MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_002505	GCT	2	6	2844305	2844310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642672
54503	NC_002505	ACG	2	6	2844405	2844410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642672
54504	NC_002505	TGA	2	6	2844430	2844435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642672
54505	NC_002505	GCA	2	6	2844451	2844456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642672
54506	NC_002505	TGT	2	6	2844457	2844462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642672
54507	NC_002505	TGAG	2	8	2844499	2844506	25 %	25 %	50 %	0 %	15642672
54508	NC_002505	CAG	2	6	2844651	2844656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642672
54509	NC_002505	AACG	2	8	2844693	2844700	50 %	0 %	25 %	25 %	15642672
54510	NC_002505	GC	3	6	2844861	2844866	0 %	0 %	50 %	50 %	15642672
54511	NC_002505	GAC	2	6	2844925	2844930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642672
54512	NC_002505	TCA	2	6	2844947	2844952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642672
54513	NC_002505	ATG	2	6	2845065	2845070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54514	NC_002505	CAGAA	2	10	2845199	2845208	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54515	NC_002505	TCA	2	6	2845252	2845257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54516	NC_002505	ATA	2	6	2845260	2845265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54517	NC_002505	AC	3	6	2845290	2845295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54518	NC_002505	ATCG	2	8	2845346	2845353	25 %	25 %	25 %	25 %	15642673
54519	NC_002505	TTG	2	6	2845382	2845387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642673
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54521	NC_002505	GTA	2	6	2845444	2845449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642673
54522	NC_002505	A	6	6	2845566	2845571	100 %	0 %	0 %	0 %	15642673
54523	NC_002505	AAGA	2	8	2845617	2845624	75 %	0 %	25 %	0 %	15642673
54524	NC_002505	TGG	2	6	2845677	2845682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642673
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54533	NC_002505	TGG	2	6	2846130	2846135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642673
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54545	NC_002505	GCCA	2	8	2846652	2846659	25 %	0 %	25 %	50 %	15642673
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54554	NC_002505	TGC	2	6	2847081	2847086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642673
54555	NC_002505	CTTTGC	2	12	2847199	2847210	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15642673
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54559	NC_002505	AT	3	6	2847650	2847655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54560	NC_002505	CT	3	6	2847685	2847690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54569	NC_002505	ATCTC	2	10	2848074	2848083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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54573	NC_002505	ATAA	2	8	2848281	2848288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54591	NC_002505	GC	3	6	2849332	2849337	0 %	0 %	50 %	50 %	15642676
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54602	NC_002505	TTGAC	2	10	2849873	2849882	20 %	40 %	20 %	20 %	15642677
54603	NC_002505	TC	3	6	2849890	2849895	0 %	50 %	0 %	50 %	15642677
54604	NC_002505	T	8	8	2849940	2849947	0 %	100 %	0 %	0 %	15642677
54605	NC_002505	TCGAA	2	10	2850035	2850044	40 %	20 %	20 %	20 %	15642677
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54608	NC_002505	AGCC	2	8	2850293	2850300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54609	NC_002505	C	6	6	2850355	2850360	0 %	0 %	0 %	100 %	15642678
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54620	NC_002505	TGG	2	6	2850952	2850957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642678
54621	NC_002505	GC	3	6	2851028	2851033	0 %	0 %	50 %	50 %	15642678
54622	NC_002505	AG	3	6	2851050	2851055	50 %	0 %	50 %	0 %	15642678
54623	NC_002505	ATC	2	6	2851109	2851114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642678
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54625	NC_002505	AGC	2	6	2851208	2851213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642678
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54628	NC_002505	TGC	2	6	2851358	2851363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642678
54629	NC_002505	CTGAT	2	10	2851391	2851400	20 %	40 %	20 %	20 %	15642678
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54631	NC_002505	TAG	2	6	2851494	2851499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642679
54632	NC_002505	TGA	2	6	2851560	2851565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642679
54633	NC_002505	TGG	3	9	2851568	2851576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642679
54634	NC_002505	TGCGC	2	10	2851665	2851674	0 %	20 %	40 %	40 %	15642679
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54640	NC_002505	CA	3	6	2851920	2851925	50 %	0 %	0 %	50 %	15642679
54641	NC_002505	CG	4	8	2851939	2851946	0 %	0 %	50 %	50 %	15642679
54642	NC_002505	ACT	2	6	2851956	2851961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642679
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54646	NC_002505	TGC	2	6	2852177	2852182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642679
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54685	NC_002505	CAT	2	6	2853954	2853959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54687	NC_002505	CATA	2	8	2853983	2853990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54688	NC_002505	ATTCAG	2	12	2854115	2854126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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54690	NC_002505	T	6	6	2854238	2854243	0 %	100 %	0 %	0 %	161581980
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54704	NC_002505	ATT	2	6	2855106	2855111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54708	NC_002505	TTG	2	6	2855362	2855367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642681
54709	NC_002505	A	7	7	2855467	2855473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54710	NC_002505	CTTAA	2	10	2855493	2855502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54711	NC_002505	CAAAGG	2	12	2855571	2855582	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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54713	NC_002505	TC	3	6	2855642	2855647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54714	NC_002505	AGCAA	2	10	2855658	2855667	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54715	NC_002505	GCC	2	6	2855760	2855765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642683
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54725	NC_002505	CG	3	6	2856330	2856335	0 %	0 %	50 %	50 %	15642683
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54727	NC_002505	G	6	6	2856409	2856414	0 %	0 %	100 %	0 %	15642683
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54732	NC_002505	CAA	2	6	2856651	2856656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642683
54733	NC_002505	CAT	2	6	2856665	2856670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642683
54734	NC_002505	AAAC	2	8	2856687	2856694	75 %	0 %	0 %	25 %	15642683
54735	NC_002505	A	6	6	2856701	2856706	100 %	0 %	0 %	0 %	15642683
54736	NC_002505	TGC	2	6	2856744	2856749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54738	NC_002505	GTG	2	6	2856832	2856837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642684
54739	NC_002505	CA	3	6	2856862	2856867	50 %	0 %	0 %	50 %	15642684
54740	NC_002505	ACC	2	6	2856871	2856876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642684
54741	NC_002505	ACC	2	6	2856952	2856957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642684
54742	NC_002505	CATC	2	8	2857035	2857042	25 %	25 %	0 %	50 %	15642684
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54758	NC_002505	CGAAT	2	10	2857735	2857744	40 %	20 %	20 %	20 %	15642684
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54762	NC_002505	TGC	2	6	2857998	2858003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54793	NC_002505	TGCA	2	8	2859128	2859135	25 %	25 %	25 %	25 %	15642686
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54855	NC_002505	CGTG	2	8	2862447	2862454	0 %	25 %	50 %	25 %	15642689
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54974	NC_002505	T	6	6	2867851	2867856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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