MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_002505	TGA	2	6	2820035	2820040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161581981
54003	NC_002505	ACC	2	6	2820071	2820076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161581981
54004	NC_002505	TGA	2	6	2820083	2820088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161581981
54005	NC_002505	ATTCCG	2	12	2820095	2820106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161581981
54006	NC_002505	GCA	2	6	2820127	2820132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161581981
54007	NC_002505	GAA	2	6	2820178	2820183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161581981
54008	NC_002505	ACTC	2	8	2820195	2820202	25 %	25 %	0 %	50 %	161581981
54009	NC_002505	CGG	2	6	2820216	2820221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161581981
54010	NC_002505	CGG	2	6	2820234	2820239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161581981
54011	NC_002505	CCA	2	6	2820271	2820276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161581981
54012	NC_002505	TAC	2	6	2820401	2820406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161581981
54013	NC_002505	CCA	2	6	2820409	2820414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161581981
54014	NC_002505	CGTG	2	8	2820486	2820493	0 %	25 %	50 %	25 %	161581981
54015	NC_002505	TGG	2	6	2820591	2820596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161581981
54016	NC_002505	TCT	2	6	2820626	2820631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161581981
54017	NC_002505	TTC	2	6	2820653	2820658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161581981
54018	NC_002505	TTC	2	6	2820748	2820753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161581981
54019	NC_002505	ATG	2	6	2820818	2820823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161581981
54020	NC_002505	TTG	2	6	2820830	2820835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161581981
54021	NC_002505	TGC	2	6	2820995	2821000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161581981
54022	NC_002505	CTG	2	6	2821009	2821014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161581981
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54024	NC_002505	GCG	2	6	2821087	2821092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161581981
54025	NC_002505	A	6	6	2821135	2821140	100 %	0 %	0 %	0 %	161581981
54026	NC_002505	T	6	6	2821177	2821182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54027	NC_002505	ATT	2	6	2821184	2821189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54028	NC_002505	AAT	2	6	2821193	2821198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54029	NC_002505	TTA	2	6	2821243	2821248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54030	NC_002505	TAC	2	6	2821257	2821262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54032	NC_002505	CAA	2	6	2821420	2821425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54033	NC_002505	TAGA	2	8	2821431	2821438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54034	NC_002505	AGCC	2	8	2821573	2821580	25 %	0 %	25 %	50 %	15642642
54035	NC_002505	CAG	2	6	2821583	2821588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642642
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54037	NC_002505	CGTG	2	8	2821744	2821751	0 %	25 %	50 %	25 %	15642642
54038	NC_002505	GAA	2	6	2821829	2821834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642642
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54042	NC_002505	AAGCC	2	10	2822010	2822019	40 %	0 %	20 %	40 %	15642642
54043	NC_002505	A	6	6	2822034	2822039	100 %	0 %	0 %	0 %	15642642
54044	NC_002505	GAT	2	6	2822041	2822046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54046	NC_002505	T	6	6	2822066	2822071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54047	NC_002505	AG	4	8	2822116	2822123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54048	NC_002505	CCG	2	6	2822140	2822145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54049	NC_002505	CTG	2	6	2822172	2822177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642644
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54052	NC_002505	ATC	2	6	2822344	2822349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642644
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54054	NC_002505	CAT	2	6	2822429	2822434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642644
54055	NC_002505	CGG	2	6	2822444	2822449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642644
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54057	NC_002505	CGC	3	9	2822703	2822711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642644
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54070	NC_002505	AGCCA	2	10	2823360	2823369	40 %	0 %	20 %	40 %	15642646
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54079	NC_002505	CAT	2	6	2823920	2823925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642646
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54083	NC_002505	CG	3	6	2824237	2824242	0 %	0 %	50 %	50 %	15642647
54084	NC_002505	CTT	2	6	2824265	2824270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642647
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54089	NC_002505	TCT	2	6	2824495	2824500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642648
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54102	NC_002505	AATC	2	8	2825577	2825584	50 %	25 %	0 %	25 %	471237109
54103	NC_002505	CG	3	6	2825724	2825729	0 %	0 %	50 %	50 %	471237109
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54109	NC_002505	GCA	2	6	2826000	2826005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237109
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54116	NC_002505	CGTGG	2	10	2826277	2826286	0 %	20 %	60 %	20 %	471237109
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54118	NC_002505	A	6	6	2826328	2826333	100 %	0 %	0 %	0 %	471237109
54119	NC_002505	CAA	2	6	2826349	2826354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237109
54120	NC_002505	CG	3	6	2826358	2826363	0 %	0 %	50 %	50 %	471237109
54121	NC_002505	TCA	2	6	2826422	2826427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237109
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54123	NC_002505	GGT	2	6	2826602	2826607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54125	NC_002505	GGA	2	6	2826712	2826717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54190	NC_002505	GGTT	2	8	2830134	2830141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54191	NC_002505	T	6	6	2830140	2830145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54192	NC_002505	AG	3	6	2830230	2830235	50 %	0 %	50 %	0 %	15642655
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54197	NC_002505	ACCA	2	8	2830406	2830413	50 %	0 %	0 %	50 %	15642655
54198	NC_002505	GCA	2	6	2830445	2830450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642655
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54202	NC_002505	AGC	2	6	2830589	2830594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642655
54203	NC_002505	ATTC	2	8	2830704	2830711	25 %	50 %	0 %	25 %	15642655
54204	NC_002505	T	6	6	2830728	2830733	0 %	100 %	0 %	0 %	15642655
54205	NC_002505	CAT	2	6	2830769	2830774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54210	NC_002505	AACAA	2	10	2831047	2831056	80 %	0 %	0 %	20 %	15642656
54211	NC_002505	TGC	2	6	2831071	2831076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642656
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54220	NC_002505	CTG	2	6	2831421	2831426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642656
54221	NC_002505	AC	3	6	2831430	2831435	50 %	0 %	0 %	50 %	15642656
54222	NC_002505	CAG	2	6	2831472	2831477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642656
54223	NC_002505	TCAA	2	8	2831512	2831519	50 %	25 %	0 %	25 %	15642656
54224	NC_002505	GT	3	6	2831521	2831526	0 %	50 %	50 %	0 %	15642656
54225	NC_002505	TTA	2	6	2831603	2831608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642656
54226	NC_002505	GGCGC	2	10	2831634	2831643	0 %	0 %	60 %	40 %	15642656
54227	NC_002505	TGA	2	6	2831657	2831662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642656
54228	NC_002505	CAT	2	6	2831815	2831820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54229	NC_002505	T	6	6	2831903	2831908	0 %	100 %	0 %	0 %	15642657
54230	NC_002505	TTG	2	6	2831914	2831919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642657
54231	NC_002505	AGT	2	6	2831993	2831998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642657
54232	NC_002505	CAT	2	6	2832026	2832031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642657
54233	NC_002505	GAA	2	6	2832138	2832143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642657
54234	NC_002505	TTCA	2	8	2832216	2832223	25 %	50 %	0 %	25 %	15642657
54235	NC_002505	AGA	2	6	2832294	2832299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642657
54236	NC_002505	GGAT	2	8	2832399	2832406	25 %	25 %	50 %	0 %	15642657
54237	NC_002505	A	7	7	2832544	2832550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54238	NC_002505	GAT	2	6	2832586	2832591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54239	NC_002505	CAT	2	6	2832594	2832599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54240	NC_002505	GCC	2	6	2832600	2832605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54241	NC_002505	CCCATG	2	12	2832613	2832624	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15642659
54242	NC_002505	TCTT	2	8	2832643	2832650	0 %	75 %	0 %	25 %	15642659
54243	NC_002505	ATC	2	6	2832664	2832669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642659
54244	NC_002505	GTG	2	6	2832676	2832681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642659
54245	NC_002505	ATC	2	6	2832682	2832687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642659
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54247	NC_002505	TTGG	2	8	2832733	2832740	0 %	50 %	50 %	0 %	15642659
54248	NC_002505	GCAC	2	8	2832814	2832821	25 %	0 %	25 %	50 %	15642659
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54311	NC_002505	TTAT	2	8	2835579	2835586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54346	NC_002505	CAGCG	2	10	2836842	2836851	20 %	0 %	40 %	40 %	15642664
54347	NC_002505	CG	3	6	2836850	2836855	0 %	0 %	50 %	50 %	15642664
54348	NC_002505	AG	4	8	2837024	2837031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54349	NC_002505	TAA	2	6	2837038	2837043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54351	NC_002505	AAT	2	6	2837076	2837081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54352	NC_002505	T	6	6	2837192	2837197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54353	NC_002505	CGT	2	6	2837228	2837233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642665
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54356	NC_002505	TGT	2	6	2837335	2837340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642665
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54358	NC_002505	GGC	2	6	2837393	2837398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642665
54359	NC_002505	GTG	2	6	2837442	2837447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642665
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54362	NC_002505	TCG	2	6	2837553	2837558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642665
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