MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_002505	GCC	2	6	2869909	2869914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55003	NC_002505	AG	3	6	2869926	2869931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55004	NC_002505	ACA	2	6	2869941	2869946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55005	NC_002505	AGCT	2	8	2869955	2869962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55006	NC_002505	TGC	2	6	2869988	2869993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55007	NC_002505	CCA	2	6	2870009	2870014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55008	NC_002505	TG	3	6	2870066	2870071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55009	NC_002505	AC	3	6	2870129	2870134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55010	NC_002505	AGC	2	6	2870177	2870182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55011	NC_002505	GATG	2	8	2870364	2870371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55012	NC_002505	TAC	2	6	2870440	2870445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55014	NC_002505	TGC	2	6	2870488	2870493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55015	NC_002505	TTGA	2	8	2870530	2870537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55016	NC_002505	GATTC	2	10	2870539	2870548	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55017	NC_002505	CGG	2	6	2870636	2870641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55018	NC_002505	AATC	2	8	2870649	2870656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55019	NC_002505	CAACC	2	10	2870726	2870735	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
55020	NC_002505	GGC	2	6	2870797	2870802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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55022	NC_002505	CAA	2	6	2870880	2870885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55023	NC_002505	GCACT	2	10	2870899	2870908	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55024	NC_002505	ATG	2	6	2871032	2871037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55123	NC_002505	TTG	2	6	2876987	2876992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642698
55124	NC_002505	GC	3	6	2877013	2877018	0 %	0 %	50 %	50 %	15642698
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55130	NC_002505	GGCA	2	8	2877256	2877263	25 %	0 %	50 %	25 %	471237110
55131	NC_002505	TGC	2	6	2877324	2877329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237110
55132	NC_002505	TAC	2	6	2877401	2877406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237110
55133	NC_002505	CG	3	6	2877415	2877420	0 %	0 %	50 %	50 %	471237110
55134	NC_002505	GTG	2	6	2877491	2877496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237110
55135	NC_002505	GC	3	6	2877500	2877505	0 %	0 %	50 %	50 %	471237110
55136	NC_002505	TCT	2	6	2877558	2877563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237110
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55142	NC_002505	GCA	2	6	2877824	2877829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237110
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55170	NC_002505	TGG	2	6	2878722	2878727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237110
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55189	NC_002505	T	6	6	2879683	2879688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55190	NC_002505	TCA	2	6	2879704	2879709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55193	NC_002505	CAGT	2	8	2879840	2879847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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55232	NC_002505	ATC	2	6	2882282	2882287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642704
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55234	NC_002505	GCA	2	6	2882312	2882317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642704
55235	NC_002505	CG	5	10	2882340	2882349	0 %	0 %	50 %	50 %	15642704
55236	NC_002505	GTC	2	6	2882406	2882411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642704
55237	NC_002505	GATG	2	8	2882503	2882510	25 %	25 %	50 %	0 %	15642704
55238	NC_002505	TGA	2	6	2882541	2882546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642704
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55240	NC_002505	TGA	2	6	2882581	2882586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642704
55241	NC_002505	CGG	2	6	2882608	2882613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642704
55242	NC_002505	AATAAA	2	12	2882615	2882626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15642704
55243	NC_002505	TGT	2	6	2882672	2882677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642704
55244	NC_002505	CAT	2	6	2882698	2882703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642704
55245	NC_002505	CAC	2	6	2882974	2882979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642704
55246	NC_002505	CAT	2	6	2883004	2883009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642704
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55251	NC_002505	ACACTG	2	12	2883450	2883461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642705
55252	NC_002505	T	7	7	2883464	2883470	0 %	100 %	0 %	0 %	15642705
55253	NC_002505	AAC	2	6	2883492	2883497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642705
55254	NC_002505	ATC	2	6	2883561	2883566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642705
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55257	NC_002505	TCAT	2	8	2883778	2883785	25 %	50 %	0 %	25 %	15642705
55258	NC_002505	CGG	2	6	2883793	2883798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642705
55259	NC_002505	GCT	2	6	2883863	2883868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642705
55260	NC_002505	TC	3	6	2883878	2883883	0 %	50 %	0 %	50 %	15642705
55261	NC_002505	CCA	2	6	2883941	2883946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642705
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55275	NC_002505	TGAT	2	8	2884654	2884661	25 %	50 %	25 %	0 %	15642705
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55285	NC_002505	CG	3	6	2885171	2885176	0 %	0 %	50 %	50 %	15642705
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55289	NC_002505	CT	3	6	2885368	2885373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55290	NC_002505	CAGAG	2	10	2885377	2885386	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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55293	NC_002505	GAAC	2	8	2885474	2885481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55294	NC_002505	ACC	2	6	2885556	2885561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55295	NC_002505	CT	3	6	2885676	2885681	0 %	50 %	0 %	50 %	15642706
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55319	NC_002505	TGC	2	6	2887047	2887052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55322	NC_002505	TTTA	2	8	2887214	2887221	25 %	75 %	0 %	0 %	15642707
55323	NC_002505	CTTGG	2	10	2887222	2887231	0 %	40 %	40 %	20 %	15642707
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55334	NC_002505	TGG	2	6	2887766	2887771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642707
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55346	NC_002505	GTA	2	6	2888273	2888278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642707
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55348	NC_002505	CG	3	6	2888379	2888384	0 %	0 %	50 %	50 %	15642707
55349	NC_002505	AGTT	2	8	2888420	2888427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55350	NC_002505	GGC	2	6	2888428	2888433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55351	NC_002505	AACA	2	8	2888446	2888453	75 %	0 %	0 %	25 %	15642708
55352	NC_002505	ACG	2	6	2888515	2888520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642708
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55354	NC_002505	CG	3	6	2888598	2888603	0 %	0 %	50 %	50 %	15642708
55355	NC_002505	AGTG	2	8	2888659	2888666	25 %	25 %	50 %	0 %	15642708
55356	NC_002505	CAC	2	6	2888679	2888684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642708
55357	NC_002505	ATG	2	6	2888732	2888737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642708
55358	NC_002505	TCT	2	6	2888741	2888746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642708
55359	NC_002505	GGC	2	6	2888778	2888783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642708
55360	NC_002505	ATC	2	6	2888842	2888847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642708
55361	NC_002505	TGT	2	6	2888919	2888924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642708
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55364	NC_002505	CAG	2	6	2889013	2889018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642708
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55367	NC_002505	ATC	3	9	2889106	2889114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642708
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55373	NC_002505	CTT	2	6	2889521	2889526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642709
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55389	NC_002505	CCA	2	6	2890029	2890034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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55397	NC_002505	CG	3	6	2890583	2890588	0 %	0 %	50 %	50 %	15642710
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55403	NC_002505	CATT	2	8	2890797	2890804	25 %	50 %	0 %	25 %	15642710
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55448	NC_002505	CGCCTC	2	12	2893093	2893104	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15642712
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55460	NC_002505	GCTTG	2	10	2894018	2894027	0 %	40 %	40 %	20 %	15642713
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55463	NC_002505	AGCC	2	8	2894241	2894248	25 %	0 %	25 %	50 %	15642713
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55466	NC_002505	GC	3	6	2894321	2894326	0 %	0 %	50 %	50 %	15642713
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55472	NC_002505	T	6	6	2894617	2894622	0 %	100 %	0 %	0 %	15642713
55473	NC_002505	ATC	2	6	2894639	2894644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642713
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55478	NC_002505	GT	3	6	2894787	2894792	0 %	50 %	50 %	0 %	15642714
55479	NC_002505	TGA	2	6	2894905	2894910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642714
55480	NC_002505	GAA	2	6	2894930	2894935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642714
55481	NC_002505	GGCC	2	8	2895079	2895086	0 %	0 %	50 %	50 %	15642714
55482	NC_002505	TGG	2	6	2895088	2895093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642714
55483	NC_002505	GAT	2	6	2895119	2895124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642714
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55499	NC_002505	GC	4	8	2895735	2895742	0 %	0 %	50 %	50 %	161581978
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