MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002506	TTG	2	6	155882	155887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600911
3002	NC_002506	TCT	2	6	155913	155918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600911
3003	NC_002506	ATCA	2	8	155984	155991	50 %	25 %	0 %	25 %	15600911
3004	NC_002506	GGC	2	6	156007	156012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600911
3005	NC_002506	AAAC	2	8	156053	156060	75 %	0 %	0 %	25 %	15600911
3006	NC_002506	CAG	3	9	156134	156142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3007	NC_002506	CAG	3	9	156275	156283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3008	NC_002506	TTG	2	6	156297	156302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600911
3009	NC_002506	ACA	2	6	156334	156339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600911
3010	NC_002506	AGC	2	6	156405	156410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3011	NC_002506	AAT	2	6	156411	156416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600911
3012	NC_002506	GCG	2	6	156472	156477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600911
3013	NC_002506	ATC	2	6	156503	156508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600911
3014	NC_002506	CTG	2	6	156648	156653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3015	NC_002506	GA	3	6	156654	156659	50 %	0 %	50 %	0 %	15600911
3016	NC_002506	AAT	2	6	156661	156666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600911
3017	NC_002506	TCA	2	6	156696	156701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600911
3018	NC_002506	CGA	2	6	156757	156762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3019	NC_002506	GCA	2	6	156786	156791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3020	NC_002506	TGC	2	6	156808	156813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3021	NC_002506	GCT	2	6	156847	156852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3022	NC_002506	GAT	2	6	156866	156871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600911
3023	NC_002506	AG	3	6	156884	156889	50 %	0 %	50 %	0 %	15600911
3024	NC_002506	TTG	2	6	156989	156994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600911
3025	NC_002506	ATC	2	6	157016	157021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600911
3026	NC_002506	GT	3	6	157039	157044	0 %	50 %	50 %	0 %	15600911
3027	NC_002506	TCA	2	6	157057	157062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600911
3028	NC_002506	GCGCT	2	10	157139	157148	0 %	20 %	40 %	40 %	15600911
3029	NC_002506	CAG	2	6	157202	157207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600911
3030	NC_002506	GGC	2	6	157343	157348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_002506	CAA	2	6	157388	157393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002506	CGTT	2	8	157433	157440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_002506	TCTA	2	8	157457	157464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_002506	ACTC	2	8	157476	157483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_002506	GCC	2	6	157488	157493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_002506	GTT	2	6	157509	157514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_002506	ATTG	2	8	157559	157566	25 %	50 %	25 %	0 %	15600912
3038	NC_002506	GAC	3	9	157569	157577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600912
3039	NC_002506	GCG	2	6	157659	157664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600912
3040	NC_002506	AGC	2	6	157669	157674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600912
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3042	NC_002506	GTG	2	6	157689	157694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600912
3043	NC_002506	TGG	2	6	157735	157740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600912
3044	NC_002506	GTCA	2	8	157893	157900	25 %	25 %	25 %	25 %	15600912
3045	NC_002506	CTG	2	6	157998	158003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600912
3046	NC_002506	TGG	2	6	158080	158085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600912
3047	NC_002506	AGCG	2	8	158106	158113	25 %	0 %	50 %	25 %	15600912
3048	NC_002506	CGGTG	2	10	158207	158216	0 %	20 %	60 %	20 %	15600912
3049	NC_002506	GGA	2	6	158221	158226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600912
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3052	NC_002506	CGA	2	6	158489	158494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600912
3053	NC_002506	TGC	2	6	158500	158505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600912
3054	NC_002506	GCT	2	6	158573	158578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600912
3055	NC_002506	GAA	3	9	158691	158699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600912
3056	NC_002506	CAG	2	6	158704	158709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600912
3057	NC_002506	AGTGA	2	10	158790	158799	40 %	20 %	40 %	0 %	15600912
3058	NC_002506	GTTTG	2	10	158849	158858	0 %	60 %	40 %	0 %	15600912
3059	NC_002506	AGG	2	6	158881	158886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600912
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3061	NC_002506	TTA	2	6	158924	158929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_002506	CG	3	6	158990	158995	0 %	0 %	50 %	50 %	15600913
3063	NC_002506	CGG	2	6	159001	159006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600913
3064	NC_002506	T	6	6	159007	159012	0 %	100 %	0 %	0 %	15600913
3065	NC_002506	TCT	2	6	159107	159112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_002506	AAT	2	6	159168	159173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600914
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3070	NC_002506	TTA	2	6	159315	159320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600914
3071	NC_002506	TGA	2	6	159428	159433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600914
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3073	NC_002506	CGG	2	6	159738	159743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600914
3074	NC_002506	CT	3	6	159856	159861	0 %	50 %	0 %	50 %	15600914
3075	NC_002506	CAC	2	6	159960	159965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600914
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3077	NC_002506	TAC	2	6	160150	160155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600914
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3079	NC_002506	AAAG	2	8	160260	160267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_002506	TTC	2	6	160280	160285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_002506	CCG	2	6	160299	160304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_002506	GCT	2	6	160322	160327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_002506	ACCCGT	2	12	160419	160430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15600916
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3085	NC_002506	CTG	2	6	160470	160475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600916
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3088	NC_002506	TGT	2	6	160627	160632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600916
3089	NC_002506	GCT	2	6	160637	160642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600916
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3091	NC_002506	GCG	2	6	160696	160701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600916
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3094	NC_002506	GGTT	2	8	160779	160786	0 %	50 %	50 %	0 %	15600916
3095	NC_002506	TCTG	2	8	160807	160814	0 %	50 %	25 %	25 %	15600916
3096	NC_002506	GGC	2	6	160845	160850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600916
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3098	NC_002506	GCG	2	6	160932	160937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600916
3099	NC_002506	GTTCAT	2	12	160955	160966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15600916
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3101	NC_002506	CAT	2	6	161009	161014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600916
3102	NC_002506	GTG	2	6	161043	161048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600916
3103	NC_002506	G	6	6	161048	161053	0 %	0 %	100 %	0 %	15600916
3104	NC_002506	TTA	2	6	161137	161142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600916
3105	NC_002506	ATG	2	6	161151	161156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600916
3106	NC_002506	A	6	6	161157	161162	100 %	0 %	0 %	0 %	15600916
3107	NC_002506	CGC	2	6	161183	161188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600916
3108	NC_002506	GCC	2	6	161228	161233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600916
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3112	NC_002506	TTTCC	2	10	161327	161336	0 %	60 %	0 %	40 %	15600916
3113	NC_002506	TGC	2	6	161416	161421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600916
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3119	NC_002506	CTG	2	6	161718	161723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600916
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3122	NC_002506	TGG	2	6	161851	161856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600916
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3124	NC_002506	GGC	2	6	161948	161953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600916
3125	NC_002506	CCG	2	6	161986	161991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600916
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3128	NC_002506	TCT	2	6	162070	162075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600916
3129	NC_002506	GT	3	6	162108	162113	0 %	50 %	50 %	0 %	15600916
3130	NC_002506	CCA	2	6	162133	162138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600916
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3132	NC_002506	GGC	2	6	162328	162333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600916
3133	NC_002506	TGC	2	6	162373	162378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600916
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3141	NC_002506	TGG	2	6	162786	162791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600917
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3153	NC_002506	AGTG	2	8	163423	163430	25 %	25 %	50 %	0 %	15600917
3154	NC_002506	TGG	2	6	163472	163477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600917
3155	NC_002506	T	6	6	163600	163605	0 %	100 %	0 %	0 %	15600917
3156	NC_002506	TG	3	6	163633	163638	0 %	50 %	50 %	0 %	15600917
3157	NC_002506	GCTT	2	8	163714	163721	0 %	50 %	25 %	25 %	15600917
3158	NC_002506	TCT	2	6	163755	163760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3159	NC_002506	TA	3	6	163783	163788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_002506	TCA	2	6	163789	163794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3161	NC_002506	ATT	2	6	163805	163810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_002506	T	7	7	163851	163857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_002506	AAG	2	6	163877	163882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_002506	TAA	3	9	163954	163962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_002506	A	6	6	164190	164195	100 %	0 %	0 %	0 %	471193279
3166	NC_002506	GGAC	2	8	164286	164293	25 %	0 %	50 %	25 %	471193279
3167	NC_002506	GGC	2	6	164345	164350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193279
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3171	NC_002506	GCT	2	6	164472	164477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193279
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3173	NC_002506	AAACG	2	10	164659	164668	60 %	0 %	20 %	20 %	471193279
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3221	NC_002506	GA	3	6	167928	167933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_002506	CGC	2	6	167947	167952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3223	NC_002506	GAC	2	6	168080	168085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600920
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3232	NC_002506	CTAT	2	8	168421	168428	25 %	50 %	0 %	25 %	15600920
3233	NC_002506	CAC	2	6	168429	168434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600920
3234	NC_002506	A	6	6	168455	168460	100 %	0 %	0 %	0 %	15600920
3235	NC_002506	A	6	6	168464	168469	100 %	0 %	0 %	0 %	15600920
3236	NC_002506	GAA	2	6	168475	168480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600920
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3238	NC_002506	GCC	2	6	168526	168531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3239	NC_002506	GGC	2	6	168541	168546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_002506	CT	3	6	168662	168667	0 %	50 %	0 %	50 %	15600921
3241	NC_002506	CAA	2	6	168728	168733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600921
3242	NC_002506	GCTT	2	8	168921	168928	0 %	50 %	25 %	25 %	15600921
3243	NC_002506	ACT	2	6	168960	168965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600921
3244	NC_002506	CCCG	2	8	168973	168980	0 %	0 %	25 %	75 %	15600921
3245	NC_002506	TGG	2	6	169097	169102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600921
3246	NC_002506	GACT	2	8	169139	169146	25 %	25 %	25 %	25 %	15600921
3247	NC_002506	GGT	2	6	169161	169166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600921
3248	NC_002506	TTG	2	6	169171	169176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600921
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3371	NC_002506	TCA	2	6	175818	175823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600928
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3373	NC_002506	CGT	2	6	175885	175890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600928
3374	NC_002506	TCA	2	6	175978	175983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600928
3375	NC_002506	TCC	2	6	175986	175991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3376	NC_002506	TTAC	2	8	176052	176059	25 %	50 %	0 %	25 %	15600929
3377	NC_002506	TCA	2	6	176291	176296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600929
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3381	NC_002506	TGC	2	6	176501	176506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600929
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3383	NC_002506	TGGCT	2	10	176557	176566	0 %	40 %	40 %	20 %	15600929
3384	NC_002506	CAG	2	6	176605	176610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600929
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3390	NC_002506	CTT	2	6	177162	177167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3391	NC_002506	GCCATC	2	12	177221	177232	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15600930
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3406	NC_002506	AG	3	6	178299	178304	50 %	0 %	50 %	0 %	15600930
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3410	NC_002506	TGT	2	6	178443	178448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3411	NC_002506	A	7	7	178464	178470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3439	NC_002506	GTT	2	6	180197	180202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_002506	CGTT	2	8	180208	180215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3444	NC_002506	AGA	2	6	180408	180413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3445	NC_002506	GTT	2	6	180451	180456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3446	NC_002506	A	6	6	180570	180575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3448	NC_002506	CGCTT	2	10	180655	180664	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3473	NC_002506	GCG	2	6	181784	181789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3499	NC_002506	GAG	2	6	183754	183759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600935
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