MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 36097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004605	TGAT	2	8	678938	678945	25 %	50 %	25 %	0 %	28900523
13002	NC_004605	GTT	2	6	679009	679014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13003	NC_004605	GAT	2	6	679015	679020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13004	NC_004605	GAT	2	6	679072	679077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13005	NC_004605	CTG	2	6	679082	679087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13006	NC_004605	GTT	2	6	679132	679137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13007	NC_004605	TGA	2	6	679146	679151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13008	NC_004605	TTG	2	6	679274	679279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13009	NC_004605	ATC	2	6	679358	679363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
13010	NC_004605	CTG	2	6	679364	679369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13011	NC_004605	GTT	2	6	679500	679505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13012	NC_004605	AGATGA	2	12	679509	679520	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13013	NC_004605	AGC	2	6	679557	679562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13014	NC_004605	GGC	2	6	679654	679659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900523
13015	NC_004605	AAC	3	9	679693	679701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900523
13016	NC_004605	GAT	2	6	679903	679908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13017	NC_004605	GCA	2	6	680105	680110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13018	NC_004605	CCG	2	6	680291	680296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900523
13019	NC_004605	GACA	2	8	680313	680320	50 %	0 %	25 %	25 %	28900523
13020	NC_004605	TAC	2	6	680433	680438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
13021	NC_004605	GCAC	2	8	680522	680529	25 %	0 %	25 %	50 %	28900523
13022	NC_004605	TAT	2	6	680542	680547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900523
13023	NC_004605	TGT	2	6	680595	680600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13024	NC_004605	TAA	2	6	680733	680738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900523
13025	NC_004605	GT	3	6	680741	680746	0 %	50 %	50 %	0 %	28900523
13026	NC_004605	CAT	2	6	680754	680759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
13027	NC_004605	TGA	2	6	680841	680846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13028	NC_004605	AAC	2	6	680854	680859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900523
13029	NC_004605	GC	3	6	680876	680881	0 %	0 %	50 %	50 %	28900523
13030	NC_004605	GCAAC	2	10	680945	680954	40 %	0 %	20 %	40 %	28900523
13031	NC_004605	TTG	2	6	681005	681010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13032	NC_004605	CAC	2	6	681090	681095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900523
13033	NC_004605	GCTC	2	8	681130	681137	0 %	25 %	25 %	50 %	28900523
13034	NC_004605	TC	3	6	681164	681169	0 %	50 %	0 %	50 %	28900523
13035	NC_004605	ATGG	2	8	681313	681320	25 %	25 %	50 %	0 %	28900523
13036	NC_004605	AGA	2	6	681324	681329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900523
13037	NC_004605	TGTT	2	8	681332	681339	0 %	75 %	25 %	0 %	28900523
13038	NC_004605	TTG	2	6	681407	681412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13039	NC_004605	ACC	2	6	681486	681491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900523
13040	NC_004605	ACG	2	6	681503	681508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13041	NC_004605	TTG	2	6	681605	681610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13042	NC_004605	TGA	2	6	681678	681683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13043	NC_004605	ACGT	2	8	681689	681696	25 %	25 %	25 %	25 %	28900523
13044	NC_004605	TTCT	2	8	681749	681756	0 %	75 %	0 %	25 %	28900523
13045	NC_004605	ACGGTA	2	12	681793	681804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28900523
13046	NC_004605	ATG	2	6	681845	681850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13047	NC_004605	CGTT	2	8	681869	681876	0 %	50 %	25 %	25 %	28900523
13048	NC_004605	GCAA	2	8	681921	681928	50 %	0 %	25 %	25 %	28900523
13049	NC_004605	TCACA	2	10	681981	681990	40 %	20 %	0 %	40 %	28900523
13050	NC_004605	TTG	2	6	682055	682060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13051	NC_004605	TTC	2	6	682174	682179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900523
13052	NC_004605	TCG	2	6	682247	682252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13053	NC_004605	CGC	2	6	682271	682276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900523
13054	NC_004605	AGTTG	2	10	682335	682344	20 %	40 %	40 %	0 %	28900523
13055	NC_004605	TTTGA	2	10	682366	682375	20 %	60 %	20 %	0 %	28900523
13056	NC_004605	GGTTC	2	10	682462	682471	0 %	40 %	40 %	20 %	28900523
13057	NC_004605	GTT	2	6	682489	682494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
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13059	NC_004605	TTG	2	6	682537	682542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13060	NC_004605	GTT	2	6	682573	682578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
13061	NC_004605	CAT	2	6	682647	682652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
13062	NC_004605	CTT	2	6	682673	682678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900523
13063	NC_004605	GGT	2	6	682686	682691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
13064	NC_004605	AACTG	2	10	682692	682701	40 %	20 %	20 %	20 %	28900523
13065	NC_004605	GTT	2	6	682702	682707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
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13067	NC_004605	TGAA	2	8	682763	682770	50 %	25 %	25 %	0 %	28900523
13068	NC_004605	TGA	2	6	682794	682799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13069	NC_004605	ACG	2	6	682847	682852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
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13071	NC_004605	CG	3	6	682905	682910	0 %	0 %	50 %	50 %	28900523
13072	NC_004605	GTG	2	6	682972	682977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
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13088	NC_004605	GTG	2	6	684260	684265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
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13098	NC_004605	TGTC	2	8	684752	684759	0 %	50 %	25 %	25 %	28900523
13099	NC_004605	TGT	2	6	684798	684803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
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13102	NC_004605	CTT	2	6	685071	685076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900523
13103	NC_004605	TTA	2	6	685130	685135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900523
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13105	NC_004605	TGA	2	6	685143	685148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
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13107	NC_004605	TGAT	2	8	685178	685185	25 %	50 %	25 %	0 %	28900523
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13109	NC_004605	CGCCAG	2	12	685397	685408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28900523
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13121	NC_004605	ATT	2	6	686365	686370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900523
13122	NC_004605	CTG	2	6	686501	686506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900523
13123	NC_004605	CAA	2	6	686640	686645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900523
13124	NC_004605	TCT	2	6	686662	686667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900523
13125	NC_004605	CGG	2	6	686718	686723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900523
13126	NC_004605	TGA	2	6	686730	686735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
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13128	NC_004605	GGT	2	6	686746	686751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
13129	NC_004605	GAT	2	6	686758	686763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13130	NC_004605	GGT	2	6	686773	686778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
13131	NC_004605	GGT	2	6	686806	686811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
13132	NC_004605	CGAT	2	8	686894	686901	25 %	25 %	25 %	25 %	28900523
13133	NC_004605	TGA	2	6	686946	686951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
13134	NC_004605	GACA	2	8	686988	686995	50 %	0 %	25 %	25 %	28900523
13135	NC_004605	TAC	2	6	687012	687017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
13136	NC_004605	TCA	2	6	687030	687035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
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13138	NC_004605	CTT	2	6	687109	687114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900523
13139	NC_004605	GCG	2	6	687164	687169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13140	NC_004605	TTA	2	6	687190	687195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13141	NC_004605	TTC	2	6	687206	687211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13142	NC_004605	T	7	7	687296	687302	0 %	100 %	0 %	0 %	28900524
13143	NC_004605	TTG	2	6	687469	687474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900524
13144	NC_004605	TTG	2	6	687523	687528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900524
13145	NC_004605	TTA	2	6	687570	687575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13146	NC_004605	TGT	2	6	687579	687584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13147	NC_004605	CAAA	2	8	687638	687645	75 %	0 %	0 %	25 %	28900525
13148	NC_004605	CTT	2	6	687763	687768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900525
13149	NC_004605	T	6	6	687767	687772	0 %	100 %	0 %	0 %	28900525
13150	NC_004605	TTG	2	6	687784	687789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900525
13151	NC_004605	CA	3	6	687859	687864	50 %	0 %	0 %	50 %	28900525
13152	NC_004605	ATTAG	2	10	687883	687892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_004605	T	6	6	687907	687912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13154	NC_004605	TTAAA	2	10	687992	688001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13155	NC_004605	TC	3	6	688071	688076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13156	NC_004605	AGTT	2	8	688085	688092	25 %	50 %	25 %	0 %	28900526
13157	NC_004605	ATAA	2	8	688144	688151	75 %	25 %	0 %	0 %	28900526
13158	NC_004605	GCT	2	6	688215	688220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900526
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13161	NC_004605	AGCA	2	8	688462	688469	50 %	0 %	25 %	25 %	28900526
13162	NC_004605	CAT	2	6	688497	688502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900526
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13165	NC_004605	CGATA	2	10	688554	688563	40 %	20 %	20 %	20 %	28900526
13166	NC_004605	GAT	2	6	688570	688575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900526
13167	NC_004605	TCT	2	6	688630	688635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900526
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13169	NC_004605	GCA	2	6	688713	688718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900526
13170	NC_004605	GTT	2	6	688795	688800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900526
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13178	NC_004605	GCT	2	6	689199	689204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900526
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13184	NC_004605	TCA	2	6	690065	690070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900526
13185	NC_004605	GCT	2	6	690230	690235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900526
13186	NC_004605	AAAC	2	8	690352	690359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13187	NC_004605	ATC	2	6	690376	690381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13188	NC_004605	GTT	2	6	690387	690392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13189	NC_004605	ATTTA	2	10	690429	690438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13190	NC_004605	A	6	6	690441	690446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13191	NC_004605	CAG	2	6	690573	690578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13192	NC_004605	TTA	2	6	690590	690595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13193	NC_004605	GCT	2	6	690631	690636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13200	NC_004605	GAA	2	6	691031	691036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900527
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13202	NC_004605	TCAA	2	8	691107	691114	50 %	25 %	0 %	25 %	28900527
13203	NC_004605	GAAC	2	8	691243	691250	50 %	0 %	25 %	25 %	28900527
13204	NC_004605	CAA	2	6	691307	691312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900527
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13206	NC_004605	CTTA	2	8	691398	691405	25 %	50 %	0 %	25 %	28900527
13207	NC_004605	TCAAGC	2	12	691417	691428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28900527
13208	NC_004605	GAA	2	6	691430	691435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900527
13209	NC_004605	GAAA	2	8	691468	691475	75 %	0 %	25 %	0 %	28900527
13210	NC_004605	GGC	2	6	691507	691512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900527
13211	NC_004605	TCA	2	6	691537	691542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900527
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13214	NC_004605	CAA	2	6	691665	691670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900527
13215	NC_004605	TGA	3	9	691726	691734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900527
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13220	NC_004605	A	6	6	691911	691916	100 %	0 %	0 %	0 %	28900527
13221	NC_004605	AG	3	6	691924	691929	50 %	0 %	50 %	0 %	28900527
13222	NC_004605	TC	3	6	692037	692042	0 %	50 %	0 %	50 %	28900527
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13226	NC_004605	GCAA	2	8	692319	692326	50 %	0 %	25 %	25 %	28900527
13227	NC_004605	CA	3	6	692336	692341	50 %	0 %	0 %	50 %	28900527
13228	NC_004605	CAA	2	6	692384	692389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900527
13229	NC_004605	AAAC	2	8	692393	692400	75 %	0 %	0 %	25 %	28900527
13230	NC_004605	TTG	2	6	692411	692416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900527
13231	NC_004605	ATG	2	6	692451	692456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900527
13232	NC_004605	ATT	2	6	692537	692542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900527
13233	NC_004605	GAA	3	9	692572	692580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900527
13234	NC_004605	ACA	2	6	692791	692796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13235	NC_004605	CTT	2	6	692896	692901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900528
13236	NC_004605	AGA	2	6	692907	692912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900528
13237	NC_004605	AGA	3	9	693034	693042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900528
13238	NC_004605	GTT	2	6	693082	693087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900528
13239	NC_004605	C	6	6	693093	693098	0 %	0 %	0 %	100 %	28900528
13240	NC_004605	T	6	6	693292	693297	0 %	100 %	0 %	0 %	28900528
13241	NC_004605	TTATGA	2	12	693317	693328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_004605	TATC	2	8	693335	693342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13243	NC_004605	T	6	6	693353	693358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_004605	ATCA	2	8	693364	693371	50 %	25 %	0 %	25 %	28900529
13245	NC_004605	TTC	2	6	693419	693424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900529
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13375	NC_004605	CA	3	6	699869	699874	50 %	0 %	0 %	50 %	28900532
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13379	NC_004605	CTTT	2	8	700141	700148	0 %	75 %	0 %	25 %	28900533
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13387	NC_004605	AT	3	6	700601	700606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13391	NC_004605	T	6	6	700738	700743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13489	NC_004605	GGT	2	6	705751	705756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900536
13490	NC_004605	TTC	2	6	705786	705791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900536
13491	NC_004605	CAT	2	6	705801	705806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900536
13492	NC_004605	GGCA	2	8	705831	705838	25 %	0 %	50 %	25 %	28900536
13493	NC_004605	GTTG	2	8	705855	705862	0 %	50 %	50 %	0 %	28900536
13494	NC_004605	GAT	2	6	705894	705899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900536
13495	NC_004605	GCT	2	6	706006	706011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900536
13496	NC_004605	AG	3	6	706051	706056	50 %	0 %	50 %	0 %	28900536
13497	NC_004605	AACT	2	8	706125	706132	50 %	25 %	0 %	25 %	28900536
13498	NC_004605	CAA	2	6	706186	706191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900536
13499	NC_004605	TGA	2	6	706260	706265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900536
13500	NC_004605	TGG	2	6	706506	706511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900536

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