MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_002506	GCA	2	6	686275	686280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601496
13003	NC_002506	AGC	2	6	686284	686289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601496
13004	NC_002506	TTG	2	6	686306	686311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601496
13005	NC_002506	GCT	2	6	686381	686386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601496
13006	NC_002506	CGA	2	6	686403	686408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601496
13007	NC_002506	T	6	6	686476	686481	0 %	100 %	0 %	0 %	15601496
13008	NC_002506	GGT	2	6	686492	686497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601496
13009	NC_002506	GTG	2	6	686532	686537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601496
13010	NC_002506	CTT	2	6	686539	686544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601496
13011	NC_002506	CTG	2	6	686612	686617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_002506	TCA	2	6	686684	686689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_002506	GCG	2	6	686801	686806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_002506	TCA	2	6	686844	686849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_002506	ATT	2	6	686882	686887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_002506	TTG	2	6	686975	686980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_002506	TCG	2	6	687057	687062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601497
13018	NC_002506	GAT	2	6	687088	687093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601497
13019	NC_002506	A	6	6	687100	687105	100 %	0 %	0 %	0 %	15601497
13020	NC_002506	CTG	2	6	687133	687138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601497
13021	NC_002506	CAT	2	6	687192	687197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601497
13022	NC_002506	CAT	2	6	687240	687245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601497
13023	NC_002506	CGT	2	6	687286	687291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601497
13024	NC_002506	A	6	6	687334	687339	100 %	0 %	0 %	0 %	15601497
13025	NC_002506	GC	3	6	687381	687386	0 %	0 %	50 %	50 %	15601498
13026	NC_002506	TC	3	6	687396	687401	0 %	50 %	0 %	50 %	15601498
13027	NC_002506	ACT	2	6	687691	687696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_002506	GACACT	2	12	687719	687730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_002506	AAT	2	6	687754	687759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_002506	TGG	2	6	687804	687809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601499
13031	NC_002506	TGA	2	6	687891	687896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601499
13032	NC_002506	GTC	2	6	687911	687916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601499
13033	NC_002506	A	7	7	687975	687981	100 %	0 %	0 %	0 %	15601499
13034	NC_002506	A	6	6	688019	688024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_002506	ATT	2	6	688047	688052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_002506	GAAA	2	8	688061	688068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_002506	GA	4	8	688078	688085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_002506	CTT	2	6	688095	688100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601500
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13040	NC_002506	CGAT	2	8	688202	688209	25 %	25 %	25 %	25 %	15601500
13041	NC_002506	GCG	2	6	688274	688279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601500
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13044	NC_002506	CGCAG	2	10	688385	688394	20 %	0 %	40 %	40 %	15601500
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13051	NC_002506	TCA	2	6	688785	688790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
13052	NC_002506	AAG	2	6	688793	688798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601500
13053	NC_002506	CCGTA	2	10	688803	688812	20 %	20 %	20 %	40 %	15601500
13054	NC_002506	CA	4	8	688837	688844	50 %	0 %	0 %	50 %	15601500
13055	NC_002506	TTG	2	6	688864	688869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601500
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13066	NC_002506	CAT	2	6	689532	689537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
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13073	NC_002506	ATCCC	2	10	689926	689935	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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13075	NC_002506	GC	3	6	690066	690071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13082	NC_002506	GC	3	6	690391	690396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13091	NC_002506	T	6	6	690896	690901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_002506	CT	4	8	690902	690909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13093	NC_002506	TTA	2	6	691016	691021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13096	NC_002506	AAC	2	6	691178	691183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_002506	ATGAA	2	10	691188	691197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13109	NC_002506	GCT	2	6	691942	691947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601502
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13115	NC_002506	TGA	2	6	692310	692315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601502
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13117	NC_002506	CGA	2	6	692515	692520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601502
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13123	NC_002506	ACA	2	6	692881	692886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601502
13124	NC_002506	ATG	2	6	692887	692892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601502
13125	NC_002506	ATG	2	6	692897	692902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601503
13126	NC_002506	GCC	2	6	692938	692943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601503
13127	NC_002506	GC	3	6	692946	692951	0 %	0 %	50 %	50 %	15601503
13128	NC_002506	A	7	7	692964	692970	100 %	0 %	0 %	0 %	15601503
13129	NC_002506	GTG	2	6	692971	692976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601503
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13133	NC_002506	CAT	2	6	693312	693317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601503
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13139	NC_002506	TGA	2	6	693605	693610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601503
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13142	NC_002506	TGG	2	6	693753	693758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601503
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13146	NC_002506	TGC	2	6	694187	694192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601503
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13154	NC_002506	GCT	2	6	694732	694737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601504
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13162	NC_002506	GCT	2	6	695165	695170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601504
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13170	NC_002506	TGAT	2	8	695583	695590	25 %	50 %	25 %	0 %	161582040
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13188	NC_002506	AGA	2	6	696887	696892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601507
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13199	NC_002506	T	8	8	697379	697386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13200	NC_002506	ATT	2	6	697402	697407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13201	NC_002506	CTG	2	6	697436	697441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13202	NC_002506	CTG	2	6	697452	697457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13224	NC_002506	GGCG	2	8	698599	698606	0 %	0 %	75 %	25 %	15601508
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13229	NC_002506	CA	3	6	698934	698939	50 %	0 %	0 %	50 %	15601509
13230	NC_002506	GCC	2	6	698985	698990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601509
13231	NC_002506	AG	3	6	699043	699048	50 %	0 %	50 %	0 %	15601509
13232	NC_002506	TTC	2	6	699157	699162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601509
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13234	NC_002506	CACG	2	8	699213	699220	25 %	0 %	25 %	50 %	15601509
13235	NC_002506	GTC	2	6	699230	699235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601509
13236	NC_002506	GGCT	2	8	699285	699292	0 %	25 %	50 %	25 %	15601509
13237	NC_002506	TGC	2	6	699311	699316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601509
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13239	NC_002506	AC	3	6	699411	699416	50 %	0 %	0 %	50 %	15601509
13240	NC_002506	ATC	2	6	699443	699448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601509
13241	NC_002506	TGA	2	6	699480	699485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601509
13242	NC_002506	T	7	7	699508	699514	0 %	100 %	0 %	0 %	15601509
13243	NC_002506	CAA	2	6	699541	699546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13244	NC_002506	GA	3	6	699547	699552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_002506	AAT	2	6	699554	699559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13246	NC_002506	GAT	2	6	699652	699657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13247	NC_002506	CAC	2	6	699732	699737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13248	NC_002506	CTC	2	6	699945	699950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13249	NC_002506	A	6	6	699951	699956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_002506	GCA	2	6	699977	699982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	533112013
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13372	NC_002506	TGA	3	9	707086	707094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601518
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13389	NC_002506	TCA	2	6	707945	707950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601518
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13396	NC_002506	GCA	2	6	708182	708187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601518
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13398	NC_002506	T	6	6	708342	708347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13402	NC_002506	TCA	2	6	708507	708512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601519
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13429	NC_002506	TCGC	2	8	710115	710122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13432	NC_002506	TG	3	6	710296	710301	0 %	50 %	50 %	0 %	471193301
13433	NC_002506	GAT	2	6	710430	710435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193301
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13442	NC_002506	AAG	2	6	710979	710984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601522
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13477	NC_002506	CGC	2	6	713150	713155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601524
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13482	NC_002506	TTG	2	6	713488	713493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601525
13483	NC_002506	CCT	2	6	713495	713500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13484	NC_002506	GTA	2	6	713636	713641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_002506	ATT	2	6	713690	713695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_002506	ATT	2	6	713782	713787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_002506	TAA	2	6	713827	713832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13490	NC_002506	TGA	2	6	713964	713969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601527
13491	NC_002506	CCA	2	6	714025	714030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601527
13492	NC_002506	TG	3	6	714135	714140	0 %	50 %	50 %	0 %	15601527
13493	NC_002506	GGC	3	9	714155	714163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601527
13494	NC_002506	GTC	2	6	714254	714259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601527
13495	NC_002506	TAT	2	6	714297	714302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601527
13496	NC_002506	GAT	2	6	714313	714318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601527
13497	NC_002506	CAG	2	6	714389	714394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601527
13498	NC_002506	CTGCG	2	10	714489	714498	0 %	20 %	40 %	40 %	15601527
13499	NC_002506	AGT	2	6	714568	714573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601527
13500	NC_002506	CAT	2	6	714661	714666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601527

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