MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_002505	ATC	2	6	2133344	2133349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237093
41003	NC_002505	TGA	2	6	2133420	2133425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237093
41004	NC_002505	TAC	2	6	2133488	2133493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237093
41005	NC_002505	TGAA	2	8	2133498	2133505	50 %	25 %	25 %	0 %	471237093
41006	NC_002505	GAC	2	6	2133516	2133521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237093
41007	NC_002505	GCA	2	6	2133522	2133527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237093
41008	NC_002505	CGG	2	6	2133652	2133657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237093
41009	NC_002505	TTGC	2	8	2133662	2133669	0 %	50 %	25 %	25 %	471237093
41010	NC_002505	CTT	2	6	2133682	2133687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237093
41011	NC_002505	A	6	6	2133717	2133722	100 %	0 %	0 %	0 %	471237093
41012	NC_002505	GT	3	6	2133763	2133768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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41015	NC_002505	GTTTG	2	10	2133910	2133919	0 %	60 %	40 %	0 %	15641985
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41119	NC_002505	GCA	2	6	2139206	2139211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641988
41120	NC_002505	TGCGT	2	10	2139285	2139294	0 %	40 %	40 %	20 %	15641988
41121	NC_002505	AG	3	6	2139354	2139359	50 %	0 %	50 %	0 %	15641988
41122	NC_002505	GGC	2	6	2139408	2139413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641988
41123	NC_002505	AAC	2	6	2139419	2139424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641988
41124	NC_002505	GTTT	2	8	2139464	2139471	0 %	75 %	25 %	0 %	15641988
41125	NC_002505	ATC	2	6	2139501	2139506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641988
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41128	NC_002505	CTT	2	6	2139760	2139765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641988
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41132	NC_002505	GATG	2	8	2140048	2140055	25 %	25 %	50 %	0 %	15641989
41133	NC_002505	CAA	2	6	2140132	2140137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641989
41134	NC_002505	ATC	2	6	2140214	2140219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641989
41135	NC_002505	CAG	3	9	2140259	2140267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641989
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41138	NC_002505	GC	3	6	2140448	2140453	0 %	0 %	50 %	50 %	15641990
41139	NC_002505	CCG	2	6	2140496	2140501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641990
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41141	NC_002505	GAGT	2	8	2140651	2140658	25 %	25 %	50 %	0 %	15641990
41142	NC_002505	TCT	2	6	2140668	2140673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41143	NC_002505	T	6	6	2140709	2140714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41144	NC_002505	CACT	2	8	2140759	2140766	25 %	25 %	0 %	50 %	15641991
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41149	NC_002505	CTT	2	6	2141035	2141040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641991
41150	NC_002505	GC	3	6	2141045	2141050	0 %	0 %	50 %	50 %	15641991
41151	NC_002505	CGC	2	6	2141093	2141098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641991
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41157	NC_002505	CGA	2	6	2141341	2141346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641991
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41159	NC_002505	TGAT	2	8	2141414	2141421	25 %	50 %	25 %	0 %	15641991
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41174	NC_002505	CAC	2	6	2142745	2142750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641992
41175	NC_002505	CATC	2	8	2142762	2142769	25 %	25 %	0 %	50 %	15641992
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41178	NC_002505	GAT	2	6	2142859	2142864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641992
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41182	NC_002505	GCT	2	6	2143104	2143109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641992
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41185	NC_002505	TTGG	2	8	2143225	2143232	0 %	50 %	50 %	0 %	15641992
41186	NC_002505	T	6	6	2143329	2143334	0 %	100 %	0 %	0 %	15641992
41187	NC_002505	CAG	2	6	2143387	2143392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641993
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41193	NC_002505	ATA	2	6	2143732	2143737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15641993
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41195	NC_002505	GGCT	2	8	2143763	2143770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41196	NC_002505	GCC	3	9	2143780	2143788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41197	NC_002505	T	6	6	2143795	2143800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41198	NC_002505	A	6	6	2143807	2143812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41199	NC_002505	A	6	6	2143842	2143847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41200	NC_002505	ATTTTT	2	12	2143876	2143887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41201	NC_002505	GTT	2	6	2143896	2143901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41202	NC_002505	A	9	9	2143910	2143918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41203	NC_002505	CTG	2	6	2143921	2143926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41204	NC_002505	TCAAC	2	10	2143986	2143995	40 %	20 %	0 %	40 %	15641994
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41206	NC_002505	AAT	2	6	2144005	2144010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15641994
41207	NC_002505	T	6	6	2144037	2144042	0 %	100 %	0 %	0 %	15641994
41208	NC_002505	GCT	2	6	2144082	2144087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641994
41209	NC_002505	AAG	2	6	2144174	2144179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641994
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41211	NC_002505	TGC	2	6	2144238	2144243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641994
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41214	NC_002505	AT	3	6	2144400	2144405	50 %	50 %	0 %	0 %	15641994
41215	NC_002505	ATC	2	6	2144449	2144454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641994
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41217	NC_002505	ACGA	2	8	2144557	2144564	50 %	0 %	25 %	25 %	15641994
41218	NC_002505	ATC	2	6	2144581	2144586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641994
41219	NC_002505	GC	3	6	2144621	2144626	0 %	0 %	50 %	50 %	15641994
41220	NC_002505	AGA	2	6	2144657	2144662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641994
41221	NC_002505	CAA	2	6	2144682	2144687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641994
41222	NC_002505	CAA	2	6	2144718	2144723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641994
41223	NC_002505	CAG	2	6	2144748	2144753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641994
41224	NC_002505	CAA	2	6	2144806	2144811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41225	NC_002505	CG	4	8	2144849	2144856	0 %	0 %	50 %	50 %	15641995
41226	NC_002505	CCA	2	6	2144886	2144891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641995
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41228	NC_002505	ATCA	2	8	2144981	2144988	50 %	25 %	0 %	25 %	15641995
41229	NC_002505	CCA	2	6	2145051	2145056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641995
41230	NC_002505	GCA	2	6	2145148	2145153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641995
41231	NC_002505	CCG	2	6	2145198	2145203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641995
41232	NC_002505	ATC	2	6	2145245	2145250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641995
41233	NC_002505	ACT	2	6	2145372	2145377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641995
41234	NC_002505	TGA	2	6	2145380	2145385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641995
41235	NC_002505	CAC	2	6	2145437	2145442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641995
41236	NC_002505	CTT	2	6	2145550	2145555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641995
41237	NC_002505	TGA	2	6	2145624	2145629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641995
41238	NC_002505	GTC	2	6	2145645	2145650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641995
41239	NC_002505	T	7	7	2145691	2145697	0 %	100 %	0 %	0 %	15641995
41240	NC_002505	GC	3	6	2145738	2145743	0 %	0 %	50 %	50 %	15641995
41241	NC_002505	AGC	2	6	2145754	2145759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641995
41242	NC_002505	TGA	2	6	2145820	2145825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641995
41243	NC_002505	GC	3	6	2145826	2145831	0 %	0 %	50 %	50 %	15641995
41244	NC_002505	CTT	2	6	2145838	2145843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641995
41245	NC_002505	GC	3	6	2145881	2145886	0 %	0 %	50 %	50 %	15641995
41246	NC_002505	TCT	2	6	2145991	2145996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641995
41247	NC_002505	GGC	2	6	2146013	2146018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641995
41248	NC_002505	CAC	3	9	2146118	2146126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641995
41249	NC_002505	TGC	2	6	2146138	2146143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641995
41250	NC_002505	CCA	2	6	2146150	2146155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641995
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41252	NC_002505	GCC	2	6	2146259	2146264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641995
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41255	NC_002505	GCA	2	6	2146507	2146512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641995
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41259	NC_002505	CCTT	2	8	2146710	2146717	0 %	50 %	0 %	50 %	15641995
41260	NC_002505	TCT	2	6	2146722	2146727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641995
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41262	NC_002505	CTT	2	6	2146829	2146834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641995
41263	NC_002505	TTG	2	6	2146933	2146938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41264	NC_002505	TTG	2	6	2147062	2147067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41265	NC_002505	TCA	2	6	2147104	2147109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641996
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41268	NC_002505	CCA	2	6	2147191	2147196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641996
41269	NC_002505	TCTG	2	8	2147225	2147232	0 %	50 %	25 %	25 %	15641996
41270	NC_002505	TTG	2	6	2147239	2147244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641996
41271	NC_002505	TTG	2	6	2147332	2147337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641996
41272	NC_002505	ACA	2	6	2147362	2147367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641996
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41280	NC_002505	TCG	2	6	2147875	2147880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641996
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41286	NC_002505	GCG	2	6	2148219	2148224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641996
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41293	NC_002505	CT	3	6	2148772	2148777	0 %	50 %	0 %	50 %	15641996
41294	NC_002505	CAA	3	9	2148813	2148821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641996
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41297	NC_002505	TCTG	2	8	2148868	2148875	0 %	50 %	25 %	25 %	15641996
41298	NC_002505	AAG	2	6	2148934	2148939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41299	NC_002505	CGC	2	6	2148974	2148979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41300	NC_002505	GGC	2	6	2149043	2149048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641997
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41302	NC_002505	CTG	2	6	2149203	2149208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641997
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41321	NC_002505	ATT	2	6	2150116	2150121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41322	NC_002505	TTGG	2	8	2150130	2150137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41323	NC_002505	ACC	2	6	2150206	2150211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641998
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41330	NC_002505	GAT	2	6	2150641	2150646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641999
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41333	NC_002505	CTGAA	2	10	2150867	2150876	40 %	20 %	20 %	20 %	15641999
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41340	NC_002505	CACC	2	8	2151463	2151470	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41341	NC_002505	GTC	2	6	2151482	2151487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41342	NC_002505	TTG	2	6	2151504	2151509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41343	NC_002505	GTC	2	6	2151549	2151554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642000
41344	NC_002505	TATT	2	8	2151708	2151715	25 %	75 %	0 %	0 %	15642000
41345	NC_002505	AAC	2	6	2151780	2151785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642000
41346	NC_002505	GGC	2	6	2151817	2151822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642000
41347	NC_002505	TCA	2	6	2151864	2151869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642000
41348	NC_002505	T	6	6	2151940	2151945	0 %	100 %	0 %	0 %	15642000
41349	NC_002505	T	6	6	2152008	2152013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41350	NC_002505	GT	3	6	2152015	2152020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41351	NC_002505	A	7	7	2152112	2152118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41352	NC_002505	T	8	8	2152126	2152133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41353	NC_002505	TAC	2	6	2152193	2152198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41354	NC_002505	TCGTT	2	10	2152281	2152290	0 %	60 %	20 %	20 %	15642002
41355	NC_002505	TGC	2	6	2152296	2152301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642002
41356	NC_002505	ACTCA	2	10	2152382	2152391	40 %	20 %	0 %	40 %	15642002
41357	NC_002505	GTT	2	6	2152513	2152518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642002
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41359	NC_002505	GTT	2	6	2152588	2152593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642002
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41434	NC_002505	CTTT	2	8	2156787	2156794	0 %	75 %	0 %	25 %	15642006
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41476	NC_002505	CT	3	6	2159072	2159077	0 %	50 %	0 %	50 %	15642008
41477	NC_002505	GAC	2	6	2159107	2159112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642008
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41480	NC_002505	CAT	2	6	2159334	2159339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642009
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