MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002506	TGC	2	6	183861	183866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600935
3502	NC_002506	GA	3	6	183884	183889	50 %	0 %	50 %	0 %	15600935
3503	NC_002506	TTG	2	6	183974	183979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600935
3504	NC_002506	CAG	2	6	184019	184024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_002506	AAAT	2	8	184051	184058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_002506	A	6	6	184070	184075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_002506	GTT	2	6	184110	184115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_002506	AT	4	8	184238	184245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_002506	TC	3	6	184318	184323	0 %	50 %	0 %	50 %	15600936
3510	NC_002506	CGG	2	6	184331	184336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600936
3511	NC_002506	A	6	6	184431	184436	100 %	0 %	0 %	0 %	15600936
3512	NC_002506	GCT	2	6	184446	184451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600936
3513	NC_002506	GATT	2	8	184478	184485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_002506	GTG	2	6	184497	184502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_002506	A	6	6	184572	184577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_002506	AATG	2	8	184587	184594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_002506	CATT	2	8	184601	184608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_002506	T	6	6	184607	184612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_002506	TGC	2	6	184733	184738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_002506	GGT	2	6	184782	184787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193281
3521	NC_002506	TCG	2	6	184928	184933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193281
3522	NC_002506	TTG	2	6	184993	184998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193281
3523	NC_002506	TTG	2	6	185142	185147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193281
3524	NC_002506	T	6	6	185151	185156	0 %	100 %	0 %	0 %	471193281
3525	NC_002506	TAA	2	6	185225	185230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471193281
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3529	NC_002506	AAG	2	6	185398	185403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471193281
3530	NC_002506	GGC	2	6	185448	185453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193281
3531	NC_002506	TCC	2	6	185480	185485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_002506	ATTG	2	8	185487	185494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_002506	GAC	2	6	185506	185511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_002506	CCA	2	6	185540	185545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_002506	CCT	2	6	185616	185621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_002506	CGG	2	6	185641	185646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_002506	GCTGC	2	10	185662	185671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3538	NC_002506	CTGTTT	2	12	185683	185694	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3539	NC_002506	CTC	2	6	185794	185799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_002506	TTG	2	6	185863	185868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_002506	CAG	2	6	186001	186006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_002506	CAG	2	6	186013	186018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_002506	AT	3	6	186023	186028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_002506	CGA	2	6	186045	186050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_002506	GGCT	2	8	186074	186081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_002506	TTC	2	6	186103	186108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_002506	TGCC	2	8	186132	186139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_002506	CCA	2	6	186174	186179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_002506	GCCT	2	8	186210	186217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_002506	CTTG	2	8	186233	186240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_002506	CT	3	6	186307	186312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_002506	GGATGT	2	12	186320	186331	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_002506	TTG	3	9	186339	186347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_002506	ATGGC	2	10	186385	186394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3555	NC_002506	TTG	2	6	186432	186437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_002506	AGT	2	6	186527	186532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_002506	GCCT	2	8	186633	186640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_002506	GCTC	2	8	186716	186723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_002506	G	6	6	186759	186764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_002506	CGA	2	6	186785	186790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_002506	GTTC	2	8	186851	186858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_002506	CTT	2	6	186885	186890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_002506	AGT	2	6	187026	187031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_002506	TGA	2	6	187038	187043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_002506	GAG	2	6	187052	187057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_002506	CAA	2	6	187074	187079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_002506	A	6	6	187078	187083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_002506	TGAC	2	8	187133	187140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_002506	CAG	2	6	187237	187242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_002506	A	6	6	187251	187256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_002506	GC	4	8	187343	187350	0 %	0 %	50 %	50 %	15600941
3572	NC_002506	AGT	2	6	187351	187356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600941
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3576	NC_002506	CAT	2	6	187562	187567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600941
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3578	NC_002506	CTG	2	6	187632	187637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600941
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3580	NC_002506	TGA	2	6	187710	187715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600941
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3583	NC_002506	TGA	2	6	187746	187751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600941
3584	NC_002506	CTG	2	6	187758	187763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600941
3585	NC_002506	TTGCTG	22	132	187764	187895	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15600941
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3587	NC_002506	CTTG	2	8	187946	187953	0 %	50 %	25 %	25 %	15600941
3588	NC_002506	AGC	2	6	188100	188105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600941
3589	NC_002506	TTG	2	6	188158	188163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600941
3590	NC_002506	CTG	2	6	188214	188219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600941
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3594	NC_002506	GCT	2	6	188462	188467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600941
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3598	NC_002506	TGA	2	6	188674	188679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600941
3599	NC_002506	GCGGCA	2	12	188716	188727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15600941
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3601	NC_002506	GA	4	8	188756	188763	50 %	0 %	50 %	0 %	15600941
3602	NC_002506	GCA	2	6	188768	188773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600941
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3605	NC_002506	TGC	2	6	188849	188854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600941
3606	NC_002506	CTT	2	6	188855	188860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600941
3607	NC_002506	AC	3	6	188960	188965	50 %	0 %	0 %	50 %	15600941
3608	NC_002506	GCG	2	6	188968	188973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600941
3609	NC_002506	CGA	2	6	189035	189040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600941
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3611	NC_002506	CAAT	2	8	189119	189126	50 %	25 %	0 %	25 %	15600941
3612	NC_002506	GCG	2	6	189157	189162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600941
3613	NC_002506	CAA	2	6	189165	189170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600941
3614	NC_002506	CAA	2	6	189180	189185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600941
3615	NC_002506	AGC	2	6	189257	189262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600942
3616	NC_002506	GATTG	2	10	189315	189324	20 %	40 %	40 %	0 %	15600942
3617	NC_002506	TTG	2	6	189373	189378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600942
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