MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_002505	GAT	2	6	2265362	2265367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642108
43502	NC_002505	CCG	2	6	2265382	2265387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642108
43503	NC_002505	TAAG	2	8	2265428	2265435	50 %	25 %	25 %	0 %	15642108
43504	NC_002505	TCA	2	6	2265460	2265465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642108
43505	NC_002505	GCTT	2	8	2265472	2265479	0 %	50 %	25 %	25 %	15642108
43506	NC_002505	AGC	2	6	2265493	2265498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642108
43507	NC_002505	ATGCCA	2	12	2265505	2265516	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642108
43508	NC_002505	GAT	2	6	2265558	2265563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642108
43509	NC_002505	TGC	3	9	2265595	2265603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642108
43510	NC_002505	GCC	2	6	2265664	2265669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642108
43511	NC_002505	GAA	2	6	2265672	2265677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642108
43512	NC_002505	CT	3	6	2265687	2265692	0 %	50 %	0 %	50 %	15642108
43513	NC_002505	CGCGGT	2	12	2265723	2265734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15642108
43514	NC_002505	ATCA	2	8	2265816	2265823	50 %	25 %	0 %	25 %	15642108
43515	NC_002505	ATC	2	6	2265825	2265830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642108
43516	NC_002505	TCA	2	6	2265907	2265912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642108
43517	NC_002505	CGA	2	6	2266001	2266006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43518	NC_002505	GCC	2	6	2266012	2266017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43519	NC_002505	T	6	6	2266142	2266147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43520	NC_002505	ACC	2	6	2266169	2266174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43521	NC_002505	GTC	2	6	2266200	2266205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43522	NC_002505	GTG	2	6	2266295	2266300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43523	NC_002505	GCC	2	6	2266394	2266399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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43525	NC_002505	AATC	2	8	2266471	2266478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43526	NC_002505	CGA	2	6	2266573	2266578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43527	NC_002505	CG	3	6	2266600	2266605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43528	NC_002505	ACC	2	6	2266631	2266636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43529	NC_002505	GCC	4	12	2266639	2266650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43530	NC_002505	TGG	2	6	2266719	2266724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43532	NC_002505	CAC	3	9	2266776	2266784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43533	NC_002505	AGT	2	6	2266875	2266880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43535	NC_002505	AGA	2	6	2267014	2267019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43536	NC_002505	CCA	2	6	2267024	2267029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43537	NC_002505	CGAT	2	8	2267156	2267163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43538	NC_002505	TTC	2	6	2267167	2267172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43539	NC_002505	GATT	2	8	2267175	2267182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43540	NC_002505	CTT	2	6	2267277	2267282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43541	NC_002505	GTT	2	6	2267287	2267292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_002505	ATA	2	6	2267306	2267311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_002505	TGA	2	6	2267322	2267327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43544	NC_002505	TAT	2	6	2267351	2267356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43545	NC_002505	GAT	2	6	2267370	2267375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43546	NC_002505	GAA	2	6	2267379	2267384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43547	NC_002505	ACG	2	6	2267501	2267506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642109
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43552	NC_002505	GGCT	2	8	2268096	2268103	0 %	25 %	50 %	25 %	15642109
43553	NC_002505	CCG	2	6	2268108	2268113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642109
43554	NC_002505	TTGA	2	8	2268118	2268125	25 %	50 %	25 %	0 %	15642109
43555	NC_002505	CAT	2	6	2268267	2268272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642109
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43557	NC_002505	GCCT	2	8	2268444	2268451	0 %	25 %	25 %	50 %	15642109
43558	NC_002505	GCG	2	6	2268481	2268486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642109
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43561	NC_002505	GGCT	2	8	2268679	2268686	0 %	25 %	50 %	25 %	15642109
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43564	NC_002505	GT	3	6	2268840	2268845	0 %	50 %	50 %	0 %	15642109
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43574	NC_002505	CA	3	6	2269467	2269472	50 %	0 %	0 %	50 %	15642109
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43587	NC_002505	T	7	7	2270153	2270159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43588	NC_002505	GTT	2	6	2270165	2270170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43589	NC_002505	AAC	2	6	2270182	2270187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43590	NC_002505	TGGTT	2	10	2270288	2270297	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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43593	NC_002505	GC	3	6	2270365	2270370	0 %	0 %	50 %	50 %	15642111
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43603	NC_002505	GGT	2	6	2270999	2271004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642112
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43605	NC_002505	TAAA	2	8	2271027	2271034	75 %	25 %	0 %	0 %	15642112
43606	NC_002505	CGC	2	6	2271044	2271049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642112
43607	NC_002505	T	6	6	2271169	2271174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43608	NC_002505	TCACCT	2	12	2271272	2271283	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43609	NC_002505	A	6	6	2271287	2271292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43610	NC_002505	ACT	2	6	2271350	2271355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43611	NC_002505	GTAG	2	8	2271363	2271370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43612	NC_002505	CGC	2	6	2271424	2271429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43613	NC_002505	TA	3	6	2271460	2271465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43614	NC_002505	CTG	2	6	2271470	2271475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43616	NC_002505	CGG	2	6	2271526	2271531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642114
43617	NC_002505	GCCG	2	8	2271555	2271562	0 %	0 %	50 %	50 %	15642114
43618	NC_002505	GGT	2	6	2271618	2271623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642114
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43622	NC_002505	TGC	2	6	2271883	2271888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642114
43623	NC_002505	ACC	2	6	2271908	2271913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642114
43624	NC_002505	CTTG	2	8	2271977	2271984	0 %	50 %	25 %	25 %	15642114
43625	NC_002505	TGG	2	6	2272024	2272029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642114
43626	NC_002505	CGG	2	6	2272123	2272128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642114
43627	NC_002505	GCA	2	6	2272247	2272252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642115
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43630	NC_002505	GAC	2	6	2272325	2272330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642115
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43638	NC_002505	TGC	2	6	2272843	2272848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642115
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43640	NC_002505	CGC	2	6	2272872	2272877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642115
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43642	NC_002505	TGA	2	6	2272945	2272950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642115
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43644	NC_002505	AC	3	6	2273069	2273074	50 %	0 %	0 %	50 %	15642115
43645	NC_002505	AG	3	6	2273076	2273081	50 %	0 %	50 %	0 %	15642115
43646	NC_002505	GGT	2	6	2273112	2273117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642115
43647	NC_002505	CGA	2	6	2273137	2273142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642115
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43650	NC_002505	CAC	2	6	2273421	2273426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43651	NC_002505	A	6	6	2273461	2273466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43652	NC_002505	TCA	2	6	2273506	2273511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43654	NC_002505	CAT	2	6	2273635	2273640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642117
43655	NC_002505	CA	3	6	2273664	2273669	50 %	0 %	0 %	50 %	15642117
43656	NC_002505	GCA	2	6	2273747	2273752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642117
43657	NC_002505	CTTCTG	2	12	2273970	2273981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15642117
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43729	NC_002505	TGGA	2	8	2278059	2278066	25 %	25 %	50 %	0 %	15642122
43730	NC_002505	AGCG	2	8	2278096	2278103	25 %	0 %	50 %	25 %	15642122
43731	NC_002505	AGC	2	6	2278127	2278132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642122
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43858	NC_002505	ACC	2	6	2283948	2283953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642129
43859	NC_002505	CAACC	2	10	2284028	2284037	40 %	0 %	0 %	60 %	15642129
43860	NC_002505	TCA	2	6	2284066	2284071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642129
43861	NC_002505	ACCG	2	8	2284133	2284140	25 %	0 %	25 %	50 %	15642129
43862	NC_002505	ATCA	2	8	2284286	2284293	50 %	25 %	0 %	25 %	15642129
43863	NC_002505	CAG	2	6	2284301	2284306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642129
43864	NC_002505	CAGG	2	8	2284318	2284325	25 %	0 %	50 %	25 %	15642129
43865	NC_002505	GAT	2	6	2284373	2284378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642129
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43868	NC_002505	GCTAAC	2	12	2284590	2284601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642129
43869	NC_002505	CGC	2	6	2284717	2284722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642130
43870	NC_002505	GGCT	2	8	2284730	2284737	0 %	25 %	50 %	25 %	15642130
43871	NC_002505	AAT	2	6	2284793	2284798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642130
43872	NC_002505	TCT	2	6	2284806	2284811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642130
43873	NC_002505	GGTT	2	8	2284894	2284901	0 %	50 %	50 %	0 %	15642130
43874	NC_002505	CAC	2	6	2284916	2284921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642130
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43877	NC_002505	CTT	2	6	2285089	2285094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642130
43878	NC_002505	TTG	2	6	2285177	2285182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642130
43879	NC_002505	TCT	2	6	2285208	2285213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642130
43880	NC_002505	CGA	2	6	2285230	2285235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642130
43881	NC_002505	CAT	2	6	2285359	2285364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642130
43882	NC_002505	CTTT	2	8	2285390	2285397	0 %	75 %	0 %	25 %	15642130
43883	NC_002505	GCA	2	6	2285424	2285429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642130
43884	NC_002505	TCA	2	6	2285445	2285450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43885	NC_002505	AAT	2	6	2285452	2285457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43886	NC_002505	TCG	2	6	2285510	2285515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43887	NC_002505	CCG	2	6	2285519	2285524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43888	NC_002505	ACG	2	6	2285554	2285559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642131
43889	NC_002505	TCA	2	6	2285637	2285642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642131
43890	NC_002505	CAG	2	6	2285646	2285651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642131
43891	NC_002505	TCT	2	6	2285676	2285681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642131
43892	NC_002505	GCA	2	6	2285742	2285747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642131
43893	NC_002505	TCG	2	6	2285765	2285770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642131
43894	NC_002505	TTCC	2	8	2285844	2285851	0 %	50 %	0 %	50 %	15642131
43895	NC_002505	TGT	3	9	2285868	2285876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642131
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43898	NC_002505	CCA	2	6	2285912	2285917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642131
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43906	NC_002505	TTTGG	2	10	2286343	2286352	0 %	60 %	40 %	0 %	15642131
43907	NC_002505	ACCC	2	8	2286382	2286389	25 %	0 %	0 %	75 %	15642131
43908	NC_002505	ATG	2	6	2286419	2286424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642131
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43918	NC_002505	CCG	2	6	2286769	2286774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642132
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43921	NC_002505	CAA	2	6	2286898	2286903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642132
43922	NC_002505	TTGAG	2	10	2287003	2287012	20 %	40 %	40 %	0 %	15642132
43923	NC_002505	TGG	2	6	2287138	2287143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642132
43924	NC_002505	CTT	2	6	2287168	2287173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642132
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43926	NC_002505	GGTT	2	8	2287251	2287258	0 %	50 %	50 %	0 %	15642132
43927	NC_002505	GT	3	6	2287312	2287317	0 %	50 %	50 %	0 %	15642132
43928	NC_002505	TGGC	2	8	2287330	2287337	0 %	25 %	50 %	25 %	15642132
43929	NC_002505	CTT	3	9	2287465	2287473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642132
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43932	NC_002505	CTGAG	2	10	2287531	2287540	20 %	20 %	40 %	20 %	15642132
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43936	NC_002505	AACA	2	8	2287700	2287707	75 %	0 %	0 %	25 %	15642132
43937	NC_002505	GCAA	2	8	2287725	2287732	50 %	0 %	25 %	25 %	15642132
43938	NC_002505	TCG	2	6	2287860	2287865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642132
43939	NC_002505	CG	3	6	2287892	2287897	0 %	0 %	50 %	50 %	15642132
43940	NC_002505	TGT	2	6	2287918	2287923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642132
43941	NC_002505	TTC	2	6	2288009	2288014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642132
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43943	NC_002505	CAGTAC	2	12	2288102	2288113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642132
43944	NC_002505	T	6	6	2288164	2288169	0 %	100 %	0 %	0 %	15642132
43945	NC_002505	CAC	3	9	2288230	2288238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642132
43946	NC_002505	GTT	2	6	2288259	2288264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642132
43947	NC_002505	ATC	2	6	2288270	2288275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642132
43948	NC_002505	TCA	2	6	2288311	2288316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43949	NC_002505	CGA	2	6	2288332	2288337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161581995
43950	NC_002505	TTA	2	6	2288382	2288387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161581995
43951	NC_002505	ATC	2	6	2288394	2288399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161581995
43952	NC_002505	GTT	2	6	2288480	2288485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161581995
43953	NC_002505	CAT	2	6	2288567	2288572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161581995
43954	NC_002505	ATTCC	2	10	2288642	2288651	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43955	NC_002505	ATGCC	2	10	2288673	2288682	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43956	NC_002505	AAT	2	6	2288810	2288815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642134
43957	NC_002505	CAC	2	6	2288839	2288844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642134
43958	NC_002505	ACT	2	6	2288864	2288869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642134
43959	NC_002505	CAC	2	6	2288878	2288883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642134
43960	NC_002505	GCG	2	6	2288932	2288937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642134
43961	NC_002505	GCT	2	6	2288972	2288977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642134
43962	NC_002505	CAT	2	6	2288980	2288985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642134
43963	NC_002505	ACG	2	6	2289060	2289065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642134
43964	NC_002505	CAG	2	6	2289104	2289109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642134
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43966	NC_002505	GCA	2	6	2289391	2289396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642134
43967	NC_002505	TGT	2	6	2289541	2289546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642134
43968	NC_002505	GAG	2	6	2289592	2289597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642134
43969	NC_002505	CTT	2	6	2289625	2289630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642134
43970	NC_002505	ATC	2	6	2289654	2289659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642134
43971	NC_002505	AGC	2	6	2289699	2289704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642134
43972	NC_002505	CAG	2	6	2289782	2289787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642134
43973	NC_002505	TCA	2	6	2289874	2289879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642134
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43975	NC_002505	C	6	6	2289933	2289938	0 %	0 %	0 %	100 %	15642134
43976	NC_002505	TGCC	2	8	2289940	2289947	0 %	25 %	25 %	50 %	15642134
43977	NC_002505	TG	3	6	2289979	2289984	0 %	50 %	50 %	0 %	15642134
43978	NC_002505	TTTGAG	2	12	2289986	2289997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15642134
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43980	NC_002505	TCT	2	6	2290086	2290091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642134
43981	NC_002505	CTTTG	2	10	2290102	2290111	0 %	60 %	20 %	20 %	15642134
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