MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_002505	T	6	6	2527222	2527227	0 %	100 %	0 %	0 %	15642366
48502	NC_002505	CTT	2	6	2527264	2527269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642366
48503	NC_002505	TTC	2	6	2527295	2527300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642366
48504	NC_002505	TTGA	2	8	2527307	2527314	25 %	50 %	25 %	0 %	15642366
48505	NC_002505	TTGA	2	8	2527340	2527347	25 %	50 %	25 %	0 %	15642366
48506	NC_002505	CG	3	6	2527357	2527362	0 %	0 %	50 %	50 %	15642366
48507	NC_002505	ACC	2	6	2527428	2527433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642366
48508	NC_002505	AGAA	2	8	2527436	2527443	75 %	0 %	25 %	0 %	15642366
48509	NC_002505	ATC	2	6	2527502	2527507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642366
48510	NC_002505	ACC	2	6	2527545	2527550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642366
48511	NC_002505	TTCA	2	8	2527653	2527660	25 %	50 %	0 %	25 %	15642366
48512	NC_002505	CA	3	6	2527702	2527707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48513	NC_002505	AGC	2	6	2527714	2527719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48514	NC_002505	CTT	2	6	2527729	2527734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48515	NC_002505	TGGTT	2	10	2527768	2527777	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48516	NC_002505	GCA	2	6	2528009	2528014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642367
48517	NC_002505	CGT	2	6	2528132	2528137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642367
48518	NC_002505	AAT	2	6	2528150	2528155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642367
48519	NC_002505	CA	3	6	2528162	2528167	50 %	0 %	0 %	50 %	15642367
48520	NC_002505	ATG	2	6	2528170	2528175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642367
48521	NC_002505	GTT	2	6	2528222	2528227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642367
48522	NC_002505	ACG	3	9	2528235	2528243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642367
48523	NC_002505	TTGG	2	8	2528292	2528299	0 %	50 %	50 %	0 %	15642367
48524	NC_002505	GCG	2	6	2528317	2528322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642367
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48526	NC_002505	AATCG	2	10	2528634	2528643	40 %	20 %	20 %	20 %	15642367
48527	NC_002505	TCTCT	2	10	2528720	2528729	0 %	60 %	0 %	40 %	15642367
48528	NC_002505	TGT	2	6	2528744	2528749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642367
48529	NC_002505	CAT	2	6	2528762	2528767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642367
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48531	NC_002505	ACAG	2	8	2528834	2528841	50 %	0 %	25 %	25 %	15642367
48532	NC_002505	GGTT	2	8	2528957	2528964	0 %	50 %	50 %	0 %	15642367
48533	NC_002505	TAA	2	6	2528990	2528995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642367
48534	NC_002505	GC	3	6	2529027	2529032	0 %	0 %	50 %	50 %	15642367
48535	NC_002505	AGTG	2	8	2529040	2529047	25 %	25 %	50 %	0 %	15642367
48536	NC_002505	TTG	2	6	2529054	2529059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642367
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48539	NC_002505	CTG	2	6	2529211	2529216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642367
48540	NC_002505	CT	3	6	2529244	2529249	0 %	50 %	0 %	50 %	15642367
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48543	NC_002505	CAC	2	6	2529440	2529445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642367
48544	NC_002505	AG	3	6	2529486	2529491	50 %	0 %	50 %	0 %	15642367
48545	NC_002505	GCAT	2	8	2529500	2529507	25 %	25 %	25 %	25 %	15642367
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48548	NC_002505	ATT	2	6	2529567	2529572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48549	NC_002505	CTT	2	6	2529630	2529635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642368
48550	NC_002505	CCA	2	6	2529667	2529672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642368
48551	NC_002505	CAC	2	6	2529683	2529688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642368
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48553	NC_002505	GAT	2	6	2529732	2529737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642368
48554	NC_002505	ATC	2	6	2529764	2529769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642368
48555	NC_002505	TGC	2	6	2529843	2529848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642368
48556	NC_002505	GTG	2	6	2529914	2529919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642368
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48559	NC_002505	TGC	2	6	2530103	2530108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642368
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48561	NC_002505	CTT	2	6	2530188	2530193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642368
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48564	NC_002505	CCCG	2	8	2530295	2530302	0 %	0 %	25 %	75 %	15642368
48565	NC_002505	CTG	3	9	2530327	2530335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642368
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48577	NC_002505	AAACC	2	10	2530711	2530720	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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48585	NC_002505	AGGAC	2	10	2530972	2530981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48586	NC_002505	TGC	2	6	2531010	2531015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48601	NC_002505	TGA	4	12	2532043	2532054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642370
48602	NC_002505	GCGCC	2	10	2532095	2532104	0 %	0 %	40 %	60 %	15642370
48603	NC_002505	CGTC	2	8	2532210	2532217	0 %	25 %	25 %	50 %	15642370
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48617	NC_002505	GACC	2	8	2532977	2532984	25 %	0 %	25 %	50 %	15642370
48618	NC_002505	CGC	2	6	2533004	2533009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642370
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48741	NC_002505	GTG	2	6	2539439	2539444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642373
48742	NC_002505	GTG	2	6	2539463	2539468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642373
48743	NC_002505	GCT	2	6	2539511	2539516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642373
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48799	NC_002505	A	6	6	2542550	2542555	100 %	0 %	0 %	0 %	15642374
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48830	NC_002505	TCG	2	6	2543994	2543999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642375
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48832	NC_002505	TCGA	2	8	2544164	2544171	25 %	25 %	25 %	25 %	15642375
48833	NC_002505	AG	3	6	2544222	2544227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48834	NC_002505	CAT	2	6	2544244	2544249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48839	NC_002505	GCGG	2	8	2544461	2544468	0 %	0 %	75 %	25 %	15642376
48840	NC_002505	TGGC	2	8	2544567	2544574	0 %	25 %	50 %	25 %	15642376
48841	NC_002505	CGC	2	6	2544580	2544585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642376
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48844	NC_002505	TG	3	6	2544688	2544693	0 %	50 %	50 %	0 %	15642376
48845	NC_002505	GTT	2	6	2544737	2544742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642376
48846	NC_002505	TGG	2	6	2544804	2544809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642376
48847	NC_002505	CG	3	6	2544812	2544817	0 %	0 %	50 %	50 %	15642376
48848	NC_002505	GCC	2	6	2544875	2544880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642376
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48850	NC_002505	CTG	3	9	2545013	2545021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642377
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48852	NC_002505	CTG	2	6	2545073	2545078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642377
48853	NC_002505	AC	3	6	2545092	2545097	50 %	0 %	0 %	50 %	15642377
48854	NC_002505	TGA	2	6	2545146	2545151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642377
48855	NC_002505	CGA	2	6	2545158	2545163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642377
48856	NC_002505	CTT	2	6	2545169	2545174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642377
48857	NC_002505	GCT	3	9	2545222	2545230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642377
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