MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52118	NC_002505	TGG	2	6	2716135	2716140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642529
52119	NC_002505	GAT	2	6	2716217	2716222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642529
52120	NC_002505	GAT	3	9	2716239	2716247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642529
52121	NC_002505	GTC	2	6	2716266	2716271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642529
52122	NC_002505	GC	3	6	2716278	2716283	0 %	0 %	50 %	50 %	15642529
52123	NC_002505	GCC	2	6	2716317	2716322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642529
52124	NC_002505	TGC	2	6	2716325	2716330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642529
52125	NC_002505	GGC	2	6	2716373	2716378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642529
52126	NC_002505	TGCTG	2	10	2716382	2716391	0 %	40 %	40 %	20 %	15642529
52127	NC_002505	CCAT	2	8	2716404	2716411	25 %	25 %	0 %	50 %	15642529
52128	NC_002505	GCG	2	6	2716414	2716419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642529
52129	NC_002505	TGA	2	6	2716501	2716506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642529
52130	NC_002505	AAG	2	6	2716507	2716512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642529
52131	NC_002505	ATC	2	6	2716551	2716556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642529
52132	NC_002505	TCG	2	6	2716564	2716569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642529
52133	NC_002505	GAT	2	6	2716616	2716621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642529
52134	NC_002505	GGT	2	6	2716704	2716709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642529
52135	NC_002505	TGC	2	6	2716771	2716776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642529
52136	NC_002505	AGTT	2	8	2716782	2716789	25 %	50 %	25 %	0 %	15642529
52137	NC_002505	TTCA	2	8	2716839	2716846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52138	NC_002505	TCAA	2	8	2716884	2716891	50 %	25 %	0 %	25 %	15642530
52139	NC_002505	CTG	2	6	2716949	2716954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642530
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52142	NC_002505	GC	3	6	2717207	2717212	0 %	0 %	50 %	50 %	15642530
52143	NC_002505	AGTA	2	8	2717226	2717233	50 %	25 %	25 %	0 %	15642530
52144	NC_002505	TGA	2	6	2717254	2717259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642530
52145	NC_002505	GAT	2	6	2717374	2717379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642530
52146	NC_002505	CCG	2	6	2717530	2717535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642530
52147	NC_002505	TAGC	2	8	2717670	2717677	25 %	25 %	25 %	25 %	15642530
52148	NC_002505	CGC	2	6	2717771	2717776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642530
52149	NC_002505	TCA	2	6	2717823	2717828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642530
52150	NC_002505	CA	3	6	2718055	2718060	50 %	0 %	0 %	50 %	15642530
52151	NC_002505	CGC	2	6	2718122	2718127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642530
52152	NC_002505	TTCA	2	8	2718205	2718212	25 %	50 %	0 %	25 %	15642530
52153	NC_002505	TTA	2	6	2718230	2718235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642530
52154	NC_002505	TCA	2	6	2718296	2718301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52155	NC_002505	TGA	2	6	2718302	2718307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52156	NC_002505	GAA	2	6	2718349	2718354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642531
52157	NC_002505	TGG	2	6	2718425	2718430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642531
52158	NC_002505	AGA	2	6	2718468	2718473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642531
52159	NC_002505	TCG	2	6	2718519	2718524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642531
52160	NC_002505	CGTCTG	2	12	2718727	2718738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642531
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52164	NC_002505	AAG	2	6	2718815	2718820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642531
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52166	NC_002505	A	6	6	2718924	2718929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52167	NC_002505	AGGATG	2	12	2719030	2719041	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15642532
52168	NC_002505	TCAC	2	8	2719064	2719071	25 %	25 %	0 %	50 %	15642532
52169	NC_002505	TGGC	2	8	2719106	2719113	0 %	25 %	50 %	25 %	15642532
52170	NC_002505	TGG	2	6	2719136	2719141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642532
52171	NC_002505	GCA	2	6	2719209	2719214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642532
52172	NC_002505	TCA	2	6	2719238	2719243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642532
52173	NC_002505	GC	3	6	2719276	2719281	0 %	0 %	50 %	50 %	15642532
52174	NC_002505	CCG	2	6	2719304	2719309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642532
52175	NC_002505	CACG	2	8	2719434	2719441	25 %	0 %	25 %	50 %	15642532
52176	NC_002505	TGC	2	6	2719536	2719541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642532
52177	NC_002505	CCA	2	6	2719566	2719571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642532
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52179	NC_002505	CGA	2	6	2719796	2719801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642533
52180	NC_002505	CCG	2	6	2719802	2719807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642533
52181	NC_002505	GA	3	6	2719939	2719944	50 %	0 %	50 %	0 %	15642533
52182	NC_002505	GC	4	8	2719955	2719962	0 %	0 %	50 %	50 %	15642533
52183	NC_002505	ACG	2	6	2720065	2720070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642533
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52188	NC_002505	GCT	2	6	2720298	2720303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642533
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52190	NC_002505	CAC	2	6	2720397	2720402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642533
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52193	NC_002505	GCA	2	6	2720509	2720514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642533
52194	NC_002505	ATCGAA	2	12	2720613	2720624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15642533
52195	NC_002505	TGG	2	6	2720654	2720659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642533
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52200	NC_002505	TGC	2	6	2720821	2720826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642533
52201	NC_002505	GCA	3	9	2720852	2720860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642533
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52207	NC_002505	CAGAT	2	10	2721190	2721199	40 %	20 %	20 %	20 %	15642533
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52209	NC_002505	TGC	2	6	2721240	2721245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642533
52210	NC_002505	GAG	2	6	2721290	2721295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642533
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52212	NC_002505	GAAA	2	8	2721384	2721391	75 %	0 %	25 %	0 %	15642534
52213	NC_002505	CCG	2	6	2721440	2721445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642534
52214	NC_002505	GGC	2	6	2721555	2721560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642534
52215	NC_002505	CAT	2	6	2721614	2721619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642534
52216	NC_002505	AG	3	6	2721657	2721662	50 %	0 %	50 %	0 %	15642534
52217	NC_002505	GCT	2	6	2721743	2721748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642534
52218	NC_002505	CAG	2	6	2721792	2721797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642534
52219	NC_002505	ATC	2	6	2721849	2721854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642534
52220	NC_002505	CCA	2	6	2721863	2721868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642534
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52222	NC_002505	CTT	2	6	2722031	2722036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642534
52223	NC_002505	GTT	2	6	2722044	2722049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642534
52224	NC_002505	CAC	2	6	2722062	2722067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642534
52225	NC_002505	TGC	2	6	2722082	2722087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642534
52226	NC_002505	CAT	2	6	2722121	2722126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642534
52227	NC_002505	CGG	2	6	2722202	2722207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642534
52228	NC_002505	GCA	2	6	2722243	2722248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642534
52229	NC_002505	CAGT	2	8	2722289	2722296	25 %	25 %	25 %	25 %	15642534
52230	NC_002505	GCTC	2	8	2722309	2722316	0 %	25 %	25 %	50 %	15642534
52231	NC_002505	GAGG	2	8	2722340	2722347	25 %	0 %	75 %	0 %	15642535
52232	NC_002505	ATT	2	6	2722361	2722366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642535
52233	NC_002505	GGTTCA	2	12	2722409	2722420	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15642535
52234	NC_002505	C	6	6	2722492	2722497	0 %	0 %	0 %	100 %	15642535
52235	NC_002505	CGC	2	6	2722574	2722579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642535
52236	NC_002505	GAT	2	6	2722631	2722636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642536
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52238	NC_002505	TGA	2	6	2722687	2722692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642536
52239	NC_002505	GCA	2	6	2722705	2722710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642536
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52355	NC_002505	GCTCA	2	10	2729970	2729979	20 %	20 %	20 %	40 %	15642542
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52359	NC_002505	GAT	2	6	2730039	2730044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642542
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52402	NC_002505	CA	3	6	2732683	2732688	50 %	0 %	0 %	50 %	15642544
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52412	NC_002505	TTTG	2	8	2733345	2733352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52413	NC_002505	CA	3	6	2733433	2733438	50 %	0 %	0 %	50 %	15642545
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52423	NC_002505	GA	3	6	2734044	2734049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52424	NC_002505	TCA	2	6	2734065	2734070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52427	NC_002505	TGAT	2	8	2734244	2734251	25 %	50 %	25 %	0 %	15642546
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52442	NC_002505	CACCG	2	10	2734662	2734671	20 %	0 %	20 %	60 %	15642547
52443	NC_002505	AC	3	6	2734821	2734826	50 %	0 %	0 %	50 %	15642547
52444	NC_002505	TGAAGA	2	12	2734866	2734877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15642547
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52449	NC_002505	GAG	2	6	2735297	2735302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52473	NC_002505	GCG	2	6	2736965	2736970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642549
52474	NC_002505	AG	3	6	2736972	2736977	50 %	0 %	50 %	0 %	15642549
52475	NC_002505	TTTGC	2	10	2737020	2737029	0 %	60 %	20 %	20 %	15642549
52476	NC_002505	CGC	2	6	2737106	2737111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642549
52477	NC_002505	GCTG	2	8	2737148	2737155	0 %	25 %	50 %	25 %	15642549
52478	NC_002505	GC	3	6	2737232	2737237	0 %	0 %	50 %	50 %	15642549
52479	NC_002505	TGAC	2	8	2737293	2737300	25 %	25 %	25 %	25 %	15642549
52480	NC_002505	TCA	2	6	2737361	2737366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642550
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52482	NC_002505	ATGCCG	2	12	2737495	2737506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15642550
52483	NC_002505	AGC	2	6	2737532	2737537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642550
52484	NC_002505	GAT	2	6	2737615	2737620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642550
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52486	NC_002505	ATT	2	6	2737696	2737701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642550
52487	NC_002505	ACG	2	6	2737841	2737846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642550
52488	NC_002505	AG	3	6	2737859	2737864	50 %	0 %	50 %	0 %	15642550
52489	NC_002505	CCCT	2	8	2737876	2737883	0 %	25 %	0 %	75 %	15642550
52490	NC_002505	GATA	2	8	2737917	2737924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52491	NC_002505	ATAA	2	8	2737947	2737954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52492	NC_002505	AAC	2	6	2738027	2738032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52493	NC_002505	TAT	2	6	2738043	2738048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52494	NC_002505	AG	3	6	2738082	2738087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52495	NC_002505	GCT	2	6	2738096	2738101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52496	NC_002505	GCG	2	6	2738104	2738109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52497	NC_002505	CAG	2	6	2738126	2738131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52498	NC_002505	GCA	2	6	2738141	2738146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52499	NC_002505	TGT	2	6	2738185	2738190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52500	NC_002505	TCA	2	6	2738281	2738286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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