MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 20279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002506	CAT	2	6	339306	339311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601106
6502	NC_002506	GGT	2	6	339426	339431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_002506	GGCG	2	8	339480	339487	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_002506	AGT	2	6	339545	339550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601107
6505	NC_002506	GAT	2	6	339702	339707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601107
6506	NC_002506	TGT	2	6	339728	339733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601107
6507	NC_002506	AAG	2	6	339747	339752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601107
6508	NC_002506	CAG	2	6	339796	339801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601107
6509	NC_002506	TAC	2	6	339808	339813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601107
6510	NC_002506	GGT	2	6	339886	339891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_002506	GTT	2	6	339896	339901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_002506	GGCG	2	8	339940	339947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_002506	TCA	2	6	339956	339961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_002506	TAG	2	6	340162	340167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601108
6515	NC_002506	TAG	2	6	340237	340242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601108
6516	NC_002506	CA	3	6	340281	340286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_002506	GGC	2	6	340356	340361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_002506	GT	3	6	340410	340415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_002506	TTG	2	6	340440	340445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_002506	TAA	2	6	340525	340530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_002506	A	6	6	340549	340554	100 %	0 %	0 %	0 %	15601109
6522	NC_002506	A	6	6	340650	340655	100 %	0 %	0 %	0 %	15601109
6523	NC_002506	ACA	2	6	340731	340736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601109
6524	NC_002506	CAG	2	6	340753	340758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601109
6525	NC_002506	T	7	7	340787	340793	0 %	100 %	0 %	0 %	15601109
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6528	NC_002506	CG	3	6	341049	341054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6529	NC_002506	GGT	2	6	341079	341084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_002506	GTT	2	6	341089	341094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_002506	GTT	2	6	341108	341113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_002506	GGCG	2	8	341133	341140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6533	NC_002506	AAC	2	6	341157	341162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_002506	TGGTAA	2	12	341171	341182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601110
6535	NC_002506	CTG	2	6	341189	341194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601110
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6540	NC_002506	GTAGT	2	10	341477	341486	20 %	40 %	40 %	0 %	15601110
6541	NC_002506	GA	3	6	341645	341650	50 %	0 %	50 %	0 %	15601110
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6544	NC_002506	GTT	2	6	341881	341886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_002506	GGCG	2	8	341925	341932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_002506	ATA	2	6	341961	341966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_002506	TTG	2	6	342043	342048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601111
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6551	NC_002506	TTAC	2	8	342208	342215	25 %	50 %	0 %	25 %	15601111
6552	NC_002506	GCTC	2	8	342246	342253	0 %	25 %	25 %	50 %	15601111
6553	NC_002506	TGG	2	6	342428	342433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601111
6554	NC_002506	A	6	6	342483	342488	100 %	0 %	0 %	0 %	15601111
6555	NC_002506	AAG	2	6	342508	342513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_002506	CG	3	6	342523	342528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_002506	AGT	2	6	342638	342643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6560	NC_002506	TTCAG	2	10	342767	342776	20 %	40 %	20 %	20 %	15601112
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6565	NC_002506	CAAG	2	8	342865	342872	50 %	0 %	25 %	25 %	15601112
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6572	NC_002506	GGT	2	6	343159	343164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_002506	GTT	2	6	343169	343174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_002506	GGCG	2	8	343213	343220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6598	NC_002506	T	6	6	344303	344308	0 %	100 %	0 %	0 %	15601115
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6601	NC_002506	CG	3	6	344546	344551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_002506	GGT	2	6	344576	344581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601116
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6604	NC_002506	ACTA	2	8	344645	344652	50 %	25 %	0 %	25 %	15601116
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6615	NC_002506	CG	3	6	345303	345308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_002506	GTT	2	6	345342	345347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_002506	GGCG	2	8	345385	345392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_002506	ATC	2	6	345412	345417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6622	NC_002506	A	6	6	345770	345775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_002506	CG	3	6	345832	345837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_002506	GGT	2	6	345862	345867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_002506	GGT	2	6	345871	345876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_002506	GTTTGG	2	12	345881	345892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6628	NC_002506	GCT	2	6	346018	346023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193284
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6631	NC_002506	AGTT	2	8	346310	346317	25 %	50 %	25 %	0 %	471193284
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