MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_002506	GC	3	6	874376	874381	0 %	0 %	50 %	50 %	15601676
16503	NC_002506	AAATC	2	10	874403	874412	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16504	NC_002506	TAA	4	12	874484	874495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_002506	TTG	2	6	874541	874546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193307
16506	NC_002506	CGT	2	6	874550	874555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193307
16507	NC_002506	TGCT	2	8	874565	874572	0 %	50 %	25 %	25 %	471193307
16508	NC_002506	GCT	2	6	874581	874586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193307
16509	NC_002506	GCA	2	6	874625	874630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193307
16510	NC_002506	TGA	2	6	874647	874652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193307
16511	NC_002506	GTAA	2	8	874666	874673	50 %	25 %	25 %	0 %	471193307
16512	NC_002506	CCG	2	6	874679	874684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193307
16513	NC_002506	TCA	2	6	874688	874693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193307
16514	NC_002506	TTGA	2	8	874729	874736	25 %	50 %	25 %	0 %	471193307
16515	NC_002506	ATC	2	6	874768	874773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193307
16516	NC_002506	CCTT	2	8	874796	874803	0 %	50 %	0 %	50 %	471193307
16517	NC_002506	TAG	2	6	874805	874810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193307
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16519	NC_002506	CAC	2	6	875124	875129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471193307
16520	NC_002506	A	6	6	875143	875148	100 %	0 %	0 %	0 %	471193307
16521	NC_002506	TCA	3	9	875216	875224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193307
16522	NC_002506	GTG	2	6	875284	875289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193307
16523	NC_002506	TGA	2	6	875292	875297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193307
16524	NC_002506	CGC	2	6	875310	875315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193307
16525	NC_002506	GAA	2	6	875330	875335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471193307
16526	NC_002506	TCGT	2	8	875393	875400	0 %	50 %	25 %	25 %	471193307
16527	NC_002506	ACG	2	6	875429	875434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193307
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16529	NC_002506	ACA	2	6	875622	875627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193307
16530	NC_002506	CATG	2	8	875682	875689	25 %	25 %	25 %	25 %	471193307
16531	NC_002506	CGA	2	6	875696	875701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193307
16532	NC_002506	AAT	2	6	875719	875724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471193307
16533	NC_002506	GCC	3	9	875764	875772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193307
16534	NC_002506	AACC	2	8	875922	875929	50 %	0 %	0 %	50 %	471193307
16535	NC_002506	GCG	2	6	875956	875961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193307
16536	NC_002506	GGT	2	6	875991	875996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193307
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16539	NC_002506	CGG	2	6	876122	876127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193307
16540	NC_002506	A	6	6	876170	876175	100 %	0 %	0 %	0 %	471193307
16541	NC_002506	CAG	2	6	876190	876195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193307
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16543	NC_002506	AGA	2	6	876252	876257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471193307
16544	NC_002506	CAA	3	9	876261	876269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193307
16545	NC_002506	CTG	2	6	876311	876316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193307
16546	NC_002506	T	7	7	876432	876438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_002506	AGC	2	6	876494	876499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193308
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16549	NC_002506	GCT	2	6	876554	876559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193308
16550	NC_002506	ACTTT	2	10	876572	876581	20 %	60 %	0 %	20 %	471193308
16551	NC_002506	TC	3	6	876719	876724	0 %	50 %	0 %	50 %	471193308
16552	NC_002506	GCG	2	6	876725	876730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193308
16553	NC_002506	TGA	2	6	876757	876762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193308
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16555	NC_002506	GA	4	8	876880	876887	50 %	0 %	50 %	0 %	471193308
16556	NC_002506	GCG	2	6	876914	876919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193308
16557	NC_002506	TGT	2	6	876958	876963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193308
16558	NC_002506	TGA	2	6	877018	877023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193308
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16561	NC_002506	AGC	3	9	877108	877116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193308
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16564	NC_002506	CGCC	2	8	877219	877226	0 %	0 %	25 %	75 %	471193308
16565	NC_002506	CGA	2	6	877275	877280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193308
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16569	NC_002506	TTGG	2	8	877606	877613	0 %	50 %	50 %	0 %	471193308
16570	NC_002506	CTTCA	2	10	877629	877638	20 %	40 %	0 %	40 %	471193308
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16583	NC_002506	ACG	2	6	878414	878419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16586	NC_002506	GGC	2	6	878533	878538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16587	NC_002506	AGTG	2	8	878540	878547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16588	NC_002506	AGAC	2	8	878633	878640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16589	NC_002506	AACG	2	8	878656	878663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16605	NC_002506	CAAG	2	8	879771	879778	50 %	0 %	25 %	25 %	15601679
16606	NC_002506	GTG	2	6	879820	879825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601679
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16995	NC_002506	ACC	2	6	900229	900234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601702
16996	NC_002506	CGC	2	6	900299	900304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601702
16997	NC_002506	A	6	6	900450	900455	100 %	0 %	0 %	0 %	15601702
16998	NC_002506	TTCAC	2	10	900463	900472	20 %	40 %	0 %	40 %	15601702
16999	NC_002506	GCA	2	6	900562	900567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601702
17000	NC_002506	CTT	2	6	900641	900646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601702

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