MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_009456	GTA	2	6	550087	550092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671518
10503	NC_009456	CAC	2	6	550093	550098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671518
10504	NC_009456	ATT	2	6	550120	550125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671518
10505	NC_009456	TGGT	2	8	550139	550146	0 %	50 %	50 %	0 %	147671518
10506	NC_009456	TAGC	2	8	550260	550267	25 %	25 %	25 %	25 %	147671518
10507	NC_009456	GCTT	2	8	550290	550297	0 %	50 %	25 %	25 %	147672041
10508	NC_009456	GCT	2	6	550320	550325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672041
10509	NC_009456	CA	3	6	550363	550368	50 %	0 %	0 %	50 %	147672041
10510	NC_009456	T	7	7	550421	550427	0 %	100 %	0 %	0 %	147672041
10511	NC_009456	TGGT	2	8	550455	550462	0 %	50 %	50 %	0 %	147672041
10512	NC_009456	CCT	2	6	550525	550530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147672041
10513	NC_009456	AAT	2	6	550550	550555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672041
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10515	NC_009456	ACC	2	6	550568	550573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672041
10516	NC_009456	CTT	2	6	550673	550678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672041
10517	NC_009456	AGC	2	6	550824	550829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672041
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10519	NC_009456	AGC	2	6	550955	550960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672041
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10522	NC_009456	AAT	2	6	551145	551150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672041
10523	NC_009456	A	6	6	551175	551180	100 %	0 %	0 %	0 %	147672041
10524	NC_009456	AAGC	2	8	551195	551202	50 %	0 %	25 %	25 %	147672041
10525	NC_009456	TGG	2	6	551224	551229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672041
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10529	NC_009456	CGT	2	6	551698	551703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10535	NC_009456	TGA	3	9	552161	552169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671719
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10540	NC_009456	TAA	2	6	552434	552439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672525
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10542	NC_009456	TG	3	6	552647	552652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_009456	CA	3	6	552681	552686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10544	NC_009456	AAC	2	6	552830	552835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671557
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10551	NC_009456	TC	3	6	553169	553174	0 %	50 %	0 %	50 %	147671557
10552	NC_009456	TCG	2	6	553198	553203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671557
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10555	NC_009456	CTG	2	6	553463	553468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671557
10556	NC_009456	CGC	2	6	553533	553538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671557
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10570	NC_009456	CGT	2	6	554115	554120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671557
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10594	NC_009456	GTTG	2	8	555086	555093	0 %	50 %	50 %	0 %	147672375
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10603	NC_009456	GAT	2	6	555474	555479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672375
10604	NC_009456	ATG	2	6	555678	555683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672375
10605	NC_009456	AAG	2	6	555748	555753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_009456	CTT	2	6	555769	555774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_009456	ATT	2	6	555791	555796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_009456	A	6	6	555860	555865	100 %	0 %	0 %	0 %	147671658
10609	NC_009456	TTGT	2	8	555970	555977	0 %	75 %	25 %	0 %	147671658
10610	NC_009456	CGA	2	6	556001	556006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671658
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10612	NC_009456	TTA	2	6	556051	556056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671658
10613	NC_009456	CAC	2	6	556217	556222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671658
10614	NC_009456	CCCAG	2	10	556293	556302	20 %	0 %	20 %	60 %	147671658
10615	NC_009456	TGC	2	6	556313	556318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671658
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10619	NC_009456	TTGG	2	8	556658	556665	0 %	50 %	50 %	0 %	147671658
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10989	NC_009456	TTCA	2	8	577805	577812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10990	NC_009456	TGA	2	6	577829	577834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10992	NC_009456	T	6	6	577862	577867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10993	NC_009456	GCA	3	9	577878	577886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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