MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_002506	ACTG	2	8	848094	848101	25 %	25 %	25 %	25 %	15601649
16003	NC_002506	CG	3	6	848109	848114	0 %	0 %	50 %	50 %	15601649
16004	NC_002506	A	7	7	848125	848131	100 %	0 %	0 %	0 %	15601649
16005	NC_002506	GCG	2	6	848161	848166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601649
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16007	NC_002506	CTG	2	6	848314	848319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601649
16008	NC_002506	AAT	2	6	848338	848343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601649
16009	NC_002506	GCC	2	6	848356	848361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601649
16010	NC_002506	CAT	2	6	848370	848375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601649
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16012	NC_002506	CTT	2	6	848520	848525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601649
16013	NC_002506	ACA	2	6	848657	848662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601649
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16015	NC_002506	TCG	2	6	848702	848707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601649
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16018	NC_002506	G	7	7	849031	849037	0 %	0 %	100 %	0 %	15601649
16019	NC_002506	CAA	2	6	849076	849081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601649
16020	NC_002506	GAC	2	6	849085	849090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601649
16021	NC_002506	TGA	2	6	849138	849143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601649
16022	NC_002506	GAT	2	6	849196	849201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601649
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16029	NC_002506	TACCC	2	10	849485	849494	20 %	20 %	0 %	60 %	15601649
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16032	NC_002506	CAT	2	6	849603	849608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601649
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16034	NC_002506	CCA	2	6	849707	849712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601649
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16039	NC_002506	ATGT	2	8	849983	849990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_002506	TCC	2	6	850047	850052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16041	NC_002506	CCG	2	6	850053	850058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_002506	GCT	2	6	850114	850119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_002506	GAT	2	6	850216	850221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601650
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16046	NC_002506	GCA	2	6	850453	850458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601650
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16114	NC_002506	CTT	2	6	853951	853956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_002506	GGA	2	6	853986	853991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16247	NC_002506	CAT	2	6	860664	860669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601659
16248	NC_002506	TCA	2	6	860724	860729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601659
16249	NC_002506	TGT	2	6	860736	860741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601659
16250	NC_002506	GAT	2	6	860746	860751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601659
16251	NC_002506	TTG	2	6	860773	860778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601659
16252	NC_002506	GAC	2	6	860803	860808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601659
16253	NC_002506	CAT	2	6	860860	860865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16254	NC_002506	CACT	2	8	860866	860873	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16255	NC_002506	AAAAG	2	10	860890	860899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16256	NC_002506	GCAG	2	8	860906	860913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16257	NC_002506	CGTTG	2	10	860984	860993	0 %	40 %	40 %	20 %	15601660
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16259	NC_002506	GTT	2	6	861017	861022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601660
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16262	NC_002506	GCA	2	6	861115	861120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601660
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16264	NC_002506	GCA	2	6	861266	861271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601660
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16273	NC_002506	CTT	2	6	861572	861577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601660
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16280	NC_002506	GAC	3	9	861942	861950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601660
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16282	NC_002506	AAT	2	6	861966	861971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601660
16283	NC_002506	CTG	2	6	862041	862046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601660
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16287	NC_002506	CT	3	6	862284	862289	0 %	50 %	0 %	50 %	15601660
16288	NC_002506	TCA	2	6	862310	862315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601660
16289	NC_002506	CGGGG	2	10	862403	862412	0 %	0 %	80 %	20 %	15601660
16290	NC_002506	A	6	6	862646	862651	100 %	0 %	0 %	0 %	15601660
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16293	NC_002506	T	6	6	862730	862735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16294	NC_002506	AGA	2	6	862753	862758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16295	NC_002506	T	7	7	862788	862794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16296	NC_002506	AG	3	6	862949	862954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16297	NC_002506	CTT	2	6	863007	863012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601661
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16302	NC_002506	ATC	2	6	863279	863284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601661
16303	NC_002506	CTT	2	6	863358	863363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601661
16304	NC_002506	TAAC	2	8	863384	863391	50 %	25 %	0 %	25 %	15601661
16305	NC_002506	GAC	2	6	863397	863402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601661
16306	NC_002506	TAT	2	6	863534	863539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16307	NC_002506	TGT	2	6	863546	863551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193306
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16320	NC_002506	TTATGC	2	12	864057	864068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15601663
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16333	NC_002506	GTAGA	2	10	864759	864768	40 %	20 %	40 %	0 %	15601663
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16339	NC_002506	C	6	6	865056	865061	0 %	0 %	0 %	100 %	15601663
16340	NC_002506	TTTG	2	8	865115	865122	0 %	75 %	25 %	0 %	15601663
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16347	NC_002506	AAT	2	6	865549	865554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16348	NC_002506	AG	3	6	865657	865662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16349	NC_002506	ATC	2	6	865681	865686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16350	NC_002506	CTG	2	6	865799	865804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601664
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16352	NC_002506	AAACCT	2	12	865972	865983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15601664
16353	NC_002506	GAA	2	6	865992	865997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601664
16354	NC_002506	AGCC	2	8	866113	866120	25 %	0 %	25 %	50 %	15601664
16355	NC_002506	CGG	2	6	866123	866128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601664
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16357	NC_002506	AATCA	2	10	866275	866284	60 %	20 %	0 %	20 %	15601664
16358	NC_002506	AGC	2	6	866285	866290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601664
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16363	NC_002506	TGC	2	6	866542	866547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601665
16364	NC_002506	GCG	2	6	866724	866729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601665
16365	NC_002506	AGC	2	6	866746	866751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601665
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16367	NC_002506	CTG	2	6	866940	866945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601665
16368	NC_002506	ATC	2	6	867185	867190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601666
16369	NC_002506	TGC	2	6	867210	867215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601666
16370	NC_002506	TGAA	2	8	867279	867286	50 %	25 %	25 %	0 %	15601666
16371	NC_002506	CGC	2	6	867427	867432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601666
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16375	NC_002506	CTG	2	6	867581	867586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601667
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16380	NC_002506	TACC	2	8	867724	867731	25 %	25 %	0 %	50 %	15601667
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16403	NC_002506	CTGG	2	8	868868	868875	0 %	25 %	50 %	25 %	15601668
16404	NC_002506	GCGA	2	8	868928	868935	25 %	0 %	50 %	25 %	15601668
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16432	NC_002506	TCA	2	6	870220	870225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16473	NC_002506	CTC	2	6	872454	872459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16488	NC_002506	T	7	7	873353	873359	0 %	100 %	0 %	0 %	15601675
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16491	NC_002506	TCA	2	6	873540	873545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601675
16492	NC_002506	GTT	2	6	873576	873581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601675
16493	NC_002506	A	6	6	873607	873612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16494	NC_002506	TTTA	2	8	873686	873693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_002506	TG	3	6	873945	873950	0 %	50 %	50 %	0 %	15601676
16496	NC_002506	T	6	6	873959	873964	0 %	100 %	0 %	0 %	15601676
16497	NC_002506	AC	4	8	873969	873976	50 %	0 %	0 %	50 %	15601676
16498	NC_002506	CCA	2	6	874093	874098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601676
16499	NC_002506	CAC	2	6	874170	874175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601676
16500	NC_002506	TGC	2	6	874242	874247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601676

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