MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_002505	TTG	2	6	2397902	2397907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642243
46003	NC_002505	CG	3	6	2397960	2397965	0 %	0 %	50 %	50 %	15642243
46004	NC_002505	CG	3	6	2397985	2397990	0 %	0 %	50 %	50 %	15642243
46005	NC_002505	TCA	2	6	2398017	2398022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642243
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46008	NC_002505	TCA	2	6	2398171	2398176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642243
46009	NC_002505	TTCA	2	8	2398238	2398245	25 %	50 %	0 %	25 %	15642243
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46013	NC_002505	CAT	2	6	2398490	2398495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642243
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46016	NC_002505	CG	3	6	2398584	2398589	0 %	0 %	50 %	50 %	15642243
46017	NC_002505	GC	3	6	2398628	2398633	0 %	0 %	50 %	50 %	15642243
46018	NC_002505	CACC	2	8	2398660	2398667	25 %	0 %	0 %	75 %	15642243
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46054	NC_002505	TAGA	2	8	2400683	2400690	50 %	25 %	25 %	0 %	15642243
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46107	NC_002505	AAT	2	6	2403176	2403181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46115	NC_002505	ATG	2	6	2403702	2403707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642246
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46118	NC_002505	ATC	2	6	2403954	2403959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642246
46119	NC_002505	ACG	2	6	2404047	2404052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642247
46120	NC_002505	TTCAAC	2	12	2404065	2404076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642247
46121	NC_002505	TCA	2	6	2404120	2404125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642247
46122	NC_002505	CTT	2	6	2404310	2404315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642247
46123	NC_002505	ATCA	2	8	2404332	2404339	50 %	25 %	0 %	25 %	15642247
46124	NC_002505	AGT	2	6	2404404	2404409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642247
46125	NC_002505	TCA	2	6	2404415	2404420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642247
46126	NC_002505	CCA	2	6	2404747	2404752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642248
46127	NC_002505	ATA	2	6	2404753	2404758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642248
46128	NC_002505	ACC	2	6	2404797	2404802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642248
46129	NC_002505	GAT	2	6	2404860	2404865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642248
46130	NC_002505	ATC	2	6	2404887	2404892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642248
46131	NC_002505	GC	3	6	2404895	2404900	0 %	0 %	50 %	50 %	15642248
46132	NC_002505	TGG	2	6	2404910	2404915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642248
46133	NC_002505	CAGC	2	8	2405134	2405141	25 %	0 %	25 %	50 %	15642248
46134	NC_002505	ACC	2	6	2405326	2405331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642248
46135	NC_002505	AAC	2	6	2405500	2405505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642248
46136	NC_002505	C	7	7	2405507	2405513	0 %	0 %	0 %	100 %	15642248
46137	NC_002505	TAG	2	6	2405519	2405524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642248
46138	NC_002505	AGTG	2	8	2405538	2405545	25 %	25 %	50 %	0 %	15642248
46139	NC_002505	ATT	2	6	2405561	2405566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642248
46140	NC_002505	TAA	2	6	2405576	2405581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642248
46141	NC_002505	CAGA	2	8	2405588	2405595	50 %	0 %	25 %	25 %	15642249
46142	NC_002505	CTT	2	6	2405651	2405656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642249
46143	NC_002505	TTC	2	6	2405668	2405673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642249
46144	NC_002505	ACG	2	6	2405721	2405726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642249
46145	NC_002505	CTT	2	6	2405909	2405914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642249
46146	NC_002505	GCT	2	6	2405992	2405997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642249
46147	NC_002505	CAT	2	6	2406012	2406017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642249
46148	NC_002505	TGA	2	6	2406018	2406023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642249
46149	NC_002505	AAT	2	6	2406030	2406035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642249
46150	NC_002505	GGCT	2	8	2406044	2406051	0 %	25 %	50 %	25 %	15642249
46151	NC_002505	TTC	2	6	2406094	2406099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642249
46152	NC_002505	GGTGAA	2	12	2406104	2406115	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15642250
46153	NC_002505	TTC	2	6	2406119	2406124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642250
46154	NC_002505	TCA	2	6	2406126	2406131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642250
46155	NC_002505	TTGG	2	8	2406225	2406232	0 %	50 %	50 %	0 %	15642250
46156	NC_002505	AAT	2	6	2406238	2406243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642250
46157	NC_002505	AGA	2	6	2406319	2406324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642250
46158	NC_002505	CTT	2	6	2406349	2406354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642250
46159	NC_002505	ATC	2	6	2406422	2406427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642250
46160	NC_002505	AGT	2	6	2406460	2406465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642250
46161	NC_002505	GCC	2	6	2406524	2406529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642250
46162	NC_002505	GCA	2	6	2406613	2406618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642250
46163	NC_002505	TGG	2	6	2406729	2406734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642250
46164	NC_002505	CCG	2	6	2406739	2406744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642250
46165	NC_002505	TTA	2	6	2406768	2406773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642250
46166	NC_002505	CAA	2	6	2406809	2406814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642250
46167	NC_002505	GCA	2	6	2406846	2406851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642250
46168	NC_002505	TTG	2	6	2406894	2406899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642250
46169	NC_002505	TCA	2	6	2406936	2406941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642250
46170	NC_002505	CAA	2	6	2406991	2406996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642250
46171	NC_002505	GCC	2	6	2407037	2407042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642250
46172	NC_002505	AAG	2	6	2407149	2407154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642250
46173	NC_002505	TTG	2	6	2407160	2407165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642250
46174	NC_002505	TTGAG	2	10	2407360	2407369	20 %	40 %	40 %	0 %	15642250
46175	NC_002505	TCA	2	6	2407410	2407415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642250
46176	NC_002505	TGT	2	6	2407423	2407428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642250
46177	NC_002505	ACC	2	6	2407482	2407487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642250
46178	NC_002505	TGC	2	6	2407497	2407502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642250
46179	NC_002505	TCA	3	9	2407506	2407514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642250
46180	NC_002505	CT	3	6	2407578	2407583	0 %	50 %	0 %	50 %	15642250
46181	NC_002505	CAC	2	6	2407672	2407677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642250
46182	NC_002505	TTCA	2	8	2407712	2407719	25 %	50 %	0 %	25 %	15642250
46183	NC_002505	CTT	2	6	2407742	2407747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642250
46184	NC_002505	GA	3	6	2407753	2407758	50 %	0 %	50 %	0 %	15642250
46185	NC_002505	TG	3	6	2407767	2407772	0 %	50 %	50 %	0 %	15642250
46186	NC_002505	AGTA	2	8	2407810	2407817	50 %	25 %	25 %	0 %	15642250
46187	NC_002505	CTT	2	6	2407850	2407855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642250
46188	NC_002505	ATC	2	6	2407862	2407867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642250
46189	NC_002505	CCA	2	6	2407880	2407885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642250
46190	NC_002505	ACC	2	6	2408034	2408039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642250
46191	NC_002505	GTA	2	6	2408072	2408077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642250
46192	NC_002505	TCT	2	6	2408082	2408087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642250
46193	NC_002505	CTC	2	6	2408174	2408179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642250
46194	NC_002505	TTG	2	6	2408190	2408195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642250
46195	NC_002505	TGA	2	6	2408308	2408313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642250
46196	NC_002505	CAA	2	6	2408366	2408371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642250
46197	NC_002505	CGC	2	6	2408372	2408377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642250
46198	NC_002505	TTC	2	6	2408509	2408514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642250
46199	NC_002505	ATCA	2	8	2408541	2408548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46200	NC_002505	ATG	2	6	2408595	2408600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642251
46201	NC_002505	CAC	2	6	2408602	2408607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642251
46202	NC_002505	ACA	2	6	2408677	2408682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642251
46203	NC_002505	ACC	2	6	2408687	2408692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642251
46204	NC_002505	GTT	2	6	2408787	2408792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642251
46205	NC_002505	ATT	2	6	2408828	2408833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642251
46206	NC_002505	CCA	2	6	2408848	2408853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642251
46207	NC_002505	T	6	6	2408858	2408863	0 %	100 %	0 %	0 %	15642251
46208	NC_002505	T	6	6	2408899	2408904	0 %	100 %	0 %	0 %	15642251
46209	NC_002505	GCTC	2	8	2409066	2409073	0 %	25 %	25 %	50 %	15642251
46210	NC_002505	TTG	2	6	2409125	2409130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642251
46211	NC_002505	TTCA	2	8	2409329	2409336	25 %	50 %	0 %	25 %	15642251
46212	NC_002505	CGG	2	6	2409349	2409354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642251
46213	NC_002505	CGG	2	6	2409658	2409663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642251
46214	NC_002505	CAT	2	6	2409667	2409672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642251
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46216	NC_002505	ATC	2	6	2409714	2409719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642251
46217	NC_002505	CGA	2	6	2409847	2409852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642251
46218	NC_002505	ATG	2	6	2409867	2409872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642251
46219	NC_002505	TGA	2	6	2410032	2410037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642252
46220	NC_002505	CATC	2	8	2410140	2410147	25 %	25 %	0 %	50 %	15642252
46221	NC_002505	GC	3	6	2410168	2410173	0 %	0 %	50 %	50 %	15642252
46222	NC_002505	TGC	2	6	2410199	2410204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642252
46223	NC_002505	GGAT	2	8	2410355	2410362	25 %	25 %	50 %	0 %	15642252
46224	NC_002505	ACGTG	2	10	2410381	2410390	20 %	20 %	40 %	20 %	15642252
46225	NC_002505	TCA	2	6	2410431	2410436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642252
46226	NC_002505	GCC	2	6	2410546	2410551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642252
46227	NC_002505	AATA	2	8	2410702	2410709	75 %	25 %	0 %	0 %	15642252
46228	NC_002505	CTT	2	6	2410731	2410736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642252
46229	NC_002505	AC	3	6	2410749	2410754	50 %	0 %	0 %	50 %	15642252
46230	NC_002505	CCG	2	6	2410770	2410775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642252
46231	NC_002505	TGG	2	6	2410779	2410784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642252
46232	NC_002505	CAA	2	6	2410803	2410808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642252
46233	NC_002505	GCC	2	6	2410811	2410816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642252
46234	NC_002505	CAT	2	6	2410830	2410835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642252
46235	NC_002505	TGC	2	6	2410924	2410929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642252
46236	NC_002505	GCC	2	6	2410959	2410964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642252
46237	NC_002505	CAA	2	6	2411016	2411021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642252
46238	NC_002505	CTG	2	6	2411029	2411034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642252
46239	NC_002505	AGC	2	6	2411145	2411150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46240	NC_002505	AGA	2	6	2411174	2411179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46241	NC_002505	GCC	2	6	2411227	2411232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642253
46242	NC_002505	TGC	2	6	2411250	2411255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642253
46243	NC_002505	GAT	2	6	2411332	2411337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642253
46244	NC_002505	CAG	2	6	2411338	2411343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642253
46245	NC_002505	AACC	2	8	2411394	2411401	50 %	0 %	0 %	50 %	15642253
46246	NC_002505	CCAGA	2	10	2411521	2411530	40 %	0 %	20 %	40 %	15642253
46247	NC_002505	AAC	2	6	2411597	2411602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642253
46248	NC_002505	AC	3	6	2411601	2411606	50 %	0 %	0 %	50 %	15642253
46249	NC_002505	GCA	2	6	2411619	2411624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642253
46250	NC_002505	CCA	2	6	2411719	2411724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642253
46251	NC_002505	ACC	2	6	2411812	2411817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642253
46252	NC_002505	TGGT	2	8	2411854	2411861	0 %	50 %	50 %	0 %	15642253
46253	NC_002505	ACT	2	6	2411900	2411905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642253
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46258	NC_002505	ACC	2	6	2412373	2412378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642254
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46260	NC_002505	GAC	2	6	2412557	2412562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642254
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46262	NC_002505	CCAT	2	8	2412709	2412716	25 %	25 %	0 %	50 %	15642254
46263	NC_002505	AGAT	2	8	2412756	2412763	50 %	25 %	25 %	0 %	15642254
46264	NC_002505	A	7	7	2412812	2412818	100 %	0 %	0 %	0 %	15642254
46265	NC_002505	TGC	2	6	2412824	2412829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46266	NC_002505	GCA	2	6	2412890	2412895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642255
46267	NC_002505	CAT	2	6	2412900	2412905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642255
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46270	NC_002505	TCT	2	6	2412968	2412973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642255
46271	NC_002505	GTT	2	6	2413009	2413014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642255
46272	NC_002505	ACG	2	6	2413021	2413026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642255
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46278	NC_002505	TTTCG	2	10	2413440	2413449	0 %	60 %	20 %	20 %	15642255
46279	NC_002505	TTCG	2	8	2413457	2413464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46280	NC_002505	ACGAC	2	10	2413516	2413525	40 %	0 %	20 %	40 %	15642256
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46283	NC_002505	TTCAAT	2	12	2413734	2413745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15642256
46284	NC_002505	GTA	2	6	2413771	2413776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642256
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46288	NC_002505	CATT	2	8	2413943	2413950	25 %	50 %	0 %	25 %	15642256
46289	NC_002505	CAA	2	6	2413979	2413984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642256
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46293	NC_002505	CAC	2	6	2414150	2414155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642256
46294	NC_002505	AG	3	6	2414222	2414227	50 %	0 %	50 %	0 %	15642256
46295	NC_002505	TCA	2	6	2414277	2414282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46296	NC_002505	CTT	2	6	2414415	2414420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642257
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46298	NC_002505	TTC	2	6	2414579	2414584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642257
46299	NC_002505	CAG	2	6	2414679	2414684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642257
46300	NC_002505	CGT	2	6	2414688	2414693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642257
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46310	NC_002505	AGC	2	6	2415088	2415093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642257
46311	NC_002505	AGC	2	6	2415097	2415102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642257
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46314	NC_002505	AGC	2	6	2415217	2415222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642257
46315	NC_002505	ATT	2	6	2415365	2415370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46316	NC_002505	CAG	2	6	2415401	2415406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642258
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46318	NC_002505	CGT	3	9	2415479	2415487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642258
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46336	NC_002505	GC	3	6	2416253	2416258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46337	NC_002505	TG	3	6	2416279	2416284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46338	NC_002505	A	6	6	2416290	2416295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46339	NC_002505	TCG	2	6	2416297	2416302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46341	NC_002505	TG	3	6	2416405	2416410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46342	NC_002505	A	6	6	2416469	2416474	100 %	0 %	0 %	0 %	15642259
46343	NC_002505	CAC	2	6	2416607	2416612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642259
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46346	NC_002505	CGTG	2	8	2416977	2416984	0 %	25 %	50 %	25 %	15642259
46347	NC_002505	GTG	2	6	2417032	2417037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642259
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46350	NC_002505	TGA	3	9	2417130	2417138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642259
46351	NC_002505	CCG	2	6	2417159	2417164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642259
46352	NC_002505	A	6	6	2417170	2417175	100 %	0 %	0 %	0 %	15642259
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46354	NC_002505	CTG	2	6	2417302	2417307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642259
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