MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_002505	AAT	2	6	569369	569374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640559
11003	NC_002505	CG	3	6	569398	569403	0 %	0 %	50 %	50 %	15640559
11004	NC_002505	ATT	2	6	569459	569464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640559
11005	NC_002505	TTCTA	2	10	569580	569589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11006	NC_002505	TCTA	2	8	569666	569673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_002505	ACTC	2	8	569685	569692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11008	NC_002505	GCC	2	6	569697	569702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_002505	GTT	2	6	569718	569723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_002505	TTGA	2	8	569741	569748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_002505	GAC	2	6	569763	569768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_002505	GCG	2	6	569778	569783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_002505	CAG	2	6	569796	569801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_002505	ATT	2	6	569845	569850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_002505	T	6	6	569873	569878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_002505	AGC	2	6	569902	569907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_002505	AAC	2	6	569947	569952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_002505	CAA	2	6	570100	570105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640560
11019	NC_002505	A	6	6	570104	570109	100 %	0 %	0 %	0 %	15640560
11020	NC_002505	ATC	2	6	570147	570152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640560
11021	NC_002505	TTA	2	6	570294	570299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640560
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11023	NC_002505	TGA	2	6	570369	570374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640560
11024	NC_002505	GT	3	6	570383	570388	0 %	50 %	50 %	0 %	15640560
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11030	NC_002505	CAT	2	6	570554	570559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640560
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11033	NC_002505	ATG	2	6	570728	570733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640560
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11035	NC_002505	CCG	2	6	570848	570853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640560
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11038	NC_002505	ATGG	2	8	570984	570991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_002505	CTG	3	9	571130	571138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640561
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11041	NC_002505	GTTTG	2	10	571276	571285	0 %	60 %	40 %	0 %	15640561
11042	NC_002505	TGCT	2	8	571287	571294	0 %	50 %	25 %	25 %	15640561
11043	NC_002505	TAT	2	6	571474	571479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640561
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11046	NC_002505	GCT	2	6	571592	571597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640561
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11050	NC_002505	TGG	2	6	571969	571974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640562
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11052	NC_002505	CTG	2	6	571995	572000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640562
11053	NC_002505	CAA	2	6	572010	572015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640562
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11055	NC_002505	CAAT	2	8	572116	572123	50 %	25 %	0 %	25 %	15640562
11056	NC_002505	TGC	2	6	572137	572142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640562
11057	NC_002505	TTG	2	6	572170	572175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640562
11058	NC_002505	TGAT	2	8	572197	572204	25 %	50 %	25 %	0 %	15640562
11059	NC_002505	GGT	2	6	572225	572230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640562
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11061	NC_002505	GCA	3	9	572390	572398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640562
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11063	NC_002505	CAT	2	6	572437	572442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640562
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11065	NC_002505	GGT	2	6	572549	572554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640562
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11069	NC_002505	TAT	2	6	572890	572895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640563
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11088	NC_002505	GCA	2	6	574527	574532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640564
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11090	NC_002505	TAA	2	6	574605	574610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_002505	GA	3	6	574681	574686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_002505	TCTCTG	2	12	574816	574827	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	471237041
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11101	NC_002505	GCTC	2	8	575083	575090	0 %	25 %	25 %	50 %	471237041
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11112	NC_002505	GAAA	2	8	575613	575620	75 %	0 %	25 %	0 %	471237041
11113	NC_002505	A	6	6	575647	575652	100 %	0 %	0 %	0 %	471237041
11114	NC_002505	TCT	2	6	575704	575709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237041
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11118	NC_002505	CTT	2	6	575823	575828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_002505	TGAG	2	8	575842	575849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_002505	CTG	2	6	575993	575998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640566
11121	NC_002505	TGAT	2	8	576002	576009	25 %	50 %	25 %	0 %	15640566
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11123	NC_002505	CA	3	6	576212	576217	50 %	0 %	0 %	50 %	15640566
11124	NC_002505	TGA	2	6	576336	576341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640566
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11126	NC_002505	CA	3	6	576420	576425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11127	NC_002505	GAAGA	2	10	576437	576446	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11232	NC_002505	GC	3	6	581906	581911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11241	NC_002505	GCC	2	6	582381	582386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471237042
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11246	NC_002505	GTC	2	6	582673	582678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11247	NC_002505	CCA	2	6	582690	582695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640572
11248	NC_002505	TGC	2	6	582731	582736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11249	NC_002505	A	6	6	582856	582861	100 %	0 %	0 %	0 %	15640572
11250	NC_002505	GAT	2	6	582931	582936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640572
11251	NC_002505	GTC	2	6	582937	582942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11252	NC_002505	GC	3	6	582957	582962	0 %	0 %	50 %	50 %	15640572
11253	NC_002505	CGA	2	6	583040	583045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11254	NC_002505	CT	3	6	583075	583080	0 %	50 %	0 %	50 %	15640572
11255	NC_002505	ACG	2	6	583084	583089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11256	NC_002505	ACA	2	6	583267	583272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640572
11257	NC_002505	CTACGG	2	12	583280	583291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11258	NC_002505	TGC	2	6	583391	583396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11259	NC_002505	A	6	6	583471	583476	100 %	0 %	0 %	0 %	15640572
11260	NC_002505	CGG	2	6	583539	583544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640572
11261	NC_002505	GTC	2	6	583838	583843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11262	NC_002505	CTG	2	6	583844	583849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11263	NC_002505	TCT	2	6	583851	583856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640572
11264	NC_002505	GCT	2	6	583887	583892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11265	NC_002505	A	6	6	583910	583915	100 %	0 %	0 %	0 %	15640572
11266	NC_002505	GAT	2	6	583939	583944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640572
11267	NC_002505	GCA	2	6	584077	584082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11268	NC_002505	GTG	2	6	584116	584121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640572
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11271	NC_002505	GC	3	6	584350	584355	0 %	0 %	50 %	50 %	15640572
11272	NC_002505	GTG	2	6	584357	584362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640572
11273	NC_002505	AAG	2	6	584384	584389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640572
11274	NC_002505	CTG	2	6	584416	584421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640572
11275	NC_002505	ATTA	2	8	584451	584458	50 %	50 %	0 %	0 %	15640573
11276	NC_002505	ATC	2	6	584503	584508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640573
11277	NC_002505	TGC	3	9	584570	584578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640573
11278	NC_002505	TAC	2	6	584647	584652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640573
11279	NC_002505	TCG	2	6	584857	584862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640573
11280	NC_002505	TGG	2	6	584874	584879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640573
11281	NC_002505	GCCA	2	8	584908	584915	25 %	0 %	25 %	50 %	15640573
11282	NC_002505	ATT	2	6	584980	584985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640573
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11285	NC_002505	GTG	2	6	585088	585093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640573
11286	NC_002505	GTG	2	6	585178	585183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640573
11287	NC_002505	GCT	2	6	585319	585324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640573
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11289	NC_002505	TGC	2	6	585408	585413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640573
11290	NC_002505	GTC	2	6	585445	585450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640573
11291	NC_002505	CTT	2	6	585483	585488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640573
11292	NC_002505	ATGC	2	8	585493	585500	25 %	25 %	25 %	25 %	15640573
11293	NC_002505	GT	3	6	585548	585553	0 %	50 %	50 %	0 %	15640573
11294	NC_002505	GTTG	2	8	585580	585587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11295	NC_002505	TA	3	6	585637	585642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11296	NC_002505	CG	3	6	585675	585680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11297	NC_002505	TGGAAA	2	12	585691	585702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	471237043
11298	NC_002505	CGGG	2	8	585840	585847	0 %	0 %	75 %	25 %	471237043
11299	NC_002505	GCA	2	6	585861	585866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237043
11300	NC_002505	GCC	2	6	585943	585948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471237043
11301	NC_002505	GGT	3	9	585996	586004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237043
11302	NC_002505	CAGT	2	8	586007	586014	25 %	25 %	25 %	25 %	471237043
11303	NC_002505	TG	3	6	586020	586025	0 %	50 %	50 %	0 %	471237043
11304	NC_002505	CCG	2	6	586102	586107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471237043
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11318	NC_002505	CTT	2	6	586626	586631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237043
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11321	NC_002505	CGC	2	6	586695	586700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640575
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11324	NC_002505	GCG	2	6	586760	586765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640575
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11326	NC_002505	TCGC	2	8	586781	586788	0 %	25 %	25 %	50 %	15640575
11327	NC_002505	GTTG	2	8	586959	586966	0 %	50 %	50 %	0 %	15640575
11328	NC_002505	ATT	2	6	586970	586975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640575
11329	NC_002505	TGA	2	6	587034	587039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640575
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11331	NC_002505	GTTT	2	8	587091	587098	0 %	75 %	25 %	0 %	15640575
11332	NC_002505	TGA	2	6	587109	587114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640576
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11339	NC_002505	CAG	2	6	587441	587446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640576
11340	NC_002505	GCGG	2	8	587468	587475	0 %	0 %	75 %	25 %	15640576
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11343	NC_002505	A	6	6	587544	587549	100 %	0 %	0 %	0 %	15640576
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11349	NC_002505	AGC	2	6	587925	587930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640576
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11352	NC_002505	TGC	2	6	587988	587993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640576
11353	NC_002505	CAA	2	6	588073	588078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640576
11354	NC_002505	AGC	2	6	588252	588257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640576
11355	NC_002505	ATC	2	6	588287	588292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640576
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11358	NC_002505	GGC	2	6	588355	588360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640576
11359	NC_002505	T	6	6	588371	588376	0 %	100 %	0 %	0 %	15640576
11360	NC_002505	TAGTG	2	10	588487	588496	20 %	40 %	40 %	0 %	15640576
11361	NC_002505	A	6	6	588570	588575	100 %	0 %	0 %	0 %	15640576
11362	NC_002505	TGA	2	6	588580	588585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640576
11363	NC_002505	TCGC	2	8	588622	588629	0 %	25 %	25 %	50 %	15640576
11364	NC_002505	AAG	2	6	588792	588797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640576
11365	NC_002505	CTG	2	6	588821	588826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640576
11366	NC_002505	AAG	2	6	588828	588833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640576
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11490	NC_002505	ATG	2	6	595697	595702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640582
11491	NC_002505	CTGC	2	8	595736	595743	0 %	25 %	25 %	50 %	15640582
11492	NC_002505	GAT	2	6	595763	595768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640582
11493	NC_002505	CAT	2	6	595792	595797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640582
11494	NC_002505	TCA	2	6	595836	595841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640582
11495	NC_002505	TGC	2	6	595864	595869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640582
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11499	NC_002505	ATG	2	6	595970	595975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640582
11500	NC_002505	GCG	2	6	595998	596003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640582

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