MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002505	ATTG	2	8	522289	522296	25 %	50 %	25 %	0 %	15640516
10002	NC_002505	TGA	2	6	522454	522459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_002505	TTG	2	6	522465	522470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_002505	GTTT	2	8	522615	522622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_002505	ACA	2	6	522649	522654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_002505	TGG	2	6	522726	522731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_002505	A	6	6	522814	522819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_002505	CTA	2	6	522838	522843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_002505	AAT	2	6	522900	522905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_002505	TTGGTT	2	12	522913	522924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_002505	TA	3	6	522962	522967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_002505	GAAAA	2	10	522970	522979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_002505	AT	4	8	523000	523007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_002505	T	6	6	523011	523016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_002505	TTTTG	2	10	523024	523033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_002505	TAG	2	6	523040	523045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_002505	T	6	6	523062	523067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_002505	TAT	2	6	523108	523113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_002505	TTC	2	6	523192	523197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640517
10020	NC_002505	TAT	2	6	523255	523260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640517
10021	NC_002505	TCT	2	6	523311	523316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640517
10022	NC_002505	AGCT	2	8	523351	523358	25 %	25 %	25 %	25 %	15640517
10023	NC_002505	ACTTG	2	10	523406	523415	20 %	40 %	20 %	20 %	15640517
10024	NC_002505	AT	3	6	523423	523428	50 %	50 %	0 %	0 %	15640517
10025	NC_002505	AGA	2	6	523459	523464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640517
10026	NC_002505	CAC	2	6	523518	523523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640517
10027	NC_002505	CTG	2	6	523556	523561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640517
10028	NC_002505	TTA	2	6	523652	523657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640517
10029	NC_002505	CT	3	6	523693	523698	0 %	50 %	0 %	50 %	15640517
10030	NC_002505	T	6	6	523732	523737	0 %	100 %	0 %	0 %	15640517
10031	NC_002505	TCACTC	2	12	523763	523774	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15640517
10032	NC_002505	CAA	2	6	523815	523820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640517
10033	NC_002505	CTAG	2	8	524012	524019	25 %	25 %	25 %	25 %	15640517
10034	NC_002505	A	6	6	524058	524063	100 %	0 %	0 %	0 %	15640517
10035	NC_002505	AAG	2	6	524089	524094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640517
10036	NC_002505	GGC	2	6	524184	524189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640517
10037	NC_002505	ATT	2	6	524206	524211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640517
10038	NC_002505	AGT	2	6	524286	524291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640517
10039	NC_002505	TTG	2	6	524301	524306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640517
10040	NC_002505	TA	3	6	524351	524356	50 %	50 %	0 %	0 %	15640517
10041	NC_002505	AGA	2	6	524413	524418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640517
10042	NC_002505	TCT	2	6	524455	524460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640517
10043	NC_002505	CTT	2	6	524478	524483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640517
10044	NC_002505	T	7	7	524670	524676	0 %	100 %	0 %	0 %	15640517
10045	NC_002505	T	6	6	524744	524749	0 %	100 %	0 %	0 %	15640517
10046	NC_002505	CAA	2	6	524811	524816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640517
10047	NC_002505	A	7	7	524815	524821	100 %	0 %	0 %	0 %	15640517
10048	NC_002505	GTTTT	2	10	524880	524889	0 %	80 %	20 %	0 %	15640517
10049	NC_002505	ACCAT	2	10	524899	524908	40 %	20 %	0 %	40 %	15640517
10050	NC_002505	TGT	2	6	524911	524916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640517
10051	NC_002505	AAT	2	6	524964	524969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640517
10052	NC_002505	ATG	2	6	524972	524977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640517
10053	NC_002505	GA	3	6	524983	524988	50 %	0 %	50 %	0 %	15640517
10054	NC_002505	TTTA	2	8	525028	525035	25 %	75 %	0 %	0 %	15640517
10055	NC_002505	CTT	2	6	525069	525074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640517
10056	NC_002505	AAC	2	6	525085	525090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640517
10057	NC_002505	A	6	6	525103	525108	100 %	0 %	0 %	0 %	15640517
10058	NC_002505	A	6	6	525114	525119	100 %	0 %	0 %	0 %	15640517
10059	NC_002505	TTG	2	6	525180	525185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640518
10060	NC_002505	TAAT	2	8	525258	525265	50 %	50 %	0 %	0 %	15640518
10061	NC_002505	CTAT	2	8	525275	525282	25 %	50 %	0 %	25 %	15640518
10062	NC_002505	AAAT	2	8	525468	525475	75 %	25 %	0 %	0 %	15640518
10063	NC_002505	TTTTTG	2	12	525514	525525	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15640518
10064	NC_002505	ATT	2	6	525574	525579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640518
10065	NC_002505	CTT	2	6	525591	525596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640518
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10069	NC_002505	A	7	7	525707	525713	100 %	0 %	0 %	0 %	15640519
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10071	NC_002505	T	6	6	525823	525828	0 %	100 %	0 %	0 %	15640519
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10076	NC_002505	TTAA	2	8	525978	525985	50 %	50 %	0 %	0 %	15640519
10077	NC_002505	CTCACT	2	12	526037	526048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15640519
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10084	NC_002505	AT	3	6	526296	526301	50 %	50 %	0 %	0 %	15640519
10085	NC_002505	TGCA	2	8	526321	526328	25 %	25 %	25 %	25 %	15640519
10086	NC_002505	GCA	2	6	526456	526461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640519
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10089	NC_002505	ATCC	2	8	526538	526545	25 %	25 %	0 %	50 %	15640519
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10092	NC_002505	TG	3	6	526643	526648	0 %	50 %	50 %	0 %	15640519
10093	NC_002505	TTC	2	6	526649	526654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640519
10094	NC_002505	GTC	2	6	526658	526663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640519
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10096	NC_002505	TGT	2	6	526771	526776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640519
10097	NC_002505	TTCA	2	8	526779	526786	25 %	50 %	0 %	25 %	15640519
10098	NC_002505	CAA	2	6	526846	526851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_002505	TAGA	2	8	526902	526909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_002505	TTG	2	6	526932	526937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_002505	TTA	2	6	526939	526944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_002505	TACC	2	8	526992	526999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_002505	ACC	2	6	527006	527011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_002505	CTG	2	6	527057	527062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640520
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10109	NC_002505	G	6	6	527166	527171	0 %	0 %	100 %	0 %	15640520
10110	NC_002505	T	6	6	527229	527234	0 %	100 %	0 %	0 %	15640520
10111	NC_002505	GCA	2	6	527484	527489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640520
10112	NC_002505	GCTT	2	8	527506	527513	0 %	50 %	25 %	25 %	15640520
10113	NC_002505	TGA	2	6	527527	527532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640520
10114	NC_002505	TC	5	10	527548	527557	0 %	50 %	0 %	50 %	15640520
10115	NC_002505	GAA	2	6	527595	527600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640520
10116	NC_002505	AAT	2	6	527612	527617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640520
10117	NC_002505	T	7	7	527627	527633	0 %	100 %	0 %	0 %	15640520
10118	NC_002505	CTT	2	6	527689	527694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640520
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10120	NC_002505	TTC	2	6	527759	527764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640520
10121	NC_002505	TGA	2	6	527818	527823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640520
10122	NC_002505	GAT	2	6	527953	527958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_002505	AT	3	6	527957	527962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_002505	T	7	7	527980	527986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_002505	A	7	7	528043	528049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_002505	ATC	2	6	528093	528098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_002505	A	6	6	528099	528104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_002505	TAAT	2	8	528134	528141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_002505	AT	4	8	528143	528150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_002505	CAAC	2	8	528179	528186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10131	NC_002505	TCA	2	6	528191	528196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10133	NC_002505	TAT	2	6	528295	528300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_002505	T	6	6	533406	533411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10245	NC_002505	ATTGT	2	10	533759	533768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_002505	CAA	2	6	533963	533968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_002505	ATA	2	6	533991	533996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_002505	TA	3	6	533995	534000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_002505	CT	3	6	534038	534043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10255	NC_002505	ATC	2	6	534198	534203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640526
10256	NC_002505	CT	3	6	534232	534237	0 %	50 %	0 %	50 %	15640526
10257	NC_002505	AGT	2	6	534282	534287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640526
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10264	NC_002505	CAA	2	6	534876	534881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10288	NC_002505	TTAC	2	8	536419	536426	25 %	50 %	0 %	25 %	15640527
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10366	NC_002505	TGC	2	6	540152	540157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10369	NC_002505	TTGG	2	8	540234	540241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10370	NC_002505	T	8	8	540277	540284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10371	NC_002505	AG	3	6	540306	540311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10377	NC_002505	TGA	2	6	540623	540628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10378	NC_002505	AGA	2	6	540744	540749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10379	NC_002505	ATC	2	6	540787	540792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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