MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002505	GTT	2	6	184066	184071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640212
3502	NC_002505	TCT	2	6	184080	184085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640212
3503	NC_002505	ATCT	2	8	184129	184136	25 %	50 %	0 %	25 %	15640212
3504	NC_002505	ATCTT	2	10	184149	184158	20 %	60 %	0 %	20 %	15640212
3505	NC_002505	T	6	6	184213	184218	0 %	100 %	0 %	0 %	15640212
3506	NC_002505	GTA	2	6	184232	184237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640212
3507	NC_002505	CTT	3	9	184264	184272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640212
3508	NC_002505	TTC	2	6	184333	184338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640212
3509	NC_002505	TGCT	2	8	184343	184350	0 %	50 %	25 %	25 %	15640212
3510	NC_002505	CAG	2	6	184445	184450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640213
3511	NC_002505	AGCC	2	8	184640	184647	25 %	0 %	25 %	50 %	15640213
3512	NC_002505	T	6	6	184728	184733	0 %	100 %	0 %	0 %	15640213
3513	NC_002505	ATTG	2	8	184755	184762	25 %	50 %	25 %	0 %	15640213
3514	NC_002505	ACC	2	6	184908	184913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640213
3515	NC_002505	TGT	2	6	184929	184934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640213
3516	NC_002505	TGG	2	6	185026	185031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640213
3517	NC_002505	GTC	2	6	185032	185037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640213
3518	NC_002505	ATT	2	6	185076	185081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640213
3519	NC_002505	TGA	2	6	185099	185104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640213
3520	NC_002505	TTA	2	6	185132	185137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640213
3521	NC_002505	A	6	6	185164	185169	100 %	0 %	0 %	0 %	15640213
3522	NC_002505	ATT	2	6	185181	185186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640213
3523	NC_002505	AAT	2	6	185196	185201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640213
3524	NC_002505	AGC	2	6	185237	185242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640213
3525	NC_002505	ATC	2	6	185265	185270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640213
3526	NC_002505	TGT	2	6	185343	185348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640213
3527	NC_002505	TGT	2	6	185389	185394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640213
3528	NC_002505	GT	3	6	185405	185410	0 %	50 %	50 %	0 %	15640213
3529	NC_002505	T	6	6	185415	185420	0 %	100 %	0 %	0 %	15640213
3530	NC_002505	TTTCTT	2	12	185429	185440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15640213
3531	NC_002505	A	6	6	185462	185467	100 %	0 %	0 %	0 %	15640213
3532	NC_002505	CAC	2	6	185495	185500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640213
3533	NC_002505	ATG	2	6	185530	185535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640213
3534	NC_002505	AAT	2	6	185604	185609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640213
3535	NC_002505	GCT	2	6	185610	185615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640213
3536	NC_002505	TTA	2	6	185635	185640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640213
3537	NC_002505	TTC	2	6	185664	185669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640213
3538	NC_002505	GTC	2	6	185703	185708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640213
3539	NC_002505	CTT	2	6	185723	185728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640213
3540	NC_002505	AGT	2	6	185752	185757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640213
3541	NC_002505	TCT	2	6	185767	185772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640213
3542	NC_002505	CTA	2	6	185792	185797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640213
3543	NC_002505	T	6	6	185857	185862	0 %	100 %	0 %	0 %	15640213
3544	NC_002505	GCT	2	6	185950	185955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640213
3545	NC_002505	T	7	7	185955	185961	0 %	100 %	0 %	0 %	15640213
3546	NC_002505	GAT	2	6	186055	186060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640213
3547	NC_002505	ATG	2	6	186168	186173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640213
3548	NC_002505	AGCAAA	2	12	186191	186202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15640213
3549	NC_002505	TC	3	6	186212	186217	0 %	50 %	0 %	50 %	15640213
3550	NC_002505	ATC	2	6	186225	186230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640213
3551	NC_002505	ACTA	2	8	186231	186238	50 %	25 %	0 %	25 %	15640213
3552	NC_002505	T	6	6	186258	186263	0 %	100 %	0 %	0 %	15640213
3553	NC_002505	TTC	2	6	186303	186308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640213
3554	NC_002505	TAC	2	6	186351	186356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640213
3555	NC_002505	CAT	2	6	186359	186364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640213
3556	NC_002505	T	7	7	186369	186375	0 %	100 %	0 %	0 %	15640213
3557	NC_002505	CTTC	2	8	186517	186524	0 %	50 %	0 %	50 %	15640214
3558	NC_002505	TTTCT	2	10	186534	186543	0 %	80 %	0 %	20 %	15640214
3559	NC_002505	GATG	2	8	186563	186570	25 %	25 %	50 %	0 %	15640214
3560	NC_002505	TTA	2	6	186616	186621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640214
3561	NC_002505	TGC	2	6	186625	186630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640214
3562	NC_002505	GGT	2	6	186638	186643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640214
3563	NC_002505	ATG	2	6	186709	186714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640214
3564	NC_002505	GGT	2	6	186761	186766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640214
3565	NC_002505	TCC	2	6	186797	186802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640214
3566	NC_002505	T	6	6	186860	186865	0 %	100 %	0 %	0 %	15640214
3567	NC_002505	CTC	2	6	186897	186902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640214
3568	NC_002505	GAA	2	6	186908	186913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640214
3569	NC_002505	T	7	7	186930	186936	0 %	100 %	0 %	0 %	15640214
3570	NC_002505	TG	3	6	186987	186992	0 %	50 %	50 %	0 %	15640214
3571	NC_002505	TGC	2	6	186996	187001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640214
3572	NC_002505	GAA	2	6	187036	187041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640214
3573	NC_002505	CAT	2	6	187172	187177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640214
3574	NC_002505	GAA	2	6	187288	187293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640214
3575	NC_002505	CTA	2	6	187300	187305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640214
3576	NC_002505	GCT	2	6	187316	187321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640214
3577	NC_002505	A	6	6	187323	187328	100 %	0 %	0 %	0 %	15640214
3578	NC_002505	ATAC	2	8	187382	187389	50 %	25 %	0 %	25 %	15640214
3579	NC_002505	ACC	2	6	187431	187436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640214
3580	NC_002505	T	6	6	187445	187450	0 %	100 %	0 %	0 %	15640214
3581	NC_002505	ACA	2	6	187505	187510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640214
3582	NC_002505	GGC	2	6	187518	187523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640214
3583	NC_002505	GTT	2	6	187566	187571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640214
3584	NC_002505	TTTG	2	8	187637	187644	0 %	75 %	25 %	0 %	15640214
3585	NC_002505	TAA	2	6	187667	187672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640214
3586	NC_002505	GA	3	6	187748	187753	50 %	0 %	50 %	0 %	15640214
3587	NC_002505	T	7	7	187791	187797	0 %	100 %	0 %	0 %	15640214
3588	NC_002505	TC	3	6	187866	187871	0 %	50 %	0 %	50 %	15640214
3589	NC_002505	TTTGT	2	10	187958	187967	0 %	80 %	20 %	0 %	15640214
3590	NC_002505	A	6	6	188083	188088	100 %	0 %	0 %	0 %	15640214
3591	NC_002505	GTTT	2	8	188110	188117	0 %	75 %	25 %	0 %	15640214
3592	NC_002505	AGG	2	6	188148	188153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640214
3593	NC_002505	TCC	2	6	188175	188180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640215
3594	NC_002505	TTTTC	2	10	188220	188229	0 %	80 %	0 %	20 %	15640215
3595	NC_002505	ATC	2	6	188261	188266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640215
3596	NC_002505	CATC	2	8	188276	188283	25 %	25 %	0 %	50 %	15640215
3597	NC_002505	TAAAGC	2	12	188291	188302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15640215
3598	NC_002505	CAA	2	6	188324	188329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640215
3599	NC_002505	ATG	2	6	188411	188416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640215
3600	NC_002505	CGA	2	6	188424	188429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640215
3601	NC_002505	TGT	2	6	188433	188438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640215
3602	NC_002505	TGC	2	6	188449	188454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640215
3603	NC_002505	ATT	2	6	188471	188476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640215
3604	NC_002505	AGT	2	6	188481	188486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640215
3605	NC_002505	TTTA	2	8	188489	188496	25 %	75 %	0 %	0 %	15640215
3606	NC_002505	TTTTC	2	10	188506	188515	0 %	80 %	0 %	20 %	15640215
3607	NC_002505	TTG	2	6	188595	188600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640215
3608	NC_002505	TG	3	6	188606	188611	0 %	50 %	50 %	0 %	15640215
3609	NC_002505	CAA	2	6	188671	188676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640215
3610	NC_002505	CTT	2	6	188698	188703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640215
3611	NC_002505	TGA	2	6	188736	188741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640215
3612	NC_002505	TCG	2	6	188751	188756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640215
3613	NC_002505	TAG	2	6	188786	188791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640215
3614	NC_002505	TTG	2	6	188795	188800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640215
3615	NC_002505	TGT	2	6	188820	188825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640215
3616	NC_002505	TTCTGA	2	12	188842	188853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15640215
3617	NC_002505	GTT	2	6	188882	188887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640215
3618	NC_002505	TCA	2	6	188893	188898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640215
3619	NC_002505	TC	3	6	188966	188971	0 %	50 %	0 %	50 %	15640215
3620	NC_002505	TGA	2	6	188995	189000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640215
3621	NC_002505	GAA	2	6	189004	189009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640215
3622	NC_002505	TC	3	6	189037	189042	0 %	50 %	0 %	50 %	15640215
3623	NC_002505	CTT	2	6	189045	189050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640215
3624	NC_002505	GCT	2	6	189051	189056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640215
3625	NC_002505	TCA	2	6	189066	189071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640215
3626	NC_002505	AAT	2	6	189127	189132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640215
3627	NC_002505	ATC	2	6	189556	189561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640216
3628	NC_002505	TCA	2	6	189562	189567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640216
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3630	NC_002505	TTC	2	6	189603	189608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640216
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3639	NC_002505	CTT	2	6	190094	190099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640216
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3658	NC_002505	ACC	2	6	190921	190926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640217
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3664	NC_002505	TCAG	2	8	191398	191405	25 %	25 %	25 %	25 %	15640217
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3670	NC_002505	T	6	6	191579	191584	0 %	100 %	0 %	0 %	15640217
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3673	NC_002505	GC	3	6	191859	191864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3674	NC_002505	T	6	6	191880	191885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3675	NC_002505	GGC	2	6	191887	191892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3676	NC_002505	GAGT	2	8	191902	191909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3677	NC_002505	CTT	2	6	192042	192047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640218
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3741	NC_002505	CG	3	6	194983	194988	0 %	0 %	50 %	50 %	15640220
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3744	NC_002505	AGCG	2	8	195110	195117	25 %	0 %	50 %	25 %	15640220
3745	NC_002505	AGC	2	6	195126	195131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640220
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3875	NC_002505	AGC	2	6	201703	201708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3876	NC_002505	TTG	2	6	201786	201791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3877	NC_002505	TCT	2	6	201850	201855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161582034
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3882	NC_002505	TGA	2	6	202064	202069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582034
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3924	NC_002505	CG	3	6	203980	203985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3996	NC_002505	CAA	2	6	208265	208270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640230
3997	NC_002505	GCG	2	6	208319	208324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640230
3998	NC_002505	TCAACA	2	12	208479	208490	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15640230
3999	NC_002505	TAC	2	6	208535	208540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640230
4000	NC_002505	TTG	2	6	208593	208598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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