MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 36097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12105	NC_004605	TTA	2	6	632380	632385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_004605	AC	3	6	632391	632396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12107	NC_004605	GTA	2	6	632403	632408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12113	NC_004605	TTA	2	6	632578	632583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12117	NC_004605	GAT	2	6	632808	632813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12119	NC_004605	GCGT	2	8	632976	632983	0 %	25 %	50 %	25 %	28900482
12120	NC_004605	TGCTT	2	10	633011	633020	0 %	60 %	20 %	20 %	28900482
12121	NC_004605	ATC	2	6	633060	633065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900482
12122	NC_004605	TCG	2	6	633088	633093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900482
12123	NC_004605	TGA	2	6	633109	633114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900482
12124	NC_004605	CGA	2	6	633152	633157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900482
12125	NC_004605	GTG	2	6	633198	633203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900482
12126	NC_004605	CAT	3	9	633218	633226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900482
12127	NC_004605	CCA	2	6	633241	633246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900482
12128	NC_004605	GTGA	2	8	633291	633298	25 %	25 %	50 %	0 %	28900482
12129	NC_004605	GTT	2	6	633344	633349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900482
12130	NC_004605	GAA	2	6	633360	633365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900482
12131	NC_004605	ACA	2	6	633433	633438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900482
12132	NC_004605	GCG	2	6	633562	633567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900482
12133	NC_004605	ATCGA	2	10	633658	633667	40 %	20 %	20 %	20 %	28900482
12134	NC_004605	GCTG	2	8	633689	633696	0 %	25 %	50 %	25 %	28900482
12135	NC_004605	TGC	2	6	633707	633712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900482
12136	NC_004605	TCC	2	6	633737	633742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28900482
12137	NC_004605	CGT	2	6	633758	633763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900482
12138	NC_004605	ATC	4	12	633862	633873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900483
12139	NC_004605	TCG	2	6	633884	633889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900483
12140	NC_004605	TGG	2	6	633893	633898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900483
12141	NC_004605	GTG	2	6	633907	633912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900483
12142	NC_004605	GAAT	2	8	633951	633958	50 %	25 %	25 %	0 %	28900483
12143	NC_004605	A	6	6	633979	633984	100 %	0 %	0 %	0 %	28900483
12144	NC_004605	GATGCT	2	12	634011	634022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28900483
12145	NC_004605	TGA	2	6	634046	634051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900483
12146	NC_004605	CAG	2	6	634060	634065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900483
12147	NC_004605	GCC	2	6	634098	634103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900483
12148	NC_004605	TTC	2	6	634150	634155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900483
12149	NC_004605	TGA	2	6	634181	634186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900483
12150	NC_004605	CAT	2	6	634188	634193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900483
12151	NC_004605	GC	3	6	634211	634216	0 %	0 %	50 %	50 %	28900483
12152	NC_004605	TGGT	2	8	634265	634272	0 %	50 %	50 %	0 %	28900483
12153	NC_004605	CTAA	2	8	634279	634286	50 %	25 %	0 %	25 %	28900483
12154	NC_004605	GGTT	2	8	634321	634328	0 %	50 %	50 %	0 %	28900483
12155	NC_004605	CCG	2	6	634336	634341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900483
12156	NC_004605	CTT	2	6	634437	634442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900483
12157	NC_004605	CCA	2	6	634445	634450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900483
12158	NC_004605	TGCGTA	2	12	634454	634465	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28900483
12159	NC_004605	ATG	2	6	634480	634485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900483
12160	NC_004605	ATC	2	6	634531	634536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900483
12161	NC_004605	GCT	2	6	634569	634574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900483
12162	NC_004605	CTT	2	6	634602	634607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900483
12163	NC_004605	GGC	2	6	634621	634626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900483
12164	NC_004605	TGA	2	6	634631	634636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900483
12165	NC_004605	TAC	2	6	634688	634693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900483
12166	NC_004605	GT	3	6	634703	634708	0 %	50 %	50 %	0 %	28900483
12167	NC_004605	CGA	2	6	634772	634777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900483
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12169	NC_004605	CTT	2	6	634854	634859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900483
12170	NC_004605	CGA	2	6	634868	634873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900483
12171	NC_004605	TTCCA	2	10	634881	634890	20 %	40 %	0 %	40 %	28900483
12172	NC_004605	GAT	2	6	634956	634961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900483
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12174	NC_004605	GGT	2	6	635092	635097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900483
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12179	NC_004605	CGT	2	6	635257	635262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900483
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12181	NC_004605	GGC	2	6	635419	635424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900483
12182	NC_004605	CCG	2	6	635455	635460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900483
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12186	NC_004605	TGG	2	6	635650	635655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900483
12187	NC_004605	GCA	2	6	635662	635667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900483
12188	NC_004605	TGG	2	6	635672	635677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900483
12189	NC_004605	TTG	2	6	635681	635686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900483
12190	NC_004605	TAC	2	6	635725	635730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900483
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12192	NC_004605	GAA	2	6	635790	635795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900483
12193	NC_004605	GAT	2	6	635824	635829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900483
12194	NC_004605	TCA	2	6	635863	635868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900484
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12197	NC_004605	TGA	2	6	635928	635933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900484
12198	NC_004605	TGC	2	6	636054	636059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900484
12199	NC_004605	TAG	2	6	636064	636069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900484
12200	NC_004605	ACG	2	6	636108	636113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900484
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12202	NC_004605	TGGT	2	8	636255	636262	0 %	50 %	50 %	0 %	28900484
12203	NC_004605	TTGG	2	8	636295	636302	0 %	50 %	50 %	0 %	28900484
12204	NC_004605	ACA	2	6	636342	636347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900484
12205	NC_004605	TCG	2	6	636469	636474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900485
12206	NC_004605	AGCG	2	8	636552	636559	25 %	0 %	50 %	25 %	28900485
12207	NC_004605	TTG	2	6	636686	636691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900485
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12215	NC_004605	TG	3	6	636924	636929	0 %	50 %	50 %	0 %	28900486
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12223	NC_004605	TCA	2	6	637234	637239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900486
12224	NC_004605	CTG	2	6	637254	637259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900486
12225	NC_004605	TGG	2	6	637402	637407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900486
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12227	NC_004605	CGT	2	6	637535	637540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900486
12228	NC_004605	GCT	2	6	637568	637573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900486
12229	NC_004605	GGT	2	6	637574	637579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900486
12230	NC_004605	GTG	2	6	637591	637596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900486
12231	NC_004605	TTTTA	2	10	637785	637794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_004605	A	6	6	637819	637824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12233	NC_004605	TAA	2	6	637834	637839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_004605	AT	3	6	637867	637872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12235	NC_004605	GTTG	2	8	637886	637893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12236	NC_004605	TAC	2	6	637896	637901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12237	NC_004605	TTG	2	6	637945	637950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12238	NC_004605	TTA	2	6	637991	637996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12239	NC_004605	GAA	2	6	638012	638017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_004605	AAATC	2	10	638070	638079	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12241	NC_004605	ATCT	2	8	638162	638169	25 %	50 %	0 %	25 %	28900487
12242	NC_004605	T	7	7	638284	638290	0 %	100 %	0 %	0 %	28900487
12243	NC_004605	ATA	2	6	638423	638428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900487
12244	NC_004605	CAT	2	6	638524	638529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900487
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12248	NC_004605	ATA	2	6	638835	638840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12286	NC_004605	GGTAA	2	10	640555	640564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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12493	NC_004605	CG	3	6	650948	650953	0 %	0 %	50 %	50 %	28900501
12494	NC_004605	TCT	2	6	650968	650973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900501
12495	NC_004605	AAT	2	6	650987	650992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900501
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12497	NC_004605	AGCA	2	8	651055	651062	50 %	0 %	25 %	25 %	28900501
12498	NC_004605	CGG	2	6	651074	651079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900501
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12500	NC_004605	CACAC	2	10	651102	651111	40 %	0 %	0 %	60 %	28900501

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