MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002506	GTT	2	6	25746	25751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600791
502	NC_002506	ATCG	2	8	25827	25834	25 %	25 %	25 %	25 %	15600791
503	NC_002506	TGG	2	6	25838	25843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600791
504	NC_002506	CAG	2	6	25905	25910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600791
505	NC_002506	ATT	2	6	25972	25977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600791
506	NC_002506	T	6	6	25976	25981	0 %	100 %	0 %	0 %	15600791
507	NC_002506	TGG	2	6	26016	26021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600791
508	NC_002506	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	15600791
509	NC_002506	AGC	2	6	26262	26267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600791
510	NC_002506	ATGG	2	8	26271	26278	25 %	25 %	50 %	0 %	15600791
511	NC_002506	TCA	2	6	26417	26422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600791
512	NC_002506	AAC	2	6	26426	26431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600791
513	NC_002506	CG	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	15600791
514	NC_002506	CAG	2	6	26700	26705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600792
515	NC_002506	TTAT	2	8	26711	26718	25 %	75 %	0 %	0 %	15600792
516	NC_002506	GA	4	8	26741	26748	50 %	0 %	50 %	0 %	15600792
517	NC_002506	CTG	2	6	26783	26788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600792
518	NC_002506	ATTT	2	8	26808	26815	25 %	75 %	0 %	0 %	15600792
519	NC_002506	T	8	8	26813	26820	0 %	100 %	0 %	0 %	15600792
520	NC_002506	GCT	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600792
521	NC_002506	ACC	2	6	26912	26917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600792
522	NC_002506	TAT	2	6	26950	26955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600792
523	NC_002506	AAG	2	6	26963	26968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600792
524	NC_002506	TGGG	2	8	27010	27017	0 %	25 %	75 %	0 %	15600792
525	NC_002506	TGTT	2	8	27028	27035	0 %	75 %	25 %	0 %	15600792
526	NC_002506	CGT	2	6	27045	27050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600792
527	NC_002506	GCGG	2	8	27073	27080	0 %	0 %	75 %	25 %	15600792
528	NC_002506	CTG	2	6	27088	27093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600792
529	NC_002506	CCACC	2	10	27114	27123	20 %	0 %	0 %	80 %	15600792
530	NC_002506	AAGA	2	8	27130	27137	75 %	0 %	25 %	0 %	15600792
531	NC_002506	ATTG	2	8	27156	27163	25 %	50 %	25 %	0 %	15600792
532	NC_002506	AAAGA	2	10	27178	27187	80 %	0 %	20 %	0 %	15600792
533	NC_002506	TGG	2	6	27188	27193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600792
534	NC_002506	T	6	6	27241	27246	0 %	100 %	0 %	0 %	15600792
535	NC_002506	TGA	2	6	27255	27260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600792
536	NC_002506	ATA	2	6	27296	27301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600792
537	NC_002506	ACT	2	6	27388	27393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_002506	GCG	2	6	27412	27417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_002506	CGT	2	6	27504	27509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600793
540	NC_002506	ATTT	2	8	27526	27533	25 %	75 %	0 %	0 %	15600793
541	NC_002506	GCG	2	6	27555	27560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600793
542	NC_002506	TGG	2	6	27585	27590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600793
543	NC_002506	GC	3	6	27610	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	15600793
544	NC_002506	AATG	2	8	27678	27685	50 %	25 %	25 %	0 %	15600793
545	NC_002506	TG	3	6	27693	27698	0 %	50 %	50 %	0 %	15600793
546	NC_002506	CCA	2	6	27767	27772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600793
547	NC_002506	GCT	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600793
548	NC_002506	TTC	2	6	27862	27867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600793
549	NC_002506	GCC	2	6	27961	27966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_002506	GTT	2	6	27982	27987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002506	GTG	2	6	28081	28086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600794
552	NC_002506	GTG	2	6	28116	28121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600794
553	NC_002506	GT	3	6	28144	28149	0 %	50 %	50 %	0 %	15600794
554	NC_002506	TCA	3	9	28189	28197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600794
555	NC_002506	CAC	2	6	28202	28207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600794
556	NC_002506	TGAC	2	8	28215	28222	25 %	25 %	25 %	25 %	15600794
557	NC_002506	GTG	2	6	28323	28328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600794
558	NC_002506	CGA	2	6	28387	28392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600794
559	NC_002506	AAC	2	6	28422	28427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600794
560	NC_002506	ACAA	2	8	28482	28489	75 %	0 %	0 %	25 %	15600794
561	NC_002506	GC	3	6	28525	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	15600794
562	NC_002506	GAC	2	6	28541	28546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600794
563	NC_002506	GCT	2	6	28550	28555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600794
564	NC_002506	GT	3	6	28607	28612	0 %	50 %	50 %	0 %	15600794
565	NC_002506	T	6	6	28612	28617	0 %	100 %	0 %	0 %	15600794
566	NC_002506	ATG	2	6	28638	28643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600794
567	NC_002506	ATC	2	6	28653	28658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600794
568	NC_002506	GCA	2	6	28720	28725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600794
569	NC_002506	TTGA	2	8	28763	28770	25 %	50 %	25 %	0 %	15600794
570	NC_002506	TAAA	2	8	28948	28955	75 %	25 %	0 %	0 %	15600794
571	NC_002506	TCA	2	6	28971	28976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600794
572	NC_002506	AAT	2	6	29018	29023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600794
573	NC_002506	T	7	7	29155	29161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_002506	A	6	6	29168	29173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002506	GGT	2	6	29277	29282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600795
576	NC_002506	ATA	2	6	29290	29295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600795
577	NC_002506	TCA	2	6	29369	29374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600795
578	NC_002506	GA	3	6	29443	29448	50 %	0 %	50 %	0 %	15600795
579	NC_002506	GCC	2	6	29517	29522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600795
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587	NC_002506	CGCGA	2	10	30040	30049	20 %	0 %	40 %	40 %	15600795
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592	NC_002506	ATA	2	6	30478	30483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_002506	TCC	2	6	31083	31088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600796
604	NC_002506	GCG	2	6	31099	31104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600796
605	NC_002506	ACTG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	25 %	25 %	15600796
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609	NC_002506	TGC	2	6	31451	31456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600796
610	NC_002506	TGG	3	9	31461	31469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
611	NC_002506	GTG	2	6	31561	31566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
612	NC_002506	GTG	2	6	31573	31578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
613	NC_002506	CTG	2	6	31633	31638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600796
614	NC_002506	ATTG	2	8	31698	31705	25 %	50 %	25 %	0 %	15600796
615	NC_002506	CCT	2	6	31715	31720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600796
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618	NC_002506	GAT	2	6	31794	31799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600796
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620	NC_002506	CAG	2	6	31951	31956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_002506	TATT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	15600797
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627	NC_002506	TTG	2	6	32232	32237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600797
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639	NC_002506	TTTGT	2	10	32812	32821	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_002506	A	6	6	32931	32936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_002506	TC	3	6	32938	32943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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646	NC_002506	CGC	2	6	33055	33060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600798
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