MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_009456	TAA	2	6	821935	821940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_009456	TTGC	2	8	822016	822023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15503	NC_009456	CCA	2	6	822094	822099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671591
15504	NC_009456	AAC	2	6	822126	822131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671591
15505	NC_009456	TAA	2	6	822189	822194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671591
15506	NC_009456	TTA	2	6	822266	822271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671591
15507	NC_009456	ACA	2	6	822278	822283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671591
15508	NC_009456	GAG	2	6	822304	822309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671591
15509	NC_009456	AAG	2	6	822455	822460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671811
15510	NC_009456	AAT	2	6	822472	822477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671811
15511	NC_009456	ACA	2	6	822506	822511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671635
15512	NC_009456	AAAC	3	12	822535	822546	75 %	0 %	0 %	25 %	147671635
15513	NC_009456	GT	3	6	822671	822676	0 %	50 %	50 %	0 %	147671635
15514	NC_009456	ACA	2	6	822722	822727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671635
15515	NC_009456	TAT	2	6	822790	822795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671635
15516	NC_009456	AAC	2	6	822850	822855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671635
15517	NC_009456	AAC	2	6	822876	822881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671635
15518	NC_009456	GAA	2	6	822896	822901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671635
15519	NC_009456	GCA	2	6	822909	822914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671635
15520	NC_009456	AGA	2	6	822949	822954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671635
15521	NC_009456	ACC	2	6	822997	823002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671635
15522	NC_009456	CCA	2	6	823115	823120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671635
15523	NC_009456	AAG	2	6	823164	823169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671635
15524	NC_009456	TTG	2	6	823170	823175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671635
15525	NC_009456	CGC	2	6	823185	823190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671635
15526	NC_009456	GTG	2	6	823193	823198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671635
15527	NC_009456	GT	3	6	823217	823222	0 %	50 %	50 %	0 %	147671635
15528	NC_009456	GTTG	2	8	823431	823438	0 %	50 %	50 %	0 %	147671635
15529	NC_009456	GCA	2	6	823452	823457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671635
15530	NC_009456	TAAC	2	8	823461	823468	50 %	25 %	0 %	25 %	147671635
15531	NC_009456	TAA	2	6	823504	823509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671635
15532	NC_009456	CAA	2	6	823538	823543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_009456	AATA	2	8	823599	823606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_009456	TAC	2	6	823722	823727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671962
15535	NC_009456	TTG	2	6	823851	823856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671962
15536	NC_009456	TTA	2	6	823918	823923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671962
15537	NC_009456	AG	3	6	823927	823932	50 %	0 %	50 %	0 %	147671962
15538	NC_009456	CTA	2	6	823936	823941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671962
15539	NC_009456	TGG	2	6	824030	824035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671962
15540	NC_009456	TAA	2	6	824089	824094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671962
15541	NC_009456	CTTC	2	8	824144	824151	0 %	50 %	0 %	50 %	147671962
15542	NC_009456	TCT	2	6	824187	824192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671962
15543	NC_009456	ATT	2	6	824313	824318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671962
15544	NC_009456	GAAA	2	8	824350	824357	75 %	0 %	25 %	0 %	147671962
15545	NC_009456	CGC	2	6	824480	824485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15546	NC_009456	CA	3	6	824495	824500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15547	NC_009456	ACAA	2	8	824513	824520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15548	NC_009456	AC	3	6	824521	824526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15549	NC_009456	TA	3	6	824585	824590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_009456	CAA	2	6	824615	824620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672458
15551	NC_009456	GCC	2	6	824645	824650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672458
15552	NC_009456	AGCGC	2	10	824686	824695	20 %	0 %	40 %	40 %	147672458
15553	NC_009456	ACCA	2	8	824734	824741	50 %	0 %	0 %	50 %	147672458
15554	NC_009456	TGA	2	6	824743	824748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672458
15555	NC_009456	AAAT	2	8	824837	824844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_009456	TAT	2	6	824875	824880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671493
15557	NC_009456	A	6	6	824930	824935	100 %	0 %	0 %	0 %	147671493
15558	NC_009456	TGA	2	6	824944	824949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671493
15559	NC_009456	AC	3	6	824954	824959	50 %	0 %	0 %	50 %	147671493
15560	NC_009456	CTAT	2	8	824967	824974	25 %	50 %	0 %	25 %	147671493
15561	NC_009456	ACA	2	6	824993	824998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_009456	AAC	2	6	825000	825005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_009456	AAGGA	2	10	825009	825018	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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15566	NC_009456	TCT	2	6	825120	825125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671985
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15569	NC_009456	AAT	2	6	825152	825157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_009456	TAA	2	6	825211	825216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671530
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15579	NC_009456	TGCCA	2	10	825586	825595	20 %	20 %	20 %	40 %	147672018
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15581	NC_009456	ATTTA	2	10	825807	825816	40 %	60 %	0 %	0 %	147672018
15582	NC_009456	GTT	2	6	825844	825849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_009456	TAAT	2	8	825874	825881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_009456	GGA	2	6	825889	825894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15587	NC_009456	TGTT	2	8	826050	826057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_009456	TAA	2	6	826069	826074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_009456	GGT	2	6	826076	826081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_009456	CTT	2	6	826085	826090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_009456	AAC	2	6	826232	826237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_009456	AATA	2	8	826238	826245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_009456	ATA	3	9	826243	826251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_009456	TAC	2	6	826277	826282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671654
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15596	NC_009456	A	6	6	826334	826339	100 %	0 %	0 %	0 %	147671654
15597	NC_009456	AG	3	6	826565	826570	50 %	0 %	50 %	0 %	147671654
15598	NC_009456	GTTA	2	8	826585	826592	25 %	50 %	25 %	0 %	147671654
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15602	NC_009456	TAG	2	6	827127	827132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671595
15603	NC_009456	GCAA	2	8	827175	827182	50 %	0 %	25 %	25 %	147671595
15604	NC_009456	CGA	2	6	827204	827209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671595
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15608	NC_009456	CAA	2	6	827377	827382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671595
15609	NC_009456	AGC	2	6	827400	827405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671595
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15613	NC_009456	AAAC	2	8	827521	827528	75 %	0 %	0 %	25 %	147671595
15614	NC_009456	GTG	2	6	827543	827548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671595
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15618	NC_009456	GTGTG	2	10	827753	827762	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_009456	AAC	2	6	827798	827803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_009456	ACT	3	9	827836	827844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_009456	CCG	2	6	827926	827931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15622	NC_009456	ACTA	2	8	827962	827969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15623	NC_009456	CGCAC	2	10	828056	828065	20 %	0 %	20 %	60 %	147672072
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