715	1007722	25 %	25 %	0 %	50 %	147672080
19017	NC_009456	TCAG	2	8	1007759	1007766	25 %	25 %	25 %	25 %	147672080
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19022	NC_009456	CTTT	2	8	1008025	1008032	0 %	75 %	0 %	25 %	147672080
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19089	NC_009456	CCG	2	6	1011956	1011961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672114
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19091	NC_009456	ATAA	2	8	1012128	1012135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_009456	CAA	2	6	1012136	1012141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19098	NC_009456	T	6	6	1012297	1012302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_009456	A	6	6	1012331	1012336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19102	NC_009456	A	7	7	1012529	1012535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_009456	GGT	2	6	1012560	1012565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_009456	TGC	2	6	1012608	1012613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19105	NC_009456	GT	3	6	1012646	1012651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_009456	A	7	7	1012678	1012684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_009456	CG	3	6	1012698	1012703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19108	NC_009456	TGGG	2	8	1012777	1012784	0 %	25 %	75 %	0 %	147671959
19109	NC_009456	TGCA	2	8	1012809	1012816	25 %	25 %	25 %	25 %	147671959
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19114	NC_009456	GT	3	6	1012999	1013004	0 %	50 %	50 %	0 %	147671992
19115	NC_009456	CAG	2	6	1013039	1013044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671992
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19119	NC_009456	ATG	2	6	1013253	1013258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671992
19120	NC_009456	GTGC	2	8	1013320	1013327	0 %	25 %	50 %	25 %	147671992
19121	NC_009456	GCTT	2	8	1013331	1013338	0 %	50 %	25 %	25 %	147671992
19122	NC_009456	CTT	2	6	1013410	1013415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671992
19123	NC_009456	TGC	3	9	1013421	1013429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671992
19124	NC_009456	TGG	2	6	1013449	1013454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671992
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19127	NC_009456	GCA	2	6	1013770	1013775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671992
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19131	NC_009456	CTT	2	6	1014119	1014124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671992
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19146	NC_009456	TGT	2	6	1014600	1014605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672087
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19235	NC_009456	GCG	2	6	1019715	1019720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671782
19236	NC_009456	CCG	2	6	1019815	1019820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671782
19237	NC_009456	CAG	2	6	1019893	1019898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671782
19238	NC_009456	AAT	2	6	1020160	1020165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671727
19239	NC_009456	GCA	2	6	1020198	1020203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671727
19240	NC_009456	GCC	2	6	1020346	1020351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671727
19241	NC_009456	GCC	2	6	1020428	1020433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
19242	NC_009456	GCT	2	6	1020491	1020496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
19243	NC_009456	GTT	2	6	1020503	1020508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672374
19244	NC_009456	GGGTT	2	10	1020638	1020647	0 %	40 %	60 %	0 %	147672374
19245	NC_009456	GGC	2	6	1020737	1020742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672374
19246	NC_009456	GAT	2	6	1020746	1020751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672374
19247	NC_009456	CCA	2	6	1020794	1020799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672374
19248	NC_009456	ACC	2	6	1020846	1020851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672374
19249	NC_009456	GCA	2	6	1020903	1020908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672374
19250	NC_009456	CCT	2	6	1020972	1020977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147672374
19251	NC_009456	CAT	2	6	1020980	1020985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672374
19252	NC_009456	CGAG	2	8	1021003	1021010	25 %	0 %	50 %	25 %	147672374
19253	NC_009456	AG	4	8	1021009	1021016	50 %	0 %	50 %	0 %	147672374
19254	NC_009456	GAT	2	6	1021043	1021048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672374
19255	NC_009456	CAGTG	2	10	1021061	1021070	20 %	20 %	40 %	20 %	147672374
19256	NC_009456	TGC	2	6	1021126	1021131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
19257	NC_009456	TGC	2	6	1021169	1021174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
19258	NC_009456	GAGC	2	8	1021288	1021295	25 %	0 %	50 %	25 %	147672374
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19260	NC_009456	TTTGC	2	10	1021304	1021313	0 %	60 %	20 %	20 %	147672374
19261	NC_009456	CCGAA	2	10	1021342	1021351	40 %	0 %	20 %	40 %	147672374
19262	NC_009456	AG	3	6	1021358	1021363	50 %	0 %	50 %	0 %	147672374
19263	NC_009456	GAA	2	6	1021457	1021462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672374
19264	NC_009456	GCC	2	6	1021496	1021501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
19265	NC_009456	AAGG	2	8	1021502	1021509	50 %	0 %	50 %	0 %	147672374
19266	NC_009456	GGC	2	6	1021523	1021528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672374
19267	NC_009456	TGG	2	6	1021543	1021548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672374
19268	NC_009456	TGA	2	6	1021607	1021612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672374
19269	NC_009456	TTA	2	6	1021641	1021646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672374
19270	NC_009456	TGC	2	6	1021721	1021726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
19271	NC_009456	CGC	3	9	1021796	1021804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
19272	NC_009456	GCC	2	6	1021881	1021886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
19273	NC_009456	CCG	2	6	1021963	1021968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
19274	NC_009456	CAC	2	6	1022065	1022070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672374
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19276	NC_009456	CAT	2	6	1022177	1022182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672374
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19279	NC_009456	CGC	2	6	1022336	1022341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671479
19280	NC_009456	T	6	6	1022398	1022403	0 %	100 %	0 %	0 %	147672405
19281	NC_009456	TACCG	2	10	1022439	1022448	20 %	20 %	20 %	40 %	147672405
19282	NC_009456	TCA	2	6	1022480	1022485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672405
19283	NC_009456	CTT	2	6	1022498	1022503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672405
19284	NC_009456	GTT	2	6	1022583	1022588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672405
19285	NC_009456	TC	4	8	1022682	1022689	0 %	50 %	0 %	50 %	147672005
19286	NC_009456	GTTG	2	8	1022691	1022698	0 %	50 %	50 %	0 %	147672005
19287	NC_009456	TG	3	6	1022706	1022711	0 %	50 %	50 %	0 %	147672005
19288	NC_009456	TTG	2	6	1022735	1022740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672005
19289	NC_009456	TGCT	2	8	1022756	1022763	0 %	50 %	25 %	25 %	147672005
19290	NC_009456	GAC	2	6	1022786	1022791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672005
19291	NC_009456	TTG	2	6	1022820	1022825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19292	NC_009456	GTC	2	6	1022967	1022972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671481
19293	NC_009456	CTG	2	6	1023003	1023008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671481
19294	NC_009456	TGG	2	6	1023062	1023067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671481
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19296	NC_009456	TGGC	2	8	1023133	1023140	0 %	25 %	50 %	25 %	147671481
19297	NC_009456	GT	3	6	1023342	1023347	0 %	50 %	50 %	0 %	147671795
19298	NC_009456	T	6	6	1023362	1023367	0 %	100 %	0 %	0 %	147671795
19299	NC_009456	ATG	2	6	1023399	1023404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671795
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19302	NC_009456	CAC	2	6	1023679	1023684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671795
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19311	NC_009456	TCG	2	6	1024190	1024195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672376
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19315	NC_009456	GCT	2	6	1024329	1024334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671900
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19321	NC_009456	CGC	2	6	1024559	1024564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671900
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19324	NC_009456	ATTTG	2	10	1024780	1024789	20 %	60 %	20 %	0 %	147672250
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19331	NC_009456	TCA	2	6	1025134	1025139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672250
19332	NC_009456	CTT	2	6	1025200	1025205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672250
19333	NC_009456	GT	3	6	1025236	1025241	0 %	50 %	50 %	0 %	147672250
19334	NC_009456	CTG	2	6	1025245	1025250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672250
19335	NC_009456	GGC	2	6	1025312	1025317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672250
19336	NC_009456	GTT	2	6	1025354	1025359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672250
19337	NC_009456	T	6	6	1025507	1025512	0 %	100 %	0 %	0 %	147672250
19338	NC_009456	TCT	2	6	1025532	1025537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672250
19339	NC_009456	ATC	2	6	1025547	1025552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672250
19340	NC_009456	GGC	2	6	1025588	1025593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672250
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19342	NC_009456	TCA	2	6	1025746	1025751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672250
19343	NC_009456	ATA	2	6	1025766	1025771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672250
19344	NC_009456	GCCAT	2	10	1025779	1025788	20 %	20 %	20 %	40 %	147672250
19345	NC_009456	GAA	2	6	1025831	1025836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671601
19346	NC_009456	CTTG	2	8	1025897	1025904	0 %	50 %	25 %	25 %	147671601
19347	NC_009456	TTC	2	6	1025987	1025992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671601
19348	NC_009456	CTT	2	6	1026014	1026019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671601
19349	NC_009456	TTG	2	6	1026044	1026049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671601
19350	NC_009456	CCA	2	6	1026115	1026120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671601
19351	NC_009456	GTG	2	6	1026123	1026128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671601
19352	NC_009456	TCA	2	6	1026184	1026189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671601
19353	NC_009456	TAA	2	6	1026194	1026199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671601
19354	NC_009456	T	8	8	1026242	1026249	0 %	100 %	0 %	0 %	147671601
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19356	NC_009456	AGC	2	6	1026303	1026308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671601
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19359	NC_009456	TCTG	2	8	1026423	1026430	0 %	50 %	25 %	25 %	147671601
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19387	NC_009456	TCA	2	6	1028203	1028208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671925
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19459	NC_009456	TAA	2	6	1031850	1031855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671611
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19464	NC_009456	GAAA	2	8	1031967	1031974	75 %	0 %	25 %	0 %	147671611
19465	NC_009456	ATG	2	6	1032025	1032030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671611
19466	NC_009456	GAC	2	6	1032070	1032075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671611
19467	NC_009456	CACTC	2	10	1032118	1032127	20 %	20 %	0 %	60 %	147671611
19468	NC_009456	GCA	2	6	1032151	1032156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671611
19469	NC_009456	TCAC	2	8	1032173	1032180	25 %	25 %	0 %	50 %	147671436
19470	NC_009456	AC	3	6	1032179	1032184	50 %	0 %	0 %	50 %	147671436
19471	NC_009456	AG	3	6	1032197	1032202	50 %	0 %	50 %	0 %	147671436
19472	NC_009456	TGA	2	6	1032293	1032298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671436
19473	NC_009456	GCC	2	6	1032308	1032313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671436
19474	NC_009456	CTG	2	6	1032369	1032374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671436
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19491	NC_009456	GT	3	6	1033089	1033094	0 %	50 %	50 %	0 %	147671436
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19496	NC_009456	GT	3	6	1033353	1033358	0 %	50 %	50 %	0 %	147672232
19497	NC_009456	AAC	2	6	1033428	1033433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672232
19498	NC_009456	TGG	2	6	1033438	1033443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672232
19499	NC_009456	GGT	2	6	1033502	1033507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672232
19500	NC_009456	GAT	2	6	1033514	1033519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672232

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