MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_002505	CTGG	2	8	2160386	2160393	0 %	25 %	50 %	25 %	15642009
41502	NC_002505	CT	3	6	2160404	2160409	0 %	50 %	0 %	50 %	15642009
41503	NC_002505	GA	3	6	2160426	2160431	50 %	0 %	50 %	0 %	15642009
41504	NC_002505	GCG	2	6	2160520	2160525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642009
41505	NC_002505	T	7	7	2160550	2160556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41506	NC_002505	TGC	2	6	2160657	2160662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41507	NC_002505	AACA	2	8	2160695	2160702	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41508	NC_002505	CAG	2	6	2160707	2160712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41509	NC_002505	AACAG	2	10	2160718	2160727	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41510	NC_002505	ATA	2	6	2160739	2160744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41511	NC_002505	ACT	2	6	2160775	2160780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41512	NC_002505	GGC	2	6	2160795	2160800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41513	NC_002505	GCC	2	6	2160812	2160817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41514	NC_002505	TTC	2	6	2160848	2160853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41515	NC_002505	GCA	2	6	2160908	2160913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41516	NC_002505	TCG	2	6	2160992	2160997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642010
41517	NC_002505	GCC	2	6	2161135	2161140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642010
41518	NC_002505	TTA	2	6	2161162	2161167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642010
41519	NC_002505	AAG	2	6	2161208	2161213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642010
41520	NC_002505	GATT	2	8	2161296	2161303	25 %	50 %	25 %	0 %	15642010
41521	NC_002505	ACG	2	6	2161331	2161336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642010
41522	NC_002505	TGC	2	6	2161343	2161348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642010
41523	NC_002505	TGA	2	6	2161350	2161355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
41524	NC_002505	CGG	2	6	2161419	2161424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642010
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41526	NC_002505	CAA	2	6	2161434	2161439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642010
41527	NC_002505	A	6	6	2161453	2161458	100 %	0 %	0 %	0 %	15642010
41528	NC_002505	GGC	2	6	2161459	2161464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642010
41529	NC_002505	CG	3	6	2161581	2161586	0 %	0 %	50 %	50 %	15642010
41530	NC_002505	TGA	2	6	2161659	2161664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
41531	NC_002505	TGA	2	6	2161671	2161676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
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41533	NC_002505	CG	3	6	2161777	2161782	0 %	0 %	50 %	50 %	15642010
41534	NC_002505	A	6	6	2161783	2161788	100 %	0 %	0 %	0 %	15642010
41535	NC_002505	GTG	2	6	2161798	2161803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642010
41536	NC_002505	CGCAA	2	10	2161809	2161818	40 %	0 %	20 %	40 %	15642010
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41538	NC_002505	GAT	2	6	2161830	2161835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
41539	NC_002505	GAT	2	6	2161992	2161997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
41540	NC_002505	GT	3	6	2162030	2162035	0 %	50 %	50 %	0 %	15642010
41541	NC_002505	GAA	3	9	2162044	2162052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642010
41542	NC_002505	CTAT	2	8	2162069	2162076	25 %	50 %	0 %	25 %	15642010
41543	NC_002505	CCAA	2	8	2162189	2162196	50 %	0 %	0 %	50 %	15642010
41544	NC_002505	AGC	2	6	2162274	2162279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642010
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41547	NC_002505	CCA	2	6	2162375	2162380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642010
41548	NC_002505	AAG	3	9	2162417	2162425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642010
41549	NC_002505	CTT	2	6	2162436	2162441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41550	NC_002505	ATG	2	6	2162631	2162636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642011
41551	NC_002505	TAA	2	6	2162685	2162690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642011
41552	NC_002505	ATC	2	6	2162745	2162750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642011
41553	NC_002505	CCA	2	6	2162770	2162775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642011
41554	NC_002505	T	6	6	2162802	2162807	0 %	100 %	0 %	0 %	15642011
41555	NC_002505	TGT	2	6	2162830	2162835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642011
41556	NC_002505	ATTC	2	8	2162843	2162850	25 %	50 %	0 %	25 %	15642011
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41559	NC_002505	AT	3	6	2163058	2163063	50 %	50 %	0 %	0 %	15642011
41560	NC_002505	TGC	2	6	2163130	2163135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642011
41561	NC_002505	CCGAT	2	10	2163262	2163271	20 %	20 %	20 %	40 %	15642011
41562	NC_002505	AT	3	6	2163292	2163297	50 %	50 %	0 %	0 %	15642011
41563	NC_002505	CTG	2	6	2163416	2163421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642011
41564	NC_002505	ATA	2	6	2163458	2163463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642011
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41569	NC_002505	GT	3	6	2163630	2163635	0 %	50 %	50 %	0 %	15642011
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41573	NC_002505	TAA	2	6	2163744	2163749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41574	NC_002505	GTC	2	6	2163823	2163828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41576	NC_002505	TATT	2	8	2163868	2163875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41577	NC_002505	CTG	3	9	2163910	2163918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642013
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41580	NC_002505	TCAA	2	8	2164096	2164103	50 %	25 %	0 %	25 %	15642013
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41587	NC_002505	AGAC	2	8	2164516	2164523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41588	NC_002505	CTTT	2	8	2164527	2164534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41589	NC_002505	ACCCAA	2	12	2164625	2164636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41590	NC_002505	TA	3	6	2164670	2164675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41591	NC_002505	ATT	2	6	2164728	2164733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41592	NC_002505	AC	3	6	2164747	2164752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41593	NC_002505	AT	4	8	2164798	2164805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41594	NC_002505	AACT	2	8	2164806	2164813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41595	NC_002505	GAT	2	6	2164829	2164834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41597	NC_002505	CTG	2	6	2164902	2164907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41598	NC_002505	GTT	2	6	2164942	2164947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41601	NC_002505	TAT	2	6	2165243	2165248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471237094
41602	NC_002505	TTGG	2	8	2165259	2165266	0 %	50 %	50 %	0 %	471237094
41603	NC_002505	TTC	2	6	2165327	2165332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237094
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41605	NC_002505	TCA	2	6	2165421	2165426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237094
41606	NC_002505	TGGG	2	8	2165442	2165449	0 %	25 %	75 %	0 %	471237094
41607	NC_002505	A	6	6	2165453	2165458	100 %	0 %	0 %	0 %	471237094
41608	NC_002505	ATG	2	6	2165483	2165488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237094
41609	NC_002505	TCGC	2	8	2165520	2165527	0 %	25 %	25 %	50 %	471237094
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41611	NC_002505	CTGG	2	8	2165753	2165760	0 %	25 %	50 %	25 %	471237094
41612	NC_002505	TTACC	2	10	2165853	2165862	20 %	40 %	0 %	40 %	471237094
41613	NC_002505	GCG	2	6	2165864	2165869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237094
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41617	NC_002505	CA	3	6	2165943	2165948	50 %	0 %	0 %	50 %	471237094
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41619	NC_002505	TGAT	2	8	2165979	2165986	25 %	50 %	25 %	0 %	471237094
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41856	NC_002505	TTG	2	6	2178148	2178153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642026
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41978	NC_002505	CGC	2	6	2184475	2184480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642032
41979	NC_002505	GTG	2	6	2184510	2184515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642032
41980	NC_002505	CG	3	6	2184529	2184534	0 %	0 %	50 %	50 %	15642032
41981	NC_002505	CTTT	2	8	2184615	2184622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41982	NC_002505	CAT	2	6	2184656	2184661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41983	NC_002505	TAC	2	6	2184687	2184692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41984	NC_002505	TGA	2	6	2184777	2184782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41985	NC_002505	TCA	2	6	2184888	2184893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41986	NC_002505	AGC	2	6	2184900	2184905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41987	NC_002505	CTT	2	6	2184944	2184949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41988	NC_002505	GCA	2	6	2184954	2184959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642033
41989	NC_002505	A	6	6	2184966	2184971	100 %	0 %	0 %	0 %	15642033
41990	NC_002505	AGT	2	6	2185149	2185154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642033
41991	NC_002505	TATT	2	8	2185189	2185196	25 %	75 %	0 %	0 %	15642033
41992	NC_002505	TTC	2	6	2185205	2185210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642033
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41994	NC_002505	TGA	2	6	2185283	2185288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642033
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42000	NC_002505	GTCACT	2	12	2185489	2185500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15642033

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