MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 DNA

Total Repeats: 9613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_020419	A	7	7	1111317	1111323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_020419	CTA	2	6	1111337	1111342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_020419	TAA	3	9	1111363	1111371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_020419	T	6	6	1111373	1111378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_020419	CAC	2	6	1111387	1111392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9506	NC_020419	A	6	6	1111442	1111447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_020419	ATAA	2	8	1111481	1111488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_020419	A	6	6	1111501	1111506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_020419	A	7	7	1111527	1111533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_020419	AACA	2	8	1111562	1111569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9511	NC_020419	AACG	2	8	1111579	1111586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9512	NC_020419	A	7	7	1111615	1111621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_020419	AAT	2	6	1111625	1111630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_020419	T	8	8	1111680	1111687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_020419	TTATA	2	10	1111695	1111704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_020419	ATT	2	6	1111705	1111710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_020419	AAAT	2	8	1111712	1111719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_020419	AT	3	6	1111718	1111723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_020419	CTC	2	6	1111761	1111766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9520	NC_020419	TTTA	2	8	1111771	1111778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_020419	CTC	2	6	1111782	1111787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9522	NC_020419	AGTC	2	8	1111802	1111809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9523	NC_020419	CAGG	2	8	1111865	1111872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9524	NC_020419	T	8	8	1111940	1111947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_020419	TAC	2	6	1111950	1111955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9526	NC_020419	G	7	7	1111983	1111989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9527	NC_020419	TAA	2	6	1112006	1112011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_020419	AAC	2	6	1112044	1112049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NC_020419	T	7	7	1112117	1112123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_020419	TAA	2	6	1112945	1112950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_020419	GATA	2	8	1112966	1112973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_020419	GACA	2	8	1112997	1113004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9533	NC_020419	CGC	2	6	1113007	1113012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9534	NC_020419	A	7	7	1113028	1113034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_020419	CTTTT	2	10	1116892	1116901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9536	NC_020419	TCT	2	6	1116970	1116975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9537	NC_020419	AT	3	6	1116985	1116990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_020419	TTTTA	2	10	1117067	1117076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_020419	T	7	7	1117080	1117086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_020419	TCG	2	6	1117162	1117167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_020419	GCA	2	6	1117250	1117255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_020419	TAT	2	6	1117268	1117273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_020419	GCC	2	6	1117288	1117293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9544	NC_020419	T	8	8	1117304	1117311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_020419	G	8	8	1117312	1117319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_020419	TGCC	2	8	1117353	1117360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9547	NC_020419	CAT	2	6	1117414	1117419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9548	NC_020419	CAC	2	6	1117518	1117523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9549	NC_020419	TTA	2	6	1117542	1117547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_020419	CTT	2	6	1117575	1117580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NC_020419	CAT	2	6	1117587	1117592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NC_020419	AT	4	8	1117591	1117598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_020419	TTA	2	6	1117658	1117663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_020419	TG	3	6	1117692	1117697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_020419	TCC	2	6	1117721	1117726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9556	NC_020419	CT	3	6	1117815	1117820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9557	NC_020419	TCTCT	2	10	1117830	1117839	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9558	NC_020419	CTT	2	6	1117843	1117848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_020419	TCC	2	6	1118206	1118211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_020419	GTGA	2	8	1118324	1118331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_020419	TTG	2	6	1118332	1118337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_020419	CAAT	2	8	1118452	1118459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9563	NC_020419	TTTCA	2	10	1118475	1118484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9564	NC_020419	ATTT	2	8	1118505	1118512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_020419	TA	3	6	1118548	1118553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_020419	ATA	2	6	1118572	1118577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_020419	ATTT	2	8	1118589	1118596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_020419	CAAAAA	2	12	1118602	1118613	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9569	NC_020419	CAA	2	6	1118628	1118633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_020419	CAA	2	6	1118693	1118698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9571	NC_020419	CGAA	2	8	1118709	1118716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9572	NC_020419	A	6	6	1118719	1118724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9573	NC_020419	AC	3	6	1118733	1118738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9574	NC_020419	CTT	2	6	1118780	1118785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9575	NC_020419	TCG	2	6	1118792	1118797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_020419	GTT	3	9	1118821	1118829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9577	NC_020419	ACA	2	6	1118862	1118867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9578	NC_020419	A	6	6	1118867	1118872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_020419	TAA	2	6	1118877	1118882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_020419	T	6	6	1118884	1118889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9581	NC_020419	CAA	2	6	1118908	1118913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9582	NC_020419	CT	3	6	1118944	1118949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9583	NC_020419	CAAGA	2	10	1118983	1118992	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9584	NC_020419	A	6	6	1119006	1119011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_020419	TA	3	6	1119151	1119156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_020419	T	6	6	1119690	1119695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_020419	CAG	2	6	1119703	1119708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9588	NC_020419	A	6	6	1119771	1119776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_020419	GAA	2	6	1119791	1119796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9590	NC_020419	AGTAT	2	10	1121471	1121480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9591	NC_020419	A	6	6	1121503	1121508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_020419	CGA	2	6	1121609	1121614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9593	NC_020419	TTG	2	6	1121688	1121693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9594	NC_020419	T	6	6	1121743	1121748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_020419	TTCA	2	8	1121783	1121790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9596	NC_020419	GAA	2	6	1121853	1121858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_020419	TGC	2	6	1121919	1121924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9598	NC_020419	ATTT	2	8	1121930	1121937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_020419	CAG	2	6	1121940	1121945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9601	NC_020419	TAT	3	9	1122022	1122030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_020419	GCT	2	6	1122034	1122039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NC_020419	A	6	6	1122064	1122069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_020419	ACTA	2	8	1122088	1122095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9605	NC_020419	TTGC	2	8	1122117	1122124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9606	NC_020419	AGA	2	6	1122132	1122137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_020419	GAACAC	2	12	1122145	1122156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9608	NC_020419	TC	3	6	1122227	1122232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9609	NC_020419	ACCG	2	8	1122282	1122289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9610	NC_020419	AGAA	2	8	1123721	1123728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_020419	TCTGA	2	10	1124956	1124965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9612	NC_020419	ATT	2	6	1125803	1125808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_020419	TTG	2	6	1125814	1125819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.