MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_002506	GAGTT	2	10	1006232	1006241	20 %	40 %	40 %	0 %	15601807
19003	NC_002506	TCA	2	6	1006325	1006330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
19004	NC_002506	ATTCC	2	10	1006418	1006427	20 %	40 %	0 %	40 %	15601807
19005	NC_002506	CCA	2	6	1006428	1006433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601807
19006	NC_002506	TCG	2	6	1006499	1006504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601807
19007	NC_002506	CTGC	2	8	1006536	1006543	0 %	25 %	25 %	50 %	15601807
19008	NC_002506	GT	3	6	1006587	1006592	0 %	50 %	50 %	0 %	15601807
19009	NC_002506	CAT	2	6	1006630	1006635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
19010	NC_002506	TGAT	2	8	1006721	1006728	25 %	50 %	25 %	0 %	15601807
19011	NC_002506	CAG	2	6	1006786	1006791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601807
19012	NC_002506	TTTC	2	8	1006863	1006870	0 %	75 %	0 %	25 %	15601807
19013	NC_002506	TAC	2	6	1006944	1006949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
19014	NC_002506	ATGA	2	8	1006970	1006977	50 %	25 %	25 %	0 %	15601807
19015	NC_002506	GCC	3	9	1006979	1006987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601807
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19018	NC_002506	CT	3	6	1007078	1007083	0 %	50 %	0 %	50 %	15601807
19019	NC_002506	CAT	2	6	1007172	1007177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
19020	NC_002506	CAT	2	6	1007235	1007240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
19021	NC_002506	CGT	2	6	1007379	1007384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601807
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19031	NC_002506	A	6	6	1007873	1007878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_002506	A	7	7	1007936	1007942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_002506	TGT	2	6	1007968	1007973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_002506	C	7	7	1008023	1008029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19120	NC_002506	TGAG	2	8	1012082	1012089	25 %	25 %	50 %	0 %	15601813
19121	NC_002506	TCA	2	6	1012100	1012105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601813
19122	NC_002506	GAA	2	6	1012191	1012196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601813
19123	NC_002506	GCCA	2	8	1012241	1012248	25 %	0 %	25 %	50 %	15601813
19124	NC_002506	GAT	2	6	1012398	1012403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
19125	NC_002506	GCC	2	6	1012428	1012433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601813
19126	NC_002506	GCC	2	6	1012536	1012541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601813
19127	NC_002506	GAA	2	6	1012551	1012556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601813
19128	NC_002506	CG	3	6	1012581	1012586	0 %	0 %	50 %	50 %	15601813
19129	NC_002506	GAT	2	6	1012617	1012622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
19130	NC_002506	ATG	3	9	1012642	1012650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
19131	NC_002506	GC	3	6	1012686	1012691	0 %	0 %	50 %	50 %	15601813
19132	NC_002506	ACC	2	6	1012692	1012697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601813
19133	NC_002506	ACC	2	6	1012896	1012901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601813
19134	NC_002506	CCG	2	6	1012906	1012911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601813
19135	NC_002506	T	6	6	1012914	1012919	0 %	100 %	0 %	0 %	15601813
19136	NC_002506	AAGAT	2	10	1012985	1012994	60 %	20 %	20 %	0 %	15601813
19137	NC_002506	ATG	2	6	1013035	1013040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
19138	NC_002506	CAT	2	6	1013049	1013054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601813
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19140	NC_002506	CTT	2	6	1013286	1013291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601814
19141	NC_002506	CA	4	8	1013344	1013351	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
19142	NC_002506	AC	3	6	1013352	1013357	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
19143	NC_002506	GCG	2	6	1013384	1013389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601814
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19145	NC_002506	CG	4	8	1013489	1013496	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
19146	NC_002506	CAT	2	6	1013523	1013528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
19147	NC_002506	CG	3	6	1013599	1013604	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
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19150	NC_002506	TCAA	2	8	1013645	1013652	50 %	25 %	0 %	25 %	15601814
19151	NC_002506	TGC	2	6	1013684	1013689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601814
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19153	NC_002506	GTT	2	6	1013761	1013766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601814
19154	NC_002506	TGG	2	6	1013790	1013795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601814
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19156	NC_002506	ATC	2	6	1013947	1013952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
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19159	NC_002506	GCA	2	6	1014171	1014176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601814
19160	NC_002506	TCTT	2	8	1014236	1014243	0 %	75 %	0 %	25 %	15601814
19161	NC_002506	CCTG	2	8	1014269	1014276	0 %	25 %	25 %	50 %	15601814
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19168	NC_002506	CG	3	6	1014443	1014448	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
19169	NC_002506	CGT	2	6	1014462	1014467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601814
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19172	NC_002506	GTG	2	6	1014658	1014663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601814
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19184	NC_002506	AAAG	2	8	1015009	1015016	75 %	0 %	25 %	0 %	15601814
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19186	NC_002506	ACG	2	6	1015039	1015044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601814
19187	NC_002506	CA	3	6	1015089	1015094	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
19188	NC_002506	ATC	2	6	1015126	1015131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
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19191	NC_002506	CAA	2	6	1015158	1015163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601814
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19196	NC_002506	T	8	8	1015360	1015367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19197	NC_002506	ATT	2	6	1015390	1015395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19199	NC_002506	AAT	2	6	1015456	1015461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19200	NC_002506	TAA	2	6	1015502	1015507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19202	NC_002506	AGATG	2	10	1015688	1015697	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19203	NC_002506	AAAG	2	8	1015708	1015715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19204	NC_002506	AGT	2	6	1015716	1015721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19205	NC_002506	AGT	2	6	1015725	1015730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19208	NC_002506	AAT	2	6	1015817	1015822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19209	NC_002506	CGT	2	6	1015838	1015843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19211	NC_002506	AT	4	8	1015922	1015929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19213	NC_002506	CAA	2	6	1015945	1015950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19214	NC_002506	AT	4	8	1015965	1015972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19215	NC_002506	ATA	2	6	1016001	1016006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19218	NC_002506	CTG	2	6	1016117	1016122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601817
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19223	NC_002506	A	7	7	1016336	1016342	100 %	0 %	0 %	0 %	15601817
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19225	NC_002506	GCA	2	6	1016416	1016421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601818
19226	NC_002506	CCCTG	2	10	1016472	1016481	0 %	20 %	20 %	60 %	15601818
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19228	NC_002506	CAT	2	6	1016506	1016511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601818
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19230	NC_002506	CA	3	6	1016540	1016545	50 %	0 %	0 %	50 %	15601818
19231	NC_002506	CAC	3	9	1016548	1016556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601818
19232	NC_002506	CT	3	6	1016592	1016597	0 %	50 %	0 %	50 %	15601818
19233	NC_002506	TCA	2	6	1016602	1016607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601818
19234	NC_002506	TTGA	2	8	1016633	1016640	25 %	50 %	25 %	0 %	15601818
19235	NC_002506	CTT	2	6	1016653	1016658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601818
19236	NC_002506	TTG	2	6	1016705	1016710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601818
19237	NC_002506	TCA	2	6	1016724	1016729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601818
19238	NC_002506	GCA	2	6	1016752	1016757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601818
19239	NC_002506	CAT	2	6	1016824	1016829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601818
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19241	NC_002506	GCA	2	6	1016962	1016967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601818
19242	NC_002506	TGG	2	6	1017004	1017009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601818
19243	NC_002506	ATG	2	6	1017021	1017026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601818
19244	NC_002506	CG	3	6	1017039	1017044	0 %	0 %	50 %	50 %	15601818
19245	NC_002506	C	6	6	1017081	1017086	0 %	0 %	0 %	100 %	15601818
19246	NC_002506	CGG	2	6	1017145	1017150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601818
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19260	NC_002506	TA	3	6	1017792	1017797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19261	NC_002506	ACT	2	6	1017799	1017804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19265	NC_002506	AG	3	6	1018122	1018127	50 %	0 %	50 %	0 %	15601819
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19361	NC_002506	CAA	2	6	1023121	1023126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601823
19362	NC_002506	CTG	2	6	1023145	1023150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601823
19363	NC_002506	AGC	2	6	1023154	1023159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601823
19364	NC_002506	AACTC	2	10	1023171	1023180	40 %	20 %	0 %	40 %	15601823
19365	NC_002506	A	6	6	1023195	1023200	100 %	0 %	0 %	0 %	15601823
19366	NC_002506	GCA	2	6	1023224	1023229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601823
19367	NC_002506	GAT	2	6	1023280	1023285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601823
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19379	NC_002506	CTG	2	6	1024111	1024116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	533112014
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19391	NC_002506	GGC	2	6	1024584	1024589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	533112014
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19474	NC_002506	TAT	2	6	1029561	1029566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601827
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19478	NC_002506	GCG	2	6	1029767	1029772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601827
19479	NC_002506	AACC	2	8	1029787	1029794	50 %	0 %	0 %	50 %	15601827
19480	NC_002506	A	6	6	1029810	1029815	100 %	0 %	0 %	0 %	15601827
19481	NC_002506	TGAT	2	8	1029816	1029823	25 %	50 %	25 %	0 %	15601827
19482	NC_002506	CAG	2	6	1029965	1029970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601827
19483	NC_002506	CAA	2	6	1029998	1030003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601827
19484	NC_002506	GC	3	6	1030012	1030017	0 %	0 %	50 %	50 %	15601827
19485	NC_002506	GAG	2	6	1030037	1030042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601827
19486	NC_002506	TG	3	6	1030081	1030086	0 %	50 %	50 %	0 %	15601827
19487	NC_002506	GACAT	2	10	1030094	1030103	40 %	20 %	20 %	20 %	15601827
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19489	NC_002506	GCA	3	9	1030402	1030410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601827
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19491	NC_002506	TGG	2	6	1030474	1030479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601827
19492	NC_002506	TGC	2	6	1030512	1030517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601827
19493	NC_002506	AAG	2	6	1030572	1030577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601827
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19497	NC_002506	TG	3	6	1030945	1030950	0 %	50 %	50 %	0 %	15601827
19498	NC_002506	ATG	2	6	1030962	1030967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601827
19499	NC_002506	GAA	2	6	1031027	1031032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601827
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