MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_002505	GCA	2	6	776559	776564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640741
15003	NC_002505	T	7	7	776655	776661	0 %	100 %	0 %	0 %	15640741
15004	NC_002505	GCA	2	6	776676	776681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640741
15005	NC_002505	GCT	2	6	776692	776697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640741
15006	NC_002505	GGC	2	6	776701	776706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640741
15007	NC_002505	ACC	2	6	776730	776735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640741
15008	NC_002505	ACC	2	6	776742	776747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640741
15009	NC_002505	ACT	2	6	776802	776807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640741
15010	NC_002505	TTG	2	6	776823	776828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640741
15011	NC_002505	TCGT	2	8	777012	777019	0 %	50 %	25 %	25 %	15640742
15012	NC_002505	TCCA	2	8	777064	777071	25 %	25 %	0 %	50 %	15640742
15013	NC_002505	CAT	2	6	777104	777109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640742
15014	NC_002505	AAT	2	6	777150	777155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640742
15015	NC_002505	TGA	2	6	777158	777163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640742
15016	NC_002505	GAT	2	6	777219	777224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640742
15017	NC_002505	GGC	2	6	777312	777317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640742
15018	NC_002505	T	6	6	777318	777323	0 %	100 %	0 %	0 %	15640742
15019	NC_002505	TTGGCG	2	12	777331	777342	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15640742
15020	NC_002505	GGT	2	6	777401	777406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640742
15021	NC_002505	CGG	2	6	777461	777466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640742
15022	NC_002505	TTGG	2	8	777474	777481	0 %	50 %	50 %	0 %	15640742
15023	NC_002505	GC	3	6	777510	777515	0 %	0 %	50 %	50 %	15640742
15024	NC_002505	AACG	2	8	777554	777561	50 %	0 %	25 %	25 %	15640742
15025	NC_002505	CTT	2	6	777572	777577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640742
15026	NC_002505	TAA	2	6	777584	777589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640742
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15028	NC_002505	ACC	4	12	777709	777720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640742
15029	NC_002505	TCA	2	6	777758	777763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640742
15030	NC_002505	GAC	2	6	777807	777812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640742
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15032	NC_002505	GTTT	2	8	777959	777966	0 %	75 %	25 %	0 %	15640742
15033	NC_002505	AAT	2	6	777971	777976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640742
15034	NC_002505	GAAA	2	8	777993	778000	75 %	0 %	25 %	0 %	15640742
15035	NC_002505	CAAG	2	8	778169	778176	50 %	0 %	25 %	25 %	15640742
15036	NC_002505	CAGA	2	8	778281	778288	50 %	0 %	25 %	25 %	15640742
15037	NC_002505	AAT	2	6	778293	778298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640742
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15039	NC_002505	GCA	2	6	778346	778351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640742
15040	NC_002505	TCA	2	6	778474	778479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640742
15041	NC_002505	GCA	2	6	778481	778486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640742
15042	NC_002505	GCA	2	6	778505	778510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640742
15043	NC_002505	CTT	2	6	778511	778516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640742
15044	NC_002505	GCTTT	2	10	778651	778660	0 %	60 %	20 %	20 %	15640742
15045	NC_002505	GAG	2	6	778671	778676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640742
15046	NC_002505	C	7	7	778696	778702	0 %	0 %	0 %	100 %	15640742
15047	NC_002505	CTT	2	6	778829	778834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640742
15048	NC_002505	TCA	2	6	778934	778939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_002505	GTT	2	6	779004	779009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_002505	CG	4	8	779136	779143	0 %	0 %	50 %	50 %	15640743
15051	NC_002505	GTG	2	6	779160	779165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640743
15052	NC_002505	TGG	2	6	779183	779188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640743
15053	NC_002505	GT	3	6	779194	779199	0 %	50 %	50 %	0 %	15640743
15054	NC_002505	GTG	2	6	779272	779277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640743
15055	NC_002505	CAA	2	6	779299	779304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640743
15056	NC_002505	TGA	2	6	779317	779322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640743
15057	NC_002505	ATG	2	6	779362	779367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640743
15058	NC_002505	GGTT	2	8	779472	779479	0 %	50 %	50 %	0 %	15640743
15059	NC_002505	AGC	2	6	779611	779616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640743
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15061	NC_002505	GCA	2	6	779681	779686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640743
15062	NC_002505	CG	3	6	779709	779714	0 %	0 %	50 %	50 %	15640743
15063	NC_002505	CAA	2	6	779718	779723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640743
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15065	NC_002505	TCG	2	6	779869	779874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640743
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15088	NC_002505	TTGG	2	8	781402	781409	0 %	50 %	50 %	0 %	15640744
15089	NC_002505	TGC	2	6	781441	781446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640744
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15091	NC_002505	GC	3	6	781657	781662	0 %	0 %	50 %	50 %	15640744
15092	NC_002505	CGCTT	2	10	781717	781726	0 %	40 %	20 %	40 %	15640744
15093	NC_002505	AAT	2	6	781896	781901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640744
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15095	NC_002505	ACA	2	6	781922	781927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640744
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15098	NC_002505	GCAA	2	8	782128	782135	50 %	0 %	25 %	25 %	15640744
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15101	NC_002505	ATC	2	6	782235	782240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640744
15102	NC_002505	CTAT	2	8	782266	782273	25 %	50 %	0 %	25 %	15640744
15103	NC_002505	GAT	2	6	782309	782314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640744
15104	NC_002505	T	6	6	782379	782384	0 %	100 %	0 %	0 %	15640744
15105	NC_002505	T	6	6	782416	782421	0 %	100 %	0 %	0 %	15640744
15106	NC_002505	ATC	2	6	782634	782639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640744
15107	NC_002505	GATT	2	8	782644	782651	25 %	50 %	25 %	0 %	15640744
15108	NC_002505	CGGTG	2	10	782699	782708	0 %	20 %	60 %	20 %	15640744
15109	NC_002505	CATC	2	8	782750	782757	25 %	25 %	0 %	50 %	15640744
15110	NC_002505	CAA	2	6	782813	782818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640744
15111	NC_002505	TAA	2	6	782909	782914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640744
15112	NC_002505	CTA	2	6	782980	782985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640745
15113	NC_002505	CCG	2	6	782990	782995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640745
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15116	NC_002505	AGGTG	2	10	783208	783217	20 %	20 %	60 %	0 %	15640745
15117	NC_002505	ATC	2	6	783240	783245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640745
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15119	NC_002505	GTG	2	6	783332	783337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640745
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15121	NC_002505	GCG	2	6	783386	783391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640745
15122	NC_002505	GCA	2	6	783407	783412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640745
15123	NC_002505	GCA	2	6	783472	783477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640745
15124	NC_002505	GCGATT	2	12	783500	783511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15640745
15125	NC_002505	CTT	2	6	783527	783532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640745
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15128	NC_002505	GCA	2	6	783637	783642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640745
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15135	NC_002505	CGA	2	6	783967	783972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640746
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15141	NC_002505	GAT	2	6	784280	784285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640746
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15150	NC_002505	TAG	2	6	784581	784586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15152	NC_002505	CGTA	2	8	784623	784630	25 %	25 %	25 %	25 %	15640747
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15232	NC_002505	AAT	2	6	788909	788914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15234	NC_002505	TCAA	2	8	788977	788984	50 %	25 %	0 %	25 %	15640753
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15242	NC_002505	TCG	2	6	789273	789278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640753
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15490	NC_002505	CG	3	6	801242	801247	0 %	0 %	50 %	50 %	15640767
15491	NC_002505	A	6	6	801254	801259	100 %	0 %	0 %	0 %	15640767
15492	NC_002505	GATG	2	8	801276	801283	25 %	25 %	50 %	0 %	15640767
15493	NC_002505	TGGC	2	8	801321	801328	0 %	25 %	50 %	25 %	15640767
15494	NC_002505	AGA	2	6	801333	801338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640767
15495	NC_002505	CTG	2	6	801373	801378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640767
15496	NC_002505	CAAG	2	8	801465	801472	50 %	0 %	25 %	25 %	15640767
15497	NC_002505	CAT	2	6	801480	801485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640767
15498	NC_002505	TGA	2	6	801618	801623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640767
15499	NC_002505	GTG	2	6	801667	801672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640767
15500	NC_002505	GTG	2	6	801715	801720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640767

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