MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 63725

< Previous12...2627282930313233343536...127128Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004603	GTC	2	6	764650	764655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897502
15002	NC_004603	A	8	8	764708	764715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_004603	A	6	6	764755	764760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_004603	TCTT	2	8	764773	764780	0 %	75 %	0 %	25 %	28897503
15005	NC_004603	ACC	2	6	764789	764794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897503
15006	NC_004603	GTT	2	6	764860	764865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897503
15007	NC_004603	GTA	2	6	764891	764896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897503
15008	NC_004603	CTG	2	6	764951	764956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897503
15009	NC_004603	GTT	2	6	764964	764969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897503
15010	NC_004603	ACG	2	6	765209	765214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897503
15011	NC_004603	GAA	2	6	765228	765233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897503
15012	NC_004603	TCC	2	6	765382	765387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28897503
15013	NC_004603	GATT	2	8	765388	765395	25 %	50 %	25 %	0 %	28897503
15014	NC_004603	TGA	2	6	765407	765412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897503
15015	NC_004603	TGT	2	6	765419	765424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897503
15016	NC_004603	AAG	2	6	765454	765459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897503
15017	NC_004603	ACTTCA	2	12	765466	765477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897503
15018	NC_004603	TGC	2	6	765489	765494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897503
15019	NC_004603	ATG	2	6	765508	765513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897503
15020	NC_004603	ATG	2	6	765553	765558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897503
15021	NC_004603	TTGGC	2	10	765570	765579	0 %	40 %	40 %	20 %	28897503
15022	NC_004603	TGG	2	6	765626	765631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897503
15023	NC_004603	TCT	2	6	765634	765639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897503
15024	NC_004603	TCA	2	6	765686	765691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897503
15025	NC_004603	ACA	2	6	765694	765699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897503
15026	NC_004603	GAT	2	6	765702	765707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897503
15027	NC_004603	ATC	2	6	765709	765714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897503
15028	NC_004603	TAA	2	6	765758	765763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897503
15029	NC_004603	AACA	2	8	765765	765772	75 %	0 %	0 %	25 %	28897503
15030	NC_004603	ACC	2	6	765789	765794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897503
15031	NC_004603	CAACCA	2	12	765840	765851	50 %	0 %	0 %	50 %	28897503
15032	NC_004603	TCA	2	6	765863	765868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897503
15033	NC_004603	AGC	2	6	765909	765914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897503
15034	NC_004603	AAG	2	6	765915	765920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897503
15035	NC_004603	AAG	2	6	766015	766020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897503
15036	NC_004603	CCG	2	6	766042	766047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28897503
15037	NC_004603	GC	4	8	766124	766131	0 %	0 %	50 %	50 %	28897503
15038	NC_004603	GTTTG	2	10	766138	766147	0 %	60 %	40 %	0 %	28897503
15039	NC_004603	AAG	2	6	766149	766154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897503
15040	NC_004603	CAA	2	6	766232	766237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897503
15041	NC_004603	TCA	2	6	766280	766285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897503
15042	NC_004603	T	6	6	766292	766297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_004603	GTA	2	6	766310	766315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_004603	TTC	2	6	766353	766358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897504
15045	NC_004603	ACG	2	6	766389	766394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897504
15046	NC_004603	CGC	2	6	766445	766450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28897504
15047	NC_004603	CTT	2	6	766502	766507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897504
15048	NC_004603	TGCT	2	8	766579	766586	0 %	50 %	25 %	25 %	28897504
15049	NC_004603	TTC	2	6	766605	766610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897504
15050	NC_004603	CGA	2	6	766640	766645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897504
15051	NC_004603	TTC	2	6	766647	766652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897504
15052	NC_004603	ACC	2	6	766686	766691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897504
15053	NC_004603	ACA	2	6	766702	766707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897504
15054	NC_004603	TTC	2	6	766725	766730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897504
15055	NC_004603	CTT	2	6	766796	766801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897504
15056	NC_004603	TAAG	2	8	766838	766845	50 %	25 %	25 %	0 %	28897504
15057	NC_004603	AAG	2	6	766854	766859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897504
15058	NC_004603	TAA	2	6	766922	766927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897504
15059	NC_004603	ATG	2	6	766990	766995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897504
15060	NC_004603	CACGCA	2	12	766997	767008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	28897504
15061	NC_004603	AAG	2	6	767149	767154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897504
15062	NC_004603	TCTT	2	8	767182	767189	0 %	75 %	0 %	25 %	28897504
15063	NC_004603	AGA	2	6	767199	767204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897504
15064	NC_004603	AG	3	6	767271	767276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_004603	CAA	2	6	767520	767525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897505
15066	NC_004603	GGC	2	6	767529	767534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897505
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15069	NC_004603	GAAA	2	8	767590	767597	75 %	0 %	25 %	0 %	28897505
15070	NC_004603	TCG	2	6	767604	767609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897505
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15072	NC_004603	TGC	2	6	767735	767740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897505
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15083	NC_004603	CTCG	2	8	768257	768264	0 %	25 %	25 %	50 %	28897506
15084	NC_004603	AAT	2	6	768280	768285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897506
15085	NC_004603	CGT	2	6	768287	768292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897506
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15087	NC_004603	CGA	2	6	768391	768396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897506
15088	NC_004603	CTG	3	9	768422	768430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897506
15089	NC_004603	TACCTG	2	12	768449	768460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897506
15090	NC_004603	TTGGT	2	10	768516	768525	0 %	60 %	40 %	0 %	28897506
15091	NC_004603	T	6	6	768546	768551	0 %	100 %	0 %	0 %	28897506
15092	NC_004603	CTT	2	6	768566	768571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897506
15093	NC_004603	CAA	2	6	768740	768745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897506
15094	NC_004603	TGT	2	6	768806	768811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897506
15095	NC_004603	CGG	2	6	768841	768846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897506
15096	NC_004603	TGA	2	6	768932	768937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_004603	CAT	2	6	769021	769026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897507
15098	NC_004603	GTAC	2	8	769070	769077	25 %	25 %	25 %	25 %	28897507
15099	NC_004603	CAC	2	6	769083	769088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897507
15100	NC_004603	TAC	2	6	769165	769170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897507
15101	NC_004603	GTT	2	6	769174	769179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897507
15102	NC_004603	GC	3	6	769190	769195	0 %	0 %	50 %	50 %	28897507
15103	NC_004603	GCT	2	6	769239	769244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897507
15104	NC_004603	AGCA	2	8	769249	769256	50 %	0 %	25 %	25 %	28897507
15105	NC_004603	TTG	2	6	769294	769299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897507
15106	NC_004603	TTC	2	6	769319	769324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897507
15107	NC_004603	CAA	2	6	769470	769475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897507
15108	NC_004603	GAT	2	6	769525	769530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897507
15109	NC_004603	TG	3	6	769549	769554	0 %	50 %	50 %	0 %	28897507
15110	NC_004603	TCA	2	6	769563	769568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897507
15111	NC_004603	GAT	2	6	769648	769653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897507
15112	NC_004603	GTC	2	6	769654	769659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897507
15113	NC_004603	CGT	2	6	769758	769763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897507
15114	NC_004603	TAG	2	6	769798	769803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897507
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15119	NC_004603	ATC	2	6	770051	770056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897507
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15493	NC_004603	TGA	2	6	788338	788343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_004603	GAG	2	6	788392	788397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15495	NC_004603	TAACC	2	10	788403	788412	40 %	20 %	0 %	40 %	28897525
15496	NC_004603	TGA	2	6	788418	788423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897525
15497	NC_004603	CAC	2	6	788479	788484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897525
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15500	NC_004603	CTG	2	6	788547	788552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897525

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