MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_002506	GTTT	2	8	714720	714727	0 %	75 %	25 %	0 %	15601527
13502	NC_002506	CAA	2	6	714755	714760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601527
13503	NC_002506	GTC	2	6	714788	714793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601527
13504	NC_002506	CTT	2	6	714796	714801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601527
13505	NC_002506	ACC	2	6	714802	714807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601527
13506	NC_002506	TGGTGA	2	12	714900	714911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15601527
13507	NC_002506	CAA	2	6	714923	714928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601527
13508	NC_002506	GCT	2	6	714994	714999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601527
13509	NC_002506	CAT	2	6	715000	715005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601527
13510	NC_002506	CTT	2	6	715152	715157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_002506	ATT	2	6	715170	715175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_002506	CT	3	6	715185	715190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13513	NC_002506	CAT	2	6	715278	715283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_002506	GA	3	6	715284	715289	50 %	0 %	50 %	0 %	15601528
13515	NC_002506	CAC	2	6	715380	715385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601528
13516	NC_002506	AGC	2	6	715427	715432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13517	NC_002506	GTC	2	6	715549	715554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13518	NC_002506	CCA	2	6	715565	715570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601528
13519	NC_002506	GCCTAT	2	12	715585	715596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15601528
13520	NC_002506	AGC	2	6	715619	715624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13521	NC_002506	TGG	2	6	715716	715721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601528
13522	NC_002506	ACC	3	9	715741	715749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601528
13523	NC_002506	TGA	2	6	715803	715808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601528
13524	NC_002506	AAAAC	2	10	715875	715884	80 %	0 %	0 %	20 %	15601528
13525	NC_002506	CAG	2	6	716009	716014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13526	NC_002506	CGA	2	6	716024	716029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13527	NC_002506	CAGC	2	8	716082	716089	25 %	0 %	25 %	50 %	15601528
13528	NC_002506	CAC	2	6	716202	716207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601528
13529	NC_002506	GCC	2	6	716251	716256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601528
13530	NC_002506	AGC	2	6	716262	716267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13531	NC_002506	GGT	2	6	716298	716303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601528
13532	NC_002506	CA	3	6	716432	716437	50 %	0 %	0 %	50 %	15601528
13533	NC_002506	CAG	2	6	716439	716444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601528
13534	NC_002506	AAGTG	2	10	716454	716463	40 %	20 %	40 %	0 %	15601528
13535	NC_002506	CAGC	2	8	716534	716541	25 %	0 %	25 %	50 %	15601528
13536	NC_002506	GCAGA	2	10	716620	716629	40 %	0 %	40 %	20 %	15601528
13537	NC_002506	CG	3	6	716685	716690	0 %	0 %	50 %	50 %	15601528
13538	NC_002506	ATCA	2	8	716743	716750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_002506	ATT	2	6	716813	716818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601529
13540	NC_002506	TG	3	6	716849	716854	0 %	50 %	50 %	0 %	15601529
13541	NC_002506	CCA	2	6	716941	716946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601529
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13543	NC_002506	GCA	2	6	717072	717077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601529
13544	NC_002506	TTA	2	6	717213	717218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601529
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13547	NC_002506	CGC	2	6	717476	717481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601529
13548	NC_002506	GTT	2	6	717506	717511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601529
13549	NC_002506	CACC	2	8	717544	717551	25 %	0 %	0 %	75 %	15601529
13550	NC_002506	TTACT	2	10	717691	717700	20 %	60 %	0 %	20 %	15601529
13551	NC_002506	ATC	2	6	717744	717749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601529
13552	NC_002506	CCT	2	6	717812	717817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13553	NC_002506	CTA	2	6	717892	717897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_002506	AAG	2	6	717964	717969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_002506	GAA	2	6	718197	718202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601531
13556	NC_002506	TGA	2	6	718303	718308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601531
13557	NC_002506	CGC	2	6	718350	718355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601531
13558	NC_002506	ATGA	2	8	718365	718372	50 %	25 %	25 %	0 %	15601531
13559	NC_002506	AAG	2	6	718375	718380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601531
13560	NC_002506	TG	3	6	718423	718428	0 %	50 %	50 %	0 %	15601531
13561	NC_002506	GC	3	6	718468	718473	0 %	0 %	50 %	50 %	15601531
13562	NC_002506	ATG	2	6	718485	718490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601531
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13565	NC_002506	CTG	2	6	718614	718619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601531
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13570	NC_002506	CAT	2	6	718979	718984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601532
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13572	NC_002506	CTT	2	6	719020	719025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601532
13573	NC_002506	ACC	2	6	719028	719033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601532
13574	NC_002506	TGAT	2	8	719038	719045	25 %	50 %	25 %	0 %	15601532
13575	NC_002506	TGG	2	6	719077	719082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601532
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13580	NC_002506	GGC	2	6	719412	719417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601532
13581	NC_002506	TGA	2	6	719522	719527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601532
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13585	NC_002506	AAGG	2	8	719678	719685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_002506	CAAG	2	8	719979	719986	50 %	0 %	25 %	25 %	15601533
13587	NC_002506	TC	3	6	720059	720064	0 %	50 %	0 %	50 %	15601533
13588	NC_002506	TGA	2	6	720144	720149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601533
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13590	NC_002506	CCA	2	6	720367	720372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601533
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13592	NC_002506	CCG	2	6	720421	720426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601533
13593	NC_002506	TG	3	6	720490	720495	0 %	50 %	50 %	0 %	15601533
13594	NC_002506	CAAGC	2	10	720523	720532	40 %	0 %	20 %	40 %	15601533
13595	NC_002506	GGTGT	2	10	720582	720591	0 %	40 %	60 %	0 %	15601533
13596	NC_002506	T	6	6	720628	720633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_002506	CG	3	6	720710	720715	0 %	0 %	50 %	50 %	15601534
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13601	NC_002506	CTG	2	6	720946	720951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601534
13602	NC_002506	CGCA	2	8	721024	721031	25 %	0 %	25 %	50 %	15601534
13603	NC_002506	TGC	2	6	721043	721048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601534
13604	NC_002506	GCCA	2	8	721059	721066	25 %	0 %	25 %	50 %	15601534
13605	NC_002506	CATGC	2	10	721165	721174	20 %	20 %	20 %	40 %	15601534
13606	NC_002506	TGCCA	2	10	721210	721219	20 %	20 %	20 %	40 %	15601534
13607	NC_002506	CCA	2	6	721258	721263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601534
13608	NC_002506	TGA	2	6	721265	721270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601534
13609	NC_002506	AGTG	2	8	721281	721288	25 %	25 %	50 %	0 %	15601534
13610	NC_002506	CGC	2	6	721294	721299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601534
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13612	NC_002506	TGG	2	6	721325	721330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601534
13613	NC_002506	CCA	2	6	721461	721466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601534
13614	NC_002506	AC	3	6	721539	721544	50 %	0 %	0 %	50 %	15601534
13615	NC_002506	TCA	2	6	721625	721630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601534
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13618	NC_002506	CCA	2	6	721746	721751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601534
13619	NC_002506	TTC	2	6	721795	721800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601534
13620	NC_002506	CGGAT	2	10	721810	721819	20 %	20 %	40 %	20 %	15601534
13621	NC_002506	GT	3	6	721856	721861	0 %	50 %	50 %	0 %	15601534
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13623	NC_002506	T	6	6	721989	721994	0 %	100 %	0 %	0 %	15601534
13624	NC_002506	ACA	2	6	722003	722008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601534
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13627	NC_002506	T	6	6	722180	722185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_002506	T	6	6	722244	722249	0 %	100 %	0 %	0 %	15601535
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13653	NC_002506	T	6	6	723534	723539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13744	NC_002506	TATT	2	8	728429	728436	25 %	75 %	0 %	0 %	15601539
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13995	NC_002506	TAA	2	6	742854	742859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601556
13996	NC_002506	AGA	2	6	742887	742892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601556
13997	NC_002506	GGC	2	6	742939	742944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601556
13998	NC_002506	GGC	2	6	743010	743015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601556
13999	NC_002506	CT	3	6	743086	743091	0 %	50 %	0 %	50 %	15601556
14000	NC_002506	GT	3	6	743095	743100	0 %	50 %	50 %	0 %	15601556

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