MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 36097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_004605	GTG	2	6	1202609	1202614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900992
23003	NC_004605	CAAT	2	8	1202743	1202750	50 %	25 %	0 %	25 %	28900992
23004	NC_004605	CGC	2	6	1202872	1202877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900992
23005	NC_004605	AACC	2	8	1202910	1202917	50 %	0 %	0 %	50 %	28900992
23006	NC_004605	TGA	2	6	1203117	1203122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900992
23007	NC_004605	A	6	6	1203154	1203159	100 %	0 %	0 %	0 %	28900992
23008	NC_004605	ATT	2	6	1203199	1203204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900992
23009	NC_004605	GCTG	2	8	1203236	1203243	0 %	25 %	50 %	25 %	28900992
23010	NC_004605	A	6	6	1203291	1203296	100 %	0 %	0 %	0 %	28900992
23011	NC_004605	CTG	2	6	1203344	1203349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900992
23012	NC_004605	TTG	2	6	1203357	1203362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900992
23013	NC_004605	TAC	2	6	1203392	1203397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900992
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23017	NC_004605	CAT	3	9	1203566	1203574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900993
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23120	NC_004605	GAT	2	6	1208543	1208548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900999
23121	NC_004605	GAG	2	6	1208550	1208555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28900999
23122	NC_004605	CGA	2	6	1208579	1208584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900999
23123	NC_004605	TAT	2	6	1208616	1208621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900999
23124	NC_004605	G	6	6	1208622	1208627	0 %	0 %	100 %	0 %	28900999
23125	NC_004605	GCT	2	6	1208641	1208646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23126	NC_004605	CGT	2	6	1208749	1208754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23127	NC_004605	AAG	2	6	1208873	1208878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901000
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23234	NC_004605	CGA	2	6	1214296	1214301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901005
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23242	NC_004605	CTG	2	6	1215019	1215024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901006
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23351	NC_004605	CTT	3	9	1220196	1220204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23352	NC_004605	CAA	2	6	1220228	1220233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23353	NC_004605	ACA	2	6	1220387	1220392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901011
23354	NC_004605	GAA	2	6	1220452	1220457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901011
23355	NC_004605	AGA	2	6	1220487	1220492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901011
23356	NC_004605	GGC	2	6	1220512	1220517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901011
23357	NC_004605	GTG	2	6	1220608	1220613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901011
23358	NC_004605	TTG	2	6	1220633	1220638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901011
23359	NC_004605	ATCG	2	8	1220676	1220683	25 %	25 %	25 %	25 %	28901011
23360	NC_004605	ACA	2	6	1220690	1220695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901011
23361	NC_004605	GGT	2	6	1220784	1220789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901011
23362	NC_004605	TGG	2	6	1220802	1220807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901011
23363	NC_004605	TGA	2	6	1220810	1220815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901011
23364	NC_004605	TCGCT	2	10	1220871	1220880	0 %	40 %	20 %	40 %	28901011
23365	NC_004605	CAT	2	6	1220892	1220897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901011
23366	NC_004605	AG	3	6	1220934	1220939	50 %	0 %	50 %	0 %	28901011
23367	NC_004605	CCA	2	6	1220986	1220991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901011
23368	NC_004605	CGAAG	2	10	1221054	1221063	40 %	0 %	40 %	20 %	28901011
23369	NC_004605	GAA	2	6	1221074	1221079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901011
23370	NC_004605	ATT	2	6	1221084	1221089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28901012
23371	NC_004605	ACA	2	6	1221100	1221105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901012
23372	NC_004605	GAA	2	6	1221195	1221200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901012
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23374	NC_004605	GTT	2	6	1221297	1221302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901012
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23379	NC_004605	GC	3	6	1221512	1221517	0 %	0 %	50 %	50 %	28901012
23380	NC_004605	TTGC	2	8	1221535	1221542	0 %	50 %	25 %	25 %	28901012
23381	NC_004605	GTG	2	6	1221673	1221678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901012
23382	NC_004605	GCA	2	6	1221682	1221687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901012
23383	NC_004605	GCT	2	6	1221753	1221758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901012
23384	NC_004605	TCG	2	6	1221811	1221816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901012
23385	NC_004605	CAA	2	6	1221902	1221907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901012
23386	NC_004605	TAAA	2	8	1221996	1222003	75 %	25 %	0 %	0 %	28901012
23387	NC_004605	ATG	3	9	1222020	1222028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23388	NC_004605	GCCAA	2	10	1222084	1222093	40 %	0 %	20 %	40 %	28901013
23389	NC_004605	CTG	2	6	1222113	1222118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901013
23390	NC_004605	AGC	2	6	1222172	1222177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901013
23391	NC_004605	GCA	2	6	1222246	1222251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901013
23392	NC_004605	ATTG	2	8	1222432	1222439	25 %	50 %	25 %	0 %	28901013
23393	NC_004605	CT	3	6	1222472	1222477	0 %	50 %	0 %	50 %	28901013
23394	NC_004605	CAA	2	6	1222481	1222486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901013
23395	NC_004605	TTGA	2	8	1222487	1222494	25 %	50 %	25 %	0 %	28901013
23396	NC_004605	CAA	2	6	1222511	1222516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901013
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23398	NC_004605	ACC	2	6	1222604	1222609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901013
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23401	NC_004605	A	7	7	1222749	1222755	100 %	0 %	0 %	0 %	28901013
23402	NC_004605	TAG	2	6	1222765	1222770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901013
23403	NC_004605	AGC	2	6	1222820	1222825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901013
23404	NC_004605	ACGA	2	8	1222842	1222849	50 %	0 %	25 %	25 %	28901013
23405	NC_004605	TCCGAC	2	12	1222850	1222861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28901013
23406	NC_004605	ACCA	2	8	1222914	1222921	50 %	0 %	0 %	50 %	28901013
23407	NC_004605	CTA	2	6	1223071	1223076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901013
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23420	NC_004605	TGA	2	6	1223650	1223655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901013
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23422	NC_004605	TCT	2	6	1223685	1223690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901013
23423	NC_004605	CGG	2	6	1223719	1223724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901013
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23426	NC_004605	ACTG	2	8	1223872	1223879	25 %	25 %	25 %	25 %	28901013
23427	NC_004605	A	6	6	1224114	1224119	100 %	0 %	0 %	0 %	28901013
23428	NC_004605	GTT	2	6	1224189	1224194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901014
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23432	NC_004605	CAC	2	6	1224371	1224376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901014
23433	NC_004605	GAT	2	6	1224447	1224452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901014
23434	NC_004605	CGC	2	6	1224455	1224460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901014
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23441	NC_004605	CA	3	6	1224719	1224724	50 %	0 %	0 %	50 %	28901014
23442	NC_004605	T	6	6	1224878	1224883	0 %	100 %	0 %	0 %	28901014
23443	NC_004605	T	6	6	1224922	1224927	0 %	100 %	0 %	0 %	28901014
23444	NC_004605	GCGTT	2	10	1224929	1224938	0 %	40 %	40 %	20 %	28901014
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23446	NC_004605	GAC	2	6	1225088	1225093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901014
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23448	NC_004605	TTC	2	6	1225291	1225296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23449	NC_004605	A	7	7	1225303	1225309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23450	NC_004605	TTTC	2	8	1225356	1225363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23451	NC_004605	T	8	8	1225384	1225391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23452	NC_004605	T	6	6	1225441	1225446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23453	NC_004605	CTT	2	6	1225447	1225452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23454	NC_004605	CAA	2	6	1225465	1225470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23455	NC_004605	TCGC	2	8	1225656	1225663	0 %	25 %	25 %	50 %	28901015
23456	NC_004605	TAA	2	6	1225708	1225713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28901015
23457	NC_004605	CA	3	6	1225883	1225888	50 %	0 %	0 %	50 %	28901015
23458	NC_004605	CCA	2	6	1225943	1225948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901015
23459	NC_004605	TGC	2	6	1225969	1225974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901015
23460	NC_004605	GAG	2	6	1226040	1226045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28901015
23461	NC_004605	TGA	2	6	1226046	1226051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901015
23462	NC_004605	GTTG	2	8	1226055	1226062	0 %	50 %	50 %	0 %	28901015
23463	NC_004605	CA	3	6	1226064	1226069	50 %	0 %	0 %	50 %	28901015
23464	NC_004605	TCG	2	6	1226186	1226191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901015
23465	NC_004605	TCA	2	6	1226289	1226294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901015
23466	NC_004605	CCG	2	6	1226373	1226378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901015
23467	NC_004605	TCT	3	9	1226522	1226530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901015
23468	NC_004605	TC	3	6	1226588	1226593	0 %	50 %	0 %	50 %	28901015
23469	NC_004605	CGA	2	6	1226753	1226758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901015
23470	NC_004605	GAT	2	6	1226806	1226811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901015
23471	NC_004605	ATC	2	6	1226842	1226847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901015
23472	NC_004605	CTG	2	6	1226852	1226857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901015
23473	NC_004605	ACGC	2	8	1226889	1226896	25 %	0 %	25 %	50 %	28901015
23474	NC_004605	CGC	2	6	1226991	1226996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901015
23475	NC_004605	GTT	2	6	1226998	1227003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901015
23476	NC_004605	GAA	2	6	1227051	1227056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901015
23477	NC_004605	TCGT	2	8	1227058	1227065	0 %	50 %	25 %	25 %	28901015
23478	NC_004605	GGC	2	6	1227121	1227126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901015
23479	NC_004605	CGG	2	6	1227153	1227158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901015
23480	NC_004605	A	6	6	1227232	1227237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23481	NC_004605	TGT	2	6	1227286	1227291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901016
23482	NC_004605	CTG	2	6	1227305	1227310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901016
23483	NC_004605	TGT	2	6	1227403	1227408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901016
23484	NC_004605	TAA	2	6	1227461	1227466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28901016
23485	NC_004605	CGG	2	6	1227519	1227524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901016
23486	NC_004605	ATCA	2	8	1227630	1227637	50 %	25 %	0 %	25 %	28901016
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23493	NC_004605	AATC	2	8	1227880	1227887	50 %	25 %	0 %	25 %	28901017
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23497	NC_004605	TTC	2	6	1228007	1228012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901017
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23499	NC_004605	CTCA	2	8	1228178	1228185	25 %	25 %	0 %	50 %	28901017
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