MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD2 DNA

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020421	CT	3	6	1320	1325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020421	GCCT	2	8	1331	1338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020421	A	6	6	1342	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020421	A	6	6	1404	1409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020421	A	7	7	1415	1421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020421	TGT	2	6	1424	1429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020421	TTAT	2	8	1488	1495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020421	TGTCT	2	10	1496	1505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020421	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020421	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020421	TAAA	2	8	1700	1707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020421	A	8	8	1715	1722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020421	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020421	A	8	8	1772	1779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020421	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020421	GCGT	2	8	1843	1850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020421	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020421	A	6	6	1903	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020421	A	6	6	1915	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020421	A	9	9	1949	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020421	AATCT	2	10	2045	2054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020421	ATA	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020421	CTT	2	6	2106	2111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020421	CTGA	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020421	CAA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020421	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020421	TGT	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020421	TAT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020421	AT	3	6	2261	2266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020421	A	6	6	2350	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020421	AGCGA	2	10	2358	2367	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020421	AT	3	6	2390	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020421	ATA	2	6	2434	2439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020421	A	9	9	2512	2520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020421	A	7	7	2523	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020421	A	7	7	2537	2543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020421	A	7	7	2547	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020421	AC	3	6	2618	2623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020421	A	7	7	2624	2630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020421	A	6	6	4313	4318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020421	CTG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020421	TA	3	6	4439	4444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020421	ACC	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020421	A	6	6	4471	4476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020421	AT	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020421	A	7	7	4565	4571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020421	ATA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020421	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020421	TAAT	2	8	4668	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020421	A	6	6	4676	4681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020421	GTT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020421	A	6	6	4688	4693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020421	TTA	3	9	5266	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020421	AATT	2	8	5346	5353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020421	T	8	8	5397	5404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020421	T	6	6	5545	5550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020421	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020421	CT	3	6	5584	5589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020421	ACT	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020421	TAC	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020421	A	6	6	5665	5670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020421	A	6	6	5674	5679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.