MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 36097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004605	T	6	6	285720	285725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_004605	GTA	2	6	285746	285751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_004605	ATT	2	6	285764	285769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900139
5504	NC_004605	GCC	2	6	285792	285797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900139
5505	NC_004605	CAAT	2	8	285881	285888	50 %	25 %	0 %	25 %	28900139
5506	NC_004605	T	6	6	285894	285899	0 %	100 %	0 %	0 %	28900139
5507	NC_004605	CGA	2	6	285992	285997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900139
5508	NC_004605	CG	3	6	286035	286040	0 %	0 %	50 %	50 %	28900139
5509	NC_004605	GAGC	2	8	286061	286068	25 %	0 %	50 %	25 %	28900139
5510	NC_004605	TG	3	6	286140	286145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_004605	CAT	2	6	286166	286171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_004605	A	6	6	286232	286237	100 %	0 %	0 %	0 %	28900140
5513	NC_004605	TTA	2	6	286278	286283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900140
5514	NC_004605	GAC	2	6	286303	286308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900140
5515	NC_004605	AGG	2	6	286361	286366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_004605	TTG	2	6	286406	286411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900141
5517	NC_004605	AAAT	2	8	286428	286435	75 %	25 %	0 %	0 %	28900141
5518	NC_004605	A	6	6	286471	286476	100 %	0 %	0 %	0 %	28900141
5519	NC_004605	ATT	2	6	286665	286670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900141
5520	NC_004605	GTA	2	6	286674	286679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_004605	T	6	6	286681	286686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_004605	GAG	2	6	286687	286692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_004605	TAT	2	6	286715	286720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900142
5524	NC_004605	A	6	6	286739	286744	100 %	0 %	0 %	0 %	28900142
5525	NC_004605	GC	3	6	286832	286837	0 %	0 %	50 %	50 %	28900142
5526	NC_004605	GAAA	2	8	286869	286876	75 %	0 %	25 %	0 %	28900142
5527	NC_004605	ATG	2	6	286943	286948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900142
5528	NC_004605	ACG	2	6	286966	286971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900142
5529	NC_004605	TACTG	2	10	286974	286983	20 %	40 %	20 %	20 %	28900142
5530	NC_004605	TCA	2	6	286994	286999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900142
5531	NC_004605	GCG	2	6	287074	287079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900142
5532	NC_004605	CG	3	6	287164	287169	0 %	0 %	50 %	50 %	28900142
5533	NC_004605	GAA	2	6	287230	287235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900142
5534	NC_004605	TCA	2	6	287309	287314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900142
5535	NC_004605	TGG	2	6	287363	287368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900142
5536	NC_004605	A	6	6	287371	287376	100 %	0 %	0 %	0 %	28900142
5537	NC_004605	CAG	2	6	287379	287384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900142
5538	NC_004605	AGA	2	6	287409	287414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900142
5539	NC_004605	TCT	2	6	287425	287430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900142
5540	NC_004605	CGCT	2	8	287431	287438	0 %	25 %	25 %	50 %	28900142
5541	NC_004605	AAC	2	6	287491	287496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900142
5542	NC_004605	CGTG	2	8	287508	287515	0 %	25 %	50 %	25 %	28900142
5543	NC_004605	CGG	2	6	287519	287524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900142
5544	NC_004605	GAT	2	6	287559	287564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900142
5545	NC_004605	CTG	2	6	287585	287590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900142
5546	NC_004605	GAA	2	6	287605	287610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900142
5547	NC_004605	GAA	2	6	287658	287663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900142
5548	NC_004605	ACA	2	6	287683	287688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900142
5549	NC_004605	GCA	2	6	287704	287709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900142
5550	NC_004605	AAGC	2	8	287711	287718	50 %	0 %	25 %	25 %	28900142
5551	NC_004605	AAC	2	6	287760	287765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900142
5552	NC_004605	CAA	2	6	287794	287799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900142
5553	NC_004605	GGC	2	6	287818	287823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900142
5554	NC_004605	AGA	2	6	287870	287875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900142
5555	NC_004605	GAA	2	6	287920	287925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900142
5556	NC_004605	TGG	3	9	287937	287945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900142
5557	NC_004605	CTAA	2	8	287953	287960	50 %	25 %	0 %	25 %	28900142
5558	NC_004605	CAAC	2	8	288062	288069	50 %	0 %	0 %	50 %	28900142
5559	NC_004605	TGA	2	6	288236	288241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900142
5560	NC_004605	CAC	2	6	288243	288248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900142
5561	NC_004605	GAT	2	6	288255	288260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900142
5562	NC_004605	ACCA	2	8	288262	288269	50 %	0 %	0 %	50 %	28900142
5563	NC_004605	TAAG	2	8	288318	288325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_004605	ACA	2	6	288333	288338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_004605	TTTC	2	8	288422	288429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_004605	TCGA	2	8	288517	288524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_004605	TCAT	2	8	288602	288609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_004605	CAGC	2	8	288624	288631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_004605	T	8	8	288644	288651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_004605	TAA	2	6	288757	288762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_004605	AAT	2	6	288763	288768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900143
5572	NC_004605	CTG	3	9	288813	288821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900143
5573	NC_004605	TTGA	2	8	288851	288858	25 %	50 %	25 %	0 %	28900143
5574	NC_004605	GAA	2	6	288883	288888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900143
5575	NC_004605	A	6	6	289001	289006	100 %	0 %	0 %	0 %	28900143
5576	NC_004605	AC	3	6	289063	289068	50 %	0 %	0 %	50 %	28900143
5577	NC_004605	TTG	2	6	289083	289088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900143
5578	NC_004605	TGG	2	6	289141	289146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900143
5579	NC_004605	ATG	2	6	289191	289196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900143
5580	NC_004605	GAC	2	6	289285	289290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900143
5581	NC_004605	CCAAA	2	10	289347	289356	60 %	0 %	0 %	40 %	28900143
5582	NC_004605	ACC	2	6	289391	289396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900143
5583	NC_004605	GTT	2	6	289467	289472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900143
5584	NC_004605	AGA	2	6	289492	289497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900143
5585	NC_004605	GAT	2	6	289588	289593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900143
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5588	NC_004605	GATT	2	8	289702	289709	25 %	50 %	25 %	0 %	28900143
5589	NC_004605	T	6	6	289796	289801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_004605	TTGA	2	8	289882	289889	25 %	50 %	25 %	0 %	28900144
5591	NC_004605	AAG	2	6	289910	289915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900144
5592	NC_004605	A	6	6	290056	290061	100 %	0 %	0 %	0 %	28900144
5593	NC_004605	GAG	2	6	290168	290173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28900144
5594	NC_004605	AGC	2	6	290206	290211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900144
5595	NC_004605	CATT	2	8	290240	290247	25 %	50 %	0 %	25 %	28900144
5596	NC_004605	TAA	2	6	290394	290399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900144
5597	NC_004605	ATG	2	6	290457	290462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_004605	GCG	2	6	290585	290590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900145
5599	NC_004605	AGCATC	2	12	290808	290819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28900145
5600	NC_004605	GTTG	2	8	290853	290860	0 %	50 %	50 %	0 %	28900145
5601	NC_004605	TGC	2	6	290872	290877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900145
5602	NC_004605	ATG	2	6	290883	290888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900145
5603	NC_004605	TCG	2	6	290965	290970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900145
5604	NC_004605	CAG	2	6	290984	290989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900145
5605	NC_004605	ACA	2	6	290997	291002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900145
5606	NC_004605	GTGG	2	8	291022	291029	0 %	25 %	75 %	0 %	28900145
5607	NC_004605	TTG	2	6	291089	291094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900145
5608	NC_004605	GCA	2	6	291130	291135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900145
5609	NC_004605	ATTTTT	2	12	291186	291197	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	28900145
5610	NC_004605	GCG	2	6	291227	291232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900145
5611	NC_004605	AT	3	6	291360	291365	50 %	50 %	0 %	0 %	28900145
5612	NC_004605	TCA	2	6	291366	291371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900145
5613	NC_004605	GT	3	6	291397	291402	0 %	50 %	50 %	0 %	28900145
5614	NC_004605	GCA	2	6	291415	291420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900145
5615	NC_004605	GTCA	2	8	291460	291467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_004605	TGGAAA	2	12	291494	291505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28900146
5617	NC_004605	TTG	2	6	291515	291520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900146
5618	NC_004605	AAATC	2	10	291521	291530	60 %	20 %	0 %	20 %	28900146
5619	NC_004605	TC	3	6	291623	291628	0 %	50 %	0 %	50 %	28900146
5620	NC_004605	CAA	2	6	291678	291683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900146
5621	NC_004605	ATG	2	6	291688	291693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900146
5622	NC_004605	AGA	2	6	291705	291710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900146
5623	NC_004605	TGT	2	6	291808	291813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900146
5624	NC_004605	CAC	2	6	291886	291891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_004605	GTTTT	2	10	291931	291940	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_004605	GGT	2	6	291986	291991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_004605	GT	3	6	291990	291995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5794	NC_004605	TGG	2	6	299451	299456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5873	NC_004605	CAT	2	6	303598	303603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900158
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