MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002505	GCC	2	6	23640	23645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640059
502	NC_002505	ATC	2	6	23682	23687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640059
503	NC_002505	AAT	2	6	23727	23732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640059
504	NC_002505	GTACC	2	10	23864	23873	20 %	20 %	20 %	40 %	15640059
505	NC_002505	GCT	3	9	23891	23899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640059
506	NC_002505	GC	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	15640059
507	NC_002505	CCG	2	6	23984	23989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640059
508	NC_002505	TCA	2	6	23998	24003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640059
509	NC_002505	CAC	2	6	24111	24116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640059
510	NC_002505	GCT	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640059
511	NC_002505	AGGC	2	8	24145	24152	25 %	0 %	50 %	25 %	15640059
512	NC_002505	CGC	2	6	24222	24227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640059
513	NC_002505	CCG	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640059
514	NC_002505	ACCG	2	8	24240	24247	25 %	0 %	25 %	50 %	15640059
515	NC_002505	TGC	2	6	24277	24282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640059
516	NC_002505	TTCGGC	2	12	24375	24386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640059
517	NC_002505	TGC	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640059
518	NC_002505	GCA	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640059
519	NC_002505	CGC	2	6	24425	24430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640059
520	NC_002505	GTG	2	6	24466	24471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640059
521	NC_002505	TGG	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640059
522	NC_002505	TGT	2	6	24599	24604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640059
523	NC_002505	CTGG	2	8	24632	24639	0 %	25 %	50 %	25 %	15640059
524	NC_002505	GCG	2	6	24927	24932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640060
525	NC_002505	GCT	2	6	24934	24939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640060
526	NC_002505	CGC	2	6	25035	25040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
527	NC_002505	ACC	2	6	25077	25082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640060
528	NC_002505	GC	3	6	25106	25111	0 %	0 %	50 %	50 %	15640060
529	NC_002505	AGGT	2	8	25138	25145	25 %	25 %	50 %	0 %	15640060
530	NC_002505	ACG	2	6	25207	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640060
531	NC_002505	GCC	2	6	25230	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
532	NC_002505	CAG	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640060
533	NC_002505	CAG	2	6	25316	25321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640060
534	NC_002505	CCA	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640060
535	NC_002505	TGCG	2	8	25389	25396	0 %	25 %	50 %	25 %	15640060
536	NC_002505	GTG	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640060
537	NC_002505	CAG	2	6	25484	25489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640060
538	NC_002505	GTTT	2	8	25528	25535	0 %	75 %	25 %	0 %	15640060
539	NC_002505	CGT	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640060
540	NC_002505	GCT	2	6	25553	25558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640060
541	NC_002505	CCGC	2	8	25642	25649	0 %	0 %	25 %	75 %	15640060
542	NC_002505	CGAT	2	8	25726	25733	25 %	25 %	25 %	25 %	15640060
543	NC_002505	TGG	2	6	25796	25801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640060
544	NC_002505	GCC	2	6	25803	25808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
545	NC_002505	GCT	2	6	25843	25848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640060
546	NC_002505	TTG	2	6	25849	25854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640060
547	NC_002505	CAT	2	6	25880	25885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640060
548	NC_002505	GTA	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640060
549	NC_002505	CAA	2	6	25913	25918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640060
550	NC_002505	CAG	2	6	25928	25933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640060
551	NC_002505	GA	4	8	25991	25998	50 %	0 %	50 %	0 %	15640060
552	NC_002505	CAT	2	6	26127	26132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640060
553	NC_002505	TGA	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640060
554	NC_002505	GCC	2	6	26196	26201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
555	NC_002505	CGC	2	6	26235	26240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
556	NC_002505	AC	3	6	26280	26285	50 %	0 %	0 %	50 %	15640060
557	NC_002505	GCC	2	6	26367	26372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
558	NC_002505	GCC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640060
559	NC_002505	ACC	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640060
560	NC_002505	GC	3	6	26563	26568	0 %	0 %	50 %	50 %	15640060
561	NC_002505	GC	4	8	26575	26582	0 %	0 %	50 %	50 %	15640060
562	NC_002505	GT	3	6	26601	26606	0 %	50 %	50 %	0 %	15640060
563	NC_002505	GGT	2	6	26607	26612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640060
564	NC_002505	GCT	2	6	26650	26655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640061
565	NC_002505	TCT	2	6	26686	26691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640061
566	NC_002505	GTG	2	6	26692	26697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640061
567	NC_002505	TAC	2	6	26727	26732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640061
568	NC_002505	CGG	3	9	26801	26809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640061
569	NC_002505	TGG	2	6	26939	26944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640061
570	NC_002505	CAC	2	6	26973	26978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640061
571	NC_002505	AG	3	6	27003	27008	50 %	0 %	50 %	0 %	15640061
572	NC_002505	CCA	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640061
573	NC_002505	AGA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640061
574	NC_002505	CTT	2	6	27179	27184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640061
575	NC_002505	C	6	6	27197	27202	0 %	0 %	0 %	100 %	15640061
576	NC_002505	ATC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640061
577	NC_002505	TTG	2	6	27310	27315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640061
578	NC_002505	CG	3	6	27329	27334	0 %	0 %	50 %	50 %	15640061
579	NC_002505	ATG	2	6	27343	27348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640061
580	NC_002505	TCGA	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	15640061
581	NC_002505	GAT	2	6	27429	27434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640061
582	NC_002505	AGC	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640061
583	NC_002505	TGCAT	2	10	27490	27499	20 %	40 %	20 %	20 %	15640061
584	NC_002505	ATC	2	6	27535	27540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640061
585	NC_002505	CAG	2	6	27563	27568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640061
586	NC_002505	TTG	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640061
587	NC_002505	CCTT	2	8	27587	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	15640061
588	NC_002505	TGT	2	6	27609	27614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640062
589	NC_002505	GTT	2	6	27617	27622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640062
590	NC_002505	CTTG	2	8	27778	27785	0 %	50 %	25 %	25 %	15640062
591	NC_002505	TAA	2	6	27827	27832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640062
592	NC_002505	TCT	2	6	27950	27955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640063
593	NC_002505	TCA	2	6	27956	27961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
594	NC_002505	GCA	2	6	27972	27977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
595	NC_002505	CGCAG	2	10	28007	28016	20 %	0 %	40 %	40 %	15640063
596	NC_002505	CTT	3	9	28023	28031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640063
597	NC_002505	TCA	2	6	28233	28238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
598	NC_002505	CAC	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640063
599	NC_002505	GCA	2	6	28292	28297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
600	NC_002505	GCC	2	6	28304	28309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640063
601	NC_002505	GC	3	6	28364	28369	0 %	0 %	50 %	50 %	15640063
602	NC_002505	TGC	2	6	28379	28384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640063
603	NC_002505	CAT	2	6	28438	28443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
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606	NC_002505	TGT	2	6	28479	28484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
607	NC_002505	GAT	2	6	28491	28496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640063
608	NC_002505	ATG	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640063
609	NC_002505	GCA	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
610	NC_002505	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
611	NC_002505	CGG	2	6	28638	28643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640063
612	NC_002505	TCA	2	6	28709	28714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
613	NC_002505	CCAC	2	8	28919	28926	25 %	0 %	0 %	75 %	15640063
614	NC_002505	ATACA	2	10	28927	28936	60 %	20 %	0 %	20 %	15640063
615	NC_002505	CCA	2	6	29070	29075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640063
616	NC_002505	GAC	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
617	NC_002505	AG	3	6	29176	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	15640063
618	NC_002505	CATC	2	8	29196	29203	25 %	25 %	0 %	50 %	15640063
619	NC_002505	TG	3	6	29226	29231	0 %	50 %	50 %	0 %	15640063
620	NC_002505	TGG	2	6	29307	29312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640063
621	NC_002505	GC	3	6	29359	29364	0 %	0 %	50 %	50 %	15640063
622	NC_002505	CGC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640063
623	NC_002505	GGC	2	6	29400	29405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640063
624	NC_002505	CAT	2	6	29439	29444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
625	NC_002505	GCC	2	6	29461	29466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640063
626	NC_002505	TGT	2	6	29495	29500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
627	NC_002505	CCT	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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629	NC_002505	TG	3	6	29575	29580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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