MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 63725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_004603	TCT	2	6	2814674	2814679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54502	NC_004603	GTCAA	2	10	2814709	2814718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54503	NC_004603	TTA	2	6	2814768	2814773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54504	NC_004603	TAAA	2	8	2814822	2814829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54505	NC_004603	ATC	2	6	2814902	2814907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54506	NC_004603	TACA	2	8	2814940	2814947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54507	NC_004603	GTT	2	6	2814975	2814980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54508	NC_004603	TCG	2	6	2815081	2815086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899439
54509	NC_004603	TCA	2	6	2815200	2815205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899439
54510	NC_004603	ATG	2	6	2815215	2815220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899439
54511	NC_004603	T	6	6	2815469	2815474	0 %	100 %	0 %	0 %	28899439
54512	NC_004603	CAT	2	6	2815577	2815582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899439
54513	NC_004603	GTGG	2	8	2815583	2815590	0 %	25 %	75 %	0 %	28899439
54514	NC_004603	GCA	2	6	2815617	2815622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899439
54515	NC_004603	CTG	2	6	2815626	2815631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899439
54516	NC_004603	TTA	2	6	2815645	2815650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899439
54517	NC_004603	ATT	2	6	2815695	2815700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899439
54518	NC_004603	GCA	2	6	2815728	2815733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899439
54519	NC_004603	GAC	2	6	2815761	2815766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899439
54520	NC_004603	CAT	2	6	2815781	2815786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899439
54521	NC_004603	CAT	2	6	2815832	2815837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899439
54522	NC_004603	TGT	2	6	2815903	2815908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899439
54523	NC_004603	TAG	2	6	2815909	2815914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899439
54524	NC_004603	TAA	2	6	2816028	2816033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_004603	TGA	2	6	2816144	2816149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899440
54526	NC_004603	CAA	2	6	2816234	2816239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899440
54527	NC_004603	GCA	2	6	2816244	2816249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899440
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54530	NC_004603	ACTTGC	2	12	2816467	2816478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28899440
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54532	NC_004603	ACCA	2	8	2816519	2816526	50 %	0 %	0 %	50 %	28899440
54533	NC_004603	CAG	2	6	2816596	2816601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899440
54534	NC_004603	CT	3	6	2816611	2816616	0 %	50 %	0 %	50 %	28899440
54535	NC_004603	TGG	2	6	2816624	2816629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899440
54536	NC_004603	GAA	2	6	2816638	2816643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899440
54537	NC_004603	ATGCT	2	10	2816782	2816791	20 %	40 %	20 %	20 %	28899440
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54540	NC_004603	GATT	2	8	2817055	2817062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54541	NC_004603	AT	3	6	2817116	2817121	50 %	50 %	0 %	0 %	28899441
54542	NC_004603	TTAT	2	8	2817136	2817143	25 %	75 %	0 %	0 %	28899441
54543	NC_004603	TCG	3	9	2817157	2817165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899441
54544	NC_004603	TTA	2	6	2817176	2817181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899441
54545	NC_004603	CAT	2	6	2817299	2817304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899441
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54547	NC_004603	CGT	2	6	2817389	2817394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899441
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54550	NC_004603	GTTG	2	8	2817569	2817576	0 %	50 %	50 %	0 %	28899441
54551	NC_004603	ACT	2	6	2817591	2817596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899441
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54553	NC_004603	GCA	2	6	2817830	2817835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899442
54554	NC_004603	TTG	2	6	2817857	2817862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899442
54555	NC_004603	CAAA	2	8	2817891	2817898	75 %	0 %	0 %	25 %	28899442
54556	NC_004603	GCTC	2	8	2818026	2818033	0 %	25 %	25 %	50 %	28899442
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54560	NC_004603	GTC	2	6	2818211	2818216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899443
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54572	NC_004603	GAA	2	6	2818823	2818828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899443
54573	NC_004603	GTAA	2	8	2818922	2818929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54574	NC_004603	TGAA	2	8	2818933	2818940	50 %	25 %	25 %	0 %	28899444
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54585	NC_004603	ATTGCC	2	12	2819392	2819403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28899444
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54593	NC_004603	AG	3	6	2819967	2819972	50 %	0 %	50 %	0 %	28899444
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54599	NC_004603	CATG	2	8	2820093	2820100	25 %	25 %	25 %	25 %	28899444
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54605	NC_004603	A	6	6	2820557	2820562	100 %	0 %	0 %	0 %	28899445
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54607	NC_004603	TAA	2	6	2820681	2820686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899445
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54612	NC_004603	TTTG	2	8	2821010	2821017	0 %	75 %	25 %	0 %	28899446
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54615	NC_004603	TGA	2	6	2821127	2821132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899446
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54618	NC_004603	TTGCG	2	10	2821224	2821233	0 %	40 %	40 %	20 %	28899447
54619	NC_004603	TAC	2	6	2821253	2821258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899447
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54632	NC_004603	AAT	2	6	2822443	2822448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54855	NC_004603	AGA	2	6	2834275	2834280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899457
54856	NC_004603	CCA	2	6	2834371	2834376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899458
54857	NC_004603	CAGT	2	8	2834378	2834385	25 %	25 %	25 %	25 %	28899458
54858	NC_004603	TGC	2	6	2834497	2834502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899458
54859	NC_004603	TCAA	2	8	2834566	2834573	50 %	25 %	0 %	25 %	28899458
54860	NC_004603	ACC	3	9	2834625	2834633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899458
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54862	NC_004603	GAT	2	6	2834670	2834675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899458
54863	NC_004603	TTC	2	6	2834676	2834681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899458
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54865	NC_004603	GCA	2	6	2834699	2834704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899458
54866	NC_004603	GC	3	6	2834787	2834792	0 %	0 %	50 %	50 %	28899458
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54870	NC_004603	CAT	2	6	2835063	2835068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899458
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54873	NC_004603	TCG	2	6	2835121	2835126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899458
54874	NC_004603	GCTT	2	8	2835139	2835146	0 %	50 %	25 %	25 %	28899458
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54882	NC_004603	CGCA	2	8	2835597	2835604	25 %	0 %	25 %	50 %	28899458
54883	NC_004603	CAAT	2	8	2835616	2835623	50 %	25 %	0 %	25 %	28899458
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54890	NC_004603	GCA	2	6	2836063	2836068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899459
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54903	NC_004603	CTTC	2	8	2836647	2836654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54904	NC_004603	TAC	2	6	2836721	2836726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899460
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54906	NC_004603	ACTTC	2	10	2836904	2836913	20 %	40 %	0 %	40 %	28899460
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54913	NC_004603	CGCGC	2	10	2837128	2837137	0 %	0 %	40 %	60 %	28899460
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54924	NC_004603	ATGGGT	2	12	2838128	2838139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28899460
54925	NC_004603	GTAA	2	8	2838183	2838190	50 %	25 %	25 %	0 %	28899460
54926	NC_004603	CAAC	2	8	2838255	2838262	50 %	0 %	0 %	50 %	28899460
54927	NC_004603	CTG	2	6	2838386	2838391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899460
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54932	NC_004603	GCG	2	6	2838617	2838622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899460
54933	NC_004603	CAT	2	6	2838627	2838632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899460
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54951	NC_004603	ATCA	2	8	2840103	2840110	50 %	25 %	0 %	25 %	28899460
54952	NC_004603	GTAG	2	8	2840161	2840168	25 %	25 %	50 %	0 %	28899460
54953	NC_004603	ACG	2	6	2840221	2840226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899460
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54956	NC_004603	A	7	7	2840485	2840491	100 %	0 %	0 %	0 %	28899460
54957	NC_004603	CAT	2	6	2840567	2840572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899461
54958	NC_004603	ACG	2	6	2840574	2840579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899461
54959	NC_004603	AATA	2	8	2840633	2840640	75 %	25 %	0 %	0 %	28899461
54960	NC_004603	TCA	2	6	2840667	2840672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899461
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54963	NC_004603	CG	3	6	2840851	2840856	0 %	0 %	50 %	50 %	28899461
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54969	NC_004603	TCTG	2	8	2841141	2841148	0 %	50 %	25 %	25 %	28899461
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54972	NC_004603	GTAC	2	8	2841283	2841290	25 %	25 %	25 %	25 %	28899461
54973	NC_004603	GTTCC	2	10	2841352	2841361	0 %	40 %	20 %	40 %	28899461
54974	NC_004603	ACG	2	6	2841434	2841439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899461
54975	NC_004603	GCA	2	6	2841474	2841479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899461
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