MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 63725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_004603	CTG	2	6	302918	302923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6003	NC_004603	CTCAA	2	10	303009	303018	40 %	20 %	0 %	40 %	28897082
6004	NC_004603	TGA	2	6	303079	303084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897082
6005	NC_004603	GT	4	8	303158	303165	0 %	50 %	50 %	0 %	28897082
6006	NC_004603	TGA	2	6	303166	303171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897082
6007	NC_004603	GAA	3	9	303233	303241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897082
6008	NC_004603	ACC	2	6	303244	303249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897082
6009	NC_004603	GATT	2	8	303334	303341	25 %	50 %	25 %	0 %	28897082
6010	NC_004603	GAG	2	6	303461	303466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28897082
6011	NC_004603	GAAA	2	8	303469	303476	75 %	0 %	25 %	0 %	28897082
6012	NC_004603	CGC	2	6	303486	303491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28897082
6013	NC_004603	CGT	2	6	303539	303544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6014	NC_004603	ATC	2	6	303594	303599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897082
6015	NC_004603	TTGGT	2	10	303600	303609	0 %	60 %	40 %	0 %	28897082
6016	NC_004603	GTG	2	6	303621	303626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897082
6017	NC_004603	CA	3	6	303685	303690	50 %	0 %	0 %	50 %	28897082
6018	NC_004603	CTG	2	6	303702	303707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6019	NC_004603	AAGC	2	8	303743	303750	50 %	0 %	25 %	25 %	28897082
6020	NC_004603	GGC	2	6	303964	303969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897082
6021	NC_004603	G	6	6	304108	304113	0 %	0 %	100 %	0 %	28897082
6022	NC_004603	GCG	2	6	304145	304150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897082
6023	NC_004603	ACCTGA	2	12	304170	304181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897082
6024	NC_004603	AAG	2	6	304209	304214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897082
6025	NC_004603	TC	3	6	304237	304242	0 %	50 %	0 %	50 %	28897082
6026	NC_004603	GGT	2	6	304268	304273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897082
6027	NC_004603	ACAA	2	8	304452	304459	75 %	0 %	0 %	25 %	28897082
6028	NC_004603	GATG	2	8	304465	304472	25 %	25 %	50 %	0 %	28897082
6029	NC_004603	GCA	2	6	304606	304611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6030	NC_004603	ACG	2	6	304707	304712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6031	NC_004603	CAA	2	6	304886	304891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897082
6032	NC_004603	TTG	2	6	304966	304971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897082
6033	NC_004603	GT	4	8	304989	304996	0 %	50 %	50 %	0 %	28897082
6034	NC_004603	GCC	2	6	305083	305088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28897082
6035	NC_004603	AGC	2	6	305208	305213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6036	NC_004603	CAGCTT	2	12	305233	305244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897082
6037	NC_004603	CTT	2	6	305398	305403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897082
6038	NC_004603	GT	3	6	305688	305693	0 %	50 %	50 %	0 %	28897082
6039	NC_004603	GCC	2	6	305719	305724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28897082
6040	NC_004603	CGC	2	6	305769	305774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28897082
6041	NC_004603	CCA	2	6	305837	305842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897082
6042	NC_004603	GT	3	6	305853	305858	0 %	50 %	50 %	0 %	28897082
6043	NC_004603	TGA	2	6	305899	305904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897082
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6045	NC_004603	ACATCA	2	12	305937	305948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	28897082
6046	NC_004603	GAC	2	6	305957	305962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897082
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6048	NC_004603	GGC	2	6	305990	305995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897082
6049	NC_004603	GAA	2	6	306104	306109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897082
6050	NC_004603	GTAT	2	8	306145	306152	25 %	50 %	25 %	0 %	28897082
6051	NC_004603	TCCGA	2	10	306227	306236	20 %	20 %	20 %	40 %	28897082
6052	NC_004603	GGT	2	6	306323	306328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897082
6053	NC_004603	GAC	2	6	306337	306342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897082
6054	NC_004603	GTT	2	6	306380	306385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897082
6055	NC_004603	TGA	2	6	306445	306450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897082
6056	NC_004603	AATTTG	2	12	306615	306626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28897082
6057	NC_004603	CA	3	6	306647	306652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_004603	GCA	2	6	306678	306683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897083
6059	NC_004603	CAT	2	6	306727	306732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897083
6060	NC_004603	TGAT	2	8	306854	306861	25 %	50 %	25 %	0 %	28897083
6061	NC_004603	GAT	3	9	306859	306867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897083
6062	NC_004603	TGG	2	6	306872	306877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897083
6063	NC_004603	AG	4	8	306916	306923	50 %	0 %	50 %	0 %	28897083
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6069	NC_004603	TCTG	2	8	307155	307162	0 %	50 %	25 %	25 %	28897084
6070	NC_004603	ACC	2	6	307174	307179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897084
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6090	NC_004603	GTAA	2	8	308677	308684	50 %	25 %	25 %	0 %	28897086
6091	NC_004603	TGA	2	6	308725	308730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897086
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6101	NC_004603	GA	3	6	309155	309160	50 %	0 %	50 %	0 %	28897086
6102	NC_004603	CAA	2	6	309195	309200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897086
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6105	NC_004603	ATTC	2	8	309394	309401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6106	NC_004603	AAG	3	9	309461	309469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_004603	GTTTA	2	10	309535	309544	20 %	60 %	20 %	0 %	28897088
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6110	NC_004603	GT	3	6	309771	309776	0 %	50 %	50 %	0 %	28897088
6111	NC_004603	GCTG	2	8	309858	309865	0 %	25 %	50 %	25 %	28897088
6112	NC_004603	CA	3	6	309873	309878	50 %	0 %	0 %	50 %	28897088
6113	NC_004603	TGG	2	6	309951	309956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897088
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6124	NC_004603	GAA	2	6	310501	310506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897088
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6373	NC_004603	ATC	2	6	322358	322363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897101
6374	NC_004603	CATCA	2	10	322406	322415	40 %	20 %	0 %	40 %	28897101
6375	NC_004603	CAT	2	6	322486	322491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897101
6376	NC_004603	TTC	2	6	322565	322570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897101
6377	NC_004603	TCA	2	6	322594	322599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897101
6378	NC_004603	TCA	2	6	322678	322683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897101
6379	NC_004603	TAAA	2	8	322701	322708	75 %	25 %	0 %	0 %	28897101
6380	NC_004603	CAA	2	6	322714	322719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897101
6381	NC_004603	GCA	2	6	322743	322748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897101
6382	NC_004603	CAT	2	6	322792	322797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897101
6383	NC_004603	GCA	2	6	322801	322806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28897101
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6385	NC_004603	CCA	2	6	322920	322925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28897101
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6387	NC_004603	TA	3	6	323091	323096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_004603	AAT	2	6	323104	323109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_004603	A	6	6	323115	323120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6390	NC_004603	T	6	6	323188	323193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6391	NC_004603	TCT	2	6	323221	323226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6392	NC_004603	TGA	2	6	323245	323250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6401	NC_004603	CGT	3	9	323536	323544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897102
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6403	NC_004603	CA	3	6	323641	323646	50 %	0 %	0 %	50 %	28897103
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6405	NC_004603	TGG	2	6	323654	323659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28897103
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6448	NC_004603	TAA	2	6	325312	325317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6450	NC_004603	GAT	2	6	325364	325369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6482	NC_004603	CTT	2	6	327060	327065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897107
6483	NC_004603	CA	3	6	327094	327099	50 %	0 %	0 %	50 %	28897107
6484	NC_004603	ACA	2	6	327201	327206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28897107
6485	NC_004603	TC	3	6	327245	327250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6486	NC_004603	A	6	6	327263	327268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6487	NC_004603	TTTTTG	2	12	327287	327298	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6492	NC_004603	T	6	6	327462	327467	0 %	100 %	0 %	0 %	28897108
6493	NC_004603	TGCGG	2	10	327477	327486	0 %	20 %	60 %	20 %	28897108
6494	NC_004603	CTT	2	6	327522	327527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28897108
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6498	NC_004603	ATA	2	6	327701	327706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28897108
6499	NC_004603	TCG	2	6	327785	327790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897108
6500	NC_004603	AGA	2	6	327800	327805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28897108

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