MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12005	NC_009456	T	6	6	633078	633083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_009456	GCCA	2	8	633104	633111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12114	NC_009456	AACA	2	8	638822	638829	75 %	0 %	0 %	25 %	147672296
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12121	NC_009456	GGT	2	6	639246	639251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672140
12122	NC_009456	GCA	2	6	639265	639270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672140
12123	NC_009456	TGC	3	9	639274	639282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672140
12124	NC_009456	ATGA	2	8	639330	639337	50 %	25 %	25 %	0 %	147672140
12125	NC_009456	CGC	2	6	639356	639361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672140
12126	NC_009456	ATG	2	6	639403	639408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672140
12127	NC_009456	CTG	2	6	639423	639428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672140
12128	NC_009456	CT	3	6	639429	639434	0 %	50 %	0 %	50 %	147672140
12129	NC_009456	CCG	2	6	639456	639461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672140
12130	NC_009456	ATC	2	6	639522	639527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672140
12131	NC_009456	ATG	2	6	639594	639599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672140
12132	NC_009456	TGA	2	6	639655	639660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672140
12133	NC_009456	CGC	2	6	639764	639769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672140
12134	NC_009456	GGT	2	6	639945	639950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672140
12135	NC_009456	GCAA	2	8	640036	640043	50 %	0 %	25 %	25 %	147672140
12136	NC_009456	CA	3	6	640130	640135	50 %	0 %	0 %	50 %	147672140
12137	NC_009456	CTA	2	6	640259	640264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672140
12138	NC_009456	GTG	2	6	640278	640283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672140
12139	NC_009456	TGT	2	6	640294	640299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672140
12140	NC_009456	GCC	2	6	640476	640481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672140
12141	NC_009456	CCA	2	6	640489	640494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672140
12142	NC_009456	TGA	2	6	640529	640534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672140
12143	NC_009456	TGC	2	6	640561	640566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672140
12144	NC_009456	CAAT	2	8	640618	640625	50 %	25 %	0 %	25 %	147672140
12145	NC_009456	CAGA	2	8	640815	640822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12146	NC_009456	TGC	2	6	640888	640893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12147	NC_009456	CAAAC	2	10	640911	640920	60 %	0 %	0 %	40 %	147671633
12148	NC_009456	ACC	2	6	640995	641000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671633
12149	NC_009456	TGC	2	6	641001	641006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671633
12150	NC_009456	GTC	2	6	641034	641039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671633
12151	NC_009456	AAAT	2	8	641047	641054	75 %	25 %	0 %	0 %	147671633
12152	NC_009456	CCG	2	6	641062	641067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671633
12153	NC_009456	CCA	2	6	641068	641073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671633
12154	NC_009456	GGAA	2	8	641130	641137	50 %	0 %	50 %	0 %	147671633
12155	NC_009456	TTC	2	6	641178	641183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671633
12156	NC_009456	AACC	2	8	641251	641258	50 %	0 %	0 %	50 %	147671633
12157	NC_009456	ATT	2	6	641265	641270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671633
12158	NC_009456	ATG	2	6	641275	641280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671633
12159	NC_009456	TGC	2	6	641414	641419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672443
12160	NC_009456	CAC	2	6	641476	641481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672443
12161	NC_009456	GCA	2	6	641562	641567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672443
12162	NC_009456	ACT	2	6	641603	641608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672443
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12164	NC_009456	TGCTGA	2	12	641781	641792	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147672443
12165	NC_009456	CAAA	2	8	641799	641806	75 %	0 %	0 %	25 %	147672443
12166	NC_009456	CCA	2	6	641895	641900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672443
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12168	NC_009456	GCTC	2	8	642042	642049	0 %	25 %	25 %	50 %	147672443
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12172	NC_009456	GCTT	2	8	642239	642246	0 %	50 %	25 %	25 %	147672443
12173	NC_009456	GCT	2	6	642275	642280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672443
12174	NC_009456	TCA	2	6	642348	642353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672443
12175	NC_009456	CATCTT	2	12	642384	642395	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	147672443
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12177	NC_009456	GCAC	2	8	642564	642571	25 %	0 %	25 %	50 %	147672443
12178	NC_009456	TGAA	2	8	642587	642594	50 %	25 %	25 %	0 %	147672443
12179	NC_009456	CGG	2	6	642666	642671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672443
12180	NC_009456	GC	3	6	642750	642755	0 %	0 %	50 %	50 %	147672443
12181	NC_009456	CCAA	2	8	642851	642858	50 %	0 %	0 %	50 %	147672443
12182	NC_009456	GAT	2	6	642894	642899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672443
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12185	NC_009456	CAT	2	6	643132	643137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672443
12186	NC_009456	ATG	2	6	643185	643190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672443
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12188	NC_009456	CTT	2	6	643293	643298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671573
12189	NC_009456	CCA	2	6	643324	643329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671573
12190	NC_009456	GCG	2	6	643334	643339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671573
12191	NC_009456	TTG	2	6	643377	643382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671573
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12193	NC_009456	AAACC	2	10	643561	643570	60 %	0 %	0 %	40 %	147671573
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12209	NC_009456	GTA	2	6	644561	644566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671495
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12211	NC_009456	CTG	2	6	644731	644736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671495
12212	NC_009456	A	6	6	644788	644793	100 %	0 %	0 %	0 %	147671495
12213	NC_009456	GGC	2	6	644832	644837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671495
12214	NC_009456	AGCA	2	8	644871	644878	50 %	0 %	25 %	25 %	147671495
12215	NC_009456	TGGTTA	2	12	644926	644937	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12216	NC_009456	GCC	2	6	645009	645014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672175
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12219	NC_009456	TCGCT	2	10	645156	645165	0 %	40 %	20 %	40 %	147672175
12220	NC_009456	CAC	2	6	645201	645206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672175
12221	NC_009456	TTGT	2	8	645379	645386	0 %	75 %	25 %	0 %	147672175
12222	NC_009456	ACGC	2	8	645484	645491	25 %	0 %	25 %	50 %	147672175
12223	NC_009456	GAT	2	6	645532	645537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672175
12224	NC_009456	TGC	2	6	645605	645610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672175
12225	NC_009456	GTT	2	6	645657	645662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672175
12226	NC_009456	CAC	2	6	645690	645695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672175
12227	NC_009456	TAAA	2	8	645889	645896	75 %	25 %	0 %	0 %	147672175
12228	NC_009456	TGG	2	6	645897	645902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672175
12229	NC_009456	CCA	2	6	645909	645914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672175
12230	NC_009456	TAA	2	6	645935	645940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672175
12231	NC_009456	CAG	2	6	645946	645951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672175
12232	NC_009456	CAC	3	9	645961	645969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672175
12233	NC_009456	CGTT	2	8	646019	646026	0 %	50 %	25 %	25 %	147672175
12234	NC_009456	GGC	2	6	646027	646032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672175
12235	NC_009456	AAC	2	6	646153	646158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671682
12236	NC_009456	CCA	3	9	646176	646184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671682
12237	NC_009456	ACC	2	6	646246	646251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671682
12238	NC_009456	TAA	2	6	646389	646394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671682
12239	NC_009456	GCG	2	6	646395	646400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671682
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12241	NC_009456	TAA	2	6	646477	646482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671682
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12350	NC_009456	TCAT	2	8	653329	653336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12486	NC_009456	GTG	3	9	660207	660215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672456
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12498	NC_009456	GCTGA	2	10	660696	660705	20 %	20 %	40 %	20 %	147672456
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12500	NC_009456	TCT	2	6	660870	660875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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