MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_002505	CTG	2	6	2316970	2316975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
44503	NC_002505	CCT	2	6	2316976	2316981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642170
44504	NC_002505	GCC	2	6	2317030	2317035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642170
44505	NC_002505	TCG	2	6	2317079	2317084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
44506	NC_002505	T	6	6	2317159	2317164	0 %	100 %	0 %	0 %	15642170
44507	NC_002505	TCCTA	2	10	2317173	2317182	20 %	40 %	0 %	40 %	15642170
44508	NC_002505	GTC	2	6	2317225	2317230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
44509	NC_002505	GCG	2	6	2317237	2317242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642170
44510	NC_002505	GCTTG	2	10	2317255	2317264	0 %	40 %	40 %	20 %	15642170
44511	NC_002505	CAA	2	6	2317383	2317388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642170
44512	NC_002505	A	7	7	2317398	2317404	100 %	0 %	0 %	0 %	15642170
44513	NC_002505	GC	3	6	2317466	2317471	0 %	0 %	50 %	50 %	15642170
44514	NC_002505	AGTGA	2	10	2317489	2317498	40 %	20 %	40 %	0 %	15642170
44515	NC_002505	GGC	2	6	2317548	2317553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642170
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44517	NC_002505	CTG	2	6	2317597	2317602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
44518	NC_002505	TTCCGG	2	12	2317610	2317621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
44519	NC_002505	CAT	2	6	2317632	2317637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642170
44520	NC_002505	TGG	2	6	2317755	2317760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642170
44521	NC_002505	TCG	2	6	2317814	2317819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
44522	NC_002505	GAA	3	9	2317888	2317896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642170
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44524	NC_002505	TCT	2	6	2317986	2317991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44525	NC_002505	GC	3	6	2318024	2318029	0 %	0 %	50 %	50 %	15642171
44526	NC_002505	TCG	2	6	2318086	2318091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642171
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44529	NC_002505	C	7	7	2318156	2318162	0 %	0 %	0 %	100 %	15642171
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44533	NC_002505	GATG	2	8	2318407	2318414	25 %	25 %	50 %	0 %	15642171
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44535	NC_002505	GATT	2	8	2318443	2318450	25 %	50 %	25 %	0 %	15642171
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44538	NC_002505	TTA	2	6	2318593	2318598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44567	NC_002505	ATGGG	2	10	2320521	2320530	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44568	NC_002505	GC	3	6	2320548	2320553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44569	NC_002505	CGT	2	6	2320575	2320580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44573	NC_002505	ATAG	2	8	2320668	2320675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44574	NC_002505	GAAC	2	8	2320692	2320699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44581	NC_002505	CGA	3	9	2321113	2321121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642174
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44593	NC_002505	AGTG	2	8	2321856	2321863	25 %	25 %	50 %	0 %	15642175
44594	NC_002505	CCAA	2	8	2321930	2321937	50 %	0 %	0 %	50 %	15642175
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44608	NC_002505	A	6	6	2322615	2322620	100 %	0 %	0 %	0 %	15642176
44609	NC_002505	GAAT	2	8	2322689	2322696	50 %	25 %	25 %	0 %	15642176
44610	NC_002505	TGA	2	6	2322701	2322706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642176
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44615	NC_002505	AGCC	2	8	2323026	2323033	25 %	0 %	25 %	50 %	15642177
44616	NC_002505	A	6	6	2323044	2323049	100 %	0 %	0 %	0 %	15642177
44617	NC_002505	GCG	2	6	2323051	2323056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642177
44618	NC_002505	CGTG	2	8	2323057	2323064	0 %	25 %	50 %	25 %	15642177
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44855	NC_002505	GA	3	6	2334420	2334425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44856	NC_002505	TGG	2	6	2334438	2334443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44863	NC_002505	CCA	2	6	2334959	2334964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642187
44864	NC_002505	ACC	2	6	2334988	2334993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642187
44865	NC_002505	CAA	2	6	2335029	2335034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642187
44866	NC_002505	CTT	2	6	2335050	2335055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642187
44867	NC_002505	TCA	2	6	2335118	2335123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642187
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44871	NC_002505	GTT	2	6	2335230	2335235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642187
44872	NC_002505	ATC	2	6	2335267	2335272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642187
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44874	NC_002505	GTTCA	2	10	2335399	2335408	20 %	40 %	20 %	20 %	15642187
44875	NC_002505	TTCA	2	8	2335429	2335436	25 %	50 %	0 %	25 %	15642187
44876	NC_002505	ATTC	2	8	2335518	2335525	25 %	50 %	0 %	25 %	15642187
44877	NC_002505	TGA	2	6	2335669	2335674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642187
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44880	NC_002505	TGT	2	6	2336099	2336104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44881	NC_002505	ACTCA	2	10	2336130	2336139	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44882	NC_002505	TGC	2	6	2336338	2336343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642189
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44975	NC_002505	TTGA	2	8	2340817	2340824	25 %	50 %	25 %	0 %	15642192
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44980	NC_002505	CAA	2	6	2340968	2340973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642192
44981	NC_002505	GTT	2	6	2341005	2341010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642192
44982	NC_002505	CAA	2	6	2341013	2341018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642192
44983	NC_002505	CAC	2	6	2341056	2341061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642192
44984	NC_002505	CGG	2	6	2341226	2341231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642192
44985	NC_002505	GCA	2	6	2341286	2341291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642192
44986	NC_002505	GTT	2	6	2341374	2341379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642192
44987	NC_002505	CAG	2	6	2341437	2341442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642192
44988	NC_002505	CT	3	6	2341488	2341493	0 %	50 %	0 %	50 %	15642192
44989	NC_002505	ACA	2	6	2341497	2341502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642192
44990	NC_002505	A	6	6	2341578	2341583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44991	NC_002505	TTGG	2	8	2341614	2341621	0 %	50 %	50 %	0 %	15642193
44992	NC_002505	ATC	2	6	2341692	2341697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642193
44993	NC_002505	CGGA	2	8	2341698	2341705	25 %	0 %	50 %	25 %	15642193
44994	NC_002505	TCA	2	6	2341729	2341734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642193
44995	NC_002505	GCC	2	6	2341843	2341848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642193
44996	NC_002505	GCC	2	6	2341920	2341925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642193
44997	NC_002505	CAT	2	6	2341949	2341954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642193
44998	NC_002505	ATCCGC	2	12	2341968	2341979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15642193
44999	NC_002505	GCT	2	6	2341987	2341992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642193
45000	NC_002505	ATG	2	6	2342020	2342025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642193

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