MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002505	TGC	2	6	339312	339317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640353
6502	NC_002505	GTT	2	6	339367	339372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640353
6503	NC_002505	AC	3	6	339377	339382	50 %	0 %	0 %	50 %	15640353
6504	NC_002505	TGC	2	6	339477	339482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640353
6505	NC_002505	AGC	2	6	339534	339539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640353
6506	NC_002505	ACTG	2	8	339555	339562	25 %	25 %	25 %	25 %	15640353
6507	NC_002505	ACG	2	6	339593	339598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640353
6508	NC_002505	TGA	2	6	339614	339619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640353
6509	NC_002505	AAG	2	6	339629	339634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640353
6510	NC_002505	CTG	2	6	339638	339643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640353
6511	NC_002505	GCT	2	6	339664	339669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640353
6512	NC_002505	AAG	2	6	339683	339688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640353
6513	NC_002505	GCTTTT	2	12	339705	339716	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6514	NC_002505	TAAA	2	8	339727	339734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_002505	TTG	2	6	339739	339744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_002505	GTT	2	6	339820	339825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640354
6517	NC_002505	CTG	4	12	339863	339874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640354
6518	NC_002505	GTT	2	6	339877	339882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640354
6519	NC_002505	GCT	4	12	339892	339903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640354
6520	NC_002505	GCT	3	9	339940	339948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640354
6521	NC_002505	AAG	2	6	340007	340012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640354
6522	NC_002505	AAG	2	6	340049	340054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640354
6523	NC_002505	AGA	2	6	340065	340070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640354
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6525	NC_002505	GAA	2	6	340096	340101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640354
6526	NC_002505	TGG	2	6	340164	340169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_002505	TAA	2	6	340172	340177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_002505	TTCG	2	8	340467	340474	0 %	50 %	25 %	25 %	471237035
6529	NC_002505	GTG	2	6	340631	340636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237035
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6533	NC_002505	GTAC	2	8	340950	340957	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
6534	NC_002505	CGT	3	9	340966	340974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
6535	NC_002505	CTGC	2	8	340978	340985	0 %	25 %	25 %	50 %	471237035
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6540	NC_002505	CGT	2	6	341167	341172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
6541	NC_002505	TGAA	2	8	341273	341280	50 %	25 %	25 %	0 %	471237035
6542	NC_002505	ATG	2	6	341473	341478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
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6546	NC_002505	CAT	2	6	341640	341645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237035
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6550	NC_002505	CTG	3	9	341864	341872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
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6553	NC_002505	CGT	2	6	341950	341955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
6554	NC_002505	GTC	2	6	342035	342040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
6555	NC_002505	TGAC	2	8	342164	342171	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
6556	NC_002505	CT	3	6	342184	342189	0 %	50 %	0 %	50 %	471237035
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6559	NC_002505	TGA	2	6	342258	342263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
6560	NC_002505	ATCG	2	8	342351	342358	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
6561	NC_002505	ACG	2	6	342386	342391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237035
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6563	NC_002505	CAGT	2	8	342541	342548	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
6564	NC_002505	TCGTA	2	10	342558	342567	20 %	40 %	20 %	20 %	471237035
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6602	NC_002505	TCTGT	2	10	344663	344672	0 %	60 %	20 %	20 %	15640356
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6606	NC_002505	TGAC	2	8	344950	344957	25 %	25 %	25 %	25 %	15640356
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6621	NC_002505	GCT	2	6	345413	345418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
6622	NC_002505	CGT	2	6	345429	345434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
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6997	NC_002505	GC	3	6	364504	364509	0 %	0 %	50 %	50 %	15640369
6998	NC_002505	ATCCA	2	10	364528	364537	40 %	20 %	0 %	40 %	15640369
6999	NC_002505	GTT	2	6	364664	364669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640369
7000	NC_002505	AACAG	2	10	364787	364796	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

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