MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002505	TGA	3	9	648534	648542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640633
12502	NC_002505	ATCA	2	8	648658	648665	50 %	25 %	0 %	25 %	15640633
12503	NC_002505	AATTC	2	10	648761	648770	40 %	40 %	0 %	20 %	15640633
12504	NC_002505	CTG	2	6	648867	648872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640634
12505	NC_002505	TGC	2	6	648911	648916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640634
12506	NC_002505	GCG	2	6	648979	648984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640634
12507	NC_002505	CGC	2	6	649016	649021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640634
12508	NC_002505	CAA	2	6	649091	649096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640634
12509	NC_002505	TCA	2	6	649124	649129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640634
12510	NC_002505	CA	3	6	649136	649141	50 %	0 %	0 %	50 %	15640634
12511	NC_002505	AGC	2	6	649174	649179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640634
12512	NC_002505	TTG	2	6	649182	649187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640634
12513	NC_002505	GC	3	6	649334	649339	0 %	0 %	50 %	50 %	15640634
12514	NC_002505	TGC	2	6	649396	649401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640634
12515	NC_002505	GTC	2	6	649470	649475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640634
12516	NC_002505	AACGC	2	10	649526	649535	40 %	0 %	20 %	40 %	15640634
12517	NC_002505	ATG	2	6	649552	649557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640634
12518	NC_002505	CCG	2	6	649630	649635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640634
12519	NC_002505	GTA	2	6	649650	649655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640634
12520	NC_002505	TCC	2	6	649668	649673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640634
12521	NC_002505	TGA	2	6	649702	649707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640634
12522	NC_002505	GCA	2	6	649765	649770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12523	NC_002505	CTG	2	6	649786	649791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12524	NC_002505	TCA	2	6	649815	649820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640635
12525	NC_002505	AC	4	8	649841	649848	50 %	0 %	0 %	50 %	15640635
12526	NC_002505	GTAA	2	8	649879	649886	50 %	25 %	25 %	0 %	15640635
12527	NC_002505	ATT	2	6	649892	649897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640635
12528	NC_002505	TGT	2	6	649924	649929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12529	NC_002505	CCA	2	6	650066	650071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640635
12530	NC_002505	TTG	2	6	650171	650176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12531	NC_002505	TGG	2	6	650329	650334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640635
12532	NC_002505	AGT	2	6	650341	650346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640635
12533	NC_002505	TCA	2	6	650472	650477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640635
12534	NC_002505	ATG	2	6	650478	650483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640635
12535	NC_002505	CAT	2	6	650494	650499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640635
12536	NC_002505	TG	3	6	650568	650573	0 %	50 %	50 %	0 %	15640635
12537	NC_002505	CG	3	6	650595	650600	0 %	0 %	50 %	50 %	15640635
12538	NC_002505	ATC	2	6	650657	650662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640635
12539	NC_002505	TTG	2	6	650675	650680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12540	NC_002505	GTT	2	6	650704	650709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12541	NC_002505	A	7	7	650746	650752	100 %	0 %	0 %	0 %	15640635
12542	NC_002505	AAC	2	6	650793	650798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640635
12543	NC_002505	TGT	2	6	650847	650852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12544	NC_002505	ACC	2	6	650883	650888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640635
12545	NC_002505	TGT	2	6	650898	650903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12546	NC_002505	CGT	2	6	650962	650967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12547	NC_002505	CAG	2	6	651005	651010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12548	NC_002505	CTTG	2	8	651016	651023	0 %	50 %	25 %	25 %	15640635
12549	NC_002505	TTG	2	6	651026	651031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640635
12550	NC_002505	AGC	2	6	651046	651051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12551	NC_002505	AGT	2	6	651064	651069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640635
12552	NC_002505	GCA	2	6	651070	651075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12553	NC_002505	GT	3	6	651135	651140	0 %	50 %	50 %	0 %	15640635
12554	NC_002505	ATA	2	6	651152	651157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640635
12555	NC_002505	CGT	2	6	651167	651172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640635
12556	NC_002505	CA	3	6	651287	651292	50 %	0 %	0 %	50 %	15640635
12557	NC_002505	CA	3	6	651316	651321	50 %	0 %	0 %	50 %	15640635
12558	NC_002505	TGGT	2	8	651363	651370	0 %	50 %	50 %	0 %	15640635
12559	NC_002505	CATT	2	8	651380	651387	25 %	50 %	0 %	25 %	15640635
12560	NC_002505	GCT	2	6	651429	651434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_002505	AAC	2	6	651456	651461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640636
12562	NC_002505	TTG	2	6	651590	651595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640636
12563	NC_002505	CCA	2	6	651705	651710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640636
12564	NC_002505	AGCG	2	8	651750	651757	25 %	0 %	50 %	25 %	15640636
12565	NC_002505	CGTG	2	8	651768	651775	0 %	25 %	50 %	25 %	15640636
12566	NC_002505	TCA	2	6	651869	651874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640636
12567	NC_002505	AAC	2	6	651880	651885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640636
12568	NC_002505	CGCTGA	2	12	651923	651934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15640636
12569	NC_002505	CCA	2	6	651935	651940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640636
12570	NC_002505	TGG	2	6	651976	651981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640636
12571	NC_002505	T	6	6	652030	652035	0 %	100 %	0 %	0 %	15640636
12572	NC_002505	CAG	2	6	652063	652068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640636
12573	NC_002505	TGG	2	6	652082	652087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640636
12574	NC_002505	TGAG	2	8	652107	652114	25 %	25 %	50 %	0 %	15640636
12575	NC_002505	GTC	2	6	652165	652170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640636
12576	NC_002505	ATC	2	6	652244	652249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640636
12577	NC_002505	GGT	2	6	652255	652260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640636
12578	NC_002505	CACC	2	8	652281	652288	25 %	0 %	0 %	75 %	15640636
12579	NC_002505	CGT	2	6	652326	652331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640636
12580	NC_002505	CAT	2	6	652342	652347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640636
12581	NC_002505	GTT	2	6	652350	652355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640636
12582	NC_002505	T	6	6	652394	652399	0 %	100 %	0 %	0 %	15640636
12583	NC_002505	CGGT	2	8	652554	652561	0 %	25 %	50 %	25 %	15640637
12584	NC_002505	GTTTT	2	10	652662	652671	0 %	80 %	20 %	0 %	15640637
12585	NC_002505	TGG	2	6	652684	652689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640637
12586	NC_002505	GGT	2	6	652719	652724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640637
12587	NC_002505	TCAA	2	8	652760	652767	50 %	25 %	0 %	25 %	15640637
12588	NC_002505	ATG	2	6	652781	652786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640637
12589	NC_002505	CTT	2	6	652857	652862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640637
12590	NC_002505	TCT	2	6	652875	652880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640637
12591	NC_002505	ACA	2	6	652901	652906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640637
12592	NC_002505	GAGCGC	2	12	652951	652962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15640637
12593	NC_002505	ACC	2	6	652990	652995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640637
12594	NC_002505	ACG	2	6	653065	653070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640637
12595	NC_002505	TTTC	2	8	653184	653191	0 %	75 %	0 %	25 %	15640637
12596	NC_002505	TCA	2	6	653213	653218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640637
12597	NC_002505	CCA	2	6	653258	653263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640637
12598	NC_002505	TGA	2	6	653265	653270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640637
12599	NC_002505	GGC	2	6	653276	653281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640637
12600	NC_002505	ATT	2	6	653462	653467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640637
12601	NC_002505	TGG	2	6	653493	653498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640638
12602	NC_002505	CTTG	2	8	653525	653532	0 %	50 %	25 %	25 %	15640638
12603	NC_002505	CAG	2	6	653628	653633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640638
12604	NC_002505	CAG	2	6	653655	653660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640638
12605	NC_002505	CCA	2	6	653664	653669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640638
12606	NC_002505	ATG	2	6	653713	653718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640638
12607	NC_002505	AGGA	2	8	653752	653759	50 %	0 %	50 %	0 %	15640638
12608	NC_002505	TCG	2	6	653762	653767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640638
12609	NC_002505	CAT	2	6	653772	653777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640638
12610	NC_002505	ACCGA	2	10	653791	653800	40 %	0 %	20 %	40 %	15640638
12611	NC_002505	GAT	2	6	653850	653855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640638
12612	NC_002505	GCGA	2	8	653924	653931	25 %	0 %	50 %	25 %	15640638
12613	NC_002505	ACC	2	6	653932	653937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640638
12614	NC_002505	AGG	2	6	653954	653959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640638
12615	NC_002505	AAT	2	6	653967	653972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640638
12616	NC_002505	CAG	2	6	654024	654029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640638
12617	NC_002505	ATG	2	6	654052	654057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640638
12618	NC_002505	GCG	2	6	654064	654069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640638
12619	NC_002505	TCG	2	6	654079	654084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640638
12620	NC_002505	CA	3	6	654202	654207	50 %	0 %	0 %	50 %	15640638
12621	NC_002505	GTG	2	6	654223	654228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640638
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12987	NC_002505	GCA	2	6	671674	671679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640650
12988	NC_002505	CTT	2	6	671701	671706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640650
12989	NC_002505	A	8	8	671807	671814	100 %	0 %	0 %	0 %	15640650
12990	NC_002505	AAT	2	6	671825	671830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640650
12991	NC_002505	GTTCA	2	10	671894	671903	20 %	40 %	20 %	20 %	15640650
12992	NC_002505	ATT	2	6	671914	671919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12997	NC_002505	CAC	2	6	672281	672286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640651
12998	NC_002505	CG	3	6	672301	672306	0 %	0 %	50 %	50 %	15640651
12999	NC_002505	AGC	2	6	672337	672342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640651
13000	NC_002505	GAT	2	6	672422	672427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640651

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