MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009456	ATCA	2	8	578251	578258	50 %	25 %	0 %	25 %	147671880
11003	NC_009456	ACC	2	6	578322	578327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671880
11004	NC_009456	CAT	2	6	578337	578342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671880
11005	NC_009456	GT	3	6	578405	578410	0 %	50 %	50 %	0 %	147671880
11006	NC_009456	TGA	2	6	578418	578423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671880
11007	NC_009456	T	6	6	578541	578546	0 %	100 %	0 %	0 %	147671880
11008	NC_009456	GTG	2	6	578560	578565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671880
11009	NC_009456	ACC	2	6	578568	578573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671880
11010	NC_009456	AGA	2	6	578630	578635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671880
11011	NC_009456	GC	3	6	578674	578679	0 %	0 %	50 %	50 %	147671880
11012	NC_009456	ACG	2	6	578707	578712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671880
11013	NC_009456	TGA	2	6	578761	578766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671880
11014	NC_009456	TCA	2	6	578825	578830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671880
11015	NC_009456	CAG	2	6	578854	578859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671880
11016	NC_009456	GGA	2	6	578988	578993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671880
11017	NC_009456	GCAA	2	8	579011	579018	50 %	0 %	25 %	25 %	147671880
11018	NC_009456	GGT	2	6	579148	579153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671880
11019	NC_009456	GAG	2	6	579154	579159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671880
11020	NC_009456	GTAA	2	8	579189	579196	50 %	25 %	25 %	0 %	147671880
11021	NC_009456	CTT	2	6	579258	579263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671880
11022	NC_009456	GCG	2	6	579316	579321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671880
11023	NC_009456	CTT	2	6	579387	579392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671880
11024	NC_009456	GCG	2	6	579437	579442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671880
11025	NC_009456	GC	3	6	579496	579501	0 %	0 %	50 %	50 %	147671880
11026	NC_009456	CG	3	6	579520	579525	0 %	0 %	50 %	50 %	147671880
11027	NC_009456	CTT	2	6	579594	579599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671880
11028	NC_009456	A	6	6	579639	579644	100 %	0 %	0 %	0 %	147671880
11029	NC_009456	GCT	2	6	579733	579738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671880
11030	NC_009456	TCA	2	6	579871	579876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672513
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11032	NC_009456	G	6	6	580013	580018	0 %	0 %	100 %	0 %	147672513
11033	NC_009456	GCTT	2	8	580078	580085	0 %	50 %	25 %	25 %	147672391
11034	NC_009456	GTC	2	6	580133	580138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671728
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11036	NC_009456	CAC	2	6	580326	580331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671728
11037	NC_009456	CCA	2	6	580339	580344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671728
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11039	NC_009456	TCCA	2	8	580551	580558	25 %	25 %	0 %	50 %	147671728
11040	NC_009456	ATCG	2	8	580646	580653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11041	NC_009456	TTA	2	6	580703	580708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672157
11042	NC_009456	GT	3	6	580870	580875	0 %	50 %	50 %	0 %	147672157
11043	NC_009456	AGT	2	6	580910	580915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672157
11044	NC_009456	TTGCC	2	10	580965	580974	0 %	40 %	20 %	40 %	147672157
11045	NC_009456	AT	3	6	581256	581261	50 %	50 %	0 %	0 %	147672157
11046	NC_009456	GGA	2	6	581342	581347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147672157
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11050	NC_009456	CA	3	6	581382	581387	50 %	0 %	0 %	50 %	147672157
11051	NC_009456	CCA	2	6	581429	581434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672157
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11053	NC_009456	TAA	2	6	581479	581484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_009456	ACG	2	6	581532	581537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_009456	AAAC	2	8	581565	581572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11056	NC_009456	T	6	6	581636	581641	0 %	100 %	0 %	0 %	147671651
11057	NC_009456	T	8	8	581654	581661	0 %	100 %	0 %	0 %	147671651
11058	NC_009456	TGT	2	6	581677	581682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671651
11059	NC_009456	T	6	6	581682	581687	0 %	100 %	0 %	0 %	147671651
11060	NC_009456	CTT	2	6	581723	581728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671651
11061	NC_009456	CGA	2	6	581750	581755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671651
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11063	NC_009456	CAC	2	6	581932	581937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671651
11064	NC_009456	TTC	2	6	582026	582031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671651
11065	NC_009456	TCG	2	6	582051	582056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671651
11066	NC_009456	ACT	2	6	582065	582070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_009456	A	6	6	582074	582079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009456	T	6	6	582107	582112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_009456	ACTAA	2	10	582135	582144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11070	NC_009456	GAT	2	6	582261	582266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672082
11071	NC_009456	GCCGT	2	10	582298	582307	0 %	20 %	40 %	40 %	147672082
11072	NC_009456	TATC	2	8	582311	582318	25 %	50 %	0 %	25 %	147672082
11073	NC_009456	GCC	2	6	582333	582338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672082
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11077	NC_009456	C	6	6	582435	582440	0 %	0 %	0 %	100 %	147672082
11078	NC_009456	TAT	3	9	582441	582449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672082
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11081	NC_009456	GAA	2	6	582636	582641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672082
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11086	NC_009456	ACG	2	6	582975	582980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_009456	GCTC	2	8	583079	583086	0 %	25 %	25 %	50 %	147671486
11088	NC_009456	ATC	2	6	583087	583092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671486
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11090	NC_009456	CCAT	2	8	583292	583299	25 %	25 %	0 %	50 %	147671486
11091	NC_009456	CGAT	2	8	583334	583341	25 %	25 %	25 %	25 %	147671486
11092	NC_009456	CAT	2	6	583393	583398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671486
11093	NC_009456	GC	3	6	583447	583452	0 %	0 %	50 %	50 %	147671486
11094	NC_009456	CAA	2	6	583548	583553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671486
11095	NC_009456	GTT	2	6	583609	583614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671486
11096	NC_009456	GTGG	2	8	583630	583637	0 %	25 %	75 %	0 %	147671486
11097	NC_009456	TGC	2	6	583693	583698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671486
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11099	NC_009456	CAA	2	6	583850	583855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672515
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11101	NC_009456	CT	3	6	583939	583944	0 %	50 %	0 %	50 %	147672515
11102	NC_009456	AAC	2	6	584089	584094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672515
11103	NC_009456	CA	3	6	584147	584152	50 %	0 %	0 %	50 %	147672515
11104	NC_009456	CAC	3	9	584231	584239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672515
11105	NC_009456	AATC	2	8	584554	584561	50 %	25 %	0 %	25 %	147671437
11106	NC_009456	TAT	2	6	584603	584608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671437
11107	NC_009456	GCG	2	6	584675	584680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671437
11108	NC_009456	GTT	2	6	584742	584747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671437
11109	NC_009456	ATC	2	6	584820	584825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671437
11110	NC_009456	TGC	2	6	584826	584831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671437
11111	NC_009456	CAA	2	6	584851	584856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671437
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11113	NC_009456	AGCGC	2	10	584953	584962	20 %	0 %	40 %	40 %	147671437
11114	NC_009456	AGC	2	6	585080	585085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672150
11115	NC_009456	CAA	2	6	585103	585108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672150
11116	NC_009456	AGTG	2	8	585198	585205	25 %	25 %	50 %	0 %	147672150
11117	NC_009456	TGA	2	6	585344	585349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672150
11118	NC_009456	GCA	2	6	585363	585368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672150
11119	NC_009456	CTT	2	6	585433	585438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_009456	GCA	2	6	585449	585454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_009456	AAG	3	9	585476	585484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_009456	ACA	2	6	585512	585517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671428
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11225	NC_009456	AAT	2	6	591179	591184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11227	NC_009456	ACT	2	6	591212	591217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11229	NC_009456	TTC	2	6	591256	591261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11230	NC_009456	AGGT	2	8	591307	591314	25 %	25 %	50 %	0 %	147672193
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