MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_002505	TGG	2	6	622014	622019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640615
12003	NC_002505	CCG	3	9	622067	622075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640615
12004	NC_002505	CTG	2	6	622141	622146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640615
12005	NC_002505	ATG	2	6	622175	622180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640615
12006	NC_002505	TTA	2	6	622229	622234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640615
12007	NC_002505	GCT	2	6	622281	622286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_002505	ACGG	2	8	622302	622309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12009	NC_002505	TAA	2	6	622320	622325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_002505	CATC	2	8	622557	622564	25 %	25 %	0 %	50 %	15640616
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12013	NC_002505	ATC	2	6	622687	622692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640616
12014	NC_002505	CAC	2	6	622696	622701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640616
12015	NC_002505	TAA	2	6	622737	622742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640616
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12017	NC_002505	ATGGTG	2	12	622772	622783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15640616
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12019	NC_002505	TGC	2	6	622847	622852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640616
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12021	NC_002505	GCC	2	6	622891	622896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640616
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12119	NC_002505	TCAG	2	8	628406	628413	25 %	25 %	25 %	25 %	15640622
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12123	NC_002505	CG	3	6	628562	628567	0 %	0 %	50 %	50 %	15640622
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12233	NC_002505	GAA	2	6	634280	634285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640625
12234	NC_002505	TGC	2	6	634320	634325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640625
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12243	NC_002505	GTGC	2	8	634898	634905	0 %	25 %	50 %	25 %	15640625
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12246	NC_002505	TGG	2	6	635046	635051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640625
12247	NC_002505	GTG	2	6	635061	635066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640625
12248	NC_002505	GAC	2	6	635107	635112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640625
12249	NC_002505	TGA	2	6	635149	635154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640625
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12251	NC_002505	TCA	2	6	635271	635276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640625
12252	NC_002505	TGG	2	6	635365	635370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640625
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12271	NC_002505	TCA	2	6	636563	636568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12281	NC_002505	TA	3	6	637105	637110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12369	NC_002505	CCG	2	6	641418	641423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640629
12370	NC_002505	TTG	2	6	641443	641448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640629
12371	NC_002505	ATCGA	2	10	641455	641464	40 %	20 %	20 %	20 %	15640629
12372	NC_002505	TGC	2	6	641489	641494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640629
12373	NC_002505	GGC	2	6	641562	641567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640629
12374	NC_002505	CTG	2	6	641658	641663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12375	NC_002505	TC	4	8	641709	641716	0 %	50 %	0 %	50 %	15640630
12376	NC_002505	TGTC	2	8	641741	641748	0 %	50 %	25 %	25 %	15640630
12377	NC_002505	ACC	2	6	641775	641780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640630
12378	NC_002505	TGC	2	6	641803	641808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12379	NC_002505	AGC	2	6	641878	641883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12380	NC_002505	GATGC	2	10	641961	641970	20 %	20 %	40 %	20 %	15640630
12381	NC_002505	AGG	2	6	641983	641988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640630
12382	NC_002505	CAG	3	9	642066	642074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12383	NC_002505	TGA	2	6	642125	642130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640630
12384	NC_002505	CAG	2	6	642198	642203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12385	NC_002505	CG	3	6	642232	642237	0 %	0 %	50 %	50 %	15640630
12386	NC_002505	AAG	2	6	642238	642243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640630
12387	NC_002505	TGA	2	6	642271	642276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640630
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12393	NC_002505	CTG	2	6	642474	642479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12394	NC_002505	CG	3	6	642501	642506	0 %	0 %	50 %	50 %	15640630
12395	NC_002505	AGC	2	6	642535	642540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640630
12396	NC_002505	TGAT	2	8	642568	642575	25 %	50 %	25 %	0 %	15640630
12397	NC_002505	GCAG	2	8	642626	642633	25 %	0 %	50 %	25 %	15640630
12398	NC_002505	A	6	6	642723	642728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_002505	TTC	2	6	642755	642760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12400	NC_002505	GAT	2	6	642787	642792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12401	NC_002505	GAT	2	6	642803	642808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12402	NC_002505	GAA	2	6	642837	642842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640631
12403	NC_002505	TAA	2	6	642886	642891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640631
12404	NC_002505	T	6	6	643000	643005	0 %	100 %	0 %	0 %	15640631
12405	NC_002505	TTG	2	6	643019	643024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640631
12406	NC_002505	TCA	2	6	643031	643036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640631
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12408	NC_002505	CCA	2	6	643149	643154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640631
12409	NC_002505	GCC	2	6	643210	643215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640631
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12411	NC_002505	CGG	2	6	643311	643316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640631
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12413	NC_002505	CAC	2	6	643354	643359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640631
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12415	NC_002505	GTA	3	9	643390	643398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640631
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12417	NC_002505	GAT	2	6	643447	643452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640631
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12421	NC_002505	TGA	2	6	643716	643721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640631
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12424	NC_002505	TCGA	2	8	643790	643797	25 %	25 %	25 %	25 %	15640631
12425	NC_002505	TGC	2	6	643829	643834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640631
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12429	NC_002505	CAC	2	6	644008	644013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640631
12430	NC_002505	CGG	2	6	644072	644077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640631
12431	NC_002505	ATG	2	6	644116	644121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640631
12432	NC_002505	GAT	2	6	644122	644127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640631
12433	NC_002505	CCA	2	6	644145	644150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640631
12434	NC_002505	TTC	2	6	644173	644178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640631
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12439	NC_002505	GATC	2	8	644540	644547	25 %	25 %	25 %	25 %	15640632
12440	NC_002505	TGG	2	6	644588	644593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640632
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12442	NC_002505	GGT	2	6	644633	644638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640632
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12444	NC_002505	ATG	2	6	644671	644676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640632
12445	NC_002505	GAT	2	6	644715	644720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640632
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12447	NC_002505	CCCATG	2	12	644798	644809	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15640632
12448	NC_002505	TCA	2	6	644878	644883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640632
12449	NC_002505	ATG	2	6	644897	644902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640632
12450	NC_002505	ACA	2	6	644993	644998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640632
12451	NC_002505	TCA	2	6	645175	645180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640632
12452	NC_002505	CAC	3	9	645251	645259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640632
12453	NC_002505	CAT	2	6	645348	645353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640632
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12455	NC_002505	TCG	2	6	645400	645405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640632
12456	NC_002505	ATCTT	2	10	645499	645508	20 %	60 %	0 %	20 %	15640632
12457	NC_002505	GT	3	6	645667	645672	0 %	50 %	50 %	0 %	15640632
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12460	NC_002505	AC	3	6	645763	645768	50 %	0 %	0 %	50 %	15640632
12461	NC_002505	TTGG	2	8	645816	645823	0 %	50 %	50 %	0 %	15640632
12462	NC_002505	GCA	2	6	645986	645991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640632
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12465	NC_002505	ATC	2	6	646170	646175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640632
12466	NC_002505	GTA	2	6	646182	646187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640632
12467	NC_002505	AACA	2	8	646377	646384	75 %	0 %	0 %	25 %	15640632
12468	NC_002505	TGG	2	6	646391	646396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640632
12469	NC_002505	CAT	2	6	646520	646525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640632
12470	NC_002505	GTGA	2	8	646601	646608	25 %	25 %	50 %	0 %	15640632
12471	NC_002505	TG	3	6	646631	646636	0 %	50 %	50 %	0 %	15640632
12472	NC_002505	TAGT	2	8	646669	646676	25 %	50 %	25 %	0 %	15640632
12473	NC_002505	TGA	2	6	646703	646708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640632
12474	NC_002505	ATTATC	2	12	646719	646730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15640632
12475	NC_002505	CGT	2	6	646827	646832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12476	NC_002505	GAA	2	6	646844	646849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12477	NC_002505	GC	3	6	646878	646883	0 %	0 %	50 %	50 %	15640633
12478	NC_002505	CAG	2	6	646906	646911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640633
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12480	NC_002505	TTC	2	6	647173	647178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640633
12481	NC_002505	GGC	2	6	647263	647268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640633
12482	NC_002505	TGA	2	6	647321	647326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640633
12483	NC_002505	CTT	2	6	647328	647333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640633
12484	NC_002505	T	6	6	647368	647373	0 %	100 %	0 %	0 %	15640633
12485	NC_002505	CA	3	6	647465	647470	50 %	0 %	0 %	50 %	15640633
12486	NC_002505	CTT	2	6	647529	647534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640633
12487	NC_002505	CGTTGT	2	12	647586	647597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15640633
12488	NC_002505	CGCGG	2	10	647665	647674	0 %	0 %	60 %	40 %	15640633
12489	NC_002505	TGTC	2	8	647838	647845	0 %	50 %	25 %	25 %	15640633
12490	NC_002505	TCA	3	9	647882	647890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640633
12491	NC_002505	TTGA	2	8	647932	647939	25 %	50 %	25 %	0 %	15640633
12492	NC_002505	GGCG	2	8	647973	647980	0 %	0 %	75 %	25 %	15640633
12493	NC_002505	CAT	2	6	647989	647994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640633
12494	NC_002505	GCA	2	6	648075	648080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640633
12495	NC_002505	GCAT	2	8	648092	648099	25 %	25 %	25 %	25 %	15640633
12496	NC_002505	CTGC	2	8	648113	648120	0 %	25 %	25 %	50 %	15640633
12497	NC_002505	TGCA	2	8	648238	648245	25 %	25 %	25 %	25 %	15640633
12498	NC_002505	GCA	2	6	648266	648271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640633
12499	NC_002505	CG	3	6	648272	648277	0 %	0 %	50 %	50 %	15640633
12500	NC_002505	CTGG	2	8	648301	648308	0 %	25 %	50 %	25 %	15640633

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