MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002506	CAA	2	6	131510	131515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600890
2502	NC_002506	CT	3	6	131534	131539	0 %	50 %	0 %	50 %	15600890
2503	NC_002506	TGG	2	6	131547	131552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600890
2504	NC_002506	TGG	2	6	131559	131564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600890
2505	NC_002506	AGC	2	6	131595	131600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2506	NC_002506	AGC	2	6	131621	131626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2507	NC_002506	TGC	2	6	131647	131652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2508	NC_002506	GCG	2	6	131666	131671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600890
2509	NC_002506	TGG	3	9	131676	131684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600890
2510	NC_002506	AGC	2	6	131701	131706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2511	NC_002506	AAAC	2	8	131708	131715	75 %	0 %	0 %	25 %	15600890
2512	NC_002506	GCA	2	6	131799	131804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2513	NC_002506	CTG	2	6	131843	131848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
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2515	NC_002506	ACA	2	6	132037	132042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600890
2516	NC_002506	CGT	2	6	132050	132055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2517	NC_002506	GCT	2	6	132064	132069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2518	NC_002506	TGGC	2	8	132122	132129	0 %	25 %	50 %	25 %	15600890
2519	NC_002506	TGC	2	6	132151	132156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2520	NC_002506	TCGG	2	8	132164	132171	0 %	25 %	50 %	25 %	15600890
2521	NC_002506	AAG	2	6	132216	132221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600890
2522	NC_002506	ATG	2	6	132252	132257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600890
2523	NC_002506	CTG	2	6	132317	132322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2524	NC_002506	ATC	2	6	132330	132335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600890
2525	NC_002506	CGATG	2	10	132337	132346	20 %	20 %	40 %	20 %	15600890
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2528	NC_002506	TTG	2	6	132483	132488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600891
2529	NC_002506	GGC	2	6	132498	132503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600891
2530	NC_002506	GGT	2	6	132514	132519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
2531	NC_002506	GCA	2	6	132521	132526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2533	NC_002506	TGGC	2	8	132600	132607	0 %	25 %	50 %	25 %	15600891
2534	NC_002506	AGC	2	6	132771	132776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2539	NC_002506	TGG	2	6	132986	132991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
2540	NC_002506	TGA	2	6	132997	133002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
2541	NC_002506	TGAT	2	8	133011	133018	25 %	50 %	25 %	0 %	15600891
2542	NC_002506	GAA	2	6	133055	133060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600891
2543	NC_002506	ATG	2	6	133062	133067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
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2545	NC_002506	GCC	3	9	133125	133133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600891
2546	NC_002506	ACCGCC	2	12	133178	133189	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15600891
2547	NC_002506	TGC	2	6	133215	133220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2549	NC_002506	TGC	2	6	133455	133460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2551	NC_002506	GCGA	2	8	133574	133581	25 %	0 %	50 %	25 %	15600891
2552	NC_002506	GTG	2	6	133608	133613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
2553	NC_002506	CAA	2	6	133634	133639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600891
2554	NC_002506	TACC	2	8	133644	133651	25 %	25 %	0 %	50 %	15600891
2555	NC_002506	TGA	2	6	133660	133665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
2556	NC_002506	CGT	2	6	133676	133681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600891
2557	NC_002506	GTCT	2	8	133686	133693	0 %	50 %	25 %	25 %	15600891
2558	NC_002506	GC	3	6	133714	133719	0 %	0 %	50 %	50 %	15600891
2559	NC_002506	CAT	2	6	133762	133767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600891
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2561	NC_002506	CT	3	6	133835	133840	0 %	50 %	0 %	50 %	15600891
2562	NC_002506	AG	3	6	133988	133993	50 %	0 %	50 %	0 %	15600891
2563	NC_002506	TTC	2	6	134042	134047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600891
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2565	NC_002506	CTT	2	6	134146	134151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600891
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2569	NC_002506	TGC	2	6	134220	134225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2574	NC_002506	AGC	2	6	134606	134611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2577	NC_002506	GC	3	6	134809	134814	0 %	0 %	50 %	50 %	15600891
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2582	NC_002506	GCA	2	6	135066	135071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600891
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2584	NC_002506	CTAT	2	8	135210	135217	25 %	50 %	0 %	25 %	15600891
2585	NC_002506	ATG	2	6	135263	135268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
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2588	NC_002506	GCTG	2	8	135370	135377	0 %	25 %	50 %	25 %	15600891
2589	NC_002506	CTT	2	6	135436	135441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600891
2590	NC_002506	TGA	2	6	135496	135501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
2591	NC_002506	GCGTC	2	10	135510	135519	0 %	20 %	40 %	40 %	15600891
2592	NC_002506	AAG	2	6	135549	135554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600891
2593	NC_002506	GATCA	2	10	135560	135569	40 %	20 %	20 %	20 %	15600891
2594	NC_002506	TTC	2	6	135596	135601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600891
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2599	NC_002506	GAT	2	6	135925	135930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
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2601	NC_002506	GAG	2	6	136159	136164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600892
2602	NC_002506	CCG	2	6	136170	136175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600892
2603	NC_002506	AAC	2	6	136229	136234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600892
2604	NC_002506	GCCT	2	8	136285	136292	0 %	25 %	25 %	50 %	15600892
2605	NC_002506	TGA	2	6	136334	136339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600892
2606	NC_002506	CCAA	2	8	136352	136359	50 %	0 %	0 %	50 %	15600892
2607	NC_002506	GTG	2	6	136423	136428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600892
2608	NC_002506	CAA	2	6	136525	136530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600892
2609	NC_002506	GTT	2	6	136674	136679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600892
2610	NC_002506	TGG	2	6	136712	136717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600892
2611	NC_002506	G	6	6	136716	136721	0 %	0 %	100 %	0 %	15600892
2612	NC_002506	TGATC	2	10	136854	136863	20 %	40 %	20 %	20 %	15600892
2613	NC_002506	GCA	2	6	136884	136889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600892
2614	NC_002506	CAG	2	6	137008	137013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600892
2615	NC_002506	CAA	2	6	137014	137019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600892
2616	NC_002506	AGA	2	6	137142	137147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600892
2617	NC_002506	CCT	2	6	137199	137204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600892
2618	NC_002506	CAAA	2	8	137250	137257	75 %	0 %	0 %	25 %	15600892
2619	NC_002506	AGC	2	6	137294	137299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600892
2620	NC_002506	TTG	2	6	137317	137322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600892
2621	NC_002506	GAAG	2	8	137334	137341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_002506	T	6	6	137371	137376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_002506	CA	3	6	137477	137482	50 %	0 %	0 %	50 %	15600893
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2749	NC_002506	GCA	2	6	143631	143636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600899
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2858	NC_002506	GCC	2	6	148431	148436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2859	NC_002506	A	7	7	148480	148486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2882	NC_002506	A	6	6	149333	149338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2997	NC_002506	GC	3	6	155585	155590	0 %	0 %	50 %	50 %	15600911
2998	NC_002506	GATG	2	8	155593	155600	25 %	25 %	50 %	0 %	15600911
2999	NC_002506	CGC	2	6	155690	155695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600911
3000	NC_002506	ATCA	2	8	155702	155709	50 %	25 %	0 %	25 %	15600911

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