MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_002506	CAAAC	2	10	580403	580412	60 %	0 %	0 %	40 %	15601403
11002	NC_002506	ACC	2	6	580487	580492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601403
11003	NC_002506	CAA	2	6	580498	580503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601403
11004	NC_002506	GTC	2	6	580526	580531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601403
11005	NC_002506	AAAT	2	8	580539	580546	75 %	25 %	0 %	0 %	15601403
11006	NC_002506	GCC	2	6	580553	580558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601403
11007	NC_002506	ACC	2	6	580559	580564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601403
11008	NC_002506	GGAA	2	8	580622	580629	50 %	0 %	50 %	0 %	15601403
11009	NC_002506	TTC	2	6	580670	580675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601403
11010	NC_002506	AACC	2	8	580743	580750	50 %	0 %	0 %	50 %	15601403
11011	NC_002506	ATT	2	6	580757	580762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601403
11012	NC_002506	ATG	2	6	580767	580772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601403
11013	NC_002506	TGC	2	6	580906	580911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193297
11014	NC_002506	CAC	2	6	580968	580973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471193297
11015	NC_002506	GCA	2	6	581054	581059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193297
11016	NC_002506	ACT	2	6	581095	581100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193297
11017	NC_002506	GATG	2	8	581219	581226	25 %	25 %	50 %	0 %	471193297
11018	NC_002506	GCT	2	6	581254	581259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193297
11019	NC_002506	TGCTGA	2	12	581273	581284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	471193297
11020	NC_002506	CAAA	2	8	581291	581298	75 %	0 %	0 %	25 %	471193297
11021	NC_002506	CCA	2	6	581387	581392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471193297
11022	NC_002506	ACCA	2	8	581526	581533	50 %	0 %	0 %	50 %	471193297
11023	NC_002506	GCTC	2	8	581534	581541	0 %	25 %	25 %	50 %	471193297
11024	NC_002506	CAAA	2	8	581554	581561	75 %	0 %	0 %	25 %	471193297
11025	NC_002506	AAT	2	6	581570	581575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471193297
11026	NC_002506	CG	3	6	581625	581630	0 %	0 %	50 %	50 %	471193297
11027	NC_002506	CAT	2	6	581664	581669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193297
11028	NC_002506	GCTT	2	8	581731	581738	0 %	50 %	25 %	25 %	471193297
11029	NC_002506	GCT	2	6	581767	581772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193297
11030	NC_002506	TCA	2	6	581840	581845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193297
11031	NC_002506	CATCTT	2	12	581876	581887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	471193297
11032	NC_002506	GCAC	2	8	582056	582063	25 %	0 %	25 %	50 %	471193297
11033	NC_002506	TGAA	2	8	582079	582086	50 %	25 %	25 %	0 %	471193297
11034	NC_002506	CGG	2	6	582158	582163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193297
11035	NC_002506	GC	3	6	582242	582247	0 %	0 %	50 %	50 %	471193297
11036	NC_002506	CCAA	2	8	582343	582350	50 %	0 %	0 %	50 %	471193297
11037	NC_002506	GAT	2	6	582386	582391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193297
11038	NC_002506	CAC	2	6	582402	582407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471193297
11039	NC_002506	TTG	2	6	582519	582524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193297
11040	NC_002506	CAT	2	6	582624	582629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193297
11041	NC_002506	ATG	2	6	582677	582682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601405
11042	NC_002506	TTG	2	6	582717	582722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601405
11043	NC_002506	CTT	2	6	582785	582790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601405
11044	NC_002506	CCA	2	6	582816	582821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601405
11045	NC_002506	GCG	2	6	582826	582831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601405
11046	NC_002506	TTG	2	6	582869	582874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601405
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11048	NC_002506	AAACC	2	10	583053	583062	60 %	0 %	0 %	40 %	15601405
11049	NC_002506	ATT	2	6	583099	583104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601406
11050	NC_002506	CAA	2	6	583293	583298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601406
11051	NC_002506	TGCG	2	8	583342	583349	0 %	25 %	50 %	25 %	15601406
11052	NC_002506	A	6	6	583385	583390	100 %	0 %	0 %	0 %	15601406
11053	NC_002506	TGA	2	6	583395	583400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601406
11054	NC_002506	CAG	2	6	583485	583490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601406
11055	NC_002506	AGC	2	6	583576	583581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601406
11056	NC_002506	TTA	2	6	583627	583632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601406
11057	NC_002506	CAT	2	6	583701	583706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601406
11058	NC_002506	A	6	6	583845	583850	100 %	0 %	0 %	0 %	15601407
11059	NC_002506	CAC	2	6	583910	583915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601407
11060	NC_002506	GCAGC	2	10	583945	583954	20 %	0 %	40 %	40 %	15601407
11061	NC_002506	TGAA	2	8	583979	583986	50 %	25 %	25 %	0 %	15601407
11062	NC_002506	CAC	2	6	584024	584029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601407
11063	NC_002506	GTA	2	6	584053	584058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601407
11064	NC_002506	GCGCA	2	10	584167	584176	20 %	0 %	40 %	40 %	15601407
11065	NC_002506	CTG	2	6	584223	584228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601407
11066	NC_002506	A	6	6	584280	584285	100 %	0 %	0 %	0 %	15601407
11067	NC_002506	GGC	2	6	584324	584329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601407
11068	NC_002506	AGCA	2	8	584363	584370	50 %	0 %	25 %	25 %	15601407
11069	NC_002506	TGGTTA	2	12	584418	584429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11073	NC_002506	AT	3	6	584639	584644	50 %	50 %	0 %	0 %	15601408
11074	NC_002506	TCGCT	2	10	584648	584657	0 %	40 %	20 %	40 %	15601408
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11084	NC_002506	TGG	2	6	585389	585394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601408
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11089	NC_002506	CGTT	2	8	585511	585518	0 %	50 %	25 %	25 %	15601408
11090	NC_002506	GGC	2	6	585519	585524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601408
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11100	NC_002506	GCT	2	6	586133	586138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601409
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11103	NC_002506	TTA	2	6	586205	586210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_002506	AAAGA	2	10	586258	586267	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_002506	GAAAA	2	10	586272	586281	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_002506	AAG	2	6	586325	586330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_002506	TGT	2	6	586382	586387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_002506	T	6	6	586421	586426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_002506	CAAAC	2	10	586456	586465	60 %	0 %	0 %	40 %	15601410
11110	NC_002506	TC	3	6	586495	586500	0 %	50 %	0 %	50 %	15601410
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11118	NC_002506	A	6	6	586999	587004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_002506	T	6	6	587078	587083	0 %	100 %	0 %	0 %	15601411
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11123	NC_002506	CAC	2	6	587258	587263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601411
11124	NC_002506	GCA	2	6	587269	587274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601411
11125	NC_002506	CAG	2	6	587331	587336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601411
11126	NC_002506	TCA	2	6	587387	587392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601411
11127	NC_002506	CAGCG	2	10	587913	587922	20 %	0 %	40 %	40 %	15601411
11128	NC_002506	CAA	2	6	587967	587972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601411
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11130	NC_002506	ACC	2	6	588117	588122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601411
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11132	NC_002506	GC	3	6	588175	588180	0 %	0 %	50 %	50 %	15601411
11133	NC_002506	CAT	2	6	588218	588223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601411
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11135	NC_002506	TGT	3	9	588556	588564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11136	NC_002506	ATCC	2	8	588755	588762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11137	NC_002506	ATG	2	6	588802	588807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601412
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11144	NC_002506	AGCA	2	8	589045	589052	50 %	0 %	25 %	25 %	15601412
11145	NC_002506	TCA	2	6	589079	589084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601412
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11155	NC_002506	ATG	2	6	589606	589611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601412
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11159	NC_002506	CTG	2	6	590032	590037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601413
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11162	NC_002506	CAC	3	9	590155	590163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601413
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11164	NC_002506	TCA	2	6	590198	590203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601413
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11170	NC_002506	GC	3	6	590587	590592	0 %	0 %	50 %	50 %	15601413
11171	NC_002506	CGCT	2	8	590596	590603	0 %	25 %	25 %	50 %	15601413
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11184	NC_002506	AT	3	6	591550	591555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11185	NC_002506	AG	3	6	591559	591564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11186	NC_002506	AT	3	6	591565	591570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11187	NC_002506	TG	3	6	591683	591688	0 %	50 %	50 %	0 %	15601414
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11202	NC_002506	CAC	2	6	592461	592466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601414
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11206	NC_002506	TCAGG	2	10	592621	592630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11207	NC_002506	ATC	2	6	592720	592725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11208	NC_002506	CATCC	2	10	592732	592741	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11209	NC_002506	GCA	2	6	592756	592761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11210	NC_002506	CA	4	8	592764	592771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11211	NC_002506	GATCAA	2	12	592835	592846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11212	NC_002506	TAG	2	6	592853	592858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11226	NC_002506	CG	3	6	593884	593889	0 %	0 %	50 %	50 %	15601415
11227	NC_002506	CAT	2	6	593896	593901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601415
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11229	NC_002506	TG	3	6	593928	593933	0 %	50 %	50 %	0 %	15601415
11230	NC_002506	CAA	2	6	593990	593995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601415
11231	NC_002506	TGA	2	6	593998	594003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601415
11232	NC_002506	GCT	2	6	594010	594015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601415
11233	NC_002506	TGG	2	6	594025	594030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601415
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11238	NC_002506	GGT	2	6	594134	594139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601415
11239	NC_002506	A	6	6	594163	594168	100 %	0 %	0 %	0 %	15601415
11240	NC_002506	TGG	2	6	594174	594179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601415
11241	NC_002506	CCTTT	2	10	594183	594192	0 %	60 %	0 %	40 %	15601415
11242	NC_002506	CAC	2	6	594241	594246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601415
11243	NC_002506	AG	3	6	594314	594319	50 %	0 %	50 %	0 %	15601415
11244	NC_002506	CAG	2	6	594437	594442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601415
11245	NC_002506	AGC	2	6	594456	594461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601415
11246	NC_002506	TCTTTT	2	12	594539	594550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11247	NC_002506	CATCGC	2	12	594637	594648	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15601416
11248	NC_002506	GCC	2	6	594671	594676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601416
11249	NC_002506	GCA	2	6	594752	594757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601416
11250	NC_002506	CTG	2	6	594817	594822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601416
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11252	NC_002506	CTG	2	6	594934	594939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601416
11253	NC_002506	TG	3	6	594938	594943	0 %	50 %	50 %	0 %	15601416
11254	NC_002506	GC	3	6	594968	594973	0 %	0 %	50 %	50 %	15601416
11255	NC_002506	GCA	2	6	595034	595039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601416
11256	NC_002506	CTG	2	6	595102	595107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601416
11257	NC_002506	GTC	2	6	595130	595135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601416
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11260	NC_002506	TGA	2	6	595241	595246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601416
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11262	NC_002506	GCG	2	6	595277	595282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601416
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11284	NC_002506	TTA	2	6	596199	596204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11285	NC_002506	AAACTC	2	12	596206	596217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11286	NC_002506	AG	3	6	596357	596362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11287	NC_002506	CGG	2	6	596413	596418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601417
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11292	NC_002506	CATTG	2	10	596817	596826	20 %	40 %	20 %	20 %	15601417
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11295	NC_002506	TCA	2	6	597056	597061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11298	NC_002506	CATT	2	8	597119	597126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11299	NC_002506	GAC	2	6	597147	597152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11361	NC_002506	TCT	2	6	600360	600365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11362	NC_002506	TG	3	6	600373	600378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_002506	CATA	2	8	600390	600397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11364	NC_002506	CTT	2	6	600423	600428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11365	NC_002506	CAT	2	6	600490	600495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11366	NC_002506	CAA	2	6	600527	600532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11367	NC_002506	AATT	2	8	600653	600660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11369	NC_002506	TGC	2	6	600925	600930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601423
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11493	NC_002506	TTA	2	6	606664	606669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601427
11494	NC_002506	CAAC	2	8	606723	606730	50 %	0 %	0 %	50 %	15601427
11495	NC_002506	AG	3	6	606828	606833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11496	NC_002506	CAA	2	6	606853	606858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601429
11497	NC_002506	ACC	2	6	606940	606945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601429
11498	NC_002506	TTAT	2	8	606951	606958	25 %	75 %	0 %	0 %	15601429
11499	NC_002506	GTG	2	6	606962	606967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601429
11500	NC_002506	GCG	2	6	607000	607005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601429

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