MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_002505	GCT	2	6	2291164	2291169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642135
44002	NC_002505	CAT	2	6	2291170	2291175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642135
44003	NC_002505	CT	3	6	2291179	2291184	0 %	50 %	0 %	50 %	15642135
44004	NC_002505	CAA	2	6	2291196	2291201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642135
44005	NC_002505	TTAA	2	8	2291254	2291261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_002505	AT	3	6	2291267	2291272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44007	NC_002505	TGT	2	6	2291298	2291303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44008	NC_002505	TCT	2	6	2291313	2291318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642136
44009	NC_002505	GGT	2	6	2291326	2291331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642136
44010	NC_002505	C	7	7	2291370	2291376	0 %	0 %	0 %	100 %	15642136
44011	NC_002505	TGA	2	6	2291397	2291402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642136
44012	NC_002505	GCG	2	6	2291463	2291468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642136
44013	NC_002505	TCT	2	6	2291513	2291518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642136
44014	NC_002505	GCTCTT	2	12	2291544	2291555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15642136
44015	NC_002505	CTGG	2	8	2291580	2291587	0 %	25 %	50 %	25 %	15642136
44016	NC_002505	CAT	2	6	2291719	2291724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642136
44017	NC_002505	TCA	2	6	2291784	2291789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642136
44018	NC_002505	TCA	2	6	2291813	2291818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642136
44019	NC_002505	GTA	2	6	2291866	2291871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642136
44020	NC_002505	ATC	2	6	2291900	2291905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642136
44021	NC_002505	GCA	2	6	2291994	2291999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642136
44022	NC_002505	GCA	2	6	2292003	2292008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642136
44023	NC_002505	GCC	2	6	2292061	2292066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642136
44024	NC_002505	CAC	2	6	2292168	2292173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642136
44025	NC_002505	CTT	2	6	2292237	2292242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642136
44026	NC_002505	TCAA	2	8	2292299	2292306	50 %	25 %	0 %	25 %	15642136
44027	NC_002505	CTT	2	6	2292315	2292320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642136
44028	NC_002505	CAA	2	6	2292339	2292344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642136
44029	NC_002505	TGCG	2	8	2292366	2292373	0 %	25 %	50 %	25 %	15642136
44030	NC_002505	TTC	2	6	2292487	2292492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642136
44031	NC_002505	GCT	2	6	2292504	2292509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642136
44032	NC_002505	CACC	2	8	2292602	2292609	25 %	0 %	0 %	75 %	15642136
44033	NC_002505	AGT	2	6	2292731	2292736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642136
44034	NC_002505	ATT	2	6	2292761	2292766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642136
44035	NC_002505	TAT	2	6	2292773	2292778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642136
44036	NC_002505	AAG	2	6	2292779	2292784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44037	NC_002505	CAT	2	6	2292805	2292810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44038	NC_002505	CAA	2	6	2292872	2292877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44039	NC_002505	A	7	7	2292876	2292882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_002505	TAGT	2	8	2292893	2292900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44041	NC_002505	TTCTA	2	10	2292904	2292913	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44042	NC_002505	GAT	2	6	2293060	2293065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642137
44043	NC_002505	CAT	2	6	2293074	2293079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642137
44044	NC_002505	AGC	2	6	2293188	2293193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642137
44045	NC_002505	ATG	2	6	2293205	2293210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642137
44046	NC_002505	TGC	2	6	2293259	2293264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642137
44047	NC_002505	GCC	2	6	2293268	2293273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642137
44048	NC_002505	T	6	6	2293366	2293371	0 %	100 %	0 %	0 %	15642137
44049	NC_002505	ATTT	2	8	2293435	2293442	25 %	75 %	0 %	0 %	15642138
44050	NC_002505	CGC	2	6	2293475	2293480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642138
44051	NC_002505	GTT	2	6	2293507	2293512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642138
44052	NC_002505	AAG	2	6	2293655	2293660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642138
44053	NC_002505	TTG	2	6	2293670	2293675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642138
44054	NC_002505	ACC	2	6	2293716	2293721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642138
44055	NC_002505	TCA	2	6	2293730	2293735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642138
44056	NC_002505	CGG	2	6	2293822	2293827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642139
44057	NC_002505	GA	3	6	2293830	2293835	50 %	0 %	50 %	0 %	15642139
44058	NC_002505	GTC	2	6	2293842	2293847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642139
44059	NC_002505	TTCA	2	8	2293866	2293873	25 %	50 %	0 %	25 %	15642139
44060	NC_002505	GCC	2	6	2293959	2293964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642139
44061	NC_002505	A	6	6	2293965	2293970	100 %	0 %	0 %	0 %	15642139
44062	NC_002505	GTT	2	6	2293989	2293994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642139
44063	NC_002505	AGCAT	2	10	2294011	2294020	40 %	20 %	20 %	20 %	15642139
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44065	NC_002505	TCAG	2	8	2294065	2294072	25 %	25 %	25 %	25 %	15642139
44066	NC_002505	GTTAA	2	10	2294335	2294344	40 %	40 %	20 %	0 %	15642139
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44068	NC_002505	GTT	2	6	2294370	2294375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642139
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44073	NC_002505	CGC	2	6	2294592	2294597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642139
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44084	NC_002505	GGC	2	6	2295006	2295011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642139
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44091	NC_002505	CT	3	6	2295558	2295563	0 %	50 %	0 %	50 %	15642139
44092	NC_002505	TGC	2	6	2295622	2295627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642139
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44101	NC_002505	TGC	2	6	2296018	2296023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642140
44102	NC_002505	TTAC	2	8	2296240	2296247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44103	NC_002505	CTG	2	6	2296336	2296341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642141
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44108	NC_002505	ACCG	2	8	2296690	2296697	25 %	0 %	25 %	50 %	15642141
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44112	NC_002505	GCCTT	2	10	2296853	2296862	0 %	40 %	20 %	40 %	15642141
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44118	NC_002505	CG	3	6	2297068	2297073	0 %	0 %	50 %	50 %	15642141
44119	NC_002505	GAA	2	6	2297081	2297086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642141
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44125	NC_002505	TC	3	6	2297469	2297474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44126	NC_002505	AAAT	2	8	2297493	2297500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44234	NC_002505	TGA	2	6	2303638	2303643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642151
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44239	NC_002505	CGC	2	6	2303887	2303892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642151
44240	NC_002505	C	7	7	2303923	2303929	0 %	0 %	0 %	100 %	15642151
44241	NC_002505	CGC	2	6	2304050	2304055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642151
44242	NC_002505	ACT	2	6	2304142	2304147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642151
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44245	NC_002505	CCA	2	6	2304279	2304284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642151
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44248	NC_002505	ATC	2	6	2304357	2304362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642151
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44251	NC_002505	CAAG	2	8	2304486	2304493	50 %	0 %	25 %	25 %	15642152
44252	NC_002505	GCT	2	6	2304594	2304599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642152
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44254	NC_002505	AC	3	6	2304629	2304634	50 %	0 %	0 %	50 %	15642152
44255	NC_002505	GTC	2	6	2304692	2304697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642152
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44258	NC_002505	T	6	6	2304840	2304845	0 %	100 %	0 %	0 %	15642152
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44268	NC_002505	CTT	2	6	2305346	2305351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44269	NC_002505	CTT	2	6	2305360	2305365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44270	NC_002505	CCA	2	6	2305368	2305373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44271	NC_002505	CTG	2	6	2305374	2305379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44288	NC_002505	TAA	2	6	2306435	2306440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44289	NC_002505	CAAT	2	8	2306526	2306533	50 %	25 %	0 %	25 %	15642156
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44293	NC_002505	CGC	2	6	2306623	2306628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642156
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44310	NC_002505	A	7	7	2307360	2307366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44311	NC_002505	TCG	2	6	2307467	2307472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44323	NC_002505	A	6	6	2308237	2308242	100 %	0 %	0 %	0 %	15642159
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44326	NC_002505	GAG	2	6	2308734	2308739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44331	NC_002505	TCAT	2	8	2309002	2309009	25 %	50 %	0 %	25 %	15642160
44332	NC_002505	GCA	2	6	2309011	2309016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642160
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44335	NC_002505	CG	5	10	2309145	2309154	0 %	0 %	50 %	50 %	15642160
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44339	NC_002505	TCAC	2	8	2309317	2309324	25 %	25 %	0 %	50 %	15642160
44340	NC_002505	TCA	2	6	2309350	2309355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
44341	NC_002505	AGCCGC	2	12	2309364	2309375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15642160
44342	NC_002505	GCT	2	6	2309441	2309446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
44343	NC_002505	CTG	2	6	2309460	2309465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
44344	NC_002505	CATG	2	8	2309516	2309523	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
44345	NC_002505	TCA	2	6	2309702	2309707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
44346	NC_002505	ATC	2	6	2309787	2309792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
44347	NC_002505	CGAT	2	8	2309807	2309814	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
44348	NC_002505	CCA	2	6	2309819	2309824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642160
44349	NC_002505	CTT	2	6	2309909	2309914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642160
44350	NC_002505	ACTG	2	8	2309936	2309943	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
44351	NC_002505	TCG	2	6	2309996	2310001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
44352	NC_002505	TGA	2	6	2310002	2310007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642160
44353	NC_002505	CAA	2	6	2310089	2310094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642160
44354	NC_002505	CTG	2	6	2310102	2310107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
44355	NC_002505	GAT	3	9	2310129	2310137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642160
44356	NC_002505	CTTT	2	8	2310180	2310187	0 %	75 %	0 %	25 %	15642160
44357	NC_002505	CAT	3	9	2310251	2310259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
44358	NC_002505	GTTG	2	8	2310357	2310364	0 %	50 %	50 %	0 %	15642160
44359	NC_002505	CAG	2	6	2310522	2310527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642160
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44362	NC_002505	TTCTG	2	10	2310600	2310609	0 %	60 %	20 %	20 %	15642160
44363	NC_002505	CT	4	8	2310682	2310689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44364	NC_002505	A	6	6	2310733	2310738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44365	NC_002505	T	6	6	2310754	2310759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44392	NC_002505	TTC	2	6	2312261	2312266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44465	NC_002505	AG	3	6	2315306	2315311	50 %	0 %	50 %	0 %	15642167
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44474	NC_002505	TCA	2	6	2315713	2315718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642167
44475	NC_002505	ATC	2	6	2315719	2315724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642167
44476	NC_002505	GCAC	2	8	2315836	2315843	25 %	0 %	25 %	50 %	15642167
44477	NC_002505	TCGG	2	8	2315857	2315864	0 %	25 %	50 %	25 %	15642167
44478	NC_002505	GCC	2	6	2315901	2315906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642167
44479	NC_002505	CAT	2	6	2315936	2315941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642167
44480	NC_002505	CTT	2	6	2316056	2316061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642167
44481	NC_002505	CCA	2	6	2316062	2316067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642167
44482	NC_002505	TGC	2	6	2316139	2316144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642167
44483	NC_002505	GC	3	6	2316143	2316148	0 %	0 %	50 %	50 %	15642167
44484	NC_002505	TTG	2	6	2316183	2316188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642167
44485	NC_002505	CAT	2	6	2316242	2316247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642167
44486	NC_002505	CTT	2	6	2316287	2316292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642167
44487	NC_002505	CGC	3	9	2316309	2316317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642167
44488	NC_002505	TGC	2	6	2316331	2316336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642167
44489	NC_002505	CAT	2	6	2316408	2316413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642167
44490	NC_002505	CATAC	2	10	2316432	2316441	40 %	20 %	0 %	40 %	15642167
44491	NC_002505	ACG	2	6	2316460	2316465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44492	NC_002505	CGT	2	6	2316541	2316546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44493	NC_002505	AAT	2	6	2316561	2316566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44494	NC_002505	TTTA	2	8	2316631	2316638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44495	NC_002505	GC	3	6	2316674	2316679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44496	NC_002505	CGC	2	6	2316796	2316801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642170
44497	NC_002505	CTT	2	6	2316824	2316829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642170
44498	NC_002505	TAT	2	6	2316846	2316851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642170
44499	NC_002505	ATT	2	6	2316934	2316939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642170
44500	NC_002505	GTG	2	6	2316947	2316952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642170

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