MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_002506	TGG	2	6	1031075	1031080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601827
19503	NC_002506	GGTA	2	8	1031197	1031204	25 %	25 %	50 %	0 %	15601827
19504	NC_002506	CG	3	6	1031229	1031234	0 %	0 %	50 %	50 %	15601827
19505	NC_002506	TTG	2	6	1031298	1031303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601827
19506	NC_002506	CAA	2	6	1031307	1031312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601827
19507	NC_002506	GCC	2	6	1031315	1031320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601827
19508	NC_002506	G	6	6	1031383	1031388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19509	NC_002506	C	6	6	1031393	1031398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19510	NC_002506	TG	3	6	1031481	1031486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_002506	CAG	2	6	1031489	1031494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19512	NC_002506	GGCT	2	8	1031571	1031578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19513	NC_002506	T	7	7	1031578	1031584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19514	NC_002506	CGC	2	6	1031648	1031653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19515	NC_002506	GGA	2	6	1031663	1031668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_002506	CCAA	2	8	1031769	1031776	50 %	0 %	0 %	50 %	471193313
19517	NC_002506	GC	3	6	1031803	1031808	0 %	0 %	50 %	50 %	471193313
19518	NC_002506	CAG	2	6	1031853	1031858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193313
19519	NC_002506	TGC	2	6	1031863	1031868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193313
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19521	NC_002506	TCCACC	2	12	1032092	1032103	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	471193313
19522	NC_002506	CG	3	6	1032145	1032150	0 %	0 %	50 %	50 %	471193313
19523	NC_002506	A	6	6	1032185	1032190	100 %	0 %	0 %	0 %	471193313
19524	NC_002506	GCA	2	6	1032193	1032198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193313
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19526	NC_002506	A	6	6	1032389	1032394	100 %	0 %	0 %	0 %	471193313
19527	NC_002506	CAA	2	6	1032417	1032422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193313
19528	NC_002506	TGAT	2	8	1032431	1032438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19534	NC_002506	TGC	2	6	1032826	1032831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601829
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19540	NC_002506	TTA	2	6	1033195	1033200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_002506	CGC	2	6	1033220	1033225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19542	NC_002506	ATT	2	6	1033245	1033250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_002506	TAA	2	6	1033259	1033264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601830
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19553	NC_002506	GAAGA	2	10	1033726	1033735	60 %	0 %	40 %	0 %	15601830
19554	NC_002506	GCTT	2	8	1033770	1033777	0 %	50 %	25 %	25 %	15601830
19555	NC_002506	TCCC	2	8	1033778	1033785	0 %	25 %	0 %	75 %	15601830
19556	NC_002506	AGCC	2	8	1033798	1033805	25 %	0 %	25 %	50 %	15601830
19557	NC_002506	TC	4	8	1033875	1033882	0 %	50 %	0 %	50 %	15601830
19558	NC_002506	TTGA	2	8	1033909	1033916	25 %	50 %	25 %	0 %	15601830
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19589	NC_002506	CCAT	2	8	1035714	1035721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19590	NC_002506	CT	3	6	1035889	1035894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19591	NC_002506	CAA	2	6	1035916	1035921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19592	NC_002506	AAC	2	6	1035938	1035943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19603	NC_002506	TG	3	6	1036385	1036390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_002506	GAC	2	6	1036391	1036396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19609	NC_002506	ATC	2	6	1036567	1036572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19612	NC_002506	CAG	2	6	1036653	1036658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19613	NC_002506	GCGT	2	8	1036709	1036716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19614	NC_002506	TC	3	6	1036862	1036867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19615	NC_002506	AAGC	2	8	1036902	1036909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19619	NC_002506	TTTC	2	8	1037227	1037234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19620	NC_002506	TTG	2	6	1037267	1037272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19621	NC_002506	TTA	2	6	1037336	1037341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601834
19622	NC_002506	CTCG	2	8	1037419	1037426	0 %	25 %	25 %	50 %	15601834
19623	NC_002506	CG	3	6	1037460	1037465	0 %	0 %	50 %	50 %	15601834
19624	NC_002506	TGC	2	6	1037506	1037511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601834
19625	NC_002506	ATCA	2	8	1037544	1037551	50 %	25 %	0 %	25 %	15601834
19626	NC_002506	TGA	2	6	1037675	1037680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601834
19627	NC_002506	CTG	2	6	1037778	1037783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601834
19628	NC_002506	GTC	2	6	1037838	1037843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601834
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19637	NC_002506	GAA	2	6	1038360	1038365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601834
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19664	NC_002506	TTA	2	6	1039497	1039502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19694	NC_002506	CTTT	2	8	1041030	1041037	0 %	75 %	0 %	25 %	15601835
19695	NC_002506	CA	3	6	1041038	1041043	50 %	0 %	0 %	50 %	15601835
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19736	NC_002506	TC	3	6	1043185	1043190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19864	NC_002506	GTT	2	6	1049047	1049052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601841
19865	NC_002506	AGC	2	6	1049055	1049060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601841
19866	NC_002506	ATT	2	6	1049072	1049077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601841
19867	NC_002506	ATC	3	9	1049106	1049114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601841
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19880	NC_002506	TCCA	2	8	1049654	1049661	25 %	25 %	0 %	50 %	15601842
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19883	NC_002506	A	6	6	1049835	1049840	100 %	0 %	0 %	0 %	15601843
19884	NC_002506	CAC	2	6	1049843	1049848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601843
19885	NC_002506	TCAAGA	2	12	1049959	1049970	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15601843
19886	NC_002506	GTT	2	6	1049976	1049981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601843
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19888	NC_002506	A	6	6	1050174	1050179	100 %	0 %	0 %	0 %	15601843
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19899	NC_002506	TGA	2	6	1051031	1051036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601844
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19927	NC_002506	TC	3	6	1053227	1053232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19928	NC_002506	GTC	2	6	1053239	1053244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19930	NC_002506	T	6	6	1053305	1053310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19931	NC_002506	TAAT	2	8	1053351	1053358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19948	NC_002506	CGAT	2	8	1054538	1054545	25 %	25 %	25 %	25 %	15601847
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19952	NC_002506	CTG	2	6	1054717	1054722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601847
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19961	NC_002506	CTGC	2	8	1055453	1055460	0 %	25 %	25 %	50 %	15601848
19962	NC_002506	CG	3	6	1055551	1055556	0 %	0 %	50 %	50 %	15601848
19963	NC_002506	TAG	2	6	1055655	1055660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601848
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19966	NC_002506	CTG	2	6	1055916	1055921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601849
19967	NC_002506	CTG	2	6	1055955	1055960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601849
19968	NC_002506	GGC	2	6	1055964	1055969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601849
19969	NC_002506	GCC	2	6	1056003	1056008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601849
19970	NC_002506	GCA	2	6	1056153	1056158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601849
19971	NC_002506	TGG	2	6	1056171	1056176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601849
19972	NC_002506	T	6	6	1056266	1056271	0 %	100 %	0 %	0 %	15601849
19973	NC_002506	GCA	2	6	1056328	1056333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601849
19974	NC_002506	CTTT	2	8	1056500	1056507	0 %	75 %	0 %	25 %	15601849
19975	NC_002506	ATG	3	9	1056543	1056551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601849
19976	NC_002506	CTA	2	6	1056566	1056571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601849
19977	NC_002506	TATT	2	8	1056613	1056620	25 %	75 %	0 %	0 %	15601849
19978	NC_002506	CTC	2	6	1056671	1056676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601850
19979	NC_002506	ACA	2	6	1056682	1056687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601850
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19981	NC_002506	ATT	2	6	1056809	1056814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601850
19982	NC_002506	AAC	2	6	1056915	1056920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601850
19983	NC_002506	GC	3	6	1056967	1056972	0 %	0 %	50 %	50 %	15601850
19984	NC_002506	CGC	2	6	1057018	1057023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601850
19985	NC_002506	GCA	2	6	1057028	1057033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601850
19986	NC_002506	TCA	2	6	1057066	1057071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601850
19987	NC_002506	CT	3	6	1057097	1057102	0 %	50 %	0 %	50 %	15601850
19988	NC_002506	GGC	2	6	1057103	1057108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601850
19989	NC_002506	TG	3	6	1057131	1057136	0 %	50 %	50 %	0 %	15601850
19990	NC_002506	AACC	2	8	1057173	1057180	50 %	0 %	0 %	50 %	15601850
19991	NC_002506	GCC	2	6	1057197	1057202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601850
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19999	NC_002506	GC	3	6	1057855	1057860	0 %	0 %	50 %	50 %	15601850
20000	NC_002506	ATC	2	6	1057946	1057951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601850

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