MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009456	TAAAA	2	10	523753	523762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_009456	AC	3	6	523919	523924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_009456	ACA	2	6	523942	523947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672289
10004	NC_009456	TTG	2	6	523990	523995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672289
10005	NC_009456	GAC	2	6	524090	524095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672289
10006	NC_009456	TCA	2	6	524100	524105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672289
10007	NC_009456	CAGCTT	2	12	524126	524137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147672289
10008	NC_009456	TTC	2	6	524162	524167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672289
10009	NC_009456	T	7	7	524238	524244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009456	TC	3	6	524265	524270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_009456	TCT	2	6	524409	524414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671944
10012	NC_009456	T	6	6	524441	524446	0 %	100 %	0 %	0 %	147671944
10013	NC_009456	GGC	2	6	524459	524464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671944
10014	NC_009456	ATC	2	6	524505	524510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671944
10015	NC_009456	CCAA	2	8	524571	524578	50 %	0 %	0 %	50 %	147671944
10016	NC_009456	GA	3	6	524616	524621	50 %	0 %	50 %	0 %	147671944
10017	NC_009456	TAC	2	6	524678	524683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671944
10018	NC_009456	GAA	2	6	524687	524692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671944
10019	NC_009456	A	6	6	524699	524704	100 %	0 %	0 %	0 %	147671944
10020	NC_009456	GTC	2	6	524742	524747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671944
10021	NC_009456	ATT	2	6	524787	524792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671944
10022	NC_009456	CCA	2	6	524827	524832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671944
10023	NC_009456	TAA	2	6	524863	524868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671944
10024	NC_009456	AGCG	2	8	524900	524907	25 %	0 %	50 %	25 %	147671944
10025	NC_009456	GCA	2	6	524946	524951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671944
10026	NC_009456	AG	3	6	525062	525067	50 %	0 %	50 %	0 %	147671944
10027	NC_009456	ATG	2	6	525096	525101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672024
10028	NC_009456	CGT	2	6	525142	525147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672024
10029	NC_009456	ACA	2	6	525149	525154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672024
10030	NC_009456	CAA	2	6	525207	525212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_009456	GTC	2	6	525306	525311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671662
10032	NC_009456	GAA	2	6	525317	525322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671662
10033	NC_009456	TCT	2	6	525408	525413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671662
10034	NC_009456	TTC	2	6	525416	525421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671662
10035	NC_009456	TAA	2	6	525434	525439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671662
10036	NC_009456	AGC	2	6	525468	525473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671662
10037	NC_009456	TG	3	6	525491	525496	0 %	50 %	50 %	0 %	147671662
10038	NC_009456	AAT	2	6	525536	525541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671662
10039	NC_009456	GCA	2	6	525562	525567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671662
10040	NC_009456	TGC	2	6	525572	525577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671662
10041	NC_009456	TAC	2	6	525608	525613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671662
10042	NC_009456	TTAC	2	8	525720	525727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_009456	GTA	2	6	525809	525814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672147
10044	NC_009456	CCG	2	6	525862	525867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672147
10045	NC_009456	T	6	6	525901	525906	0 %	100 %	0 %	0 %	147672147
10046	NC_009456	TGA	2	6	525982	525987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672147
10047	NC_009456	GCA	2	6	525997	526002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672147
10048	NC_009456	TCA	2	6	526041	526046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672147
10049	NC_009456	CGA	2	6	526069	526074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672147
10050	NC_009456	GCA	2	6	526093	526098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672147
10051	NC_009456	CAAC	2	8	526123	526130	50 %	0 %	0 %	50 %	147672147
10052	NC_009456	CAC	2	6	526136	526141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672147
10053	NC_009456	GAT	2	6	526144	526149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672147
10054	NC_009456	GCAA	2	8	526179	526186	50 %	0 %	25 %	25 %	147672147
10055	NC_009456	TCA	2	6	526326	526331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672147
10056	NC_009456	ATG	2	6	526379	526384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672147
10057	NC_009456	CGC	2	6	526495	526500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672147
10058	NC_009456	TTG	2	6	526529	526534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672147
10059	NC_009456	TCAG	2	8	526539	526546	25 %	25 %	25 %	25 %	147672147
10060	NC_009456	ACGC	2	8	526611	526618	25 %	0 %	25 %	50 %	147672147
10061	NC_009456	TCAA	2	8	526718	526725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_009456	TTATG	2	10	526761	526770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009456	GATG	2	8	526771	526778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009456	A	6	6	526907	526912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009456	TCG	2	6	526933	526938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_009456	TGA	2	6	527034	527039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671684
10067	NC_009456	TCC	2	6	527126	527131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147671684
10068	NC_009456	CCA	2	6	527155	527160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671684
10069	NC_009456	AGC	2	6	527213	527218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671684
10070	NC_009456	TCA	2	6	527310	527315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671684
10071	NC_009456	GAT	2	6	527316	527321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671684
10072	NC_009456	ATG	2	6	527365	527370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671684
10073	NC_009456	TGT	2	6	527586	527591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009456	CTT	2	6	527656	527661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_009456	TGG	2	6	527679	527684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_009456	CTT	2	6	527757	527762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_009456	GTTC	2	8	527831	527838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_009456	T	6	6	527842	527847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_009456	CTT	2	6	527854	527859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_009456	AAT	2	6	527910	527915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_009456	GAT	2	6	528069	528074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672161
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10083	NC_009456	TAC	2	6	528085	528090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672161
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10086	NC_009456	GC	4	8	528206	528213	0 %	0 %	50 %	50 %	147672161
10087	NC_009456	TCA	2	6	528240	528245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672161
10088	NC_009456	TTGT	2	8	528262	528269	0 %	75 %	25 %	0 %	147672161
10089	NC_009456	ATCTC	2	10	528287	528296	20 %	40 %	0 %	40 %	147672161
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10091	NC_009456	TTA	2	6	528464	528469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672161
10092	NC_009456	A	7	7	528516	528522	100 %	0 %	0 %	0 %	147672161
10093	NC_009456	TGC	2	6	528542	528547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671417
10094	NC_009456	TGAT	2	8	528589	528596	25 %	50 %	25 %	0 %	147671417
10095	NC_009456	GC	3	6	528604	528609	0 %	0 %	50 %	50 %	147671417
10096	NC_009456	TCAA	2	8	528615	528622	50 %	25 %	0 %	25 %	147671417
10097	NC_009456	CGCAG	2	10	528786	528795	20 %	0 %	40 %	40 %	147671417
10098	NC_009456	TGACT	2	10	528884	528893	20 %	40 %	20 %	20 %	147671417
10099	NC_009456	GGT	2	6	528960	528965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671417
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10101	NC_009456	GCTT	2	8	529146	529153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_009456	CAT	2	6	529264	529269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671415
10103	NC_009456	GCA	2	6	529312	529317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671415
10104	NC_009456	GTTT	2	8	529324	529331	0 %	75 %	25 %	0 %	147671415
10105	NC_009456	TTC	2	6	529352	529357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671415
10106	NC_009456	GA	3	6	529362	529367	50 %	0 %	50 %	0 %	147671415
10107	NC_009456	AGA	2	6	529429	529434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671415
10108	NC_009456	CCA	2	6	529447	529452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671415
10109	NC_009456	ATCAC	2	10	529476	529485	40 %	20 %	0 %	40 %	147671415
10110	NC_009456	TCA	2	6	529489	529494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671415
10111	NC_009456	CTTGG	2	10	529513	529522	0 %	40 %	40 %	20 %	147671415
10112	NC_009456	AGT	2	6	529525	529530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671415
10113	NC_009456	AG	3	6	529565	529570	50 %	0 %	50 %	0 %	147671415
10114	NC_009456	ACCA	2	8	529574	529581	50 %	0 %	0 %	50 %	147671415
10115	NC_009456	AGC	2	6	529607	529612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671415
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10117	NC_009456	TCA	2	6	529690	529695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671415
10118	NC_009456	TGAC	2	8	529735	529742	25 %	25 %	25 %	25 %	147671415
10119	NC_009456	ACA	2	6	529770	529775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671415
10120	NC_009456	GGC	2	6	529778	529783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671415
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10122	NC_009456	CAC	2	6	529837	529842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671415
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10237	NC_009456	ATAC	2	8	535628	535635	50 %	25 %	0 %	25 %	147671895
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