MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_002506	CAT	2	6	526656	526661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601348
10003	NC_002506	AAT	2	6	526704	526709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601348
10004	NC_002506	GCA	2	6	526738	526743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601348
10005	NC_002506	GCAC	2	8	526780	526787	25 %	0 %	25 %	50 %	15601348
10006	NC_002506	CCA	2	6	526793	526798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601348
10007	NC_002506	ATG	2	6	526822	526827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601348
10008	NC_002506	ACC	2	6	526835	526840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601348
10009	NC_002506	CAA	2	6	526853	526858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601348
10010	NC_002506	GAT	2	6	526869	526874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601348
10011	NC_002506	AGCC	2	8	526936	526943	25 %	0 %	25 %	50 %	15601348
10012	NC_002506	ACA	2	6	527015	527020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601348
10013	NC_002506	ATC	2	6	527070	527075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601348
10014	NC_002506	GAT	2	6	527169	527174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601348
10015	NC_002506	TCAA	2	8	527188	527195	50 %	25 %	0 %	25 %	15601348
10016	NC_002506	CCA	2	6	527242	527247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601348
10017	NC_002506	GAG	2	6	527307	527312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601348
10018	NC_002506	GCTT	3	12	527447	527458	0 %	50 %	25 %	25 %	15601348
10019	NC_002506	ATG	2	6	527526	527531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601349
10020	NC_002506	CAA	2	6	527537	527542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601349
10021	NC_002506	TCAA	2	8	527649	527656	50 %	25 %	0 %	25 %	15601349
10022	NC_002506	GAA	2	6	527669	527674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601349
10023	NC_002506	ATG	2	6	527706	527711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601349
10024	NC_002506	CG	5	10	527771	527780	0 %	0 %	50 %	50 %	15601349
10025	NC_002506	TTG	2	6	527906	527911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601349
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10033	NC_002506	CAAAAC	2	12	528280	528291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601349
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10037	NC_002506	TGA	2	6	528493	528498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601349
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10039	NC_002506	CCT	2	6	528558	528563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_002506	CG	3	6	528584	528589	0 %	0 %	50 %	50 %	15601350
10041	NC_002506	CCA	2	6	528607	528612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601350
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10045	NC_002506	GAT	2	6	528819	528824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601350
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10049	NC_002506	GTT	2	6	529043	529048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601350
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10052	NC_002506	CTT	2	6	529131	529136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601350
10053	NC_002506	GTT	2	6	529233	529238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601350
10054	NC_002506	AAAT	2	8	529434	529441	75 %	25 %	0 %	0 %	15601350
10055	NC_002506	CTTGG	2	10	529534	529543	0 %	40 %	40 %	20 %	15601350
10056	NC_002506	TAG	2	6	529607	529612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601350
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10059	NC_002506	ATA	2	6	529909	529914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601350
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10066	NC_002506	AAT	2	6	530496	530501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_002506	ATAGT	2	10	530515	530524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_002506	ACT	2	6	530530	530535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10070	NC_002506	TTC	2	6	530574	530579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10093	NC_002506	TGA	2	6	532132	532137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601352
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10096	NC_002506	TTA	2	6	532275	532280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10101	NC_002506	TG	3	6	532503	532508	0 %	50 %	50 %	0 %	15601353
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10104	NC_002506	GC	3	6	532686	532691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_002506	CCA	2	6	532722	532727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601354
10106	NC_002506	TCAGT	2	10	532775	532784	20 %	40 %	20 %	20 %	15601354
10107	NC_002506	CTG	2	6	532815	532820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601354
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10109	NC_002506	TGG	2	6	532838	532843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601354
10110	NC_002506	ACG	2	6	532936	532941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601354
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10123	NC_002506	AC	3	6	533652	533657	50 %	0 %	0 %	50 %	15601354
10124	NC_002506	CT	3	6	533677	533682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_002506	ATTC	2	8	533718	533725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_002506	TCA	2	6	533731	533736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10128	NC_002506	T	6	6	533788	533793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_002506	TTATT	2	10	533811	533820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_002506	ATG	2	6	533909	533914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10133	NC_002506	ATG	2	6	534011	534016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10142	NC_002506	CGT	2	6	534437	534442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10145	NC_002506	GCG	2	6	534599	534604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10154	NC_002506	GTG	2	6	535040	535045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_002506	GTG	2	6	535055	535060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10158	NC_002506	GCA	2	6	535199	535204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10162	NC_002506	GCC	2	6	535311	535316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10164	NC_002506	GTG	2	6	535362	535367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10187	NC_002506	CAAT	2	8	536493	536500	50 %	25 %	0 %	25 %	15601358
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10237	NC_002506	TG	3	6	539002	539007	0 %	50 %	50 %	0 %	15601360
10238	NC_002506	AC	3	6	539054	539059	50 %	0 %	0 %	50 %	15601360
10239	NC_002506	GAC	2	6	539103	539108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601360
10240	NC_002506	CAAAT	2	10	539163	539172	60 %	20 %	0 %	20 %	15601360
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10248	NC_002506	TAA	2	6	539523	539528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601360
10249	NC_002506	GCT	3	9	539567	539575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601360
10250	NC_002506	AG	3	6	539583	539588	50 %	0 %	50 %	0 %	15601360
10251	NC_002506	ATC	2	6	539626	539631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601360
10252	NC_002506	TTC	2	6	539706	539711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601360
10253	NC_002506	GCT	2	6	539765	539770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601360
10254	NC_002506	A	6	6	539779	539784	100 %	0 %	0 %	0 %	15601360
10255	NC_002506	TGG	2	6	539803	539808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601360
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10257	NC_002506	GGT	2	6	539856	539861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601360
10258	NC_002506	CTG	2	6	539986	539991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601360
10259	NC_002506	TGC	2	6	540010	540015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601360
10260	NC_002506	GAT	2	6	540026	540031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601360
10261	NC_002506	TGA	2	6	540129	540134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_002506	AGG	2	6	540148	540153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_002506	CCT	2	6	540160	540165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10264	NC_002506	TGA	2	6	540167	540172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_002506	AGG	2	6	540206	540211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_002506	CCT	2	6	540218	540223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10267	NC_002506	TGA	2	6	540225	540230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10268	NC_002506	GCA	2	6	540283	540288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601361
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10270	NC_002506	GATAG	2	10	540392	540401	40 %	20 %	40 %	0 %	15601361
10271	NC_002506	CTTT	2	8	540468	540475	0 %	75 %	0 %	25 %	15601361
10272	NC_002506	TG	3	6	540633	540638	0 %	50 %	50 %	0 %	15601361
10273	NC_002506	A	7	7	540860	540866	100 %	0 %	0 %	0 %	15601361
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10278	NC_002506	CAG	2	6	541130	541135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601361
10279	NC_002506	CTT	2	6	541165	541170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601361
10280	NC_002506	TGC	2	6	541199	541204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601361
10281	NC_002506	TCA	2	6	541240	541245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601361
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10283	NC_002506	TACCC	2	10	541290	541299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10284	NC_002506	GAA	2	6	541320	541325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10285	NC_002506	ACG	2	6	541340	541345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10286	NC_002506	GTT	2	6	541439	541444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10287	NC_002506	GAA	2	6	541489	541494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601362
10288	NC_002506	CTG	2	6	541505	541510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601362
10289	NC_002506	CGTG	2	8	541540	541547	0 %	25 %	50 %	25 %	15601362
10290	NC_002506	GAT	3	9	541577	541585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601362
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10295	NC_002506	CCA	2	6	541698	541703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601362
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10298	NC_002506	TGA	2	6	541843	541848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601362
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10300	NC_002506	CGATG	2	10	541984	541993	20 %	20 %	40 %	20 %	15601362
10301	NC_002506	TCAGC	2	10	542049	542058	20 %	20 %	20 %	40 %	15601362
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10303	NC_002506	CTCA	2	8	542143	542150	25 %	25 %	0 %	50 %	15601362
10304	NC_002506	GC	3	6	542282	542287	0 %	0 %	50 %	50 %	15601362
10305	NC_002506	CAT	2	6	542380	542385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601362
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10309	NC_002506	CAA	2	6	542579	542584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601362
10310	NC_002506	ACC	2	6	542674	542679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601363
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10320	NC_002506	CGG	2	6	543033	543038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601363
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10322	NC_002506	TCC	2	6	543210	543215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601363
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10329	NC_002506	GCTGC	2	10	543623	543632	0 %	20 %	40 %	40 %	15601363
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10339	NC_002506	CG	3	6	544364	544369	0 %	0 %	50 %	50 %	15601364
10340	NC_002506	GATG	2	8	544410	544417	25 %	25 %	50 %	0 %	15601364
10341	NC_002506	GAT	2	6	544474	544479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601364
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10352	NC_002506	ATT	2	6	544803	544808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601364
10353	NC_002506	TCT	2	6	544897	544902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10354	NC_002506	TGAT	2	8	544942	544949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10355	NC_002506	TATT	2	8	544971	544978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10356	NC_002506	GGA	2	6	544981	544986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10357	NC_002506	GTG	2	6	545013	545018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601365
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10359	NC_002506	GTC	2	6	545148	545153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601365
10360	NC_002506	A	6	6	545206	545211	100 %	0 %	0 %	0 %	15601365
10361	NC_002506	AGC	2	6	545238	545243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601365
10362	NC_002506	CAA	2	6	545301	545306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601365
10363	NC_002506	ATC	2	6	545349	545354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601365
10364	NC_002506	GGT	2	6	545417	545422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10365	NC_002506	CAA	2	6	545465	545470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601366
10366	NC_002506	TC	4	8	545473	545480	0 %	50 %	0 %	50 %	15601366
10367	NC_002506	TGA	2	6	545538	545543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601366
10368	NC_002506	GGTTG	2	10	545633	545642	0 %	40 %	60 %	0 %	15601366
10369	NC_002506	CTT	2	6	545698	545703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601366
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10371	NC_002506	GTCA	2	8	545729	545736	25 %	25 %	25 %	25 %	15601366
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10494	NC_002506	TGA	2	6	553611	553616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601376
10495	NC_002506	GCG	2	6	553735	553740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601376
10496	NC_002506	GGT	2	6	553866	553871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601376
10497	NC_002506	ATT	2	6	553876	553881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601376
10498	NC_002506	ACTG	2	8	553914	553921	25 %	25 %	25 %	25 %	15601376
10499	NC_002506	ACT	2	6	554147	554152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_002506	CAG	2	6	554182	554187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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