MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_002505	GGT	2	6	2449787	2449792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642293
47003	NC_002505	GAT	2	6	2449851	2449856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642293
47004	NC_002505	CCA	2	6	2449886	2449891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642293
47005	NC_002505	CAC	2	6	2449941	2449946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642293
47006	NC_002505	CCACG	2	10	2450037	2450046	20 %	0 %	20 %	60 %	15642293
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47009	NC_002505	ATCGC	2	10	2450395	2450404	20 %	20 %	20 %	40 %	15642293
47010	NC_002505	ATTG	2	8	2450420	2450427	25 %	50 %	25 %	0 %	15642293
47011	NC_002505	TCA	2	6	2450455	2450460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642293
47012	NC_002505	GAA	2	6	2450486	2450491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642293
47013	NC_002505	CAC	2	6	2450501	2450506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642293
47014	NC_002505	GATT	2	8	2450507	2450514	25 %	50 %	25 %	0 %	15642293
47015	NC_002505	TTC	2	6	2450560	2450565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642293
47016	NC_002505	T	7	7	2450589	2450595	0 %	100 %	0 %	0 %	15642293
47017	NC_002505	TCA	2	6	2450599	2450604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642293
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47019	NC_002505	CAAG	2	8	2450651	2450658	50 %	0 %	25 %	25 %	15642293
47020	NC_002505	T	6	6	2450664	2450669	0 %	100 %	0 %	0 %	15642293
47021	NC_002505	T	6	6	2450731	2450736	0 %	100 %	0 %	0 %	15642293
47022	NC_002505	ACT	2	6	2450758	2450763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642293
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47024	NC_002505	TTGT	2	8	2450873	2450880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47025	NC_002505	ATC	2	6	2451059	2451064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47026	NC_002505	TGAC	2	8	2451118	2451125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47027	NC_002505	TAA	2	6	2451185	2451190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47028	NC_002505	C	6	6	2451254	2451259	0 %	0 %	0 %	100 %	15642294
47029	NC_002505	TGC	2	6	2451296	2451301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642294
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47031	NC_002505	TCAC	2	8	2451419	2451426	25 %	25 %	0 %	50 %	15642294
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47036	NC_002505	AAC	2	6	2451835	2451840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237099
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47039	NC_002505	GCA	2	6	2451977	2451982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237099
47040	NC_002505	CAGTT	2	10	2451997	2452006	20 %	40 %	20 %	20 %	471237099
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47042	NC_002505	ATG	2	6	2452033	2452038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237099
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47045	NC_002505	TGA	2	6	2452496	2452501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237099
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47052	NC_002505	A	6	6	2452707	2452712	100 %	0 %	0 %	0 %	471237099
47053	NC_002505	CAA	2	6	2452805	2452810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237099
47054	NC_002505	TG	3	6	2452858	2452863	0 %	50 %	50 %	0 %	471237099
47055	NC_002505	A	6	6	2452892	2452897	100 %	0 %	0 %	0 %	15642296
47056	NC_002505	TTAC	2	8	2452922	2452929	25 %	50 %	0 %	25 %	15642296
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47059	NC_002505	ATGG	2	8	2453252	2453259	25 %	25 %	50 %	0 %	15642296
47060	NC_002505	CAG	2	6	2453495	2453500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642297
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47065	NC_002505	A	6	6	2453911	2453916	100 %	0 %	0 %	0 %	15642297
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47067	NC_002505	ATC	2	6	2454043	2454048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47068	NC_002505	ATTG	2	8	2454184	2454191	25 %	50 %	25 %	0 %	15642298
47069	NC_002505	CTGG	2	8	2454204	2454211	0 %	25 %	50 %	25 %	15642298
47070	NC_002505	GT	3	6	2454258	2454263	0 %	50 %	50 %	0 %	15642298
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47075	NC_002505	GTC	2	6	2454563	2454568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642298
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47087	NC_002505	TGG	2	6	2455054	2455059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642298
47088	NC_002505	CT	3	6	2455137	2455142	0 %	50 %	0 %	50 %	15642298
47089	NC_002505	TCG	2	6	2455143	2455148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642298
47090	NC_002505	ACTTC	2	10	2455152	2455161	20 %	40 %	0 %	40 %	15642298
47091	NC_002505	TCCT	2	8	2455187	2455194	0 %	50 %	0 %	50 %	15642298
47092	NC_002505	GTG	2	6	2455287	2455292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642298
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47101	NC_002505	CTG	2	6	2455883	2455888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642299
47102	NC_002505	TGC	2	6	2455992	2455997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642299
47103	NC_002505	AATCG	2	10	2456009	2456018	40 %	20 %	20 %	20 %	15642299
47104	NC_002505	AGA	2	6	2456057	2456062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642299
47105	NC_002505	AGACGT	2	12	2456273	2456284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15642300
47106	NC_002505	TCT	2	6	2456342	2456347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642300
47107	NC_002505	TGC	2	6	2456369	2456374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642300
47108	NC_002505	TCA	2	6	2456403	2456408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642300
47109	NC_002505	AGG	2	6	2456458	2456463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642300
47110	NC_002505	AAT	2	6	2456466	2456471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642300
47111	NC_002505	ATC	2	6	2456485	2456490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642300
47112	NC_002505	GA	3	6	2456575	2456580	50 %	0 %	50 %	0 %	15642300
47113	NC_002505	TCA	2	6	2456676	2456681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642300
47114	NC_002505	TG	3	6	2456732	2456737	0 %	50 %	50 %	0 %	15642300
47115	NC_002505	GGC	2	6	2456778	2456783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642300
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47117	NC_002505	CAT	2	6	2457039	2457044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642301
47118	NC_002505	A	6	6	2457046	2457051	100 %	0 %	0 %	0 %	15642301
47119	NC_002505	CTTGG	2	10	2457141	2457150	0 %	40 %	40 %	20 %	15642301
47120	NC_002505	ACTGT	2	10	2457165	2457174	20 %	40 %	20 %	20 %	15642301
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47122	NC_002505	CGA	2	6	2457234	2457239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642301
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47136	NC_002505	CTT	2	6	2457823	2457828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47233	NC_002505	ATCA	2	8	2462573	2462580	50 %	25 %	0 %	25 %	15642309
47234	NC_002505	GC	3	6	2462603	2462608	0 %	0 %	50 %	50 %	15642309
47235	NC_002505	ACC	2	6	2462636	2462641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642309
47236	NC_002505	CA	4	8	2462651	2462658	50 %	0 %	0 %	50 %	15642309
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47238	NC_002505	GTTG	2	8	2462722	2462729	0 %	50 %	50 %	0 %	15642309
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47359	NC_002505	CAAG	2	8	2469438	2469445	50 %	0 %	25 %	25 %	15642318
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47477	NC_002505	GCG	2	6	2475096	2475101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642320
47478	NC_002505	CGCA	2	8	2475259	2475266	25 %	0 %	25 %	50 %	15642320
47479	NC_002505	GGC	2	6	2475284	2475289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642320
47480	NC_002505	TGC	2	6	2475330	2475335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642320
47481	NC_002505	CCA	2	6	2475477	2475482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642320
47482	NC_002505	T	6	6	2475555	2475560	0 %	100 %	0 %	0 %	15642320
47483	NC_002505	ATC	2	6	2475583	2475588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642320
47484	NC_002505	AGC	2	6	2475638	2475643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642320
47485	NC_002505	CTT	2	6	2475678	2475683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642320
47486	NC_002505	GCGCT	2	10	2475692	2475701	0 %	20 %	40 %	40 %	15642320
47487	NC_002505	TTGG	2	8	2475919	2475926	0 %	50 %	50 %	0 %	15642320
47488	NC_002505	TGC	2	6	2475956	2475961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642320
47489	NC_002505	TCA	2	6	2475967	2475972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642320
47490	NC_002505	A	6	6	2476010	2476015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47491	NC_002505	AT	3	6	2476034	2476039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47494	NC_002505	GGC	2	6	2476084	2476089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47495	NC_002505	AGTG	2	8	2476091	2476098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47496	NC_002505	GAAC	2	8	2476136	2476143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47497	NC_002505	CAC	3	9	2476250	2476258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642321
47498	NC_002505	TCCA	2	8	2476332	2476339	25 %	25 %	0 %	50 %	15642321
47499	NC_002505	GAT	2	6	2476445	2476450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642321
47500	NC_002505	TCA	2	6	2476456	2476461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642321

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