MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 36097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_004605	TTTGA	2	10	1254769	1254778	20 %	60 %	20 %	0 %	28901040
24002	NC_004605	TGC	2	6	1254787	1254792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901040
24003	NC_004605	ACC	2	6	1254811	1254816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901040
24004	NC_004605	ATG	2	6	1254824	1254829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901040
24005	NC_004605	CAA	2	6	1254855	1254860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901040
24006	NC_004605	AACC	2	8	1254966	1254973	50 %	0 %	0 %	50 %	28901040
24007	NC_004605	AAGA	2	8	1254978	1254985	75 %	0 %	25 %	0 %	28901040
24008	NC_004605	CGT	2	6	1255018	1255023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901040
24009	NC_004605	AGC	2	6	1255130	1255135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901040
24010	NC_004605	TCA	2	6	1255274	1255279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901040
24011	NC_004605	CTGCAG	2	12	1255311	1255322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28901040
24012	NC_004605	ATC	2	6	1255363	1255368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901040
24013	NC_004605	GAA	2	6	1255418	1255423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901040
24014	NC_004605	CAT	2	6	1255497	1255502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901040
24015	NC_004605	TACTTC	2	12	1255516	1255527	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24016	NC_004605	GTT	2	6	1255531	1255536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24017	NC_004605	AGC	2	6	1255591	1255596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24018	NC_004605	AAAT	2	8	1255676	1255683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24019	NC_004605	CAAA	2	8	1255685	1255692	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24020	NC_004605	ATA	2	6	1255725	1255730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24021	NC_004605	ATC	2	6	1255754	1255759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24022	NC_004605	TAC	2	6	1255786	1255791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24023	NC_004605	TAA	2	6	1255831	1255836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_004605	TTG	2	6	1255859	1255864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24025	NC_004605	T	6	6	1255914	1255919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24026	NC_004605	CAAT	2	8	1255956	1255963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24027	NC_004605	AGC	2	6	1256000	1256005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901041
24028	NC_004605	GTA	2	6	1256017	1256022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901041
24029	NC_004605	GC	3	6	1256023	1256028	0 %	0 %	50 %	50 %	28901041
24030	NC_004605	TGCT	2	8	1256093	1256100	0 %	50 %	25 %	25 %	28901041
24031	NC_004605	TGA	3	9	1256117	1256125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901041
24032	NC_004605	GGT	2	6	1256334	1256339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901041
24033	NC_004605	ATG	2	6	1256346	1256351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901041
24034	NC_004605	CTT	2	6	1256489	1256494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901041
24035	NC_004605	TGC	2	6	1256537	1256542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901041
24036	NC_004605	TGT	2	6	1256543	1256548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901041
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24038	NC_004605	AGT	2	6	1256558	1256563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901041
24039	NC_004605	AGA	2	6	1256606	1256611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901041
24040	NC_004605	CGT	2	6	1256781	1256786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901041
24041	NC_004605	ACA	2	6	1256878	1256883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901041
24042	NC_004605	TTCG	2	8	1256933	1256940	0 %	50 %	25 %	25 %	28901041
24043	NC_004605	CA	3	6	1256977	1256982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24044	NC_004605	TCA	2	6	1256986	1256991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24045	NC_004605	ATG	2	6	1257041	1257046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24046	NC_004605	A	6	6	1257113	1257118	100 %	0 %	0 %	0 %	28901042
24047	NC_004605	ATT	2	6	1257123	1257128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28901042
24048	NC_004605	CAG	2	6	1257155	1257160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901042
24049	NC_004605	ATCT	2	8	1257227	1257234	25 %	50 %	0 %	25 %	28901042
24050	NC_004605	TCCCG	2	10	1257360	1257369	0 %	20 %	20 %	60 %	28901042
24051	NC_004605	TTC	2	6	1257396	1257401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901042
24052	NC_004605	CAA	2	6	1257524	1257529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901042
24053	NC_004605	AAATC	2	10	1257583	1257592	60 %	20 %	0 %	20 %	28901042
24054	NC_004605	TTGC	2	8	1257602	1257609	0 %	50 %	25 %	25 %	28901042
24055	NC_004605	GGCA	2	8	1257624	1257631	25 %	0 %	50 %	25 %	28901042
24056	NC_004605	ATCA	2	8	1257636	1257643	50 %	25 %	0 %	25 %	28901042
24057	NC_004605	CCAT	2	8	1257649	1257656	25 %	25 %	0 %	50 %	28901042
24058	NC_004605	TCC	2	6	1257669	1257674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28901042
24059	NC_004605	AATC	2	8	1257686	1257693	50 %	25 %	0 %	25 %	28901042
24060	NC_004605	TCT	2	6	1257708	1257713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24061	NC_004605	TGGTG	2	10	1257978	1257987	0 %	40 %	60 %	0 %	28901043
24062	NC_004605	CA	3	6	1258011	1258016	50 %	0 %	0 %	50 %	28901043
24063	NC_004605	A	7	7	1258019	1258025	100 %	0 %	0 %	0 %	28901043
24064	NC_004605	GCC	2	6	1258069	1258074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901043
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24067	NC_004605	CGC	2	6	1258123	1258128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901043
24068	NC_004605	A	7	7	1258158	1258164	100 %	0 %	0 %	0 %	28901043
24069	NC_004605	A	6	6	1258174	1258179	100 %	0 %	0 %	0 %	28901043
24070	NC_004605	AAC	2	6	1258221	1258226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24071	NC_004605	T	6	6	1258262	1258267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24072	NC_004605	ACA	2	6	1258285	1258290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24073	NC_004605	CTCAT	2	10	1258364	1258373	20 %	40 %	0 %	40 %	28901044
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24075	NC_004605	CT	3	6	1258545	1258550	0 %	50 %	0 %	50 %	28901044
24076	NC_004605	AAAG	2	8	1258665	1258672	75 %	0 %	25 %	0 %	28901044
24077	NC_004605	AAC	2	6	1258837	1258842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901044
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24083	NC_004605	CAAG	2	8	1258997	1259004	50 %	0 %	25 %	25 %	28901044
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24088	NC_004605	ACA	2	6	1259260	1259265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901044
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24091	NC_004605	GCGGT	2	10	1259542	1259551	0 %	20 %	60 %	20 %	28901044
24092	NC_004605	CAT	2	6	1259555	1259560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901044
24093	NC_004605	CTTG	2	8	1259585	1259592	0 %	50 %	25 %	25 %	28901044
24094	NC_004605	GTG	2	6	1259715	1259720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901044
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24100	NC_004605	GAAT	2	8	1260104	1260111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24101	NC_004605	TCTA	2	8	1260130	1260137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24102	NC_004605	TCAGC	2	10	1260147	1260156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24103	NC_004605	TCA	3	9	1260178	1260186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901045
24104	NC_004605	GCC	2	6	1260207	1260212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901045
24105	NC_004605	TCT	2	6	1260218	1260223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901045
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24107	NC_004605	CA	4	8	1260282	1260289	50 %	0 %	0 %	50 %	28901045
24108	NC_004605	ACC	2	6	1260294	1260299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901045
24109	NC_004605	CGAG	2	8	1260314	1260321	25 %	0 %	50 %	25 %	28901045
24110	NC_004605	GCG	2	6	1260346	1260351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901045
24111	NC_004605	AGGA	2	8	1260583	1260590	50 %	0 %	50 %	0 %	28901045
24112	NC_004605	ACC	2	6	1260610	1260615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901045
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24118	NC_004605	ATG	2	6	1260847	1260852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901045
24119	NC_004605	TGT	2	6	1260866	1260871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901045
24120	NC_004605	GAC	2	6	1261093	1261098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24121	NC_004605	GTT	2	6	1261112	1261117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901045
24122	NC_004605	TGC	2	6	1261206	1261211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24123	NC_004605	ATC	2	6	1261216	1261221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901045
24124	NC_004605	AGC	2	6	1261293	1261298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24125	NC_004605	GGC	2	6	1261318	1261323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901045
24126	NC_004605	GCT	2	6	1261360	1261365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24127	NC_004605	GCT	2	6	1261381	1261386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24128	NC_004605	CGC	2	6	1261470	1261475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901045
24129	NC_004605	TTC	2	6	1261530	1261535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901045
24130	NC_004605	TCA	2	6	1261547	1261552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901045
24131	NC_004605	TCT	2	6	1261630	1261635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901045
24132	NC_004605	GTC	2	6	1261657	1261662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24133	NC_004605	GAA	2	6	1261668	1261673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901045
24134	NC_004605	GCA	2	6	1261681	1261686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24135	NC_004605	GAA	2	6	1261698	1261703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901045
24136	NC_004605	GTA	2	6	1261759	1261764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901045
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24139	NC_004605	ATG	2	6	1261921	1261926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901045
24140	NC_004605	CCA	2	6	1262102	1262107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901045
24141	NC_004605	ATG	2	6	1262173	1262178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901045
24142	NC_004605	TAGG	2	8	1262250	1262257	25 %	25 %	50 %	0 %	28901045
24143	NC_004605	CGA	2	6	1262321	1262326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24144	NC_004605	GTCGT	2	10	1262332	1262341	0 %	40 %	40 %	20 %	28901045
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24147	NC_004605	CTT	2	6	1262633	1262638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901045
24148	NC_004605	GTT	2	6	1262643	1262648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901045
24149	NC_004605	CAG	2	6	1262672	1262677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24150	NC_004605	AGC	2	6	1262703	1262708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901045
24151	NC_004605	T	6	6	1262744	1262749	0 %	100 %	0 %	0 %	28901045
24152	NC_004605	CAC	3	9	1262780	1262788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901045
24153	NC_004605	TTAA	2	8	1262857	1262864	50 %	50 %	0 %	0 %	28901045
24154	NC_004605	TCA	2	6	1262872	1262877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901045
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24156	NC_004605	ATCGG	2	10	1263130	1263139	20 %	20 %	40 %	20 %	28901045
24157	NC_004605	GTA	2	6	1263177	1263182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901045
24158	NC_004605	GAT	2	6	1263270	1263275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901045
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24163	NC_004605	ACG	2	6	1263561	1263566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901046
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24167	NC_004605	TGC	2	6	1264069	1264074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901046
24168	NC_004605	TTGC	2	8	1264135	1264142	0 %	50 %	25 %	25 %	28901046
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24172	NC_004605	CTT	2	6	1264231	1264236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901046
24173	NC_004605	CTGTG	2	10	1264268	1264277	0 %	40 %	40 %	20 %	28901046
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24176	NC_004605	CT	4	8	1264377	1264384	0 %	50 %	0 %	50 %	28901046
24177	NC_004605	ATT	2	6	1264391	1264396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28901046
24178	NC_004605	GCC	2	6	1264428	1264433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901046
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24180	NC_004605	AC	3	6	1264500	1264505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24181	NC_004605	ACAG	2	8	1264513	1264520	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24182	NC_004605	TAAT	2	8	1264568	1264575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24183	NC_004605	TTCA	2	8	1264624	1264631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24184	NC_004605	TCA	2	6	1264706	1264711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24185	NC_004605	TTG	2	6	1264724	1264729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24186	NC_004605	T	7	7	1264805	1264811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24187	NC_004605	A	8	8	1264812	1264819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24188	NC_004605	TGG	2	6	1264910	1264915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901047
24189	NC_004605	AGGT	2	8	1264943	1264950	25 %	25 %	50 %	0 %	28901047
24190	NC_004605	CGA	2	6	1265031	1265036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901047
24191	NC_004605	TGCA	2	8	1265063	1265070	25 %	25 %	25 %	25 %	28901047
24192	NC_004605	CG	3	6	1265180	1265185	0 %	0 %	50 %	50 %	28901047
24193	NC_004605	GAC	2	6	1265296	1265301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901047
24194	NC_004605	CGTT	2	8	1265322	1265329	0 %	50 %	25 %	25 %	28901047
24195	NC_004605	T	6	6	1265376	1265381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24196	NC_004605	AATTG	2	10	1265401	1265410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24197	NC_004605	TCA	2	6	1265425	1265430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901048
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24202	NC_004605	CG	3	6	1265579	1265584	0 %	0 %	50 %	50 %	28901048
24203	NC_004605	ACC	2	6	1265593	1265598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901048
24204	NC_004605	TGT	2	6	1265694	1265699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901048
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24209	NC_004605	CTG	2	6	1265913	1265918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901048
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24212	NC_004605	CAC	2	6	1266120	1266125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901048
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24219	NC_004605	CAA	2	6	1266372	1266377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901048
24220	NC_004605	TGG	2	6	1266442	1266447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901048
24221	NC_004605	CAA	2	6	1266544	1266549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901048
24222	NC_004605	CAAA	2	8	1266707	1266714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24223	NC_004605	GCC	2	6	1266812	1266817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24224	NC_004605	TAA	2	6	1266827	1266832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24225	NC_004605	T	6	6	1266883	1266888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24226	NC_004605	CATA	2	8	1266915	1266922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24227	NC_004605	TTC	2	6	1266961	1266966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901049
24228	NC_004605	TTG	2	6	1267141	1267146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901049
24229	NC_004605	ACA	2	6	1267151	1267156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901049
24230	NC_004605	AT	3	6	1267195	1267200	50 %	50 %	0 %	0 %	28901049
24231	NC_004605	TTC	2	6	1267300	1267305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901049
24232	NC_004605	CTC	2	6	1267312	1267317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28901049
24233	NC_004605	TC	3	6	1267335	1267340	0 %	50 %	0 %	50 %	28901049
24234	NC_004605	TTTC	2	8	1267376	1267383	0 %	75 %	0 %	25 %	28901049
24235	NC_004605	TTG	3	9	1267417	1267425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901049
24236	NC_004605	T	6	6	1267503	1267508	0 %	100 %	0 %	0 %	28901049
24237	NC_004605	TGC	2	6	1267517	1267522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901049
24238	NC_004605	AT	3	6	1267580	1267585	50 %	50 %	0 %	0 %	28901049
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24240	NC_004605	AAC	2	6	1267640	1267645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901049
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24478	NC_004605	GATT	2	8	1280088	1280095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24479	NC_004605	TTC	2	6	1280134	1280139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24480	NC_004605	TA	3	6	1280205	1280210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24481	NC_004605	TACA	2	8	1280220	1280227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24482	NC_004605	CAG	2	6	1280231	1280236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24483	NC_004605	AAT	3	9	1280306	1280314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24484	NC_004605	A	6	6	1280419	1280424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24485	NC_004605	AT	3	6	1280438	1280443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24486	NC_004605	GTTT	2	8	1280466	1280473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24487	NC_004605	TAT	2	6	1280494	1280499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24488	NC_004605	ATTTTA	2	12	1280525	1280536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24489	NC_004605	CTAA	2	8	1280556	1280563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24490	NC_004605	GTA	2	6	1280587	1280592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24491	NC_004605	TCA	2	6	1280644	1280649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24492	NC_004605	CTTT	2	8	1280690	1280697	0 %	75 %	0 %	25 %	28901061
24493	NC_004605	GAT	3	9	1280778	1280786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901061
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24499	NC_004605	TGA	2	6	1281215	1281220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901061
24500	NC_004605	TGA	2	6	1281239	1281244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901061

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