MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 56764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_002505	CGC	2	6	2603520	2603525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642427
50003	NC_002505	TGA	2	6	2603534	2603539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642427
50004	NC_002505	TTACCT	2	12	2603545	2603556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15642427
50005	NC_002505	TCA	2	6	2603660	2603665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642427
50006	NC_002505	CAG	2	6	2603718	2603723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642427
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50012	NC_002505	CG	4	8	2603861	2603868	0 %	0 %	50 %	50 %	15642427
50013	NC_002505	CGAG	2	8	2603888	2603895	25 %	0 %	50 %	25 %	15642427
50014	NC_002505	TGCT	2	8	2603925	2603932	0 %	50 %	25 %	25 %	15642427
50015	NC_002505	CAT	2	6	2604002	2604007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642427
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50019	NC_002505	GCG	2	6	2604123	2604128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642427
50020	NC_002505	ATC	2	6	2604129	2604134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642427
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50107	NC_002505	CA	3	6	2608594	2608599	50 %	0 %	0 %	50 %	15642430
50108	NC_002505	CGA	2	6	2608627	2608632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
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50118	NC_002505	CTCA	2	8	2608775	2608782	25 %	25 %	0 %	50 %	15642430
50119	NC_002505	CAG	2	6	2608844	2608849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
50120	NC_002505	T	7	7	2608940	2608946	0 %	100 %	0 %	0 %	15642430
50121	NC_002505	GT	3	6	2608987	2608992	0 %	50 %	50 %	0 %	15642430
50122	NC_002505	CCG	2	6	2609113	2609118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642430
50123	NC_002505	GAC	2	6	2609175	2609180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
50124	NC_002505	TTAT	2	8	2609209	2609216	25 %	75 %	0 %	0 %	15642430
50125	NC_002505	TTCG	2	8	2609324	2609331	0 %	50 %	25 %	25 %	15642431
50126	NC_002505	GC	3	6	2609342	2609347	0 %	0 %	50 %	50 %	15642431
50127	NC_002505	ACT	2	6	2609369	2609374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642431
50128	NC_002505	GACA	2	8	2609411	2609418	50 %	0 %	25 %	25 %	15642431
50129	NC_002505	TCA	2	6	2609445	2609450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642431
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50131	NC_002505	AGC	2	6	2609519	2609524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642431
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50133	NC_002505	GCAG	2	8	2609559	2609566	25 %	0 %	50 %	25 %	15642431
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50137	NC_002505	TCA	2	6	2609782	2609787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642432
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50141	NC_002505	CTT	2	6	2609947	2609952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642432
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50146	NC_002505	TTA	2	6	2610231	2610236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642432
50147	NC_002505	TCTT	2	8	2610249	2610256	0 %	75 %	0 %	25 %	15642432
50148	NC_002505	GCT	2	6	2610271	2610276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642432
50149	NC_002505	CCT	2	6	2610298	2610303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642432
50150	NC_002505	TGA	2	6	2610306	2610311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642432
50151	NC_002505	TA	3	6	2610366	2610371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50152	NC_002505	T	6	6	2610384	2610389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50153	NC_002505	A	6	6	2610433	2610438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50154	NC_002505	A	6	6	2610527	2610532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50155	NC_002505	ATT	2	6	2610541	2610546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50156	NC_002505	TGC	2	6	2610553	2610558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642433
50157	NC_002505	TGC	2	6	2610664	2610669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642433
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50162	NC_002505	A	6	6	2610848	2610853	100 %	0 %	0 %	0 %	15642433
50163	NC_002505	CAA	2	6	2610887	2610892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642433
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50186	NC_002505	ACC	2	6	2611955	2611960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50210	NC_002505	GATAA	2	10	2612972	2612981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50211	NC_002505	CTG	2	6	2613031	2613036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50212	NC_002505	GTGAG	2	10	2613111	2613120	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50213	NC_002505	TTG	2	6	2613122	2613127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50216	NC_002505	AAG	2	6	2613189	2613194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50217	NC_002505	AC	3	6	2613336	2613341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50218	NC_002505	GCC	2	6	2613417	2613422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50219	NC_002505	CTG	2	6	2613451	2613456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50220	NC_002505	GATT	2	8	2613515	2613522	25 %	50 %	25 %	0 %	15642434
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50222	NC_002505	TCA	2	6	2613612	2613617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642434
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50226	NC_002505	CCG	2	6	2613764	2613769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642434
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50228	NC_002505	ACC	2	6	2613800	2613805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642434
50229	NC_002505	CTC	2	6	2613823	2613828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642434
50230	NC_002505	GT	3	6	2613855	2613860	0 %	50 %	50 %	0 %	15642434
50231	NC_002505	TTG	2	6	2613871	2613876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642434
50232	NC_002505	GCG	2	6	2613879	2613884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
50233	NC_002505	ATC	2	6	2613896	2613901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642434
50234	NC_002505	CG	4	8	2613902	2613909	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
50235	NC_002505	CTT	2	6	2613939	2613944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642434
50236	NC_002505	TCA	2	6	2613956	2613961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642434
50237	NC_002505	GAT	2	6	2614066	2614071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642434
50238	NC_002505	GCGCT	2	10	2614072	2614081	0 %	20 %	40 %	40 %	15642434
50239	NC_002505	TAGA	2	8	2614087	2614094	50 %	25 %	25 %	0 %	15642434
50240	NC_002505	GGC	2	6	2614098	2614103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
50241	NC_002505	CAC	2	6	2614216	2614221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642434
50242	NC_002505	CAA	2	6	2614311	2614316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642434
50243	NC_002505	TCAC	2	8	2614343	2614350	25 %	25 %	0 %	50 %	15642434
50244	NC_002505	TCA	2	6	2614353	2614358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642434
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50246	NC_002505	CTG	2	6	2614435	2614440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642434
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50249	NC_002505	ATCA	2	8	2614531	2614538	50 %	25 %	0 %	25 %	15642434
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50251	NC_002505	CG	3	6	2614562	2614567	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
50252	NC_002505	GCT	2	6	2614569	2614574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642434
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50255	NC_002505	GCA	2	6	2614677	2614682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642434
50256	NC_002505	CG	3	6	2614692	2614697	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
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50263	NC_002505	TCT	2	6	2615075	2615080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642434
50264	NC_002505	GCA	2	6	2615121	2615126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642434
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50291	NC_002505	AAT	2	6	2616375	2616380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50292	NC_002505	T	6	6	2616380	2616385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50293	NC_002505	AGC	2	6	2616479	2616484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642435
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50324	NC_002505	TGAG	2	8	2617696	2617703	25 %	25 %	50 %	0 %	15642435
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50326	NC_002505	ATA	2	6	2617752	2617757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50327	NC_002505	TCA	2	6	2617806	2617811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50328	NC_002505	AGAC	2	8	2617892	2617899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50329	NC_002505	GAAC	2	8	2617914	2617921	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50330	NC_002505	AAGG	2	8	2617948	2617955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50331	NC_002505	TCA	2	6	2617978	2617983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50332	NC_002505	GCCTCC	2	12	2618106	2618117	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50333	NC_002505	TTAT	2	8	2618119	2618126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50334	NC_002505	CTC	2	6	2618258	2618263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642436
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50338	NC_002505	CTG	2	6	2618426	2618431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642436
50339	NC_002505	GTT	2	6	2618506	2618511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642436
50340	NC_002505	T	6	6	2618542	2618547	0 %	100 %	0 %	0 %	15642436
50341	NC_002505	CT	3	6	2618673	2618678	0 %	50 %	0 %	50 %	15642436
50342	NC_002505	TCT	2	6	2618745	2618750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642436
50343	NC_002505	GGCGC	2	10	2618834	2618843	0 %	0 %	60 %	40 %	15642436
50344	NC_002505	ATG	2	6	2618847	2618852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642436
50345	NC_002505	CCG	2	6	2618853	2618858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642436
50346	NC_002505	GCC	2	6	2618913	2618918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642436
50347	NC_002505	AAT	2	6	2619058	2619063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642436
50348	NC_002505	GGC	2	6	2619065	2619070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642436
50349	NC_002505	GCT	2	6	2619087	2619092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642436
50350	NC_002505	GC	3	6	2619137	2619142	0 %	0 %	50 %	50 %	15642436
50351	NC_002505	CCA	2	6	2619220	2619225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642436
50352	NC_002505	AG	3	6	2619310	2619315	50 %	0 %	50 %	0 %	15642436
50353	NC_002505	TCA	2	6	2619483	2619488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642436
50354	NC_002505	ACG	2	6	2619491	2619496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642436
50355	NC_002505	GAA	2	6	2619580	2619585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642436
50356	NC_002505	CG	3	6	2619605	2619610	0 %	0 %	50 %	50 %	15642436
50357	NC_002505	A	6	6	2619638	2619643	100 %	0 %	0 %	0 %	15642436
50358	NC_002505	AG	3	6	2619724	2619729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50359	NC_002505	GC	3	6	2619789	2619794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50360	NC_002505	TTA	2	6	2619855	2619860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50475	NC_002505	T	6	6	2625260	2625265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50476	NC_002505	GGC	2	6	2625295	2625300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50480	NC_002505	GAA	2	6	2625529	2625534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642442
50481	NC_002505	CTG	2	6	2625538	2625543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642442
50482	NC_002505	CGC	2	6	2625544	2625549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642442
50483	NC_002505	TGAT	2	8	2625593	2625600	25 %	50 %	25 %	0 %	15642442
50484	NC_002505	CGC	2	6	2625624	2625629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642442
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50495	NC_002505	CAAG	2	8	2625984	2625991	50 %	0 %	25 %	25 %	15642442
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